Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D6RLI3

Protein Details
Accession D6RLI3    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MPPKPAQKSKASKPDPKAIGKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-34KPAQKSKASKPDPKAIGKGPGRKAAAKQPIP
243-248KVRKSR
265-284RWLKKSERSTFAHGKRRKGA
306-316AKSGGKGKKKR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013699  Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd  
IPR026270  SRP72  
IPR031545  SRP_TPR-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0005786  C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
KEGG cci:CC1G_14101  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08492  SRP72  
PF17004  SRP_TPR_like  
Amino Acid Sequences MPPKPAQKSKASKPDPKAIGKGPGRKAAAKQPIPLPERLKRLFTSLCAQIDGGHFANAIKTCDKILRLEPNDVDAVKTKLFLLLQTEQYETALALLDQYPEAHRFERAYTLYRLHRESEASAILQEIRAQDSEHRGAAHLEAQLSYREGNYEAAFDTYNQLLDSAEPDSEEQSDILTNLQASQQHLDFVNEGYLRALDGLPTNVNTALESIPPPVPAAPAPGLTSSVNTGADNQQATNPPVKKVRKSRIPPGVIPGVTPPPDPERWLKKSERSTFAHGKRRKGAGGGATQGSAVDPIPQTSSSGPAKSGGKGKKKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.8
3 0.77
4 0.73
5 0.66
6 0.68
7 0.66
8 0.68
9 0.64
10 0.64
11 0.62
12 0.59
13 0.59
14 0.59
15 0.62
16 0.57
17 0.56
18 0.54
19 0.59
20 0.58
21 0.6
22 0.58
23 0.54
24 0.59
25 0.57
26 0.56
27 0.48
28 0.5
29 0.46
30 0.42
31 0.41
32 0.38
33 0.36
34 0.33
35 0.31
36 0.27
37 0.26
38 0.27
39 0.21
40 0.15
41 0.14
42 0.13
43 0.17
44 0.16
45 0.17
46 0.14
47 0.14
48 0.16
49 0.19
50 0.2
51 0.2
52 0.25
53 0.32
54 0.35
55 0.39
56 0.38
57 0.37
58 0.38
59 0.34
60 0.3
61 0.22
62 0.21
63 0.16
64 0.16
65 0.14
66 0.14
67 0.14
68 0.13
69 0.16
70 0.18
71 0.21
72 0.22
73 0.22
74 0.2
75 0.2
76 0.2
77 0.14
78 0.1
79 0.07
80 0.05
81 0.05
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.07
86 0.08
87 0.09
88 0.12
89 0.12
90 0.13
91 0.13
92 0.14
93 0.19
94 0.19
95 0.21
96 0.22
97 0.26
98 0.3
99 0.32
100 0.33
101 0.3
102 0.29
103 0.27
104 0.25
105 0.23
106 0.19
107 0.15
108 0.13
109 0.12
110 0.1
111 0.09
112 0.1
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.1
118 0.14
119 0.16
120 0.15
121 0.15
122 0.14
123 0.14
124 0.14
125 0.15
126 0.11
127 0.1
128 0.09
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.09
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.06
155 0.06
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.05
160 0.06
161 0.05
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.07
168 0.08
169 0.1
170 0.1
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.1
175 0.09
176 0.11
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.08
181 0.07
182 0.08
183 0.07
184 0.05
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.09
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.09
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.11
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.12
205 0.11
206 0.11
207 0.12
208 0.12
209 0.14
210 0.13
211 0.14
212 0.11
213 0.12
214 0.12
215 0.11
216 0.12
217 0.12
218 0.15
219 0.15
220 0.14
221 0.15
222 0.18
223 0.2
224 0.26
225 0.25
226 0.27
227 0.35
228 0.41
229 0.47
230 0.55
231 0.63
232 0.66
233 0.72
234 0.78
235 0.79
236 0.79
237 0.72
238 0.68
239 0.65
240 0.54
241 0.47
242 0.4
243 0.35
244 0.31
245 0.29
246 0.25
247 0.24
248 0.25
249 0.28
250 0.33
251 0.38
252 0.41
253 0.48
254 0.51
255 0.55
256 0.64
257 0.7
258 0.68
259 0.64
260 0.68
261 0.71
262 0.74
263 0.76
264 0.71
265 0.71
266 0.71
267 0.71
268 0.65
269 0.57
270 0.53
271 0.5
272 0.5
273 0.46
274 0.39
275 0.34
276 0.32
277 0.29
278 0.23
279 0.17
280 0.11
281 0.11
282 0.1
283 0.11
284 0.14
285 0.14
286 0.16
287 0.16
288 0.23
289 0.23
290 0.24
291 0.24
292 0.26
293 0.28
294 0.31
295 0.39
296 0.42