Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1E694

Protein Details
Accession A0A0D1E694    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MSKGSKSKDKSKRAESKSASSEHydrophilic
344-364QQDEPSSTSPPKRDKKRRKQAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-28KSKDKSKRAESKSASSESTKRRK
354-364PKRDKKRRKQA
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0005736  C:RNA polymerase I complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
KEGG uma:UMAG_01363  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MSKGSKSKDKSKRAESKSASSESTKRRKSASSSSSSSSFSNTASVSDVAIRVPDSDAGSGTVGEAVSSRTVTSAFCTLYPILNLPIAPVWSSDPYSAFSDLMDTLVMRYVPQLSGVLITHSPTRFLQDTAVFSADSAFATASVGFECVVWTPRIGQMLEGNICLSSPSHVSLLLYGLFNASIPASHLPEEFEFVLNDAEATDHGMGYWRSKVDGSKLGASDGKLSFTVISLTVANHMLSLHGSLLDEPFKGPPPTLDRSYLKKSLLPWQALGLGRTRSATDATAQPATPTPPPRRVRWQDEDDTSAVESDDLSKFDTPPSIVQAKSPKSCGTKRKSTSAVTHAQQDEPSSTSPPKRDKKRRKQA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.83
3 0.81
4 0.78
5 0.72
6 0.65
7 0.6
8 0.6
9 0.6
10 0.64
11 0.62
12 0.58
13 0.58
14 0.61
15 0.63
16 0.65
17 0.64
18 0.61
19 0.59
20 0.6
21 0.58
22 0.54
23 0.47
24 0.4
25 0.32
26 0.24
27 0.22
28 0.18
29 0.16
30 0.17
31 0.17
32 0.14
33 0.14
34 0.14
35 0.12
36 0.12
37 0.12
38 0.1
39 0.1
40 0.12
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.12
45 0.13
46 0.11
47 0.1
48 0.09
49 0.08
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.08
55 0.08
56 0.07
57 0.08
58 0.08
59 0.1
60 0.13
61 0.13
62 0.12
63 0.15
64 0.16
65 0.17
66 0.17
67 0.16
68 0.14
69 0.14
70 0.14
71 0.12
72 0.12
73 0.11
74 0.11
75 0.1
76 0.11
77 0.12
78 0.14
79 0.14
80 0.13
81 0.16
82 0.18
83 0.18
84 0.15
85 0.13
86 0.14
87 0.13
88 0.12
89 0.09
90 0.07
91 0.06
92 0.07
93 0.07
94 0.06
95 0.07
96 0.08
97 0.07
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.09
102 0.09
103 0.1
104 0.09
105 0.1
106 0.13
107 0.13
108 0.14
109 0.13
110 0.17
111 0.17
112 0.17
113 0.19
114 0.18
115 0.2
116 0.19
117 0.2
118 0.16
119 0.14
120 0.14
121 0.12
122 0.09
123 0.07
124 0.05
125 0.04
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.04
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.05
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.08
139 0.09
140 0.12
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.14
145 0.15
146 0.14
147 0.12
148 0.1
149 0.09
150 0.09
151 0.07
152 0.05
153 0.05
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.04
168 0.03
169 0.04
170 0.05
171 0.06
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.09
176 0.11
177 0.1
178 0.09
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.05
185 0.04
186 0.04
187 0.05
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.06
192 0.07
193 0.08
194 0.1
195 0.09
196 0.09
197 0.11
198 0.12
199 0.14
200 0.19
201 0.2
202 0.22
203 0.22
204 0.23
205 0.23
206 0.22
207 0.23
208 0.17
209 0.16
210 0.12
211 0.13
212 0.11
213 0.1
214 0.11
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.07
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.12
237 0.13
238 0.13
239 0.15
240 0.21
241 0.26
242 0.28
243 0.33
244 0.33
245 0.39
246 0.46
247 0.46
248 0.42
249 0.39
250 0.38
251 0.42
252 0.45
253 0.4
254 0.34
255 0.31
256 0.35
257 0.34
258 0.32
259 0.26
260 0.2
261 0.19
262 0.19
263 0.18
264 0.14
265 0.15
266 0.15
267 0.14
268 0.16
269 0.19
270 0.2
271 0.2
272 0.19
273 0.2
274 0.22
275 0.24
276 0.29
277 0.32
278 0.4
279 0.44
280 0.5
281 0.59
282 0.65
283 0.69
284 0.7
285 0.72
286 0.69
287 0.69
288 0.67
289 0.56
290 0.49
291 0.4
292 0.31
293 0.23
294 0.15
295 0.11
296 0.1
297 0.11
298 0.1
299 0.12
300 0.13
301 0.14
302 0.15
303 0.18
304 0.17
305 0.17
306 0.23
307 0.25
308 0.24
309 0.29
310 0.37
311 0.41
312 0.44
313 0.45
314 0.46
315 0.49
316 0.58
317 0.62
318 0.62
319 0.66
320 0.67
321 0.73
322 0.72
323 0.71
324 0.71
325 0.68
326 0.67
327 0.59
328 0.62
329 0.55
330 0.51
331 0.46
332 0.4
333 0.35
334 0.29
335 0.29
336 0.25
337 0.29
338 0.34
339 0.41
340 0.48
341 0.56
342 0.65
343 0.75
344 0.81