Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D6RNA6

Protein Details
Accession D6RNA6    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
849-870QIKIAHRKKVLKHHPDKKVSTTBasic
991-1024GSDSRDDKRYTEKKNKTERARRKKEDTAKLRTLVBasic
1029-1049SVDPRIKRIKQQEKEAREAKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1003-1015KKNKTERARRKKE
1033-1108RIKRIKQQEKEAREAKRRAAQGGPVKKSKADEDAEKKRLEEEAKQKEEAEKAARAEAKKAKAAAANAAKKARRAQR
Subcellular Location(s) mito 23.5, cyto_mito 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029058  AB_hydrolase  
IPR013785  Aldolase_TIM  
IPR001623  DnaJ_domain  
IPR018253  DnaJ_domain_CS  
IPR043594  HMGL  
IPR036869  J_dom_sf  
IPR000891  PYR_CT  
Gene Ontology GO:0004419  F:hydroxymethylglutaryl-CoA lyase activity  
GO:0044283  P:small molecule biosynthetic process  
KEGG cci:CC1G_15525  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00226  DnaJ  
PF00682  HMGL-like  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00636  DNAJ_1  
PS50076  DNAJ_2  
PS50991  PYR_CT  
CDD cd06257  DnaJ  
cd07938  DRE_TIM_HMGL  
Amino Acid Sequences MILRQFASSLSPCRQRALATMAKNNLVNIVEVGPRDGLQNEKGQVIPVGVKVELIDRLVDAGLSTVEAGSFVSPKWVPQMGGTPDVLKQIRSRRPNVHYPVLVPNQRGLDDLLSLLDSHPALTDEIAVFTSATDAFNKANLNCTVAESLQKLQSVVSTAKEKGLRVRGYVSVVVVCPYSGKVDYRKVREVAKELVDMGCYEVSLGDTVGQARPHEVAEMLEEVKLSVPVHQLAGHFHDTYGTAVANVLKALEHGVRTIDASVGGLGGCPYSPGATGNVATEDVLYALQDSPYTVNGADDTPVSLEKVASIGSWISQALGRDTVQWCDVILSLPRRINGHVFTEPVYLHGLQSLPVQVKAGLAPFRPLPSLTSPFSRAGRAMVLNKQTYVFDPRPNYPLVVTANRYWDPETSAVDGVTVVFAHGTGFNKESWEPTIEDVQKALEGNQTVRVREYWSIDAPNHGDSAALNQETLKVGYTPICECHLQIFDSVLSRIASRMGRVREVHPSFPFWLWKRRRRGFLETEAGGSGAFHGGCVTAPINESSRVLMTGHYPHVKFEKVILCEVMCMNPKFVGRAGNFLTQGAEKRRDVWPSREEAYNILKDRGTWKTWDDRVLRSFVDTALRPVDEGKQEVTLKCSRVQEAACYRDPLGSSRAYGLLGEYVKRVPTHLIYGGIDDYLPAEVKTDILKVVGDSVQSFTRVPKAGHLISRIIGDDERLKMASVQVLPIEIPAVPESYKIPSAPSSSRLSPPHPSGHRQLLQVGPAYLNHLRLTLRHSHSFSALDKHLEEERERLAKLNPDADAEEDDLGVGDEEETEELLSYDPKEWKKHDLYAILGLSHLRYRANAEQIKIAHRKKVLKHHPDKKVSTTGPTTDIHLNTNDDAFFKCIQKAHEVLTNPEKRRQFDSVDPQFLELEEYLPTASRVKAKDFDFFKEFSSVFDLYSRFSKIQPVPGLGHIDSTKEEVEHFYDFWYNFDSWRSFEWLDKEVNEGSDSRDDKRYTEKKNKTERARRKKEDTAKLRTLVDLALSVDPRIKRIKQQEKEAREAKRRAAQGGPVKKSKADEDAEKKRLEEEAKQKEEAEKAARAEAKKAKAAAANAAKKARRAQRAAEEAAAAAAAGN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.39
3 0.4
4 0.43
5 0.43
6 0.41
7 0.48
8 0.48
9 0.5
10 0.49
11 0.44
12 0.4
13 0.33
14 0.26
15 0.2
16 0.19
17 0.17
18 0.17
19 0.18
20 0.15
21 0.15
22 0.16
23 0.16
24 0.17
25 0.18
26 0.24
27 0.24
28 0.26
29 0.26
30 0.26
31 0.25
32 0.23
33 0.22
34 0.18
35 0.18
36 0.16
37 0.16
38 0.15
39 0.16
40 0.16
41 0.15
42 0.13
43 0.1
44 0.12
45 0.11
46 0.11
47 0.08
48 0.07
49 0.07
50 0.06
51 0.06
52 0.05
53 0.05
54 0.05
55 0.06
56 0.06
57 0.07
58 0.07
59 0.12
60 0.12
61 0.14
62 0.19
63 0.21
64 0.21
65 0.22
66 0.31
67 0.3
68 0.33
69 0.33
70 0.29
71 0.28
72 0.34
73 0.32
74 0.26
75 0.29
76 0.35
77 0.44
78 0.51
79 0.57
80 0.6
81 0.67
82 0.75
83 0.76
84 0.75
85 0.68
86 0.63
87 0.65
88 0.64
89 0.61
90 0.52
91 0.48
92 0.42
93 0.39
94 0.37
95 0.29
96 0.22
97 0.18
98 0.17
99 0.13
100 0.11
101 0.11
102 0.1
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.1
109 0.09
110 0.11
111 0.09
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.09
116 0.08
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.09
121 0.1
122 0.1
123 0.13
124 0.17
125 0.16
126 0.21
127 0.21
128 0.23
129 0.21
130 0.23
131 0.23
132 0.21
133 0.24
134 0.2
135 0.22
136 0.23
137 0.23
138 0.21
139 0.19
140 0.19
141 0.19
142 0.18
143 0.19
144 0.2
145 0.21
146 0.26
147 0.29
148 0.29
149 0.33
150 0.41
151 0.39
152 0.37
153 0.4
154 0.37
155 0.38
156 0.37
157 0.3
158 0.23
159 0.21
160 0.19
161 0.16
162 0.13
163 0.1
164 0.1
165 0.11
166 0.12
167 0.15
168 0.2
169 0.3
170 0.38
171 0.44
172 0.5
173 0.5
174 0.54
175 0.56
176 0.55
177 0.52
178 0.47
179 0.41
180 0.36
181 0.34
182 0.28
183 0.23
184 0.19
185 0.13
186 0.1
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.08
195 0.11
196 0.12
197 0.11
198 0.13
199 0.14
200 0.13
201 0.13
202 0.12
203 0.1
204 0.11
205 0.13
206 0.12
207 0.11
208 0.11
209 0.1
210 0.1
211 0.11
212 0.09
213 0.1
214 0.11
215 0.12
216 0.13
217 0.15
218 0.15
219 0.16
220 0.21
221 0.21
222 0.19
223 0.18
224 0.18
225 0.17
226 0.17
227 0.16
228 0.11
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.09
233 0.08
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.08
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.11
245 0.09
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.06
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.08
261 0.09
262 0.1
263 0.1
264 0.11
265 0.11
266 0.1
267 0.09
268 0.08
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.08
279 0.09
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.09
284 0.09
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.07
292 0.06
293 0.07
294 0.06
295 0.05
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.11
306 0.11
307 0.14
308 0.15
309 0.16
310 0.16
311 0.15
312 0.13
313 0.12
314 0.12
315 0.1
316 0.13
317 0.15
318 0.19
319 0.21
320 0.22
321 0.23
322 0.24
323 0.27
324 0.25
325 0.27
326 0.24
327 0.23
328 0.23
329 0.23
330 0.22
331 0.19
332 0.19
333 0.14
334 0.12
335 0.12
336 0.11
337 0.1
338 0.11
339 0.13
340 0.11
341 0.11
342 0.12
343 0.1
344 0.11
345 0.11
346 0.13
347 0.12
348 0.12
349 0.13
350 0.14
351 0.15
352 0.15
353 0.15
354 0.15
355 0.18
356 0.22
357 0.22
358 0.24
359 0.26
360 0.29
361 0.3
362 0.28
363 0.23
364 0.2
365 0.2
366 0.2
367 0.21
368 0.23
369 0.27
370 0.26
371 0.26
372 0.26
373 0.24
374 0.22
375 0.26
376 0.23
377 0.24
378 0.27
379 0.29
380 0.31
381 0.31
382 0.3
383 0.23
384 0.24
385 0.22
386 0.22
387 0.23
388 0.22
389 0.26
390 0.26
391 0.27
392 0.24
393 0.21
394 0.2
395 0.19
396 0.19
397 0.16
398 0.16
399 0.14
400 0.13
401 0.13
402 0.1
403 0.08
404 0.06
405 0.04
406 0.03
407 0.03
408 0.04
409 0.05
410 0.07
411 0.08
412 0.09
413 0.1
414 0.11
415 0.12
416 0.13
417 0.13
418 0.14
419 0.13
420 0.14
421 0.21
422 0.2
423 0.2
424 0.19
425 0.17
426 0.16
427 0.15
428 0.14
429 0.09
430 0.09
431 0.1
432 0.17
433 0.18
434 0.18
435 0.19
436 0.19
437 0.19
438 0.2
439 0.23
440 0.18
441 0.18
442 0.2
443 0.19
444 0.21
445 0.2
446 0.18
447 0.15
448 0.12
449 0.1
450 0.08
451 0.11
452 0.11
453 0.09
454 0.09
455 0.08
456 0.09
457 0.1
458 0.1
459 0.08
460 0.06
461 0.06
462 0.08
463 0.1
464 0.1
465 0.11
466 0.13
467 0.13
468 0.13
469 0.15
470 0.14
471 0.13
472 0.12
473 0.12
474 0.1
475 0.11
476 0.11
477 0.09
478 0.08
479 0.08
480 0.08
481 0.1
482 0.1
483 0.1
484 0.16
485 0.16
486 0.2
487 0.22
488 0.23
489 0.3
490 0.32
491 0.34
492 0.3
493 0.31
494 0.29
495 0.28
496 0.32
497 0.25
498 0.32
499 0.38
500 0.45
501 0.53
502 0.57
503 0.64
504 0.65
505 0.7
506 0.66
507 0.65
508 0.62
509 0.52
510 0.46
511 0.38
512 0.32
513 0.24
514 0.17
515 0.1
516 0.05
517 0.05
518 0.03
519 0.03
520 0.04
521 0.04
522 0.05
523 0.05
524 0.04
525 0.05
526 0.06
527 0.08
528 0.08
529 0.09
530 0.08
531 0.08
532 0.08
533 0.08
534 0.08
535 0.08
536 0.1
537 0.13
538 0.16
539 0.16
540 0.16
541 0.18
542 0.18
543 0.17
544 0.19
545 0.21
546 0.19
547 0.19
548 0.18
549 0.16
550 0.16
551 0.16
552 0.14
553 0.13
554 0.12
555 0.11
556 0.13
557 0.13
558 0.13
559 0.14
560 0.18
561 0.15
562 0.18
563 0.21
564 0.21
565 0.21
566 0.2
567 0.2
568 0.15
569 0.18
570 0.18
571 0.19
572 0.16
573 0.19
574 0.21
575 0.27
576 0.29
577 0.32
578 0.32
579 0.33
580 0.35
581 0.33
582 0.31
583 0.28
584 0.29
585 0.28
586 0.25
587 0.22
588 0.2
589 0.19
590 0.23
591 0.23
592 0.2
593 0.17
594 0.19
595 0.25
596 0.27
597 0.34
598 0.32
599 0.33
600 0.33
601 0.34
602 0.31
603 0.25
604 0.23
605 0.17
606 0.17
607 0.14
608 0.13
609 0.12
610 0.12
611 0.11
612 0.12
613 0.14
614 0.12
615 0.13
616 0.12
617 0.15
618 0.17
619 0.17
620 0.21
621 0.2
622 0.21
623 0.24
624 0.25
625 0.22
626 0.24
627 0.24
628 0.26
629 0.29
630 0.32
631 0.29
632 0.29
633 0.28
634 0.26
635 0.27
636 0.22
637 0.19
638 0.14
639 0.14
640 0.13
641 0.13
642 0.12
643 0.11
644 0.09
645 0.1
646 0.09
647 0.09
648 0.09
649 0.09
650 0.1
651 0.11
652 0.11
653 0.1
654 0.11
655 0.13
656 0.13
657 0.14
658 0.13
659 0.14
660 0.14
661 0.12
662 0.1
663 0.07
664 0.07
665 0.05
666 0.05
667 0.04
668 0.05
669 0.05
670 0.06
671 0.07
672 0.07
673 0.07
674 0.07
675 0.07
676 0.06
677 0.08
678 0.08
679 0.07
680 0.07
681 0.09
682 0.09
683 0.1
684 0.11
685 0.1
686 0.14
687 0.16
688 0.15
689 0.17
690 0.22
691 0.23
692 0.26
693 0.27
694 0.24
695 0.22
696 0.23
697 0.2
698 0.16
699 0.13
700 0.12
701 0.13
702 0.12
703 0.12
704 0.12
705 0.11
706 0.11
707 0.12
708 0.14
709 0.11
710 0.11
711 0.1
712 0.1
713 0.1
714 0.09
715 0.09
716 0.05
717 0.06
718 0.06
719 0.07
720 0.06
721 0.07
722 0.09
723 0.1
724 0.11
725 0.11
726 0.12
727 0.13
728 0.17
729 0.18
730 0.21
731 0.24
732 0.25
733 0.31
734 0.32
735 0.34
736 0.35
737 0.37
738 0.41
739 0.4
740 0.42
741 0.42
742 0.48
743 0.48
744 0.43
745 0.43
746 0.36
747 0.34
748 0.31
749 0.26
750 0.18
751 0.15
752 0.18
753 0.16
754 0.16
755 0.14
756 0.14
757 0.14
758 0.15
759 0.19
760 0.24
761 0.27
762 0.31
763 0.32
764 0.32
765 0.34
766 0.36
767 0.33
768 0.29
769 0.26
770 0.22
771 0.21
772 0.22
773 0.23
774 0.22
775 0.22
776 0.19
777 0.22
778 0.23
779 0.23
780 0.22
781 0.22
782 0.26
783 0.27
784 0.28
785 0.24
786 0.23
787 0.23
788 0.22
789 0.21
790 0.17
791 0.14
792 0.11
793 0.1
794 0.08
795 0.08
796 0.06
797 0.05
798 0.03
799 0.03
800 0.04
801 0.04
802 0.04
803 0.04
804 0.04
805 0.04
806 0.05
807 0.06
808 0.06
809 0.1
810 0.16
811 0.2
812 0.25
813 0.27
814 0.35
815 0.39
816 0.44
817 0.45
818 0.42
819 0.41
820 0.42
821 0.39
822 0.31
823 0.27
824 0.21
825 0.17
826 0.15
827 0.14
828 0.09
829 0.09
830 0.15
831 0.19
832 0.28
833 0.3
834 0.3
835 0.34
836 0.36
837 0.43
838 0.46
839 0.44
840 0.41
841 0.44
