Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A8N0H0

Protein Details
Accession A8N0H0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
401-426GVNPNAEGTKKKKKKRLSIAPTPAASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
219-230KKKAGEKGGKGG
409-417TKKKKKKRL
Subcellular Location(s) extr 13, cyto 5.5, mito 5, cyto_nucl 4.5, nucl 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG cci:CC1G_04391  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MPCVVLSFEWSFVCSLRPYWTLFWNANGSSPCPVLLDVPPTRISTSLPTLLLLLPPPAKPTVSKSNPKYPYPQANGPLTEQNVFDYFATSMFYDKQSNNQVLRMQTIYTGVPIANEAEELRRFTGIEFAVVHAQPPAFFIIHKRERISPDEVKPLAAYFINNNRIYQAPDLYSLLSNRLLTSVSALQTTLDVLRKKRPDYTPRTGFVWPIVGEPEDDAKKKAGEKGGKGGGTGTAKKELVPSLNPTADKAGGGRLSDMAGGVGGPEGDDGGDGGVDGDPTEPATSQVPGGGGSGGGIGKEGTQGTQSAPTPGSTTQKRQNTILLMNAMRTTAVHSKIGLPAGIDTRLAAAESSATGVGGANEGAPASAGGGGDSGGATPATSALRSSATPAPSGQEAAIKGVNPNAEGTKKKKKKRLSIAPTPAAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.19
4 0.21
5 0.24
6 0.27
7 0.31
8 0.34
9 0.34
10 0.36
11 0.36
12 0.34
13 0.35
14 0.34
15 0.31
16 0.28
17 0.27
18 0.23
19 0.19
20 0.19
21 0.17
22 0.18
23 0.24
24 0.23
25 0.26
26 0.28
27 0.28
28 0.29
29 0.27
30 0.26
31 0.23
32 0.26
33 0.27
34 0.25
35 0.23
36 0.24
37 0.24
38 0.23
39 0.18
40 0.17
41 0.15
42 0.16
43 0.18
44 0.18
45 0.19
46 0.19
47 0.26
48 0.33
49 0.39
50 0.49
51 0.53
52 0.62
53 0.67
54 0.69
55 0.69
56 0.67
57 0.68
58 0.65
59 0.65
60 0.61
61 0.6
62 0.58
63 0.54
64 0.5
65 0.42
66 0.36
67 0.3
68 0.25
69 0.21
70 0.2
71 0.17
72 0.14
73 0.12
74 0.11
75 0.12
76 0.1
77 0.11
78 0.11
79 0.14
80 0.16
81 0.17
82 0.23
83 0.28
84 0.34
85 0.34
86 0.36
87 0.37
88 0.34
89 0.37
90 0.31
91 0.25
92 0.19
93 0.2
94 0.16
95 0.13
96 0.13
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.1
105 0.11
106 0.12
107 0.13
108 0.12
109 0.13
110 0.12
111 0.17
112 0.14
113 0.14
114 0.13
115 0.14
116 0.17
117 0.17
118 0.17
119 0.12
120 0.12
121 0.1
122 0.11
123 0.11
124 0.08
125 0.08
126 0.12
127 0.21
128 0.27
129 0.3
130 0.32
131 0.35
132 0.38
133 0.43
134 0.46
135 0.43
136 0.41
137 0.46
138 0.44
139 0.4
140 0.36
141 0.31
142 0.25
143 0.19
144 0.15
145 0.11
146 0.18
147 0.25
148 0.25
149 0.25
150 0.25
151 0.26
152 0.27
153 0.25
154 0.2
155 0.13
156 0.14
157 0.15
158 0.14
159 0.14
160 0.12
161 0.13
162 0.12
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.09
167 0.08
168 0.1
169 0.11
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.11
178 0.13
179 0.15
180 0.22
181 0.26
182 0.28
183 0.35
184 0.41
185 0.46
186 0.53
187 0.61
188 0.6
189 0.58
190 0.6
191 0.53
192 0.45
193 0.36
194 0.3
195 0.2
196 0.14
197 0.13
198 0.1
199 0.09
200 0.09
201 0.12
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.12
206 0.13
207 0.14
208 0.18
209 0.21
210 0.24
211 0.25
212 0.3
213 0.33
214 0.32
215 0.3
216 0.27
217 0.23
218 0.22
219 0.21
220 0.17
221 0.16
222 0.16
223 0.16
224 0.18
225 0.16
226 0.15
227 0.15
228 0.18
229 0.19
230 0.21
231 0.21
232 0.2
233 0.2
234 0.18
235 0.17
236 0.13
237 0.12
238 0.1
239 0.11
240 0.1
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.08
245 0.06
246 0.04
247 0.04
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.02
252 0.02
253 0.02
254 0.02
255 0.02
256 0.02
257 0.02
258 0.02
259 0.02
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.07
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.06
287 0.06
288 0.05
289 0.06
290 0.07
291 0.08
292 0.12
293 0.13
294 0.14
295 0.14
296 0.14
297 0.16
298 0.18
299 0.24
300 0.24
301 0.31
302 0.37
303 0.44
304 0.46
305 0.46
306 0.48
307 0.45
308 0.43
309 0.4
310 0.36
311 0.29
312 0.27
313 0.26
314 0.21
315 0.17
316 0.15
317 0.16
318 0.16
319 0.19
320 0.18
321 0.19
322 0.21
323 0.24
324 0.25
325 0.21
326 0.15
327 0.15
328 0.16
329 0.16
330 0.14
331 0.11
332 0.11
333 0.11
334 0.1
335 0.08
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.07
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.04
353 0.04
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.06
361 0.05
362 0.04
363 0.05
364 0.04
365 0.04
366 0.06
367 0.07
368 0.07
369 0.08
370 0.09
371 0.11
372 0.11
373 0.16
374 0.2
375 0.2
376 0.22
377 0.22
378 0.23
379 0.23
380 0.24
381 0.2
382 0.19
383 0.18
384 0.2
385 0.21
386 0.19
387 0.18
388 0.2
389 0.21
390 0.17
391 0.19
392 0.21
393 0.25
394 0.31
395 0.38
396 0.47
397 0.55
398 0.65
399 0.72
400 0.77
401 0.83
402 0.87
403 0.91
404 0.9
405 0.91
406 0.92