FuNGI

A0A318Z6M4

Protein Details

Accession

A0A318Z6M4

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-27	MVSDKVEKKRKRASDRHERPSKKPALG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-24	EKKRKRASDRHERPSKKP
325-334	PKGAGPGSKR
464-497	GIKGGKAEAAARRVARLRIPVEFPKVSRGGGKRR

Subcellular Location(s)

nucl 11, cyto_nucl 10, mito 9, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MVSDKVEKKRKRASDRHERPSKKPALGLQDLPPLASSVVEDDSELAPVIVTTPGLNAPRNLRLKPYLKTRSKTSSTSTRNKGIVSSELLLQSAEHPKLDFVGREAEEDADSQLKHYVAVVDPENKTWQFVEVRKMTLRGAVRKLRSIDEEEEEEEEEEELQTLRAQRTELTNTFGTKQSRKAAQSLAENAQLSNLPSGAASAAESAILSSMPTEGVNDIAAKAAMVQAQVQANKPIPTPHLDAAHPAEVYPLSELVPNGESTLRQLPGVQEWIDTATSGEPVVTTSRYVSRRVEAVIQSGNTTHLQILRFILLLLELNRHLKRDPKGAGPGSKRLPPRNELRTVLSGGTSPTSASSSGSSEAIPDPIIDAIRRKFAPGTGGSLSRNDVTFLHTTICALSLHIPPQPAKDGGNSSQGGNAPNELATDPSDLRDDLHLESPVILQYFRELGCRVDKPRESEFAKWGIKGGKAEAAARRVARLRIPVEFPKVSRGGGKRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.86
2	0.9
3	0.92
4	0.92
5	0.88
6	0.84
7	0.84
8	0.83
9	0.75
10	0.7
11	0.66
12	0.64
13	0.63
14	0.61
15	0.55
16	0.54
17	0.49
18	0.44
19	0.37
20	0.29
21	0.23
22	0.19
23	0.14
24	0.09
25	0.11
26	0.1
27	0.1
28	0.11
29	0.12
30	0.12
31	0.12
32	0.09
33	0.07
34	0.07
35	0.08
36	0.06
37	0.06
38	0.06
39	0.07
40	0.11
41	0.14
42	0.16
43	0.18
44	0.23
45	0.31
46	0.37
47	0.37
48	0.39
49	0.45
50	0.49
51	0.53
52	0.59
53	0.61
54	0.64
55	0.68
56	0.69
57	0.7
58	0.69
59	0.67
60	0.63
61	0.63
62	0.63
63	0.68
64	0.67
65	0.65
66	0.62
67	0.58
68	0.53
69	0.45
70	0.4
71	0.34
72	0.29
73	0.25
74	0.23
75	0.22
76	0.2
77	0.17
78	0.18
79	0.2
80	0.19
81	0.17
82	0.17
83	0.17
84	0.19
85	0.21
86	0.18
87	0.13
88	0.19
89	0.19
90	0.2
91	0.21
92	0.2
93	0.18
94	0.18
95	0.17
96	0.13
97	0.12
98	0.12
99	0.13
100	0.12
101	0.12
102	0.12
103	0.13
104	0.11
105	0.15
106	0.17
107	0.2
108	0.21
109	0.23
110	0.26
111	0.24
112	0.24
113	0.21
114	0.22
115	0.22
116	0.25
117	0.31
118	0.3
119	0.33
120	0.34
121	0.35
122	0.31
123	0.31
124	0.33
125	0.32
126	0.37
127	0.4
128	0.41
129	0.45
130	0.47
131	0.44
132	0.42
133	0.41
134	0.36
135	0.32
136	0.32
137	0.28
138	0.26
139	0.24
140	0.21
141	0.16
142	0.13
143	0.1
144	0.08
145	0.07
146	0.06
147	0.05
148	0.07
149	0.09
150	0.1
151	0.11
152	0.11
153	0.13
154	0.17
155	0.23
156	0.22
157	0.23
158	0.24
159	0.25
160	0.26
161	0.29
162	0.3
163	0.26
164	0.3
165	0.32
166	0.36
167	0.37
168	0.38
169	0.37
170	0.36
171	0.38
172	0.37
173	0.34
174	0.31
175	0.29
176	0.25
177	0.23
178	0.19
179	0.15
180	0.11
181	0.09
182	0.06
183	0.06
184	0.06
185	0.05
186	0.05
187	0.04
188	0.04
189	0.04
190	0.04
191	0.04
192	0.04
193	0.04
194	0.03
195	0.03
196	0.03
197	0.03
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.05
203	0.05
204	0.05
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.04
209	0.04
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.07
215	0.09
216	0.11
217	0.11
218	0.13
219	0.14
220	0.14
221	0.15
222	0.14
223	0.13
224	0.16
225	0.19
226	0.19
227	0.2
228	0.19
229	0.21
230	0.21
231	0.21
232	0.17
233	0.14
234	0.12
235	0.1
236	0.1
237	0.08
238	0.06
239	0.05
240	0.06
241	0.06
242	0.06
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.08
249	0.12
250	0.11
251	0.1
252	0.11
253	0.11
254	0.12
255	0.14
256	0.12
257	0.09
258	0.09
259	0.1
260	0.09
261	0.09
262	0.08
263	0.06
264	0.06
265	0.05
266	0.05
267	0.04
268	0.05
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.07
273	0.14
274	0.16
275	0.19
276	0.19
277	0.2
278	0.21
279	0.22
280	0.25
281	0.19
282	0.2
283	0.19
284	0.18
285	0.17
286	0.16
287	0.16
288	0.12
289	0.12
290	0.1
291	0.11
292	0.11
293	0.12
294	0.13
295	0.11
296	0.11
297	0.1
298	0.09
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.08
303	0.08
304	0.13
305	0.14
306	0.15
307	0.16
308	0.22
309	0.25
310	0.31
311	0.33
312	0.33
313	0.41
314	0.44
315	0.5
316	0.48
317	0.51
318	0.46
319	0.49
320	0.5
321	0.49
322	0.49
323	0.47
324	0.52
325	0.53
326	0.55
327	0.52
328	0.51
329	0.46
330	0.43
331	0.38
332	0.3
333	0.23
334	0.18
335	0.16
336	0.12
337	0.09
338	0.08
339	0.08
340	0.08
341	0.09
342	0.09
343	0.1
344	0.11
345	0.12
346	0.11
347	0.11
348	0.12
349	0.11
350	0.1
351	0.09
352	0.08
353	0.08
354	0.09
355	0.09
356	0.13
357	0.14
358	0.19
359	0.2
360	0.21
361	0.21
362	0.21
363	0.26
364	0.22
365	0.26
366	0.23
367	0.26
368	0.25
369	0.25
370	0.26
371	0.22
372	0.2
373	0.16
374	0.14
375	0.16
376	0.16
377	0.16
378	0.16
379	0.14
380	0.15
381	0.14
382	0.14
383	0.1
384	0.1
385	0.13
386	0.13
387	0.16
388	0.17
389	0.2
390	0.19
391	0.23
392	0.26
393	0.23
394	0.22
395	0.24
396	0.27
397	0.28
398	0.34
399	0.31
400	0.28
401	0.3
402	0.31
403	0.29
404	0.24
405	0.22
406	0.16
407	0.15
408	0.15
409	0.12
410	0.12
411	0.11
412	0.14
413	0.13
414	0.14
415	0.15
416	0.14
417	0.16
418	0.17
419	0.17
420	0.16
421	0.2
422	0.19
423	0.18
424	0.18
425	0.18
426	0.18
427	0.16
428	0.14
429	0.1
430	0.11
431	0.14
432	0.14
433	0.16
434	0.15
435	0.18
436	0.25
437	0.31
438	0.34
439	0.4
440	0.45
441	0.48
442	0.52
443	0.57
444	0.55
445	0.53
446	0.54
447	0.53
448	0.51
449	0.46
450	0.45
451	0.41
452	0.4
453	0.37
454	0.35
455	0.31
456	0.29
457	0.34
458	0.35
459	0.34
460	0.36
461	0.34
462	0.37
463	0.36
464	0.38
465	0.38
466	0.4
467	0.41
468	0.41
469	0.47
470	0.48
471	0.52
472	0.53
473	0.49
474	0.49
475	0.47
476	0.43
477	0.45

A0A318Z6M4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer