Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A319EKH3

Protein Details
Accession A0A319EKH3    Localization Confidence High Confidence Score 19.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
90-109KDAQRRGPRGDRPRHDRQSRBasic
209-235GEYFKGKEDKAKREKQRKEKNVLEVDMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-46PRVGKRDAPK
60-60R
84-84K
89-103GKDAQRRGPRGDRPR
195-228KKWAGAKELKRTEEGEYFKGKEDKAKREKQRKEK
241-274PRGGANGPRGRGGRGGRGGRGGRGGDRAAAPRTE
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MAEIRSKNLYELLGNDPELDPNRAPEPPTKAVDRPAPRVGKRDAPKEVPSQPRENNNSRRGGRATGNEAAFRDRNAGRTNNREKPTEDGKDAQRRGPRGDRPRHDRQSRTGQTDTRKQVNQGWGNQSGEKTLDDEKAGENIAHNEESEPQTPAEEAQEPIDKSKSYNDYLAEKAAQGDLSAKPVRAANEGSKLDKKWAGAKELKRTEEGEYFKGKEDKAKREKQRKEKNVLEVDMRFVEAPRGGANGPRGRGGRGGRGGRGGRGGDRAAAPRTERPSGPAPASVSVDEKNFPSLGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.22
4 0.25
5 0.26
6 0.27
7 0.22
8 0.22
9 0.25
10 0.25
11 0.27
12 0.29
13 0.35
14 0.36
15 0.4
16 0.42
17 0.42
18 0.46
19 0.53
20 0.53
21 0.51
22 0.54
23 0.59
24 0.57
25 0.6
26 0.59
27 0.59
28 0.6
29 0.62
30 0.6
31 0.58
32 0.6
33 0.6
34 0.64
35 0.64
36 0.63
37 0.63
38 0.61
39 0.64
40 0.67
41 0.7
42 0.71
43 0.68
44 0.71
45 0.65
46 0.65
47 0.58
48 0.54
49 0.5
50 0.46
51 0.45
52 0.41
53 0.41
54 0.37
55 0.35
56 0.35
57 0.31
58 0.26
59 0.25
60 0.2
61 0.23
62 0.26
63 0.32
64 0.33
65 0.43
66 0.51
67 0.55
68 0.57
69 0.56
70 0.53
71 0.53
72 0.55
73 0.5
74 0.44
75 0.41
76 0.46
77 0.53
78 0.53
79 0.52
80 0.48
81 0.46
82 0.49
83 0.52
84 0.53
85 0.54
86 0.62
87 0.66
88 0.69
89 0.77
90 0.81
91 0.8
92 0.74
93 0.71
94 0.72
95 0.69
96 0.67
97 0.6
98 0.55
99 0.54
100 0.58
101 0.57
102 0.52
103 0.47
104 0.43
105 0.44
106 0.48
107 0.47
108 0.43
109 0.42
110 0.39
111 0.39
112 0.38
113 0.33
114 0.25
115 0.21
116 0.16
117 0.13
118 0.12
119 0.12
120 0.11
121 0.12
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.09
130 0.08
131 0.08
132 0.1
133 0.12
134 0.13
135 0.12
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.09
142 0.08
143 0.09
144 0.13
145 0.13
146 0.14
147 0.15
148 0.13
149 0.13
150 0.18
151 0.2
152 0.18
153 0.2
154 0.21
155 0.23
156 0.23
157 0.24
158 0.19
159 0.16
160 0.14
161 0.12
162 0.1
163 0.07
164 0.09
165 0.08
166 0.12
167 0.13
168 0.12
169 0.13
170 0.15
171 0.16
172 0.16
173 0.19
174 0.17
175 0.24
176 0.25
177 0.28
178 0.3
179 0.29
180 0.3
181 0.29
182 0.27
183 0.27
184 0.28
185 0.32
186 0.36
187 0.41
188 0.48
189 0.53
190 0.53
191 0.48
192 0.47
193 0.44
194 0.43
195 0.4
196 0.34
197 0.32
198 0.32
199 0.34
200 0.35
201 0.32
202 0.33
203 0.38
204 0.45
205 0.5
206 0.59
207 0.66
208 0.73
209 0.83
210 0.86
211 0.9
212 0.89
213 0.88
214 0.86
215 0.85
216 0.81
217 0.74
218 0.68
219 0.57
220 0.51
221 0.42
222 0.35
223 0.25
224 0.18
225 0.18
226 0.13
227 0.13
228 0.11
229 0.12
230 0.12
231 0.15
232 0.22
233 0.25
234 0.26
235 0.3
236 0.3
237 0.3
238 0.36
239 0.36
240 0.37
241 0.4
242 0.43
243 0.4
244 0.46
245 0.46
246 0.42
247 0.43
248 0.36
249 0.3
250 0.3
251 0.29
252 0.24
253 0.26
254 0.28
255 0.27
256 0.28
257 0.29
258 0.32
259 0.37
260 0.39
261 0.36
262 0.38
263 0.41
264 0.43
265 0.42
266 0.39
267 0.36
268 0.35
269 0.38
270 0.34
271 0.3
272 0.27
273 0.27
274 0.24
275 0.23
276 0.22