Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0D1DPX6

Protein Details
Accession A0A0D1DPX6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
277-305EGGPKHKDRTEKQKQKKTKKVTGNLAQVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
281-296KHKDRTEKQKQKKTKK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, cyto 5.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025724  GAG-pre-integrase_dom  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR013103  RVT_2  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003887  F:DNA-directed DNA polymerase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003964  F:RNA-directed DNA polymerase activity  
GO:0015074  P:DNA integration  
GO:0032196  P:transposition  
KEGG uma:UMAG_11580  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13976  gag_pre-integrs  
PF14223  Retrotran_gag_2  
PF00665  rve  
PF07727  RVT_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50994  INTEGRASE  
Amino Acid Sequences MSPINDQDLAFSSMRVGLPKRLMSSEDYFEWATSMQNVLSCKNANLWFIIEGRLVKPEEHLGEGDLKEVKLGNKFPTKDIAEYYRADVEARSILLKLPGTRSQQALVDTSTTARKVWEKLRENYAQNVAQQIASLEAQLANLYQGDDKINVYSYKLETICRKLDHVDAPVSGLRKLRTFLRGLGPQHDVWRKIFYFNTRLFFQKEGDSDETANKKALEDYEIAVSTIMAEEAEQKSFRRQYPARAMQAQSQPVKKGKDKFCTNCKRDNHNLEDCFMEGGPKHKDRTEKQKQKKTKKVTGNLAQVDSDEMNLCLHVSTPDDNVAPQNETWIIDSGASRHMTGDKTLFSTYGPSPVQEVFVADNRGVPVAGMGNVRLVMSNSKGSRKSITLQDVLHVPGLGNNLFSTPQVQRLGGSINFTKKTVEIFDKKGRLALRGKRRGDVNYLLVEGTTTAVAKLVTSEKALDQAKLWHQRLGHLHMQATLKTASLTDGMNLKAMSGPSVGNNCETCIKSKHRHAPIKSRGPKTTRPLELVHMDLAGPLPEGLSKEKYYLLMVDDCTRYCFGAALIYKSSAFQAFRTIDRWTQTQLGKRICRVRTDNGGEFLSREFSNYLNHRGIGREVTPRFTPQSNGLVERTNQIVKDYIRCMLEEANLTTQYWPFAFSHGLKLRNMSATSTDSSKTPHEGMHGKRQDLQGLRVFGCKAWARVPDELRKSLDPKSVECIHLGHVSNNHPYIYRLMDVETGQIFTSRHVIFRENERIRRKSEAPFEELSDDETGTTGNNLPRPGLPAPVRSSLNIPRTSPSSEEPSQPVGATNYPHLASIEEAQLADTTESGDSLESPTQQLVPSAESTDDEFHEPINLIPSRRRPQDIRGRDSPSRHQEIDDESDDSLALLPTPHQTVGGDTTTVGDTRTVGDKNNANESTGDESRYNLRARPHRLGDYARHVTTNLSKPPATLKQARMRADWPLWEGAIQAELKSHESNKTWTLVDHPQNKATNVVSCKWVFAIKKKADGSLDKYKARLVARGFTQRYGYDYDETFSPVVKATTLRILIGLAAAFDWKIVHWDAVTAFLNEDAYRQKYT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.24
3 0.23
4 0.25
5 0.31
6 0.35
7 0.37
8 0.36
9 0.37
10 0.39
11 0.41
12 0.39
13 0.34
14 0.34
15 0.31
16 0.29
17 0.28
18 0.22
19 0.18
20 0.14
21 0.14
22 0.11
23 0.14
24 0.15
25 0.16
26 0.2
27 0.2
28 0.2
29 0.26
30 0.28
31 0.27
32 0.27
33 0.27
34 0.25
35 0.24
36 0.26
37 0.21
38 0.2
39 0.2
40 0.23
41 0.23
42 0.21
43 0.22
44 0.26
45 0.25
46 0.26
47 0.25
48 0.22
49 0.27
50 0.26
51 0.27
52 0.23
53 0.21
54 0.19
55 0.21
56 0.23
57 0.23
58 0.27
59 0.32
60 0.38
61 0.41
62 0.42
63 0.48
64 0.48
65 0.44
66 0.46
67 0.44
68 0.4
69 0.39
70 0.4
71 0.35
72 0.32
73 0.3
74 0.24
75 0.21
76 0.19
77 0.18
78 0.15
79 0.13
80 0.14
81 0.17
82 0.19
83 0.2
84 0.23
85 0.29
86 0.35
87 0.38
88 0.38
89 0.37
90 0.38
91 0.37
92 0.33
93 0.28
94 0.23
95 0.2
96 0.21
97 0.22
98 0.19
99 0.18
100 0.19
101 0.22
102 0.26
103 0.34
104 0.42
105 0.47
106 0.52
107 0.6
108 0.65
109 0.63
110 0.63
111 0.62
112 0.54
113 0.47
114 0.44
115 0.36
116 0.29
117 0.26
118 0.2
119 0.15
120 0.13
121 0.11
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.06
128 0.07
129 0.08
130 0.07
131 0.09
132 0.1
133 0.11
134 0.12
135 0.12
136 0.15
137 0.15
138 0.15
139 0.18
140 0.18
141 0.23
142 0.23
143 0.26
144 0.3
145 0.35
146 0.4
147 0.38
148 0.38
149 0.35
150 0.4
151 0.4
152 0.38
153 0.34
154 0.28
155 0.3
156 0.3
157 0.29
158 0.25
159 0.24
160 0.22
161 0.21
162 0.23
163 0.25
164 0.28
165 0.29
166 0.32
167 0.36
168 0.41
169 0.42
170 0.44
171 0.43
172 0.4
173 0.45
174 0.46
175 0.41
176 0.36
177 0.4
178 0.36
179 0.36
180 0.38
181 0.37
182 0.39
183 0.41
184 0.44
185 0.39
186 0.42
187 0.41
188 0.39
189 0.34
190 0.32
191 0.28
192 0.3
193 0.31
194 0.29
195 0.28
196 0.32
197 0.34
198 0.3
199 0.3
200 0.24
201 0.21
202 0.22
203 0.22
204 0.18
205 0.17
206 0.17
207 0.18
208 0.18
209 0.18
210 0.15
211 0.14
212 0.11
213 0.09
214 0.07
215 0.04
216 0.04
217 0.08
218 0.1
219 0.12
220 0.13
221 0.14
222 0.21
223 0.27
224 0.3
225 0.35
226 0.37
227 0.44
228 0.55
229 0.62
230 0.61
231 0.61
232 0.61
233 0.59
234 0.62
235 0.6
236 0.54
237 0.49
238 0.47
239 0.47
240 0.51
241 0.5
242 0.53
243 0.55
244 0.59
245 0.66
246 0.69
247 0.75
248 0.8
249 0.79
250 0.78
251 0.76
252 0.75
253 0.75
254 0.75
255 0.72
256 0.7
257 0.66
258 0.58
259 0.52
260 0.44
261 0.35
262 0.26
263 0.2
264 0.11
265 0.15
266 0.21
267 0.23
268 0.25
269 0.27
270 0.36
271 0.41
272 0.52
273 0.58
274 0.63
275 0.7
276 0.78
277 0.86
278 0.89
279 0.92
280 0.91
281 0.89
282 0.89
283 0.87
284 0.87
285 0.85
286 0.82
287 0.75
288 0.66
289 0.56
290 0.46
291 0.39
292 0.29
293 0.2
294 0.12
295 0.09
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.05
300 0.06
301 0.06
302 0.07
303 0.08
304 0.09
305 0.11
306 0.11
307 0.12
308 0.14
309 0.14
310 0.14
311 0.13
312 0.13
313 0.12
314 0.13
315 0.14
316 0.13
317 0.12
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.14
322 0.14
323 0.13
324 0.12
325 0.14
326 0.14
327 0.16
328 0.16
329 0.13
330 0.15
331 0.15
332 0.15
333 0.12
334 0.15
335 0.14
336 0.18
337 0.17
338 0.15
339 0.17
340 0.17
341 0.18
342 0.14
343 0.15
344 0.11
345 0.14
346 0.15
347 0.13
348 0.13
349 0.12
350 0.13
351 0.11
352 0.09
353 0.07
354 0.06
355 0.08
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.09
365 0.14
366 0.15
367 0.2
368 0.22
369 0.24
370 0.26
371 0.27
372 0.29
373 0.31
374 0.34
375 0.33
376 0.31
377 0.31
378 0.3
379 0.28
380 0.24
381 0.17
382 0.12
383 0.1
384 0.11
385 0.1
386 0.09
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.09
391 0.1
392 0.09
393 0.14
394 0.15
395 0.15
396 0.15
397 0.15
398 0.19
399 0.16
400 0.18
401 0.16
402 0.2
403 0.2
404 0.2
405 0.2
406 0.17
407 0.18
408 0.19
409 0.23
410 0.23
411 0.29
412 0.35
413 0.38
414 0.37
415 0.4
416 0.37
417 0.35
418 0.38
419 0.4
420 0.44
421 0.51
422 0.52
423 0.52
424 0.54
425 0.51
426 0.49
427 0.44
428 0.36
429 0.28
430 0.27
431 0.23
432 0.2
433 0.17
434 0.12
435 0.08
436 0.05
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.06
443 0.07
444 0.07
445 0.08
446 0.09
447 0.08
448 0.14
449 0.15
450 0.14
451 0.13
452 0.16
453 0.23
454 0.31
455 0.32
456 0.29
457 0.28
458 0.32
459 0.36
460 0.38
461 0.35
462 0.28
463 0.27
464 0.29
465 0.3
466 0.25
467 0.24
468 0.18
469 0.14
470 0.12
471 0.12
472 0.08
473 0.08
474 0.08
475 0.07
476 0.09
477 0.09
478 0.1
479 0.1
480 0.09
481 0.09
482 0.09
483 0.08
484 0.07
485 0.07
486 0.08
487 0.1
488 0.1
489 0.1
490 0.11
491 0.11
492 0.13
493 0.13
494 0.15
495 0.18
496 0.24
497 0.29
498 0.37
499 0.45
500 0.52
501 0.59
502 0.62
503 0.68
504 0.71
505 0.76
506 0.76
507 0.72
508 0.68
509 0.65
510 0.67
511 0.63
512 0.61
513 0.53
514 0.47
515 0.44
516 0.41
517 0.38
518 0.32
519 0.25
520 0.17
521 0.14
522 0.11
523 0.1
524 0.06
525 0.05
526 0.03
527 0.03
528 0.04
529 0.05
530 0.06
531 0.09
532 0.09
533 0.1
534 0.11
535 0.11
536 0.11
537 0.11
538 0.11
539 0.1
540 0.1
541 0.12
542 0.13
543 0.12
544 0.13
545 0.13
546 0.11
547 0.1
548 0.09
549 0.06
550 0.1
551 0.11
552 0.12
553 0.12
554 0.12
555 0.12
556 0.12
557 0.13
558 0.1
559 0.1
560 0.08
561 0.13
562 0.14
563 0.15
564 0.17
565 0.18
566 0.18
567 0.2
568 0.21
569 0.17
570 0.21
571 0.23
572 0.27
573 0.32
574 0.37
575 0.37
576 0.41
577 0.46
578 0.43
579 0.46
580 0.45
581 0.43
582 0.44
583 0.48
584 0.45
585 0.4
586 0.39
587 0.32
588 0.28
589 0.24
590 0.18
591 0.12
592 0.11
593 0.09
594 0.09
595 0.14
596 0.16
597 0.21
598 0.19
599 0.2
600 0.2
601 0.2
602 0.21
603 0.18
604 0.17
605 0.2
606 0.2
607 0.22
608 0.22
609 0.23
610 0.25
611 0.23
612 0.23
613 0.19
614 0.24
615 0.23
616 0.24
617 0.23
618 0.22
619 0.22
620 0.22
621 0.21
622 0.16
623 0.15
624 0.13
625 0.16
626 0.15
627 0.18
628 0.18
629 0.19
630 0.18
631 0.18
632 0.18
633 0.16
634 0.17
635 0.14
636 0.14
637 0.14
638 0.14
639 0.14
640 0.13
641 0.12
642 0.11
643 0.1
644 0.1
645 0.08
646 0.1
647 0.12
648 0.12
649 0.21
650 0.25
651 0.27
652 0.26
653 0.27
654 0.27
655 0.27
656 0.27
657 0.19
658 0.17
659 0.17
660 0.18
661 0.18
662 0.17
663 0.14
664 0.16
665 0.17
666 0.17
667 0.15
668 0.15
669 0.17
670 0.24
671 0.27
672 0.36
673 0.39
674 0.37
675 0.4
676 0.41
677 0.42
678 0.37
679 0.37
680 0.31
681 0.3
682 0.3
683 0.27
684 0.27
685 0.21
686 0.24
687 0.21
688 0.18
689 0.19
690 0.23
691 0.25
692 0.3
693 0.34
694 0.37
695 0.4
696 0.41
697 0.41
698 0.39
699 0.38
700 0.37
701 0.38
702 0.32
703 0.29
704 0.32
705 0.33
706 0.31
707 0.29
708 0.25
709 0.22
710 0.26
711 0.25
712 0.21
713 0.21
714 0.23
715 0.26
716 0.26
717 0.24
718 0.19
719 0.19
720 0.19
721 0.18
722 0.15
723 0.13
724 0.13
725 0.14
726 0.14
727 0.15
728 0.13
729 0.11
730 0.1
731 0.12
732 0.11
733 0.1
734 0.16
735 0.14
736 0.16
737 0.16
738 0.2
739 0.2
740 0.28
741 0.38
742 0.39
743 0.47
744 0.53
745 0.55
