Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A395HXU1

Protein Details
Accession A0A395HXU1    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
134-153ESEKWDKRMDKKQRHRDDVABasic
240-263DLRKAEEVRLKKRRDRRGDDDGDVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
65-66KA
68-68K
248-255RLKKRRDR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPTEHEIAQPAASSAETKEEHTSEQPSDVPQEPAVSDASESAPKGADKKDDDAASKARLRQERFKALKARAKTATERNLKETAAETQRLATDPALLSSISRKHAFASHNLLKADTEAAGEDFERKRAWDWTVDESEKWDKRMDKKQRHRDDVAFQDYTQDARKVYKRQLREMQPNLESYERDKMAAIEKAAANGDLEIVETNDGEMIAVDKNGTFYSTADTVGFTENKPDRAAVDKLVSDLRKAEEVRLKKRRDRRGDDDGDVTYINEKNKQFNQKLARFYNKYTTEIRDSFERGTMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.15
3 0.16
4 0.18
5 0.22
6 0.23
7 0.26
8 0.28
9 0.32
10 0.27
11 0.28
12 0.27
13 0.24
14 0.28
15 0.27
16 0.26
17 0.22
18 0.22
19 0.2
20 0.2
21 0.19
22 0.14
23 0.12
24 0.11
25 0.13
26 0.13
27 0.13
28 0.13
29 0.14
30 0.14
31 0.18
32 0.19
33 0.24
34 0.25
35 0.29
36 0.34
37 0.35
38 0.36
39 0.37
40 0.37
41 0.37
42 0.37
43 0.37
44 0.39
45 0.43
46 0.46
47 0.52
48 0.57
49 0.62
50 0.63
51 0.67
52 0.67
53 0.69
54 0.71
55 0.64
56 0.63
57 0.57
58 0.57
59 0.56
60 0.57
61 0.58
62 0.59
63 0.58
64 0.55
65 0.52
66 0.48
67 0.42
68 0.36
69 0.33
70 0.29
71 0.28
72 0.23
73 0.22
74 0.23
75 0.22
76 0.22
77 0.15
78 0.13
79 0.12
80 0.12
81 0.11
82 0.1
83 0.1
84 0.12
85 0.15
86 0.16
87 0.17
88 0.17
89 0.17
90 0.23
91 0.24
92 0.25
93 0.31
94 0.33
95 0.36
96 0.36
97 0.35
98 0.3
99 0.28
100 0.25
101 0.15
102 0.1
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.1
108 0.09
109 0.1
110 0.11
111 0.11
112 0.12
113 0.15
114 0.16
115 0.17
116 0.2
117 0.23
118 0.28
119 0.28
120 0.26
121 0.27
122 0.33
123 0.29
124 0.27
125 0.26
126 0.26
127 0.32
128 0.43
129 0.5
130 0.54
131 0.64
132 0.73
133 0.79
134 0.81
135 0.78
136 0.72
137 0.67
138 0.63
139 0.57
140 0.47
141 0.37
142 0.32
143 0.28
144 0.26
145 0.21
146 0.15
147 0.11
148 0.14
149 0.19
150 0.22
151 0.31
152 0.35
153 0.38
154 0.45
155 0.53
156 0.57
157 0.62
158 0.62
159 0.59
160 0.55
161 0.52
162 0.46
163 0.39
164 0.31
165 0.24
166 0.24
167 0.19
168 0.18
169 0.17
170 0.16
171 0.18
172 0.2
173 0.18
174 0.15
175 0.15
176 0.15
177 0.15
178 0.14
179 0.11
180 0.08
181 0.08
182 0.05
183 0.05
184 0.04
185 0.04
186 0.05
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.03
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.1
204 0.1
205 0.11
206 0.1
207 0.11
208 0.11
209 0.14
210 0.14
211 0.11
212 0.19
213 0.2
214 0.22
215 0.22
216 0.22
217 0.2
218 0.25
219 0.27
220 0.21
221 0.22
222 0.21
223 0.22
224 0.27
225 0.26
226 0.22
227 0.22
228 0.21
229 0.23
230 0.23
231 0.28
232 0.31
233 0.39
234 0.49
235 0.56
236 0.62
237 0.65
238 0.74
239 0.79
240 0.81
241 0.82
242 0.8
243 0.81
244 0.81
245 0.76
246 0.7
247 0.6
248 0.5
249 0.41
250 0.33
251 0.26
252 0.22
253 0.21
254 0.24
255 0.24
256 0.3
257 0.38
258 0.49
259 0.48
260 0.54
261 0.63
262 0.63
263 0.7
264 0.71
265 0.73
266 0.67
267 0.69
268 0.7
269 0.63
270 0.6
271 0.56
272 0.53
273 0.52
274 0.49
275 0.48
276 0.43
277 0.43
278 0.41