FuNGI

A8N356

Protein Details

Accession

A8N356

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
498-529	VGRPRNESKEEKKARKAAAKAAKQSRRVEKKA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
269-274	KKRRRK
496-528	PAVGRPRNESKEEKKARKAAAKAAKQSRRVEKK

Subcellular Location(s)

nucl 24, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
KEGG	cci:CC1G_00480 -
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPKSKSIFRQPGVKHFQLVHRSQRDPLINDPDASQHILKPFERENVKKGKSRADLEELLSEELSSGQIPKNIGEASLYGIYYDDTEYDYMQHLRPVGIQEEGVESILIEAPATSKNKRSGKQTLELPKDTLPPTYELPRTYESQQAIPESIAGFQPDMDPHLRQVLEALEDDAFVDDGLEDDFFQELVGDGERGSDEDFDFEFEEDGVQDQAAEGEEAEPAEETWEDRFKKFKQEQRAAPREDSDDGLASEGGDTIRSLQTISVIGGKKRRRKGSSVASGYSMSSSSMYRHEGLQTLDERFDQMMLKQYGEDEDEDEEDHEGDHEHMSDSDEDSDEAPELITSRDDFDSMVNEFLNDYEILGRKMRPKLEGETGLDKLDTLRRAVGEAKIREGQDNSDSDEDLFIEEEDKKDRWDCETILTTYSNLENHPRLIRARDSKPVPKIVLDTKTGMPSVVAPTLPKVKDQRVKETRKVTFSNSEDTDGSDDEDSAPRGPAVGRPRNESKEEKKARKAAAKAAKQSRRVEKKAMQVQFDTEIRDQKKKLAHSGIKMKKL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.68
2	0.61
3	0.55
4	0.6
5	0.59
6	0.61
7	0.61
8	0.6
9	0.6
10	0.59
11	0.63
12	0.61
13	0.55
14	0.56
15	0.54
16	0.49
17	0.47
18	0.45
19	0.4
20	0.35
21	0.35
22	0.29
23	0.23
24	0.25
25	0.3
26	0.3
27	0.32
28	0.34
29	0.38
30	0.45
31	0.46
32	0.5
33	0.56
34	0.61
35	0.62
36	0.63
37	0.64
38	0.63
39	0.65
40	0.63
41	0.6
42	0.57
43	0.53
44	0.52
45	0.44
46	0.37
47	0.31
48	0.25
49	0.17
50	0.14
51	0.12
52	0.09
53	0.09
54	0.1
55	0.13
56	0.14
57	0.14
58	0.17
59	0.17
60	0.17
61	0.15
62	0.14
63	0.15
64	0.16
65	0.15
66	0.12
67	0.12
68	0.12
69	0.12
70	0.12
71	0.08
72	0.08
73	0.09
74	0.09
75	0.1
76	0.13
77	0.14
78	0.15
79	0.16
80	0.16
81	0.16
82	0.18
83	0.19
84	0.18
85	0.16
86	0.16
87	0.14
88	0.15
89	0.15
90	0.13
91	0.1
92	0.08
93	0.08
94	0.09
95	0.08
96	0.06
97	0.05
98	0.06
99	0.11
100	0.15
101	0.16
102	0.21
103	0.3
104	0.38
105	0.43
106	0.49
107	0.54
108	0.57
109	0.63
110	0.66
111	0.67
112	0.66
113	0.64
114	0.59
115	0.51
116	0.5
117	0.43
118	0.37
119	0.29
120	0.24
121	0.25
122	0.29
123	0.3
124	0.26
125	0.29
126	0.29
127	0.31
128	0.3
129	0.33
130	0.29
131	0.29
132	0.3
133	0.27
134	0.25
135	0.22
136	0.2
137	0.14
138	0.14
139	0.11
140	0.1
141	0.08
142	0.08
143	0.09
144	0.08
145	0.11
146	0.12
147	0.12
148	0.12
149	0.17
150	0.16
151	0.15
152	0.16
153	0.14
154	0.14
155	0.13
156	0.13
157	0.09
158	0.09
159	0.09
160	0.08
161	0.07
162	0.05
163	0.05
164	0.03
165	0.04
166	0.04
167	0.04
168	0.04
169	0.04
170	0.04
171	0.04
172	0.04
173	0.04
174	0.04
175	0.04
176	0.05
177	0.05
178	0.04
179	0.05
180	0.05
181	0.06
182	0.06
183	0.06
184	0.06
185	0.07
186	0.07
187	0.08
188	0.09
189	0.09
190	0.08
191	0.07
192	0.07
193	0.06
194	0.06
195	0.05
196	0.05
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.05
212	0.07
213	0.13
214	0.14
215	0.15
216	0.2
217	0.21
218	0.32
219	0.38
220	0.43
221	0.48
222	0.55
223	0.63
224	0.69
225	0.75
226	0.68
227	0.62
228	0.58
229	0.49
230	0.42
231	0.34
232	0.24
233	0.16
234	0.13
235	0.12
236	0.1
237	0.07
238	0.06
239	0.05
240	0.05
241	0.04
242	0.04
243	0.05
244	0.06
245	0.06
246	0.06
247	0.05
248	0.06
249	0.07
250	0.07
251	0.11
252	0.12
253	0.14
254	0.21
255	0.28
256	0.35
257	0.42
258	0.5
259	0.48
260	0.52
261	0.58
262	0.61
263	0.65
264	0.61
265	0.54
266	0.48
267	0.44
268	0.39
269	0.31
270	0.21
271	0.11
272	0.08
273	0.08
274	0.07
275	0.09
276	0.11
277	0.11
278	0.11
279	0.12
280	0.13
281	0.13
282	0.15
283	0.15
284	0.14
285	0.14
286	0.13
287	0.13
288	0.11
289	0.12
290	0.09
291	0.08
292	0.14
293	0.14
294	0.15
295	0.14
296	0.14
297	0.14
298	0.15
299	0.14
300	0.08
301	0.08
302	0.08
303	0.08
304	0.08
305	0.08
306	0.07
307	0.06
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.06
314	0.06
315	0.07
316	0.08
317	0.08
318	0.08
319	0.08
320	0.09
321	0.09
322	0.09
323	0.07
324	0.07
325	0.06
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.05
331	0.08
332	0.08
333	0.08
334	0.08
335	0.08
336	0.1
337	0.1
338	0.11
339	0.08
340	0.08
341	0.08
342	0.08
343	0.09
344	0.07
345	0.06
346	0.08
347	0.09
348	0.11
349	0.12
350	0.15
351	0.19
352	0.24
353	0.26
354	0.27
355	0.3
356	0.33
357	0.38
358	0.4
359	0.37
360	0.37
361	0.36
362	0.33
363	0.29
364	0.24
365	0.19
366	0.19
367	0.16
368	0.13
369	0.13
370	0.13
371	0.15
372	0.17
373	0.21
374	0.25
375	0.24
376	0.27
377	0.3
378	0.3
379	0.31
380	0.3
381	0.27
382	0.23
383	0.24
384	0.23
385	0.2
386	0.19
387	0.17
388	0.17
389	0.14
390	0.11
391	0.1
392	0.07
393	0.08
394	0.08
395	0.09
396	0.12
397	0.13
398	0.14
399	0.17
400	0.18
401	0.21
402	0.24
403	0.23
404	0.26
405	0.29
406	0.29
407	0.28
408	0.27
409	0.23
410	0.21
411	0.22
412	0.17
413	0.14
414	0.18
415	0.18
416	0.21
417	0.23
418	0.25
419	0.25
420	0.29
421	0.36
422	0.39
423	0.42
424	0.47
425	0.52
426	0.57
427	0.6
428	0.62
429	0.55
430	0.49
431	0.49
432	0.47
433	0.45
434	0.4
435	0.37
436	0.33
437	0.34
438	0.32
439	0.27
440	0.2
441	0.18
442	0.18
443	0.16
444	0.15
445	0.13
446	0.16
447	0.24
448	0.24
449	0.28
450	0.31
451	0.39
452	0.46
453	0.51
454	0.58
455	0.61
456	0.7
457	0.73
458	0.77
459	0.73
460	0.73
461	0.71
462	0.66
463	0.65
464	0.59
465	0.58
466	0.5
467	0.47
468	0.4
469	0.38
470	0.34
471	0.25
472	0.24
473	0.17
474	0.15
475	0.14
476	0.16
477	0.16
478	0.15
479	0.15
480	0.12
481	0.13
482	0.14
483	0.18
484	0.26
485	0.33
486	0.35
487	0.42
488	0.51
489	0.56
490	0.61
491	0.64
492	0.62
493	0.65
494	0.73
495	0.74
496	0.76
497	0.78
498	0.8
499	0.8
500	0.77
501	0.76
502	0.76
503	0.75
504	0.76
505	0.78
506	0.78
507	0.77
508	0.81
509	0.81
510	0.81
511	0.78
512	0.78
513	0.74
514	0.77
515	0.78
516	0.75
517	0.69
518	0.6
519	0.58
520	0.55
521	0.49
522	0.44
523	0.38
524	0.41
525	0.41
526	0.47
527	0.45
528	0.46
529	0.51
530	0.52
531	0.58
532	0.6
533	0.63
534	0.65
535	0.74

A8N356

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer