FuNGI

A0A318Z572

Protein Details

Accession

A0A318Z572

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
13-52	ASPALNRSPEKERKRKHKDTSSPSKKKRKHTITDEQATPM	Hydrophilic
62-83	SSTSKKSSLKSQKKSTNAPAES	Hydrophilic
443-478	DTPSKSTSSTKIKKEKKSKSSSSSVKKEKKEKKSKD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
21-42	PEKERKRKHKDTSSPSKKKRKH
453-478	KIKKEKKSKSSSSSVKKEKKEKKSKD

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MAIDAMEIDSQIASPALNRSPEKERKRKHKDTSSPSKKKRKHTITDEQATPMPIRDKKSSSSSTSKKSSLKSQKKSTNAPAESSPYTLTTATLYLPLSPISISPTHAQASLMAEHLSPLLLTYYPPLQGIVLAYSNVTISSTPPNSPESAAAAAATEDHPQPLTLARTAGEYGVLYVYLTATFLVFRPQRGQLLEGWVNVQSEGFLGAIALNLFSVGIERKRLPSNWKWIPPGDEQEVESSTATTTTTISTTNNTSSDDTKRFPSSDDDDDDESDSESKPKFDPELEHFTPVTLASDANPLNPSNSNPSTDLSAINDPTTAANANHEDDDEVEGYFQSVSGHRVRGTIKFRVVDIDVIPGSERDRGFISIEGTMLTPEEEVQVLEDERNGILSSAGPGSSRRHGSVDTPSVSFTVPLGAAKTDRVDELRDVDDQEKEEIAAVDTPSKSTSSTKIKKEKKSKSSSSSVKKEKKEKKSKD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.07
2	0.12
3	0.15
4	0.22
5	0.23
6	0.27
7	0.38
8	0.48
9	0.57
10	0.63
11	0.7
12	0.75
13	0.85
14	0.91
15	0.91
16	0.92
17	0.92
18	0.92
19	0.94
20	0.94
21	0.94
22	0.94
23	0.94
24	0.91
25	0.91
26	0.91
27	0.9
28	0.9
29	0.89
30	0.89
31	0.89
32	0.89
33	0.81
34	0.73
35	0.65
36	0.56
37	0.46
38	0.39
39	0.36
40	0.32
41	0.35
42	0.37
43	0.39
44	0.42
45	0.5
46	0.51
47	0.51
48	0.57
49	0.59
50	0.6
51	0.63
52	0.64
53	0.62
54	0.61
55	0.64
56	0.66
57	0.69
58	0.71
59	0.75
60	0.77
61	0.79
62	0.83
63	0.82
64	0.81
65	0.73
66	0.66
67	0.59
68	0.56
69	0.5
70	0.43
71	0.34
72	0.25
73	0.24
74	0.21
75	0.18
76	0.13
77	0.13
78	0.11
79	0.13
80	0.12
81	0.1
82	0.11
83	0.11
84	0.1
85	0.09
86	0.09
87	0.11
88	0.11
89	0.13
90	0.14
91	0.17
92	0.17
93	0.17
94	0.17
95	0.15
96	0.17
97	0.16
98	0.15
99	0.13
100	0.11
101	0.11
102	0.11
103	0.09
104	0.06
105	0.05
106	0.05
107	0.05
108	0.06
109	0.07
110	0.09
111	0.1
112	0.1
113	0.1
114	0.09
115	0.09
116	0.1
117	0.09
118	0.08
119	0.08
120	0.07
121	0.07
122	0.07
123	0.07
124	0.07
125	0.05
126	0.06
127	0.12
128	0.14
129	0.15
130	0.17
131	0.19
132	0.19
133	0.2
134	0.19
135	0.16
136	0.15
137	0.14
138	0.12
139	0.1
140	0.09
141	0.09
142	0.09
143	0.08
144	0.07
145	0.08
146	0.08
147	0.08
148	0.08
149	0.1
150	0.11
151	0.1
152	0.11
153	0.11
154	0.12
155	0.12
156	0.11
157	0.09
158	0.07
159	0.07
160	0.06
161	0.06
162	0.04
163	0.04
164	0.04
165	0.04
166	0.04
167	0.03
168	0.03
169	0.04
170	0.04
171	0.11
172	0.12
173	0.13
174	0.16
175	0.18
176	0.21
177	0.21
178	0.22
179	0.17
180	0.23
181	0.23
182	0.2
183	0.19
184	0.17
185	0.17
186	0.15