842 0.5
843 0.52
844 0.61
845 0.65
846 0.67
847 0.75
848 0.79
849 0.83
850 0.85
851 0.82
852 0.77
853 0.75
854 0.66
855 0.61
856 0.54
857 0.46
858 0.41
859 0.37
860 0.35
861 0.31
862 0.3
863 0.26
864 0.24
865 0.24
866 0.21
867 0.22
868 0.19
869 0.15
870 0.15
871 0.16
872 0.17
873 0.16
874 0.18
875 0.2
876 0.22
877 0.26
878 0.26
879 0.26
880 0.29
881 0.28
882 0.31
883 0.39
884 0.45
885 0.44
886 0.49
887 0.51
888 0.49
889 0.53
890 0.52
891 0.47
892 0.47
893 0.55
894 0.56
895 0.57
896 0.54
897 0.5
898 0.45
899 0.4
900 0.33
901 0.22
902 0.15
903 0.1
904 0.1
905 0.09
906 0.09
907 0.1
908 0.1
909 0.12
910 0.17
911 0.18
912 0.23
913 0.29
914 0.31
915 0.38
916 0.39
917 0.43
918 0.41
919 0.39
920 0.37
921 0.35
922 0.33
923 0.26
924 0.28
925 0.22
926 0.19
927 0.21
928 0.2
929 0.18
930 0.21
931 0.23
932 0.19
933 0.19
934 0.28
935 0.28
936 0.36
937 0.38
938 0.38
939 0.37
940 0.39
941 0.44
942 0.35
943 0.35
944 0.27
945 0.25
946 0.22
947 0.22
948 0.19
949 0.14
950 0.15
951 0.14
952 0.16
953 0.17
954 0.16
955 0.15
956 0.19
957 0.19
958 0.2
959 0.21
960 0.19
961 0.18
962 0.22
963 0.22
964 0.19
965 0.21
966 0.26
967 0.23
968 0.27
969 0.3
970 0.29
971 0.31
972 0.29
973 0.3
974 0.25
975 0.26
976 0.23
977 0.19
978 0.2
979 0.24
980 0.26
981 0.26
982 0.32
983 0.32
984 0.33
985 0.43
986 0.48
987 0.51
988 0.6
989 0.67
990 0.7
991 0.8
992 0.88
993 0.88
994 0.91
995 0.92
996 0.92
997 0.93
998 0.92
999 0.9
1000 0.9
1001 0.9
1002 0.89
1003 0.88
1004 0.86
1005 0.82
1006 0.77
1007 0.69
1008 0.59
1009 0.5
1010 0.39
1011 0.31
1012 0.22
1013 0.17
1014 0.16
1015 0.15
1016 0.15
1017 0.19
1018 0.19
1019 0.22
1020 0.28
1021 0.29
1022 0.36
1023 0.46
1024 0.57
1025 0.6
1026 0.71
1027 0.77
1028 0.77
1029 0.83
1030 0.82
1031 0.8
1032 0.79
1033 0.76
1034 0.73
1035 0.7
1036 0.66
1037 0.61
1038 0.58
1039 0.57
1040 0.58
1041 0.62
1042 0.62
1043 0.6
1044 0.59
1045 0.57
1046 0.56
1047 0.52
1048 0.49
1049 0.45
1050 0.48
1051 0.52
1052 0.6
1053 0.63
1054 0.61
1055 0.57
1056 0.51
1057 0.52
1058 0.46
1059 0.45
1060 0.46
1061 0.5
1062 0.54
1063 0.55
1064 0.55
1065 0.54
1066 0.53
1067 0.5
1068 0.44
1069 0.38
1070 0.35
1071 0.41
1072 0.44
1073 0.41
1074 0.46
1075 0.48
1076 0.48
1077 0.48
1078 0.48
1079 0.45
1080 0.45
1081 0.45
1082 0.46
1083 0.49
1084 0.5
1085 0.51
1086 0.57
1087 0.55
1088 0.55
1089 0.62
1090 0.62
1091 0.61
1092 0.6
1093 0.63
1094 0.65
1095 0.71
1096 0.7
1097 0.62
1098 0.54
1099 0.44
1100 0.38
1101 0.29