FuNGI

A0A319C4B2

Protein Details

Accession

A0A319C4B2

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-40	QPMRIRRPKVADPLVRPKRRP	Basic
132-153	AQFTRPVRLQRRDPRTRPHETT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
24-41	IRRPKVADPLVRPKRRPV
410-432	EKKEKEARRVLGKKVRKALQKRE
495-502	KKVAPRKR

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto 4, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MTPLPNETAPRAQTGANGPQPMRIRRPKVADPLVRPKRRPVAKPSTLTSANGGLKLPSKQATPSTLSTVRSEKPTRVNSGNEFSTNGFSGLLLSETFVDYPIVTTKRAIREGLKHHIARFSSKKSVDPRDEAQFTRPVRLQRRDPRTRPHETTTEKGMGNQRTGSESNNQGDDAEREELEARKAAREKQRADNMAQIAPSMGSAPKRPNAPKQKTQQVSRTDMTPEEIAKTRIKYEEALPWHLEDFDNKNIWVGNYEAALSETHAVFVFENTGQMRMIPVEKWYRFSAKNQFKALTIEEAERFMAKKVKDPRWFMEKQQELAQRKELEQFAKQRKVYAGKQGTPGAAEGLEADDMDFEEDRFADDEEHDDLFNEDEEAKAAEKRIKQDQLKANVFNLKEEKDYEDEELREKKEKEARRVLGKKVRKALQKREKNYDYSSGSDINPYSDEESSDDSEAERMKEEERKAEDEKDKKEPLSKVNTTPSGRTKHTDALKKVAPRKRLGSPSDASGTDTSRKKGKSKYSSQASQPTSLSVSGTSSVAPVSKKRVRQMQLGGAGSTSDLEGGAGSGGEVGESGKSKKLKLNPPSMTPQSGTPQGSRVGSPVPLNSRGFPGSRASSPEPLRGSTRISTPGPSSIAQGFPTPAEIHAAIPPTGILSSDLLKVFRPRIGESKENHRRFIAIVKDVGVYGKEDRLLRPGILKEA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.39
3	0.38
4	0.41
5	0.38
6	0.43
7	0.5
8	0.53
9	0.56
10	0.57
11	0.59
12	0.62
13	0.7
14	0.72
15	0.75
16	0.78
17	0.77
18	0.75
19	0.79
20	0.82
21	0.82
22	0.77
23	0.76
24	0.76
25	0.77
26	0.75
27	0.74
28	0.75
29	0.75
30	0.79
31	0.74
32	0.71
33	0.65
34	0.58
35	0.5
36	0.47
37	0.4
38	0.35
39	0.31
40	0.25
41	0.26
42	0.27
43	0.29
44	0.23
45	0.23
46	0.25
47	0.29
48	0.32
49	0.34
50	0.34
51	0.37
52	0.39
53	0.4
54	0.4
55	0.41
56	0.39
57	0.42
58	0.43
59	0.42
60	0.47
61	0.51
62	0.55
63	0.54
64	0.57
65	0.54
66	0.57
67	0.54
68	0.46
69	0.42
70	0.36
71	0.34
72	0.29
73	0.23
74	0.16
75	0.13
76	0.13
77	0.11
78	0.1
79	0.07
80	0.07
81	0.07
82	0.08
83	0.08
84	0.08
85	0.08
86	0.07
87	0.09
88	0.14
89	0.15
90	0.15
91	0.18
92	0.24
93	0.3
94	0.33
95	0.35
96	0.34
97	0.41
98	0.48
99	0.55
100	0.57
101	0.53
102	0.52
103	0.55
104	0.51
105	0.5
106	0.5
107	0.48
108	0.48
109	0.47
110	0.52
111	0.55
112	0.63
113	0.61
114	0.59
115	0.57
116	0.57
117	0.59
118	0.54
119	0.49
120	0.47
121	0.42
122	0.42
123	0.41
124	0.41
125	0.46
126	0.53
127	0.59
128	0.62
129	0.72
130	0.77
131	0.8
132	0.82
133	0.81
134	0.82
135	0.78
136	0.74
137	0.72
138	0.67
139	0.65
140	0.61
141	0.58
142	0.48
143	0.47
144	0.48
145	0.42
146	0.39
147	0.37
148	0.31
149	0.3
150	0.31
151	0.29
152	0.26
153	0.29