187	0.14
188	0.07
189	0.05
190	0.06
191	0.05
192	0.03
193	0.03
194	0.03
195	0.04
196	0.04
197	0.03
198	0.03
199	0.03
200	0.03
201	0.02
202	0.03
203	0.05
204	0.06
205	0.08
206	0.09
207	0.12
208	0.15
209	0.18
210	0.24
211	0.29
212	0.38
213	0.42
214	0.46
215	0.46
216	0.44
217	0.47
218	0.42
219	0.4
220	0.33
221	0.27
222	0.23
223	0.22
224	0.21
225	0.17
226	0.14
227	0.1
228	0.08
229	0.07
230	0.07
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.06
235	0.06
236	0.07
237	0.08
238	0.1
239	0.11
240	0.11
241	0.12
242	0.13
243	0.15
244	0.2
245	0.21
246	0.21
247	0.23
248	0.24
249	0.23
250	0.23
251	0.25
252	0.24
253	0.25
254	0.26
255	0.26
256	0.25
257	0.25
258	0.25
259	0.2
260	0.16
261	0.13
262	0.1
263	0.11
264	0.1
265	0.11
266	0.11
267	0.12
268	0.13
269	0.14
270	0.18
271	0.21
272	0.3
273	0.3
274	0.32
275	0.3
276	0.29
277	0.27
278	0.23
279	0.18
280	0.09
281	0.08
282	0.06
283	0.11
284	0.11
285	0.12
286	0.13
287	0.12
288	0.13
289	0.14
290	0.15
291	0.18
292	0.19
293	0.2
294	0.2
295	0.21
296	0.22
297	0.22
298	0.21
299	0.16
300	0.18
301	0.16
302	0.15
303	0.14
304	0.12
305	0.11
306	0.12
307	0.1
308	0.08
309	0.1
310	0.11
311	0.13
312	0.12
313	0.12
314	0.12
315	0.11
316	0.13
317	0.11
318	0.09
319	0.08
320	0.07
321	0.08
322	0.07
323	0.07
324	0.06
325	0.06
326	0.1
327	0.12
328	0.14
329	0.14
330	0.18
331	0.2
332	0.27
333	0.31
334	0.34
335	0.36
336	0.35
337	0.35
338	0.35
339	0.34
340	0.28
341	0.23
342	0.21
343	0.16
344	0.16
345	0.16
346	0.13
347	0.13
348	0.16
349	0.15
350	0.12
351	0.14
352	0.16
353	0.17
354	0.18
355	0.18
356	0.14
357	0.14
358	0.13
359	0.12
360	0.1
361	0.09
362	0.08
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.07
369	0.08
370	0.09
371	0.09
372	0.09
373	0.09
374	0.09
375	0.1
376	0.09
377	0.07
378	0.07
379	0.07
380	0.09
381	0.09
382	0.09
383	0.09
384	0.11
385	0.15
386	0.21
387	0.24
388	0.24
389	0.26
390	0.27
391	0.3
392	0.37
393	0.4
394	0.36
395	0.34
396	0.32
397	0.31
398	0.29
399	0.26
400	0.17
401	0.12
402	0.1
403	0.1
404	0.11
405	0.12
406	0.12
407	0.14
408	0.15
409	0.14
410	0.16
411	0.17
412	0.19
413	0.19
414	0.22
415	0.23
416	0.22
417	0.24
418	0.24
419	0.25
420	0.24
421	0.24
422	0.2
423	0.18
424	0.18
425	0.15
426	0.15
427	0.15
428	0.14
429	0.18
430	0.17
431	0.18
432	0.18
433	0.18
434	0.19
435	0.19
436	0.27
437	0.33
438	0.42
439	0.51
440	0.6
441	0.69
442	0.78
443	0.86
444	0.88
445	0.88
446	0.9
447	0.9
448	0.87
449	0.88
450	0.88
451	0.87
452	0.87
453	0.87
454	0.86
455	0.86
456	0.88
457	0.89
458	0.89

A0A318Z572

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer