Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A8P685

Protein Details
Accession A8P685    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
397-421SEEPDGQPKKKKKKDGPGVTARNMSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
404-411PKKKKKKD
Subcellular Location(s) mito 11.5, cyto_mito 9.5, nucl 8, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
KEGG cci:CC1G_08827  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
CDD cd08045  TAF4  
Amino Acid Sequences MTSTPTSSTPTPVTMAAQTTVQAGTPVQTYPSPAHAQWAAGQLQVQMDTAQQQQQQAAAQQSQTPTATAASVTAPKPQHATQSYYQSYTHYPYYQQYIAQAVAAQQAQQQAAAAASQHQAHTPTPVATAQRASVPAATPAATATSTPVAPAHTPAVATAQTTTAPVTAAMPAAQAANANTLDTSDISTLNDALGSAGVDLRAEEESLQRHDAHGTSHLQSHSLYMQNRPYEDRSRKQPVKPAFDTRALGTTMRAIGSQHKVTKIPDESINYLALALRARLQDLVTAMIRASKYRKQAQFDRPASFYETLNNVNNAMDVDGVKMESQTPMWSVVVRSDVGKQLAALEKAEREEEMRIRRERKERQEMAAANLASMSQAGTPGADPSLGANALSASGGSEEPDGQPKKKKKKDGPGVTARNMSEDVRKKMSNAVATQAAGLGKYAWMTAAASSPSPAPKPKASTSTTATGSGTTPASSWARPYVPKKPQQQMTTTTTPEQKTEVEDPNKVVVTMRDAMFVVEKERGHGGGRGAARGWT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.21
4 0.19
5 0.18
6 0.17
7 0.16
8 0.14
9 0.12
10 0.1
11 0.1
12 0.11
13 0.11
14 0.12
15 0.12
16 0.16
17 0.17
18 0.23
19 0.25
20 0.24
21 0.29
22 0.27
23 0.28
24 0.28
25 0.31
26 0.26
27 0.23
28 0.24
29 0.2
30 0.2
31 0.19
32 0.16
33 0.11
34 0.11
35 0.13
36 0.16
37 0.19
38 0.21
39 0.22
40 0.22
41 0.24
42 0.25
43 0.26
44 0.27
45 0.24
46 0.23
47 0.25
48 0.25
49 0.26
50 0.25
51 0.21
52 0.18
53 0.16
54 0.15
55 0.12
56 0.11
57 0.11
58 0.15
59 0.15
60 0.21
61 0.22
62 0.23
63 0.28
64 0.28
65 0.35
66 0.34
67 0.4
68 0.38
69 0.47
70 0.48
71 0.46
72 0.44
73 0.38
74 0.38
75 0.35
76 0.34
77 0.26
78 0.26
79 0.26
80 0.32
81 0.31
82 0.28
83 0.26
84 0.25
85 0.23
86 0.21
87 0.18
88 0.13
89 0.15
90 0.14
91 0.13
92 0.12
93 0.15
94 0.14
95 0.14
96 0.13
97 0.1
98 0.1
99 0.1
100 0.08
101 0.07
102 0.09
103 0.1
104 0.11
105 0.12
106 0.14
107 0.14
108 0.17
109 0.17
110 0.15
111 0.16
112 0.18
113 0.19
114 0.18
115 0.19
116 0.17
117 0.18
118 0.18
119 0.17
120 0.16
121 0.15
122 0.15
123 0.14
124 0.14
125 0.11
126 0.1
127 0.11
128 0.09
129 0.08
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.13
143 0.11
144 0.11
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.07
167 0.07
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.06
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.07
192 0.09
193 0.11
194 0.13
195 0.12
196 0.13
197 0.14
198 0.14
199 0.13
200 0.14
201 0.15
202 0.15
203 0.18
204 0.18
205 0.17
206 0.17
207 0.17
208 0.16
209 0.18
210 0.18
211 0.18
212 0.23
213 0.23
214 0.24
215 0.26
216 0.28
217 0.33
218 0.39
219 0.41
220 0.44
221 0.53
222 0.59
223 0.59
224 0.62
225 0.61
226 0.62
227 0.62
228 0.6
229 0.54
230 0.51
231 0.49
232 0.41
233 0.36
234 0.28
235 0.23
236 0.17
237 0.14
238 0.11
239 0.1
240 0.09
241 0.08
242 0.11
243 0.15
244 0.18
245 0.19
246 0.2
247 0.21
248 0.22
249 0.27
250 0.24
251 0.22
252 0.22
253 0.22
254 0.23
255 0.23
256 0.22
257 0.17
258 0.15
259 0.13
260 0.1
261 0.08
262 0.06
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.09
267 0.08
268 0.09
269 0.09
270 0.1
271 0.08
272 0.08
273 0.07
274 0.09
275 0.09
276 0.1
277 0.14
278 0.17
279 0.23
280 0.31
281 0.36
282 0.4
283 0.49
284 0.57
285 0.64
286 0.63
287 0.6
288 0.53
289 0.49
290 0.48
291 0.4
292 0.3
293 0.22
294 0.2
295 0.2
296 0.2
297 0.19
298 0.16
299 0.14
300 0.14
301 0.11
302 0.09
303 0.07
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.07
315 0.08
316 0.08
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.11
321 0.11
322 0.11
323 0.11
324 0.14
325 0.14
326 0.14
327 0.12
328 0.13
329 0.16
330 0.16
331 0.14
332 0.13
333 0.13
334 0.14
335 0.15
336 0.12
337 0.1
338 0.13
339 0.18
340 0.23
341 0.29
342 0.34
343 0.39
344 0.46
345 0.54
346 0.6
347 0.65
348 0.7
349 0.67
350 0.65
351 0.69
352 0.63
353 0.57
354 0.53
355 0.42
356 0.31
357 0.27
358 0.23
359 0.14
360 0.13
361 0.09
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.05
366 0.05
367 0.06
368 0.06
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.05
380 0.04
381 0.05
382 0.05
383 0.06
384 0.06
385 0.07
386 0.08
387 0.17
388 0.2
389 0.22
390 0.32
391 0.41
392 0.52
393 0.6
394 0.7
395 0.72
396 0.8
397 0.87
398 0.89
399 0.89
400 0.88
401 0.87
402 0.8
403 0.75
404 0.64
405 0.55
406 0.45
407 0.37
408 0.35
409 0.35
410 0.36
411 0.37
412 0.37
413 0.36
414 0.41
415 0.44
416 0.41
417 0.36
418 0.34
419 0.31
420 0.31
421 0.3
422 0.25
423 0.2
424 0.14
425 0.13
426 0.09
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.05
431 0.06
432 0.06
433 0.07
434 0.09
435 0.1
436 0.1
437 0.11
438 0.13
439 0.16
440 0.19
441 0.23
442 0.25
443 0.3
444 0.37
445 0.41
446 0.46
447 0.46
448 0.49
449 0.49
450 0.5
451 0.46
452 0.41
453 0.36
454 0.3
455 0.27
456 0.24
457 0.2
458 0.14
459 0.12
460 0.15
461 0.17
462 0.17
463 0.18
464 0.21
465 0.25
466 0.32
467 0.39
468 0.45
469 0.52
470 0.6
471 0.67
472 0.72
473 0.76
474 0.74
475 0.74
476 0.71
477 0.69
478 0.67
479 0.61
480 0.56
481 0.55
482 0.5
483 0.46
484 0.41
485 0.35
486 0.34
487 0.37
488 0.41
489 0.4
490 0.41
491 0.42
492 0.44
493 0.43
494 0.37
495 0.32
496 0.25
497 0.25
498 0.28
499 0.25
500 0.22
501 0.22
502 0.23
503 0.24
504 0.23
505 0.2
506 0.2
507 0.2
508 0.2
509 0.22
510 0.23
511 0.22
512 0.24
513 0.24
514 0.26
515 0.27
516 0.27