Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A319EHT4

Protein Details
Accession A0A319EHT4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
78-101YDNAREARERKKRERDMMDAAKRKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-101RERKKRERDMMDAAKRK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 9, nucl 8.5, cyto 8.5, mito 3, extr 2, pero 1, E.R. 1, golg 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001623  DnaJ_domain  
IPR018253  DnaJ_domain_CS  
IPR036869  J_dom_sf  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00226  DnaJ  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00636  DNAJ_1  
PS50076  DNAJ_2  
PS50102  RRM  
CDD cd06257  DnaJ  
Amino Acid Sequences MASNDDLKAHAASTEDFYALLDISPAAAESEIRRAYRRTALKYHPDKIANPTPADIDKFHVLQIAYDVLSDPSVRQLYDNAREARERKKRERDMMDAAKRKMREDLEARERAGAAGMGGATQRGVKRSWMGTDAGSDDAEAKLQREIDRIAEDGRRRRREAEERLKQEMEEEEKLMRQEEEEAQRAADRSSQKVDRSKEGGANVPELERGVKVRWVREGRGLDLDKDRLMSLFSSFGKIENILLLKDKRQRLGDNREKKTVATGVVIFASIVSAHSAVLDSEKKIRQSTGQADSVWSAIESVFWASGNQPDLGTEANGHSSAPTTSEQSTAPKTQGPAPSAAPSKPSFNFPGLKSASSGAAGKQPGKAPSFGSFASAAGKSAKPAPAGSTNGSSAPSLEEVTLMRLKNAQREKERKALEEQLRKEDEAADAAEAEAKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.15
3 0.15
4 0.14
5 0.14
6 0.13
7 0.11
8 0.08
9 0.06
10 0.06
11 0.06
12 0.06
13 0.06
14 0.06
15 0.07
16 0.08
17 0.16
18 0.2
19 0.22
20 0.25
21 0.27
22 0.32
23 0.4
24 0.46
25 0.46
26 0.51
27 0.59
28 0.67
29 0.73
30 0.73
31 0.72
32 0.68
33 0.63
34 0.63
35 0.63
36 0.57
37 0.5
38 0.46
39 0.41
40 0.4
41 0.4
42 0.32
43 0.27
44 0.26
45 0.25
46 0.24
47 0.24
48 0.21
49 0.18
50 0.19
51 0.16
52 0.13
53 0.12
54 0.13
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.09
59 0.12
60 0.13
61 0.13
62 0.14
63 0.18
64 0.25
65 0.31
66 0.38
67 0.36
68 0.37
69 0.43
70 0.45
71 0.51
72 0.54
73 0.57
74 0.6
75 0.68
76 0.75
77 0.79
78 0.83
79 0.8
80 0.8
81 0.81
82 0.8
83 0.77
84 0.71
85 0.66
86 0.59
87 0.53
88 0.5
89 0.41
90 0.39
91 0.38
92 0.44
93 0.48
94 0.51
95 0.5
96 0.45
97 0.43
98 0.35
99 0.29
100 0.19
101 0.1
102 0.07
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.07
109 0.08
110 0.1
111 0.11
112 0.12
113 0.17
114 0.19
115 0.21
116 0.21
117 0.21
118 0.19
119 0.2
120 0.2
121 0.17
122 0.14
123 0.12
124 0.1
125 0.09
126 0.1
127 0.09
128 0.08
129 0.09
130 0.11
131 0.12
132 0.13
133 0.14
134 0.15
135 0.16
136 0.16
137 0.17
138 0.2
139 0.25
140 0.31
141 0.4
142 0.44
143 0.45
144 0.48
145 0.54
146 0.59
147 0.64
148 0.67
149 0.67
150 0.67
151 0.7
152 0.66
153 0.57
154 0.48
155 0.41
156 0.34
157 0.26
158 0.21
159 0.17
160 0.18
161 0.18
162 0.18
163 0.14
164 0.1
165 0.11
166 0.15
167 0.18
168 0.19
169 0.19
170 0.19
171 0.2
172 0.2
173 0.17
174 0.17
175 0.15
176 0.15
177 0.2
178 0.23
179 0.27
180 0.33
181 0.35
182 0.35
183 0.36
184 0.36
185 0.34
186 0.32
187 0.32
188 0.26
189 0.25
190 0.21
191 0.18
192 0.16
193 0.13
194 0.12
195 0.08
196 0.08
197 0.07
198 0.11
199 0.13
200 0.14
201 0.22
202 0.24
203 0.25
204 0.3
205 0.31
206 0.29
207 0.33
208 0.32
209 0.27
210 0.26
211 0.26
212 0.19
213 0.18
214 0.17
215 0.1
216 0.1
217 0.08
218 0.07
219 0.09
220 0.09
221 0.11
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.09
228 0.09
229 0.08
230 0.11
231 0.12
232 0.16
233 0.23
234 0.25
235 0.27
236 0.29
237 0.35
238 0.4
239 0.5
240 0.55
241 0.59
242 0.61
243 0.62
244 0.59
245 0.54
246 0.48
247 0.4
248 0.31
249 0.22
250 0.18
251 0.14
252 0.14
253 0.14
254 0.1
255 0.08
256 0.06
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.07
266 0.09
267 0.09
268 0.15
269 0.17
270 0.19
271 0.2
272 0.21
273 0.22
274 0.28
275 0.33
276 0.33
277 0.34
278 0.32
279 0.32
280 0.31
281 0.28
282 0.21
283 0.14
284 0.09
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.06
292 0.06
293 0.09
294 0.11
295 0.11
296 0.1
297 0.1
298 0.11
299 0.11
300 0.1
301 0.09
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.1
310 0.1
311 0.12
312 0.13
313 0.14
314 0.15
315 0.18
316 0.23
317 0.22
318 0.23
319 0.23
320 0.24
321 0.28
322 0.33
323 0.31
324 0.29
325 0.29
326 0.33
327 0.34
328 0.32
329 0.3
330 0.27
331 0.3
332 0.28
333 0.31
334 0.29
335 0.3
336 0.35
337 0.32
338 0.39
339 0.36
340 0.36
341 0.32
342 0.3
343 0.27
344 0.23
345 0.23
346 0.15
347 0.18
348 0.2
349 0.2
350 0.23
351 0.26
352 0.29
353 0.3
354 0.31
355 0.28
356 0.29
357 0.31
358 0.27
359 0.26
360 0.22
361 0.2
362 0.22
363 0.19
364 0.17
365 0.17
366 0.17
367 0.16
368 0.2
369 0.23
370 0.21
371 0.22
372 0.25
373 0.28
374 0.31
375 0.33
376 0.31
377 0.29
378 0.29
379 0.29
380 0.24
381 0.19
382 0.17
383 0.15
384 0.13
385 0.12
386 0.12
387 0.11
388 0.16
389 0.2
390 0.18
391 0.18
392 0.22
393 0.25
394 0.33
395 0.42
396 0.46
397 0.53
398 0.62
399 0.68
400 0.72
401 0.74
402 0.68
403 0.67
404 0.68
405 0.67
406 0.68
407 0.66
408 0.66
409 0.65
410 0.62
411 0.55
412 0.47
413 0.39
414 0.31
415 0.27
416 0.18
417 0.15
418 0.14