Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A319C6I9

Protein Details
Accession A0A319C6I9    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-49ISSRGGVAQPPRSKRKKNRGGAEWEVSRHydrophilic
487-506LQAKCFYFSRKKKLPTPVNVHydrophilic
581-602GQDTPSARSRRRKPWELESGEHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-40PRSKRKKNR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007198  Ssl1-like  
IPR012170  TFIIH_SSL1/p44  
IPR002035  VWF_A  
IPR036465  vWFA_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF17733  DUF5572  
PF04056  Ssl1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50234  VWFA  
CDD cd01453  vWA_transcription_factor_IIH_type  
Amino Acid Sequences MADSDEEYAGEISEDEVDGSHISSRGGVAQPPRSKRKKNRGGAEWEVSRTWESLVEGADGTINSTVEGLLEAGKRKRLLRDTTPLQRGIIRHLILILDLSHSMAEKDLRPTRYLLSLRYAQEFVREFFEQNPISQLGVLGLRDGLAVRVSDMSGNPTEHISAIQALREHDPKGLPSLQNGLEMARGALFHTPTHGTREVLIIFGSLLSSDPGDIHHTIATLVSEKIRVGIVGLAAQVAICRELCSKTNHGDDKTYGVALNEQHFRELVMGVTTPPATFSQRQSASSLLMMGFPSRSVEAHPSLCACHSNASCGGYSCSRCNSKVCGLPAECPSCSLTLILSTHLARSYHHLFPLMNWVEVPWARASRSLACFACGITFPQVPPREQWQAADVQSRGMSELHISLLNTVMNPTRTPAVWEASIQSSGKEAVPPPGVEQEKWDIELFERLSSYPFEDDHEFAHGLSIILGHPEIPASRAEIDRDDDVTLQAKCFYFSRKKKLPTPVNVGDYQLWLQARPIAAEAAGPVNQQQLNNVVSEDHANAPLKQAEPAYPSSFAHIVELITTGQTIPGIQQIPDTILAGQDTPSARSRRRKPWELESGEHVSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.06
3 0.06
4 0.07
5 0.08
6 0.08
7 0.1
8 0.1
9 0.1
10 0.1
11 0.11
12 0.14
13 0.16
14 0.2
15 0.24
16 0.33
17 0.41
18 0.5
19 0.6
20 0.65
21 0.74
22 0.81
23 0.86
24 0.87
25 0.89
26 0.91
27 0.89
28 0.89
29 0.86
30 0.84
31 0.76
32 0.69
33 0.59
34 0.5
35 0.42
36 0.34
37 0.26
38 0.2
39 0.16
40 0.15
41 0.15
42 0.15
43 0.13
44 0.13
45 0.13
46 0.11
47 0.11
48 0.1
49 0.09
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.06
54 0.07
55 0.06
56 0.08
57 0.11
58 0.17
59 0.2
60 0.25
61 0.28
62 0.31
63 0.4
64 0.45
65 0.5
66 0.53
67 0.6
68 0.65
69 0.71
70 0.73
71 0.66
72 0.59
73 0.55
74 0.47
75 0.44
76 0.42
77 0.33
78 0.28
79 0.27
80 0.25
81 0.22
82 0.21
83 0.15
84 0.09
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.09
91 0.11
92 0.12
93 0.2
94 0.27
95 0.29
96 0.3
97 0.32
98 0.33
99 0.39
100 0.39
101 0.33
102 0.32
103 0.36
104 0.37
105 0.38
106 0.37
107 0.29
108 0.33
109 0.32
110 0.27
111 0.26
112 0.25
113 0.23
114 0.23
115 0.3
116 0.25
117 0.23
118 0.25
119 0.21
120 0.2
121 0.19
122 0.17
123 0.11
124 0.12
125 0.11
126 0.08
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.08
139 0.11
140 0.12
141 0.13
142 0.13
143 0.13
144 0.13
145 0.12
146 0.12
147 0.1
148 0.11
149 0.11
150 0.12
151 0.13
152 0.14
153 0.17
154 0.19
155 0.19
156 0.19
157 0.19
158 0.18
159 0.22
160 0.25
161 0.22
162 0.21
163 0.26
164 0.24
165 0.24
166 0.24
167 0.19
168 0.14
169 0.14
170 0.12
171 0.08
172 0.07
173 0.06
174 0.08
175 0.09
176 0.08
177 0.1
178 0.13
179 0.14
180 0.19
181 0.2
182 0.18
183 0.18
184 0.21
185 0.18
186 0.16
187 0.15
188 0.1
189 0.08
190 0.07
191 0.07
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.09
200 0.09
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.06
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.06
229 0.08
230 0.11
231 0.15
232 0.19
233 0.22
234 0.29
235 0.32
236 0.32
237 0.33
238 0.31
239 0.3
240 0.27
241 0.23
242 0.17
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.16
247 0.16
248 0.16
249 0.16
250 0.15
251 0.15
252 0.14
253 0.12
254 0.09
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.07
262 0.08
263 0.1
264 0.12
265 0.14
266 0.21
267 0.23
268 0.24
269 0.24
270 0.24
271 0.21
272 0.19
273 0.18
274 0.1
275 0.09
276 0.08
277 0.07
278 0.06
279 0.05
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.09
285 0.11
286 0.12
287 0.12
288 0.12
289 0.12
290 0.13
291 0.12
292 0.1
293 0.12
294 0.11
295 0.13
296 0.14
297 0.15
298 0.14
299 0.14
300 0.15
301 0.13
302 0.15
303 0.15
304 0.18
305 0.19
306 0.2
307 0.22
308 0.24
309 0.25
310 0.28
311 0.28
312 0.29
313 0.28
314 0.3
315 0.33
316 0.31
317 0.27
318 0.23
319 0.23
320 0.18
321 0.17
322 0.14
323 0.09
324 0.08
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.11
331 0.11
332 0.09
333 0.15
334 0.19
335 0.19
336 0.2
337 0.2
338 0.19
339 0.19
340 0.29
341 0.24
342 0.19
343 0.17
344 0.16
345 0.18
346 0.18
347 0.19
348 0.11
349 0.11
350 0.11
351 0.13
352 0.15
353 0.18
354 0.2
355 0.24
356 0.22
357 0.22
358 0.22
359 0.2
360 0.19
361 0.14
362 0.13
363 0.11
364 0.12
365 0.11
366 0.18
367 0.21
368 0.21
369 0.23
370 0.27
371 0.29
372 0.29
373 0.3
374 0.24
375 0.26
376 0.27
377 0.29
378 0.23
379 0.19
380 0.19
381 0.18
382 0.17
383 0.13
384 0.11
385 0.08
386 0.09
387 0.08
388 0.09
389 0.09
390 0.08
391 0.09
392 0.09
393 0.08
394 0.08
395 0.09
396 0.1
397 0.1
398 0.11
399 0.11
400 0.11
401 0.15
402 0.16
403 0.16
404 0.16
405 0.16
406 0.17
407 0.17
408 0.2
409 0.16
410 0.14
411 0.13
412 0.13
413 0.13
414 0.13
415 0.12
416 0.15
417 0.17
418 0.17
419 0.18
420 0.24
421 0.25
422 0.23
423 0.26
424 0.26
425 0.25
426 0.26
427 0.25
428 0.18
429 0.17
430 0.22
431 0.2
432 0.15
433 0.15
434 0.14
435 0.15
436 0.15
437 0.16
438 0.13
439 0.12
440 0.15
441 0.17
442 0.17
443 0.17
444 0.19
445 0.17
446 0.16
447 0.16
448 0.13
449 0.1
450 0.1
451 0.09
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.05
457 0.06
458 0.06
459 0.07
460 0.07
461 0.09
462 0.11
463 0.12
464 0.14
465 0.16
466 0.19
467 0.19
468 0.2
469 0.19
470 0.16
471 0.17
472 0.19
473 0.17
474 0.15
475 0.16
476 0.15
477 0.16
478 0.17
479 0.24
480 0.31
481 0.39
482 0.49
483 0.55
484 0.63
485 0.69
486 0.79
487 0.81
488 0.79
489 0.8
490 0.77
491 0.73
492 0.66
493 0.61
494 0.51
495 0.43
496 0.35
497 0.29
498 0.22
499 0.17
500 0.16
501 0.16
502 0.16
503 0.14
504 0.15
505 0.11
506 0.11
507 0.11
508 0.11
509 0.11
510 0.11
511 0.11
512 0.1
513 0.15
514 0.17
515 0.16
516 0.17
517 0.18
518 0.19
519 0.19
520 0.19
521 0.14
522 0.13
523 0.16
524 0.16
525 0.14
526 0.17
527 0.19
528 0.19
529 0.22
530 0.24
531 0.23
532 0.23
533 0.23
534 0.21
535 0.24
536 0.28
537 0.28
538 0.27
539 0.26
540 0.28
541 0.28
542 0.25
543 0.23
544 0.19
545 0.16
546 0.14
547 0.15
548 0.11
549 0.1
550 0.1
551 0.08
552 0.07
553 0.08
554 0.07
555 0.07
556 0.12
557 0.13
558 0.13
559 0.15
560 0.15
561 0.17
562 0.18
563 0.18
564 0.13
565 0.12
566 0.13
567 0.12
568 0.12
569 0.14
570 0.14
571 0.16
572 0.23
573 0.29
574 0.36
575 0.46
576 0.56
577 0.62
578 0.72
579 0.78
580 0.79
581 0.83
582 0.86
583 0.83
584 0.78
585 0.74