154	0.29
155	0.28
156	0.27
157	0.23
158	0.23
159	0.22
160	0.2
161	0.16
162	0.13
163	0.13
164	0.15
165	0.16
166	0.16
167	0.18
168	0.15
169	0.19
170	0.22
171	0.29
172	0.37
173	0.44
174	0.48
175	0.54
176	0.62
177	0.6
178	0.59
179	0.58
180	0.51
181	0.44
182	0.39
183	0.3
184	0.21
185	0.17
186	0.15
187	0.1
188	0.09
189	0.09
190	0.12
191	0.16
192	0.19
193	0.26
194	0.31
195	0.4
196	0.5
197	0.56
198	0.62
199	0.67
200	0.74
201	0.74
202	0.76
203	0.73
204	0.69
205	0.67
206	0.59
207	0.53
208	0.44
209	0.38
210	0.34
211	0.27
212	0.21
213	0.18
214	0.18
215	0.19
216	0.2
217	0.21
218	0.21
219	0.21
220	0.22
221	0.21
222	0.22
223	0.26
224	0.27
225	0.29
226	0.28
227	0.26
228	0.25
229	0.24
230	0.21
231	0.17
232	0.18
233	0.18
234	0.19
235	0.18
236	0.18
237	0.18
238	0.18
239	0.16
240	0.13
241	0.09
242	0.08
243	0.09
244	0.08
245	0.08
246	0.08
247	0.07
248	0.08
249	0.07
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.08
256	0.06
257	0.08
258	0.08
259	0.09
260	0.08
261	0.08
262	0.09
263	0.08
264	0.09
265	0.07
266	0.11
267	0.18
268	0.19
269	0.22
270	0.24
271	0.28
272	0.29
273	0.34
274	0.41
275	0.43
276	0.48
277	0.48
278	0.47
279	0.43
280	0.44
281	0.39
282	0.31
283	0.23
284	0.19
285	0.16
286	0.16
287	0.15
288	0.13
289	0.12
290	0.11
291	0.14
292	0.13
293	0.19
294	0.28
295	0.37
296	0.44
297	0.48
298	0.5
299	0.54
300	0.56
301	0.52
302	0.53
303	0.46
304	0.41
305	0.43
306	0.46
307	0.41
308	0.41
309	0.43
310	0.34
311	0.33
312	0.35
313	0.31
314	0.25
315	0.27
316	0.34
317	0.37
318	0.42
319	0.42
320	0.39
321	0.41
322	0.44
323	0.42
324	0.44
325	0.41
326	0.37
327	0.4
328	0.39
329	0.36
330	0.3
331	0.27
332	0.17
333	0.11
334	0.09
335	0.06
336	0.05
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.03
341	0.03
342	0.04
343	0.04
344	0.03
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.07
353	0.09
354	0.09
355	0.08
356	0.08
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.06
361	0.05
362	0.04
363	0.05
364	0.05
365	0.06
366	0.06
367	0.08
368	0.11
369	0.14
370	0.17
371	0.24
372	0.31
373	0.33
374	0.4
375	0.46
376	0.51
377	0.53
378	0.5
379	0.46
380	0.43
381	0.41
382	0.35
383	0.3
384	0.22
385	0.19
386	0.19
387	0.2
388	0.17
389	0.18
390	0.18
391	0.18
392	0.17
393	0.2
394	0.22
395	0.22
396	0.26
397	0.25
398	0.29
399	0.34
400	0.4
401	0.45
402	0.51
403	0.54
404	0.59
405	0.63
406	0.65
407	0.67
408	0.67
409	0.65
410	0.63
411	0.65
412	0.63
413	0.66
414	0.7
415	0.71
416	0.74
417	0.74
418	0.76
419	0.73
420	0.69
421	0.64
422	0.59
423	0.51
424	0.44
425	0.4
426	0.32
427	0.29
428	0.26
429	0.23
430	0.17
431	0.15
432	0.14
433	0.13
434	0.11
435	0.12
436	0.11
437	0.14
438	0.14
439	0.14
440	0.13
441	0.11
442	0.12
443	0.13
444	0.12
445	0.1
446	0.1
447	0.12
448	0.18
449	0.19
450	0.24
451	0.26
452	0.3
453	0.32
454	0.39
455	0.44
456	0.46
457	0.49
458	0.5
459	0.49
460	0.46
461	0.5
462	0.47
463	0.46
464	0.48
465	0.47
466	0.45
467	0.48
468	0.53
469	0.49
470	0.5
471	0.49
472	0.45
473	0.44
474	0.42
475	0.4
476	0.4
477	0.46
478	0.49
479	0.45
480	0.47
481	0.49
482	0.53
483	0.58
484	0.57
485	0.56
486	0.53
487	0.55
488	0.57
489	0.6
490	0.56
491	0.54
492	0.5
493	0.47
494	0.45
495	0.4
496	0.34
497	0.27
498	0.26
499	0.27
500	0.28
501	0.27
502	0.3
503	0.33
504	0.37
505	0.44
506	0.52
507	0.55
508	0.61
509	0.69
510	0.71
511	0.74
512	0.74
513	0.75
514	0.67
515	0.61
516	0.52
517	0.43
518	0.36
519	0.3
520	0.24
521	0.15
522	0.14
523	0.11
524	0.11
525	0.1
526	0.08
527	0.08
528	0.1
529	0.12
530	0.13
531	0.21
532	0.27
533	0.32
534	0.39
535	0.48
536	0.5
537	0.56
538	0.6
539	0.59
540	0.6
541	0.56
542	0.49
543	0.4
544	0.36
545	0.27
546	0.21
547	0.13
548	0.06
549	0.04
550	0.04
551	0.04
552	0.04
553	0.04
554	0.03
555	0.03
556	0.03
557	0.03
558	0.03
559	0.03
560	0.04
561	0.05
562	0.07
563	0.09
564	0.14
565	0.16
566	0.19
567	0.26
568	0.35
569	0.44
570	0.51
571	0.6
572	0.6
573	0.63
574	0.69
575	0.67
576	0.61
577	0.52
578	0.47
579	0.41
580	0.42
581	0.39
582	0.32
583	0.3
584	0.3
585	0.3
586	0.27
587	0.24
588	0.21
589	0.21
590	0.21
591	0.24
592	0.25
593	0.3
594	0.31
595	0.31
596	0.32
597	0.32
598	0.31
599	0.29
600	0.29
601	0.28
602	0.28
603	0.34
604	0.34
605	0.4
606	0.41
607	0.46
608	0.43
609	0.41
610	0.43
611	0.38
612	0.38
613	0.33
614	0.34
615	0.34
616	0.33
617	0.33
618	0.32
619	0.34
620	0.32
621	0.3
622	0.29
623	0.26
624	0.26
625	0.24
626	0.23
627	0.2
628	0.17
629	0.2
630	0.17
631	0.15
632	0.17
633	0.16
634	0.16
635	0.18
636	0.2
637	0.17
638	0.17
639	0.16
640	0.13
641	0.12
642	0.11
643	0.1
644	0.09
645	0.11
646	0.15
647	0.16
648	0.16
649	0.19
650	0.23
651	0.25
652	0.26
653	0.28
654	0.28
655	0.36
656	0.43
657	0.48
658	0.48
659	0.56
660	0.64
661	0.65
662	0.64
663	0.56
664	0.5
665	0.45
666	0.49
667	0.45
668	0.39
669	0.37
670	0.35
671	0.35
672	0.33
673	0.32
674	0.25
675	0.19
676	0.17
677	0.18
678	0.21
679	0.22
680	0.23
681	0.27
682	0.3
683	0.28
684	0.32

A0A319C4B2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer