Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A8P0J3

Protein Details
Accession A8P0J3    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MPPKGSKKKGGRKAKAAVVEEBasic
343-366GKINKDIDKKAKFHRKRLNEDEGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-15KGSKKKGGRKAK
233-240KLARKKRR
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG cci:CC1G_10325  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPPKGSKKKGGRKAKAAVVEEIPNVEPEVETPQEDTQMNVDEQTTTEQPEASTSAKLASTVTNAVVEAEHAVEHAVEKVVEKVAEVGGAAKEFVEEMTMTGVESGSSGNASESATPGAQESGKDEPMEQDSSREASQSAEAESKPKLTLEERRAKMEALRKKMREGTMANRQSLAEETAKAKLTARELARLERQRKLAETLRLKADAEERGEDVERRKNWEYTIEENDEWEKKLARKKRRADFEFHDDAQASRRRYKKDLDQIKPDLEAYNRQKALAMGLNPSANALTSFSSTDVVASSSSSALQAVSSEEQRIAAENLYRDANTLIYGDSKPSDEAIDRVVGKINKDIDKKAKFHRKRLNEDEGDITYINEHNRVFNKKIARYYDKYTAEIRASFERGTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.82
3 0.75
4 0.69
5 0.62
6 0.55
7 0.46
8 0.4
9 0.33
10 0.25
11 0.22
12 0.18
13 0.13
14 0.11
15 0.16
16 0.15
17 0.15
18 0.17
19 0.18
20 0.21
21 0.22
22 0.21
23 0.18
24 0.21
25 0.2
26 0.18
27 0.18
28 0.14
29 0.15
30 0.18
31 0.17
32 0.15
33 0.16
34 0.16
35 0.15
36 0.17
37 0.19
38 0.16
39 0.15
40 0.13
41 0.15
42 0.14
43 0.15
44 0.14
45 0.12
46 0.13
47 0.14
48 0.14
49 0.13
50 0.13
51 0.13
52 0.12
53 0.1
54 0.09
55 0.07
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.07
62 0.07
63 0.06
64 0.07
65 0.09
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.05
83 0.05
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.04
93 0.04
94 0.05
95 0.04
96 0.05
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.11
108 0.13
109 0.14
110 0.14
111 0.14
112 0.15
113 0.18
114 0.21
115 0.18
116 0.16
117 0.16
118 0.18
119 0.18
120 0.16
121 0.13
122 0.11
123 0.13
124 0.12
125 0.12
126 0.13
127 0.13
128 0.14
129 0.15
130 0.15
131 0.14
132 0.13
133 0.14
134 0.15
135 0.24
136 0.31
137 0.41
138 0.41
139 0.44
140 0.45
141 0.43
142 0.44
143 0.44
144 0.42
145 0.41
146 0.47
147 0.45
148 0.48
149 0.53
150 0.49
151 0.47
152 0.43
153 0.41
154 0.43
155 0.46
156 0.42
157 0.38
158 0.36
159 0.31
160 0.28
161 0.24
162 0.14
163 0.12
164 0.13
165 0.14
166 0.15
167 0.15
168 0.15
169 0.15
170 0.16
171 0.2
172 0.2
173 0.22
174 0.23
175 0.26
176 0.32
177 0.38
178 0.39
179 0.38
180 0.4
181 0.36
182 0.36
183 0.38
184 0.36
185 0.36
186 0.37
187 0.36
188 0.35
189 0.34
190 0.33
191 0.29
192 0.26
193 0.21
194 0.18
195 0.16
196 0.14
197 0.14
198 0.15
199 0.15
200 0.16
201 0.2
202 0.19
203 0.24
204 0.26
205 0.27
206 0.27
207 0.31
208 0.32
209 0.31
210 0.35
211 0.32
212 0.3
213 0.3
214 0.31
215 0.26
216 0.23
217 0.19
218 0.16
219 0.17
220 0.25
221 0.33
222 0.41
223 0.5
224 0.59
225 0.66
226 0.75
227 0.74
228 0.74
229 0.71
230 0.69
231 0.65
232 0.56
233 0.49
234 0.38
235 0.35
236 0.33
237 0.32
238 0.27
239 0.28
240 0.33
241 0.36
242 0.4
243 0.46
244 0.5
245 0.55
246 0.62
247 0.62
248 0.65
249 0.65
250 0.62
251 0.57
252 0.48
253 0.39
254 0.3
255 0.33
256 0.29
257 0.34
258 0.33
259 0.32
260 0.32
261 0.3
262 0.32
263 0.27
264 0.23
265 0.16
266 0.18
267 0.18
268 0.17
269 0.17
270 0.13
271 0.09
272 0.09
273 0.08
274 0.07
275 0.08
276 0.09
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.08
294 0.1
295 0.11
296 0.12
297 0.12
298 0.12
299 0.12
300 0.14
301 0.12
302 0.12
303 0.14
304 0.14
305 0.16
306 0.17
307 0.16
308 0.15
309 0.15
310 0.13
311 0.11
312 0.1
313 0.09
314 0.11
315 0.11
316 0.12
317 0.13
318 0.14
319 0.14
320 0.14
321 0.15
322 0.13
323 0.14
324 0.14
325 0.18
326 0.17
327 0.18
328 0.23
329 0.23
330 0.23
331 0.28
332 0.32
333 0.34
334 0.38
335 0.44
336 0.48
337 0.54
338 0.58
339 0.63
340 0.68
341 0.7
342 0.77
343 0.8
344 0.81
345 0.83
346 0.87
347 0.87
348 0.79
349 0.74
350 0.68
351 0.59
352 0.52
353 0.41
354 0.32
355 0.23
356 0.22
357 0.2
358 0.19
359 0.18
360 0.21
361 0.28
362 0.34
363 0.36
364 0.4
365 0.48
366 0.51
367 0.58
368 0.62
369 0.64
370 0.63
371 0.67
372 0.7
373 0.65
374 0.61
375 0.56
376 0.53
377 0.48
378 0.45
379 0.42
380 0.37
381 0.37
382 0.34