746 0.55
747 0.59
748 0.55
749 0.52
750 0.55
751 0.51
752 0.49
753 0.47
754 0.45
755 0.4
756 0.36
757 0.31
758 0.22
759 0.17
760 0.12
761 0.1
762 0.09
763 0.07
764 0.08
765 0.09
766 0.11
767 0.14
768 0.14
769 0.15
770 0.16
771 0.21
772 0.2
773 0.24
774 0.24
775 0.26
776 0.3
777 0.34
778 0.34
779 0.3
780 0.35
781 0.35
782 0.4
783 0.38
784 0.35
785 0.32
786 0.34
787 0.36
788 0.34
789 0.29
790 0.3
791 0.29
792 0.31
793 0.32
794 0.32
795 0.3
796 0.27
797 0.25
798 0.2
799 0.2
800 0.18
801 0.17
802 0.16
803 0.16
804 0.16
805 0.15
806 0.13
807 0.13
808 0.13
809 0.13
810 0.11
811 0.11
812 0.1
813 0.1
814 0.1
815 0.09
816 0.07
817 0.07
818 0.06
819 0.06
820 0.06
821 0.06
822 0.06
823 0.08
824 0.1
825 0.09
826 0.1
827 0.11
828 0.12
829 0.12
830 0.13
831 0.12
832 0.12
833 0.13
834 0.13
835 0.13
836 0.12
837 0.14
838 0.15
839 0.15
840 0.15
841 0.14
842 0.13
843 0.14
844 0.14
845 0.12
846 0.17
847 0.18
848 0.17
849 0.23
850 0.32
851 0.39
852 0.44
853 0.49
854 0.47
855 0.54
856 0.64
857 0.68
858 0.66
859 0.66
860 0.69
861 0.68
862 0.7
863 0.69
864 0.67
865 0.64
866 0.57
867 0.51
868 0.46
869 0.46
870 0.46
871 0.39
872 0.31
873 0.25
874 0.24
875 0.22
876 0.19
877 0.15
878 0.08
879 0.06
880 0.05
881 0.06
882 0.09
883 0.11
884 0.11
885 0.1
886 0.11
887 0.13
888 0.16
889 0.16
890 0.14
891 0.12
892 0.14
893 0.14
894 0.14
895 0.12
896 0.09
897 0.08
898 0.1
899 0.15
900 0.14
901 0.16
902 0.21
903 0.25
904 0.28
905 0.37
906 0.35
907 0.32
908 0.31
909 0.32
910 0.34
911 0.3
912 0.3
913 0.21
914 0.22
915 0.26
916 0.31
917 0.29
918 0.26
919 0.33
920 0.4
921 0.47
922 0.55
923 0.56
924 0.56
925 0.59
926 0.62
927 0.6
928 0.61
929 0.6
930 0.52
931 0.46
932 0.41
933 0.4
934 0.42
935 0.43
936 0.39
937 0.37
938 0.36
939 0.36
940 0.43
941 0.47
942 0.46
943 0.46
944 0.49
945 0.55
946 0.62
947 0.65
948 0.61
949 0.56
950 0.56
951 0.51
952 0.46
953 0.4
954 0.34
955 0.31
956 0.27
957 0.25
958 0.18
959 0.18
960 0.15
961 0.12
962 0.12
963 0.13
964 0.16
965 0.19
966 0.21
967 0.23
968 0.25
969 0.29
970 0.31
971 0.32
972 0.3
973 0.28
974 0.31
975 0.35
976 0.42
977 0.46
978 0.47
979 0.5
980 0.53
981 0.53
982 0.51
983 0.44
984 0.42
985 0.38
986 0.37
987 0.36
988 0.33
989 0.33
990 0.31
991 0.34
992 0.32
993 0.36
994 0.44
995 0.43
996 0.51
997 0.51
998 0.54
999 0.54
1000 0.56
1001 0.55
1002 0.56
1003 0.59
1004 0.53
1005 0.52
1006 0.5
1007 0.5
1008 0.46
1009 0.44
1010 0.37
1011 0.37
1012 0.42
1013 0.51
1014 0.51
1015 0.48
1016 0.5
1017 0.44
1018 0.43
1019 0.4
1020 0.37
1021 0.3
1022 0.28
1023 0.28
1024 0.25
1025 0.27
1026 0.24
1027 0.2
1028 0.17
1029 0.15
1030 0.15
1031 0.14
1032 0.15
1033 0.14
1034 0.21
1035 0.21
1036 0.21
1037 0.2
1038 0.19
1039 0.18
1040 0.18
1041 0.15
1042 0.08
1043 0.07
1044 0.07
1045 0.07
1046 0.07
1047 0.07
1048 0.06
1049 0.09
1050 0.11
1051 0.12
1052 0.11
1053 0.14
1054 0.14
1055 0.19
1056 0.2
1057 0.17
1058 0.17
1059 0.16
1060 0.18
1061 0.15
1062 0.17
1063 0.18