Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A8PDN2

Protein Details
Accession A8PDN2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
167-191EEAAKEKARKEKLEKEKAKEKKGKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
168-191EAAKEKARKEKLEKEKAKEKKGKR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 13, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023139  PBDC1-like_dom_sf  
IPR008476  PBDC1_metazoa/fungi  
KEGG cci:CC1G_11280  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04669  Polysacc_synt_4  
Amino Acid Sequences MSTEIKSIPPVIGPDGKPQHFDPNTAQNLIEIEKQFAVKAVEQAQTYWNLLEKVPPRELRLTKLDDEIFDDLMKTFPELAEPPHTKLIKIDEEWMKNSQGKKKWREFCERYKDRVKDYNFGSLIRTDAEDEYGERNTIFVTRIQFYGFEIARNRLGLNDKAHELAKEEAAKEKARKEKLEKEKAKEKKGKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.4
3 0.41
4 0.42
5 0.42
6 0.48
7 0.43
8 0.45
9 0.41
10 0.42
11 0.44
12 0.42
13 0.4
14 0.3
15 0.3
16 0.28
17 0.28
18 0.19
19 0.17
20 0.17
21 0.18
22 0.17
23 0.17
24 0.18
25 0.14
26 0.17
27 0.19
28 0.21
29 0.21
30 0.22
31 0.22
32 0.22
33 0.21
34 0.18
35 0.15
36 0.13
37 0.13
38 0.18
39 0.22
40 0.25
41 0.3
42 0.32
43 0.33
44 0.4
45 0.42
46 0.41
47 0.42
48 0.41
49 0.36
50 0.38
51 0.35
52 0.28
53 0.29
54 0.25
55 0.2
56 0.15
57 0.14
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.07
62 0.06
63 0.05
64 0.07
65 0.07
66 0.09
67 0.16
68 0.18
69 0.2
70 0.26
71 0.26
72 0.25
73 0.26
74 0.28
75 0.24
76 0.23
77 0.26
78 0.24
79 0.26
80 0.28
81 0.28
82 0.26
83 0.25
84 0.28
85 0.29
86 0.32
87 0.39
88 0.45
89 0.53
90 0.6
91 0.63
92 0.7
93 0.7
94 0.73
95 0.75
96 0.72
97 0.69
98 0.7
99 0.67
100 0.61
101 0.63
102 0.56
103 0.51
104 0.48
105 0.49
106 0.41
107 0.38
108 0.34
109 0.26
110 0.24
111 0.18
112 0.17
113 0.1
114 0.09
115 0.1
116 0.09
117 0.1
118 0.11
119 0.11
120 0.11
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.13
128 0.14
129 0.15
130 0.15
131 0.15
132 0.15
133 0.21
134 0.18
135 0.18
136 0.2
137 0.22
138 0.23
139 0.23
140 0.22
141 0.19
142 0.24
143 0.25
144 0.27
145 0.27
146 0.27
147 0.29
148 0.29
149 0.27
150 0.25
151 0.22
152 0.23
153 0.23
154 0.23
155 0.27
156 0.3
157 0.35
158 0.36
159 0.42
160 0.47
161 0.51
162 0.58
163 0.61
164 0.68
165 0.73
166 0.8
167 0.8
168 0.8
169 0.83
170 0.84
171 0.86