Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A319CMY2

Protein Details
Accession A0A319CMY2    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
341-360GTPIRRKKRKGALTNPSAYSHydrophilic
450-473NTGSQAKRKGVKYKRGKHGNEAIGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
345-350RRKKRK
456-466KRKGVKYKRGK
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 8, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPPRKQWIDKKNATTYQLFHRSQHDPLIHDPSADDRVLAPVSGPAPTSSSSSSSTADAHRGQNLATLTQQFGSGAVRKNEGEAANYGIFYDDTKYDYMQHLRELGSGAGDAHFVEAKNQAPSSKGKMKLEDALRQVSLDDGQGSEFGGSYAPSEMRSTATAYSRKPTYQDQQNVPDAIAGFQPNMDPRLREVLEALEDEEYVDEADDDNLFGQLTTRAEEMDQGDWEDTLYDDFDEEDDEGWESDATEKAPVQTDTTAAKAQYEKRAAAAGGDDAEEMMPEHDAPAPDMHPEDQGWMREFAKFKKDVKAGVAKPAVPAAAPSVGPSEQQSTLASTVFTVGGTPIRRKKRKGALTNPSAYSMTSSALARTEGHRLLDDRFDRVEQLYALDEEDEFDDSMSMVSGMTGMTAMTGMSAISEAPSLIDANGQTVNPRHNFTSVMDDFLAGWDDNTGSQAKRKGVKYKRGKHGNEAIGIRMLDEVRQGLGPARVGSSGRVPGRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.63
3 0.62
4 0.63
5 0.57
6 0.5
7 0.5
8 0.49
9 0.48
10 0.53
11 0.46
12 0.39
13 0.43
14 0.48
15 0.42
16 0.38
17 0.35
18 0.31
19 0.32
20 0.28
21 0.23
22 0.15
23 0.18
24 0.18
25 0.18
26 0.14
27 0.13
28 0.13
29 0.14
30 0.14
31 0.12
32 0.13
33 0.15
34 0.17
35 0.16
36 0.18
37 0.21
38 0.22
39 0.23
40 0.22
41 0.24
42 0.23
43 0.27
44 0.28
45 0.27
46 0.28
47 0.27
48 0.26
49 0.27
50 0.26
51 0.22
52 0.21
53 0.2
54 0.18
55 0.18
56 0.18
57 0.13
58 0.13
59 0.15
60 0.18
61 0.22
62 0.23
63 0.25
64 0.25
65 0.27
66 0.31
67 0.28
68 0.25
69 0.2
70 0.23
71 0.21
72 0.2
73 0.19
74 0.15
75 0.14
76 0.12
77 0.13
78 0.09
79 0.11
80 0.12
81 0.12
82 0.14
83 0.19
84 0.24
85 0.23
86 0.24
87 0.25
88 0.24
89 0.25
90 0.24
91 0.19
92 0.14
93 0.13
94 0.11
95 0.09
96 0.08
97 0.07
98 0.07
99 0.08
100 0.07
101 0.09
102 0.11
103 0.13
104 0.15
105 0.16
106 0.16
107 0.17
108 0.21
109 0.27
110 0.33
111 0.37
112 0.38
113 0.41
114 0.43
115 0.48
116 0.5
117 0.48
118 0.43
119 0.41
120 0.37
121 0.33
122 0.3
123 0.24
124 0.19
125 0.13
126 0.1
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.08
141 0.09
142 0.1
143 0.11
144 0.12
145 0.13
146 0.18
147 0.22
148 0.22
149 0.27
150 0.28
151 0.28
152 0.29
153 0.32
154 0.36
155 0.41
156 0.47
157 0.48
158 0.52
159 0.54
160 0.51
161 0.45
162 0.38
163 0.28
164 0.21
165 0.17
166 0.12
167 0.08
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.11
172 0.11
173 0.1
174 0.11
175 0.18
176 0.19
177 0.18
178 0.17
179 0.16
180 0.17
181 0.16
182 0.15
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.06
188 0.05
189 0.04
190 0.03
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.09
207 0.1
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.05
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.06
236 0.07
237 0.08
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.1
242 0.11
243 0.12
244 0.13
245 0.11
246 0.12
247 0.14
248 0.16
249 0.21
250 0.23
251 0.21
252 0.21
253 0.22
254 0.2
255 0.17
256 0.15
257 0.09
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.03
267 0.03
268 0.04
269 0.05
270 0.06
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.1
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.11
280 0.11
281 0.13
282 0.14
283 0.15
284 0.15
285 0.17
286 0.2
287 0.2
288 0.25
289 0.28
290 0.29
291 0.35
292 0.37
293 0.35
294 0.39
295 0.45
296 0.39
297 0.42
298 0.42
299 0.34
300 0.32
301 0.31
302 0.26
303 0.16
304 0.15
305 0.09
306 0.09
307 0.08
308 0.08
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.11
313 0.13
314 0.12
315 0.13
316 0.13
317 0.12
318 0.13
319 0.13
320 0.12
321 0.08
322 0.09
323 0.08
324 0.07
325 0.06
326 0.06
327 0.09
328 0.12
329 0.18
330 0.25
331 0.36
332 0.43
333 0.47
334 0.57
335 0.63
336 0.71
337 0.76
338 0.78
339 0.78
340 0.8
341 0.81
342 0.72
343 0.64
344 0.54
345 0.43
346 0.35
347 0.25
348 0.17
349 0.13
350 0.12
351 0.11
352 0.11
353 0.12
354 0.11
355 0.12
356 0.17
357 0.17
358 0.18
359 0.19
360 0.19
361 0.21
362 0.27
363 0.27
364 0.24
365 0.24
366 0.24
367 0.24
368 0.23
369 0.23
370 0.15
371 0.15
372 0.14
373 0.12
374 0.12
375 0.11
376 0.1
377 0.09
378 0.1
379 0.09
380 0.08
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.06
386 0.05
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.05
408 0.06
409 0.06
410 0.08
411 0.07
412 0.09
413 0.11
414 0.11
415 0.13
416 0.15
417 0.22
418 0.23
419 0.26
420 0.26
421 0.26
422 0.28
423 0.27
424 0.35
425 0.28
426 0.29
427 0.26
428 0.24
429 0.23
430 0.22
431 0.22
432 0.12
433 0.11
434 0.09
435 0.09
436 0.09
437 0.11
438 0.12
439 0.11
440 0.17
441 0.23
442 0.28
443 0.36
444 0.43
445 0.51
446 0.59
447 0.69
448 0.74
449 0.79
450 0.84
451 0.87
452 0.85
453 0.84
454 0.84
455 0.8
456 0.76
457 0.67
458 0.58
459 0.51
460 0.46
461 0.37
462 0.29
463 0.22
464 0.16
465 0.16
466 0.15
467 0.12
468 0.13
469 0.13
470 0.14
471 0.17
472 0.18
473 0.17
474 0.18
475 0.18
476 0.19
477 0.21
478 0.23
479 0.28