FuNGI

D6RMV5

Protein Details

Accession

D6RMV5

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
7-39	SLSLLFHPKKNQNQKGPAQSQPKPRPKPPGAVE	Hydrophilic
147-172	GTSSKDKGKANKRRFQKKTRQVFLVP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
28-35	PKPRPKPP
151-164	KDKGKANKRRFQKK
554-559	KLKKKK

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	cci:CC1G_14627 -

Amino Acid Sequences

MPPKNHSLSLLFHPKKNQNQKGPAQSQPKPRPKPPGAVEKKEEEDEDHLKLPDTPYSEYKLLSSSLKGWKYDVMKFDSRKPVDILRWTAPVKLNRKDLRREDRTAAAAKVPEAVRPMLGLDGKPVIGVDGKPVMVDAEGKPIHESGGTSSKDKGKANKRRFQKKTRQVFLVPDEVRQMQREERYPWVMEDSHPTHKEHWIGQLEDLSKAETHAFFMPAANDSFKFVPAHRWYKFQKKLNHDFPTATADVESAYTKAQKKDPQAWLATFHGGKGASASTMAIFKGEAEDQKPSGPVGPGGRKLKAVDRPPTSLLEDDEDPAVRRKRERELGEEGDLDEQLFEEDFADDEEMAAPDIDEEEAKELEERMKREYKLANKQRDAGVDEDEEDDEEEDLAKVKAKRRMEKMIRNREGNDAYESDDDENPYLSSAEEEEEEELPVPTGPAIQPQPQQVDQPNTPRPSTNKPAAPGSNSRTTSPATSPSLGGHSLVAKRATSPKVPKARVPGSQPGSRATSPNPGSRATSPLANGAQKRKAEDPGTPASQNGGPSAGGQPKLKKKKVAATASNAELEGLIIDWLRNTENPTTRGCIQHFNSYLVDAAKKKEFSEMVKRVAALKDGRLTLKPEFRSRNP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.67
3	0.74
4	0.75
5	0.74
6	0.8
7	0.85
8	0.87
9	0.84
10	0.82
11	0.8
12	0.78
13	0.79
14	0.8
15	0.81
16	0.79
17	0.8
18	0.82
19	0.79
20	0.82
21	0.78
22	0.79
23	0.78
24	0.78
25	0.76
26	0.71
27	0.7
28	0.62
29	0.55
30	0.47
31	0.44
32	0.39
33	0.38
34	0.34
35	0.3
36	0.29
37	0.3
38	0.28
39	0.26
40	0.25
41	0.26
42	0.26
43	0.31
44	0.32
45	0.3
46	0.29
47	0.27
48	0.25
49	0.24
50	0.22
51	0.23
52	0.3
53	0.33
54	0.33
55	0.32
56	0.36
57	0.39
58	0.42
59	0.41
60	0.4
61	0.45
62	0.47
63	0.54
64	0.58
65	0.55
66	0.53
67	0.51
68	0.51
69	0.49
70	0.53
71	0.51
72	0.44
73	0.48
74	0.46
75	0.47
76	0.47
77	0.49
78	0.5
79	0.51
80	0.57
81	0.59
82	0.65
83	0.7
84	0.74
85	0.76
86	0.75
87	0.74
88	0.69
89	0.67
90	0.64
91	0.58
92	0.49
93	0.42
94	0.36
95	0.3
96	0.31
97	0.26
98	0.23
99	0.22
100	0.21
101	0.17
102	0.16
103	0.16
104	0.14
105	0.15
106	0.13
107	0.13
108	0.13
109	0.13
110	0.13
111	0.12
112	0.1
113	0.1
114	0.1
115	0.11
116	0.12
117	0.12
118	0.12
119	0.12
120	0.11
121	0.1
122	0.12
123	0.1
124	0.16
125	0.16
126	0.17
127	0.18
128	0.18
129	0.18
130	0.16
131	0.16
132	0.12
133	0.2
134	0.21
135	0.21
136	0.25
137	0.3
138	0.35
139	0.38
140	0.44
141	0.46
142	0.56
143	0.65
144	0.69
145	0.74
146	0.79
147	0.85
148	0.86
149	0.87
150	0.87
151	0.87
152	0.86
153	0.82
154	0.74
155	0.71
156	0.64
157	0.63
158	0.53
159	0.43
160	0.39
161	0.35
162	0.33
163	0.28
164	0.27
165	0.22
166	0.26
167	0.29
168	0.3
169	0.32
170	0.35
171	0.34
172	0.32
173	0.31
174	0.27
175	0.24
176	0.28
177	0.28
178	0.32
179	0.33
180	0.33
181	0.32
182	0.35
183	0.37
184	0.31
185	0.34
186	0.3
187	0.29
188	0.29
189	0.31
190	0.28
191	0.26
192	0.24
193	0.17
194	0.13
195	0.13
196	0.14
197	0.09
198	0.11
199	0.11
200	0.11
201	0.11
202	0.11
203	0.11
204	0.11
205	0.12
206	0.11
207	0.1
208	0.12
209	0.12
210	0.13
211	0.13
212	0.12
213	0.2
214	0.26
215	0.34
216	0.33
217	0.4
218	0.44
219	0.54
220	0.62
221	0.61
222	0.62
223	0.63
224	0.72
225	0.75
226	0.75
227	0.66
228	0.58
229	0.52
230	0.49
231	0.4
232	0.3
233	0.2
234	0.14
235	0.13
236	0.12
237	0.11
238	0.06
239	0.06
240	0.11
241	0.15
242	0.17
243	0.22
244	0.27
245	0.32
246	0.41
247	0.46
248	0.46
249	0.46
250	0.44
251	0.42
252	0.38
253	0.35
254	0.26
255	0.2
256	0.17
257	0.14
258	0.13
259	0.11
260	0.09
261	0.06
262	0.06
263	0.06
264	0.05
265	0.06
266	0.06
267	0.05
268	0.05
269	0.05
270	0.06
271	0.07
272	0.08
273	0.08
274	0.1
275	0.1
276	0.11
277	0.11
278	0.1
279	0.1
280	0.09
281	0.1
282	0.14
283	0.17
284	0.22
285	0.25
286	0.25
287	0.25
288	0.26
289	0.3
290	0.32
291	0.34
292	0.36
293	0.37
294	0.39
295	0.39
296	0.4
297	0.35
298	0.29
299	0.23
300	0.18
301	0.15
302	0.13
303	0.12
304	0.1
305	0.1
306	0.14
307	0.17
308	0.16
309	0.18
310	0.21
311	0.28
312	0.36
313	0.38
314	0.39
315	0.43
316	0.44
317	0.43
318	0.4
319	0.33
320	0.26
321	0.23
322	0.17
323	0.09
324	0.06
325	0.04
326	0.04
327	0.03
328	0.03
329	0.03
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.05
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.03
341	0.04
342	0.04
343	0.03
344	0.03
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.06
349	0.06
350	0.11
351	0.14
352	0.15
353	0.19
354	0.25
355	0.25
356	0.29
357	0.35
358	0.39
359	0.47
360	0.55
361	0.59
362	0.55
363	0.58
364	0.56
365	0.52
366	0.45
367	0.36
368	0.29
369	0.2
370	0.19
371	0.17
372	0.14
373	0.12
374	0.1
375	0.09
376	0.06
377	0.06
378	0.05
379	0.05
380	0.06
381	0.06
382	0.1
383	0.13
384	0.18
385	0.25
386	0.32
387	0.39
388	0.45
389	0.56
390	0.61
391	0.68
392	0.74
393	0.78
394	0.77
395	0.73
396	0.69
397	0.64
398	0.57
399	0.48
400	0.4
401	0.29
402	0.26
403	0.23
404	0.22
405	0.18
406	0.17
407	0.15
408	0.13
409	0.13
410	0.1
411	0.1
412	0.09
413	0.07
414	0.07
415	0.06
416	0.07
417	0.07
418	0.07
419	0.09
420	0.09
421	0.09
422	0.09
423	0.09
424	0.08
425	0.07
426	0.07
427	0.05
428	0.06
429	0.06
430	0.1
431	0.13
432	0.17
433	0.2
434	0.23
435	0.28
436	0.28
437	0.32
438	0.32
439	0.36
440	0.36
441	0.41
442	0.45
443	0.43
444	0.43
445	0.43
446	0.43
447	0.45
448	0.49
449	0.49
450	0.45
451	0.45
452	0.51
453	0.5
454	0.49
455	0.48
456	0.46
457	0.47
458	0.44
459	0.42
460	0.38
461	0.37
462	0.35
463	0.3
464	0.3
465	0.25
466	0.25
467	0.25
468	0.24
469	0.25
470	0.22
471	0.2
472	0.16
473	0.16
474	0.16
475	0.19
476	0.19
477	0.16
478	0.19
479	0.26
480	0.28
481	0.32
482	0.39
483	0.45
484	0.54
485	0.57
486	0.59
487	0.61
488	0.63
489	0.61
490	0.6
491	0.6
492	0.56
493	0.57
494	0.54
495	0.48
496	0.47
497	0.43
498	0.39
499	0.32
500	0.35
501	0.35
502	0.39
503	0.38
504	0.34
505	0.37
506	0.36
507	0.38
508	0.3
509	0.3
510	0.25
511	0.28
512	0.3
513	0.31
514	0.34
515	0.37
516	0.42
517	0.41
518	0.44
519	0.43
520	0.46
521	0.43
522	0.43
523	0.42
524	0.42
525	0.45
526	0.41
527	0.38
528	0.34
529	0.33
530	0.29
531	0.24
532	0.18
533	0.13
534	0.14
535	0.2
536	0.21
537	0.23
538	0.26
539	0.34
540	0.43
541	0.54
542	0.58
543	0.6
544	0.63
545	0.69
546	0.75
547	0.77
548	0.73
549	0.71
550	0.71
551	0.66
552	0.6
553	0.51
554	0.41
555	0.3
556	0.22
557	0.14
558	0.09
559	0.06
560	0.05
561	0.05
562	0.06
563	0.07
564	0.09
565	0.1
566	0.14
567	0.21
568	0.28
569	0.3
570	0.34
571	0.38
572	0.4
573	0.45
574	0.44
575	0.46
576	0.43
577	0.5
578	0.49
579	0.46
580	0.43
581	0.38
582	0.37
583	0.3
584	0.32
585	0.25
586	0.27
587	0.31
588	0.31
589	0.31
590	0.36
591	0.37
592	0.39
593	0.48
594	0.5
595	0.49
596	0.5
597	0.5
598	0.48
599	0.46
600	0.45
601	0.37
602	0.36
603	0.36
604	0.37
605	0.4
606	0.38
607	0.41
608	0.42
609	0.48
610	0.48
611	0.52

D6RMV5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer