Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A319DHX3

Protein Details
Accession A0A319DHX3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-33AADAHSTPRPRPPRRGGRGRGRGSAHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-31PRPRPPRRGGRGRGRGS
80-113RPPRGPRGGKRGGRGAGAQNSNASRRQGRPRGGG
Subcellular Location(s) mito 21, nucl 3.5, cyto_nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034078  NFX1_fam  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR034077  R3H_FAP1  
IPR024934  Rubredoxin-like_dom  
IPR000967  Znf_NFX1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0005506  F:iron ion binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
PF01422  zf-NF-X1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51061  R3H  
PS50903  RUBREDOXIN_LIKE  
CDD cd06008  NF-X1-zinc-finger  
cd06006  R3H_unknown_2  
Amino Acid Sequences MSVSPAPAADAHSTPRPRPPRRGGRGRGRGSAHRTTQAQQTQTQAQQTQAQTQAPPPTDAQPQAQQQQQPADAATAQTSRPPRGPRGGKRGGRGAGAQNSNASRRQGRPRGGGGGDQATIPGGRRFEGRLTKPERSAEDNGPEIPGGAAAEDAGLRADAPAFVPGEEVPKAGAASAPASASAAGIGKGKSRAKNQTPRPAAPKVTTKSVAPDIATRIHEDITHNLYECPICTAELGKRSRVWSCGLCWTVFHLSCVKKWSRNEGAAAQDASRRQGDGESSLPRAWRCPGCNLPQEVFPSSYTCWCEKEVDPRSFPGLPPHSCGQTCSRMRKGCPHPCDATCHAGPCAPCTAMGPTQDCFCGRNSSTKRCQDTDYENGWSCGEVCGDLLPCGEHTCSRPCHEGLCGSCEVRIEARCYCGKVESEMLCSSKDEELDSEMLHGGQDGEEGEVEEWIGCFNCGDQCGRPFDCGVHLCEKSCHAQDAHPAHCPRSPDVVPNCPCGKTPLASIPGSAPRTSCEDPIAHCSEACGKLLPCGHPCEKICHIGSCGPCMQKVPIQCRCGRNTFTTICPQGEMEPPQCFRICKAGLHCGRHACTERCCPGEQKAIERQALRRKLKAHLRPSDEDVEAEHICTRICGRMLKCGRHTCPEICHKGPCNTCREAIFEEIACNCGRSILHPPLPCGTQPPACSSPCERPKPCGHPQTPHNCHTDDESCPKCPYLTEKACLCGKRVLKNQPCWLADSRCGQVCGELLKCGSHTCQKHCHRPGDCEDASRPCQQRCGKTKTMCGHPCTDPCHAPYPCPEKTPCTSMITVTCGCGRLRQERRCNAAKAVVSKGQLQQAQRGPATTPLTCDDECGRLERNRSLASALGVDINPSTTVSQTLTSTNLPYSAETLDIYIQLSSSYPLSTLQTYESTLHTLATSPAQRSTRFQPAKSPLRAFAHSLAADWGFSSESFDPEPHRHVFILRPTVWTPPVFGTGNGTAIGIGGMSVADCVKLRERHRAKEQEAQRLAAAEIKAQREAARTQVNGSSDGGWAQVAASRKSNPSLARSSALSPSPWSSTMFAALAGDDPDAPPKKEKLVLRSGVKQLRTQGSAVEKGESSASAETDNAEQNI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.44
3 0.52
4 0.57
5 0.65
6 0.72
7 0.75
8 0.81
9 0.89
10 0.89
11 0.9
12 0.92
13 0.88
14 0.85
15 0.8
16 0.78
17 0.74
18 0.73
19 0.67
20 0.63
21 0.61
22 0.56
23 0.6
24 0.58
25 0.54
26 0.48
27 0.49
28 0.49
29 0.5
30 0.52
31 0.45
32 0.41
33 0.45
34 0.43
35 0.44
36 0.41
37 0.39
38 0.35
39 0.38
40 0.43
41 0.37
42 0.38
43 0.34
44 0.34
45 0.37
46 0.39
47 0.38
48 0.38
49 0.42
50 0.46
51 0.49
52 0.48
53 0.47
54 0.5
55 0.46
56 0.4
57 0.34
58 0.3
59 0.25
60 0.23
61 0.21
62 0.17
63 0.15
64 0.2
65 0.24
66 0.26
67 0.32
68 0.37
69 0.41
70 0.5
71 0.6
72 0.64
73 0.7
74 0.77
75 0.76
76 0.76
77 0.77
78 0.7
79 0.62
80 0.56
81 0.53
82 0.51
83 0.48
84 0.43
85 0.39
86 0.4
87 0.4
88 0.4
89 0.37
90 0.35
91 0.4
92 0.5
93 0.54
94 0.58
95 0.62
96 0.63
97 0.65
98 0.6
99 0.56
100 0.49
101 0.43
102 0.35
103 0.28
104 0.23
105 0.17
106 0.16
107 0.15
108 0.14
109 0.12
110 0.13
111 0.15
112 0.18
113 0.25
114 0.34
115 0.37
116 0.44
117 0.51
118 0.56
119 0.58
120 0.61
121 0.58
122 0.55
123 0.56
124 0.52
125 0.49
126 0.46
127 0.42
128 0.37
129 0.32
130 0.26
131 0.2
132 0.14
133 0.09
134 0.06
135 0.06
136 0.04
137 0.05
138 0.04
139 0.05
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.09
151 0.1
152 0.13
153 0.13
154 0.13
155 0.11
156 0.11
157 0.11
158 0.1
159 0.1
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.09
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.09
172 0.1
173 0.12
174 0.19
175 0.25
176 0.3
177 0.38
178 0.47
179 0.55
180 0.65
181 0.72
182 0.76
183 0.78
184 0.78
185 0.77
186 0.73
187 0.67
188 0.62
189 0.62
190 0.55
191 0.54
192 0.5
193 0.44
194 0.43
195 0.42
196 0.39
197 0.31
198 0.3
199 0.26
200 0.29
201 0.29
202 0.26
203 0.23
204 0.22
205 0.22
206 0.21
207 0.23
208 0.22
209 0.23
210 0.21
211 0.2
212 0.21
213 0.2
214 0.18
215 0.16
216 0.12
217 0.11
218 0.11
219 0.14
220 0.17
221 0.25
222 0.27
223 0.27
224 0.3
225 0.32
226 0.34
227 0.34
228 0.34
229 0.29
230 0.29
231 0.34
232 0.33
233 0.3
234 0.28
235 0.3
236 0.33
237 0.3
238 0.28
239 0.27
240 0.27
241 0.29
242 0.36
243 0.36
244 0.36
245 0.4
246 0.47
247 0.48
248 0.5
249 0.51
250 0.49
251 0.48
252 0.44
253 0.42
254 0.33
255 0.29
256 0.26
257 0.25
258 0.21
259 0.17
260 0.14
261 0.15
262 0.16
263 0.16
264 0.19
265 0.19
266 0.21
267 0.22
268 0.24
269 0.23
270 0.23
271 0.26
272 0.27
273 0.27
274 0.32
275 0.38
276 0.43
277 0.49
278 0.51
279 0.47
280 0.45
281 0.46
282 0.4
283 0.35
284 0.29
285 0.25
286 0.22
287 0.24
288 0.24
289 0.22
290 0.22
291 0.22
292 0.25
293 0.25
294 0.34
295 0.39
296 0.41
297 0.41
298 0.41
299 0.44
300 0.41
301 0.39
302 0.38
303 0.36
304 0.32
305 0.35
306 0.35
307 0.34
308 0.33
309 0.35
310 0.31
311 0.34
312 0.39
313 0.42
314 0.48
315 0.49
316 0.52
317 0.59
318 0.65
319 0.65
320 0.64
321 0.62
322 0.59
323 0.56
324 0.6
325 0.54
326 0.49
327 0.41
328 0.37
329 0.31
330 0.28
331 0.27
332 0.22
333 0.21
334 0.15
335 0.14
336 0.13
337 0.16
338 0.17
339 0.19
340 0.19
341 0.17
342 0.18
343 0.19
344 0.18
345 0.16
346 0.15
347 0.19
348 0.18
349 0.27
350 0.32
351 0.4
352 0.49
353 0.56
354 0.59
355 0.55
356 0.56
357 0.52
358 0.52
359 0.51
360 0.45
361 0.41
362 0.37
363 0.35
364 0.33
365 0.27
366 0.21
367 0.15
368 0.11
369 0.07
370 0.06
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.06
376 0.07
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.11
381 0.16
382 0.19
383 0.22
384 0.25
385 0.24
386 0.25
387 0.25
388 0.28
389 0.23
390 0.25
391 0.23
392 0.2
393 0.2
394 0.19
395 0.18
396 0.16
397 0.17
398 0.15
399 0.14
400 0.18
401 0.19
402 0.2
403 0.2
404 0.19
405 0.18
406 0.17
407 0.22
408 0.19
409 0.21
410 0.21
411 0.21
412 0.19
413 0.19
414 0.19
415 0.15
416 0.14
417 0.11
418 0.1
419 0.11
420 0.11
421 0.11
422 0.1
423 0.08
424 0.08
425 0.07
426 0.07
427 0.05
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.05
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.03
442 0.03
443 0.04
444 0.05
445 0.06
446 0.08
447 0.09
448 0.11
449 0.16
450 0.17
451 0.17
452 0.17
453 0.16
454 0.19
455 0.19
456 0.2
457 0.2
458 0.2
459 0.2
460 0.21
461 0.22
462 0.21
463 0.2
464 0.19
465 0.15
466 0.16
467 0.23
468 0.28
469 0.27
470 0.3
471 0.3
472 0.3
473 0.31
474 0.31
475 0.26
476 0.27
477 0.26
478 0.27
479 0.3
480 0.38
481 0.38
482 0.41
483 0.4
484 0.34
485 0.34
486 0.29
487 0.27
488 0.19
489 0.19
490 0.19
491 0.22
492 0.21
493 0.21
494 0.2
495 0.24
496 0.24
497 0.22
498 0.17
499 0.15
500 0.21
501 0.22
502 0.2
503 0.17
504 0.17
505 0.18
506 0.23
507 0.25
508 0.19
509 0.17
510 0.17
511 0.19
512 0.19
513 0.18
514 0.15
515 0.11
516 0.14
517 0.17
518 0.19
519 0.16
520 0.2
521 0.21
522 0.25
523 0.26
524 0.28
525 0.28
526 0.3
527 0.29
528 0.25
529 0.26
530 0.25
531 0.25
532 0.22
533 0.23
534 0.18
535 0.18
536 0.18
537 0.17
538 0.15
539 0.19
540 0.24
541 0.29
542 0.32
543 0.37
544 0.4
545 0.42
546 0.45
547 0.43
548 0.38
549 0.36
550 0.34
551 0.31
552 0.32
553 0.3
554 0.26
555 0.23
556 0.2
557 0.17
558 0.18
559 0.19
560 0.16
561 0.17
562 0.18
563 0.19
564 0.2
565 0.18
566 0.16
567 0.21
568 0.2
569 0.2
570 0.22
571 0.29
572 0.33
573 0.37
574 0.38
575 0.34
576 0.33
577 0.35
578 0.36
579 0.29
580 0.28
581 0.31
582 0.32
583 0.31
584 0.32
585 0.3
586 0.29
587 0.35
588 0.32
589 0.31
590 0.34
591 0.36
592 0.38
593 0.37
594 0.39
595 0.4
596 0.49
597 0.46
598 0.44
599 0.42
600 0.47
601 0.55
602 0.58
603 0.58
604 0.57
605 0.6
606 0.59
607 0.6
608 0.56
609 0.47
610 0.38
611 0.29
612 0.25
613 0.19
614 0.17
615 0.13
616 0.09
617 0.09
618 0.09
619 0.09
620 0.08
621 0.09
622 0.14
623 0.14
624 0.24
625 0.29
626 0.34
627 0.41
628 0.46
629 0.47
630 0.47
631 0.5
632 0.43
633 0.44
634 0.47
635 0.47
636 0.41
637 0.44
638 0.42
639 0.45
640 0.49
641 0.46
642 0.44
643 0.39
644 0.39
645 0.35
646 0.35
647 0.3
648 0.26
649 0.23
650 0.18
651 0.17
652 0.15
653 0.16
654 0.12
655 0.1
656 0.08
657 0.08
658 0.08
659 0.09
660 0.16
661 0.2
662 0.26
663 0.27
664 0.28
665 0.29
666 0.3
667 0.28
668 0.25
669 0.22
670 0.21
671 0.21
672 0.26
673 0.28
674 0.27
675 0.3
676 0.3
677 0.36
678 0.41
679 0.49
680 0.44
681 0.47
682 0.54
683 0.59
684 0.65
685 0.65
686 0.6
687 0.58
688 0.65
689 0.7
690 0.68
691 0.64
692 0.59
693 0.49
694 0.46
695 0.44
696 0.38
697 0.31
698 0.33
699 0.31
700 0.31
701 0.31
702 0.3
703 0.26
704 0.24
705 0.26
706 0.28
707 0.3
708 0.32
709 0.33
710 0.37
711 0.41
712 0.41
713 0.37
714 0.34
715 0.34
716 0.37
717 0.44
718 0.5
719 0.54
720 0.6
721 0.65
722 0.65
723 0.62
724 0.57
725 0.54
726 0.47
727 0.43
728 0.39
729 0.35
730 0.29
731 0.29
732 0.25
733 0.21
734 0.19
735 0.18
736 0.15
737 0.13
738 0.12
739 0.11
740 0.12
741 0.12
742 0.14
743 0.18
744 0.22
745 0.26
746 0.36
747 0.43
748 0.53
749 0.6
750 0.66
751 0.62
752 0.64
753 0.66
754 0.64
755 0.58
756 0.51
757 0.47
758 0.43
759 0.43
760 0.45
761 0.43
762 0.34
763 0.42
764 0.44
765 0.51
766 0.54
767 0.58
768 0.6
769 0.6
770 0.67
771 0.65
772 0.7
773 0.66
774 0.61
775 0.58
776 0.53
777 0.53
778 0.49
779 0.47
780 0.39
781 0.36
782 0.42
783 0.37
784 0.34
785 0.38
786 0.41
787 0.39
788 0.41
789 0.39
790 0.36
791 0.39
792 0.42
793 0.37
794 0.34
795 0.32
796 0.3
797 0.3
798 0.29
799 0.26
800 0.23
801 0.21
802 0.18
803 0.18
804 0.2
805 0.23
806 0.29
807 0.38
808 0.46
809 0.55
810 0.61
811 0.68
812 0.7
813 0.69
814 0.62
815 0.58
816 0.52
817 0.46
818 0.43
819 0.4
820 0.35
821 0.36
822 0.36
823 0.35
824 0.35
825 0.32
826 0.35
827 0.35
828 0.38
829 0.35
830 0.33
831 0.28
832 0.31
833 0.34
834 0.26
835 0.24
836 0.22
837 0.27
838 0.26
839 0.27
840 0.22
841 0.22
842 0.22
843 0.22
844 0.24
845 0.23
846 0.27
847 0.28
848 0.31
849 0.3
850 0.3
851 0.29
852 0.25
853 0.23
854 0.2
855 0.16
856 0.14
857 0.12
858 0.12
859 0.1
860 0.1
861 0.09
862 0.09
863 0.09
864 0.07
865 0.08
866 0.09
867 0.11
868 0.11
869 0.12
870 0.14
871 0.15
872 0.16
873 0.15
874 0.15
875 0.14
876 0.13
877 0.14
878 0.12
879 0.12
880 0.1
881 0.11
882 0.1
883 0.1
884 0.1
885 0.08
886 0.08
887 0.07
888 0.07
889 0.07
890 0.07
891 0.07
892 0.07
893 0.08
894 0.11
895 0.11
896 0.12
897 0.13
898 0.14
899 0.16
900 0.17
901 0.17
902 0.17
903 0.16
904 0.16
905 0.14
906 0.13
907 0.12
908 0.17
909 0.19
910 0.18
911 0.24
912 0.27
913 0.28
914 0.32
915 0.37
916 0.43
917 0.45
918 0.44
919 0.48
920 0.54
921 0.62
922 0.65
923 0.62
924 0.58
925 0.58
926 0.59
927 0.53
928 0.47
929 0.43
930 0.36
931 0.33
932 0.28
933 0.23
934 0.2
935 0.17
936 0.14
937 0.09
938 0.09
939 0.12
940 0.11
941 0.13
942 0.14
943 0.16
944 0.2
945 0.22
946 0.28
947 0.26
948 0.27
949 0.26
950 0.27
951 0.32
952 0.35
953 0.41
954 0.37
955 0.39
956 0.38
957 0.42
958 0.42
959 0.37
960 0.31
961 0.25
962 0.28
963 0.25
964 0.23
965 0.24
966 0.22
967 0.23
968 0.21
969 0.18
970 0.13
971 0.12
972 0.12
973 0.06
974 0.05
975 0.03
976 0.03
977 0.03
978 0.04
979 0.04
980 0.05
981 0.05
982 0.08
983 0.15
984 0.23
985 0.27
986 0.38
987 0.46
988 0.54
989 0.64
990 0.72
991 0.7
992 0.73
993 0.77
994 0.76
995 0.72
996 0.64
997 0.54
998 0.46
999 0.41
1000 0.36
1001 0.28
1002 0.22
1003 0.24
1004 0.25
1005 0.25
1006 0.25
1007 0.27
1008 0.25
1009 0.27
1010 0.29
1011 0.31
1012 0.29
1013 0.31
1014 0.34
1015 0.34
1016 0.32
1017 0.32
1018 0.26
1019 0.19
1020 0.19
1021 0.16
1022 0.12
1023 0.1
1024 0.08
1025 0.1
1026 0.13
1027 0.15
1028 0.18
1029 0.22
1030 0.25
1031 0.28
1032 0.34
1033 0.35
1034 0.37
1035 0.41
1036 0.41
1037 0.4
1038 0.4
1039 0.4
1040 0.39
1041 0.37
1042 0.32
1043 0.29
1044 0.29
1045 0.29
1046 0.28
1047 0.27
1048 0.24
1049 0.23
1050 0.25
1051 0.22
1052 0.19
1053 0.15
1054 0.14
1055 0.13
1056 0.12
1057 0.11
1058 0.09
1059 0.09
1060 0.17
1061 0.21
1062 0.23
1063 0.26
1064 0.29
1065 0.34
1066 0.4
1067 0.46
1068 0.46
1069 0.52
1070 0.58
1071 0.6
1072 0.65
1073 0.7
1074 0.69
1075 0.66
1076 0.62
1077 0.6
1078 0.58
1079 0.54
1080 0.47
1081 0.43
1082 0.43
1083 0.46
1084 0.43
1085 0.38
1086 0.31
1087 0.29
1088 0.3
1089 0.24
1090 0.2
1091 0.16
1092 0.15
1093 0.13
1094 0.13
1095 0.14
1096 0.16