FuNGI

A0A319CSH8

Protein Details

Accession

A0A319CSH8

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-39	AATQKSAPRKAPKPAAPRLKL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
26-38	PRKAPKPAAPRLK
200-268	EKKANKAKESSKSSKHKSDKDSKSEKVQAKKLLQRPDKESQPSATERPEKKSKSDKATKEAVKAASKQA
292-301	PAAERKRERG
320-325	GRRKGK
478-552	ANPGGEKGRGKGRSEAQPSSGGGGGGGGGGGGGGGNSNRGGKSSEGGSGGSGGNSRGPRGGRGSKSKGGSKGSGG

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, mito 9, cyto_nucl 8.5, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1 PF03467 Smg4_UPF3
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3 cd00590 RRM_SF

Amino Acid Sequences

MTQIPAGKSTGGVLQIPVAATQKSAPRKAPKPAAPRLKLVVRRLPPGLTQAEFETALGPEWKAGGGKVDWFQYKPGKVSKDPAKPSRPSRAYIHILSNDHTIPLSNTVRQASFLDARNTSNDPVLLGPPSLEFAPYAKIPGSRSRKDARQGTIDQDPEFIAFLESLTQPIAKPALVESTTDAEDKKDAVTVTPLVQYIREKKANKAKESSKSSKHKSDKDSKSEKVQAKKLLQRPDKESQPSATERPEKKSKSDKATKEAVKAASKQAASVAAKQAAKSSPAQNSPKDAPQPAAERKRERGNVAAAAKILQRDLGLAPSGRRKGKAAPADDASKNDQSNTASPDTGKKDSPAKPSRGGQSKAKGGSAQQSNEPTEANTPPVSTTPKPAKSAKGKQASAGPTATATQAFLKHANPSQGVTEPLLEAAFAPFGKIVKVEIDKKKGFGYVDFAEPDGLQKAIAASPVAVAQSQVVVLERKANPGGEKGRGKGRSEAQPSSGGGGGGGGGGGGGGGNSNRGGKSSEGGSGGSGGNSRGPRGGRGSKSKGGSKGSGGGGNAGNAGGNTEGKGNPESK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.15
3	0.15
4	0.16
5	0.15
6	0.12
7	0.13
8	0.16
9	0.23
10	0.3
11	0.35
12	0.42
13	0.5
14	0.57
15	0.66
16	0.73
17	0.74
18	0.75
19	0.8
20	0.83
21	0.77
22	0.76
23	0.72
24	0.71
25	0.7
26	0.68
27	0.67
28	0.61
29	0.62
30	0.59
31	0.55
32	0.48
33	0.46
34	0.43
35	0.34
36	0.31
37	0.28
38	0.28
39	0.25
40	0.23
41	0.18
42	0.14
43	0.14
44	0.14
45	0.12
46	0.1
47	0.1
48	0.11
49	0.1
50	0.1
51	0.12
52	0.12
53	0.16
54	0.18
55	0.23
56	0.25
57	0.25
58	0.31
59	0.35
60	0.37
61	0.39
62	0.43
63	0.44
64	0.45
65	0.53
66	0.57
67	0.6
68	0.66
69	0.69
70	0.71
71	0.72
72	0.77
73	0.78
74	0.72
75	0.67
76	0.63
77	0.63
78	0.6
79	0.56
80	0.55
81	0.5
82	0.48
83	0.45
84	0.43
85	0.35
86	0.29
87	0.25
88	0.19
89	0.14
90	0.2
91	0.21
92	0.19
93	0.22
94	0.24
95	0.24
96	0.25
97	0.25
98	0.23
99	0.25
100	0.27
101	0.29
102	0.28
103	0.29
104	0.31
105	0.32
106	0.28
107	0.25
108	0.21
109	0.17
110	0.17
111	0.17
112	0.14
113	0.12
114	0.11
115	0.09
116	0.11
117	0.1
118	0.09
119	0.08
120	0.08
121	0.11
122	0.1
123	0.12
124	0.12
125	0.14
126	0.17
127	0.26
128	0.34
129	0.35
130	0.41
131	0.46
132	0.52
133	0.58
134	0.63
135	0.57
136	0.56
137	0.56
138	0.54
139	0.53
140	0.49
141	0.4
142	0.34
143	0.29
144	0.22
145	0.19
146	0.15
147	0.09
148	0.07
149	0.06
150	0.08
151	0.07
152	0.07
153	0.08
154	0.08
155	0.07
156	0.09
157	0.1
158	0.07
159	0.08
160	0.08
161	0.12
162	0.12
163	0.13
164	0.13
165	0.15
166	0.16
167	0.16
168	0.16
169	0.12
170	0.12
171	0.12
172	0.1
173	0.1
174	0.09
175	0.09
176	0.11
177	0.12
178	0.13
179	0.13
180	0.14
181	0.12
182	0.14
183	0.17
184	0.21
185	0.27
186	0.33
187	0.33
188	0.4
189	0.5
190	0.56
191	0.57
192	0.59
193	0.59
194	0.61
195	0.69
196	0.68
197	0.68
198	0.69
199	0.71
200	0.73
201	0.74
202	0.72
203	0.72
204	0.75
205	0.74
206	0.75
207	0.76
208	0.69
209	0.68
210	0.69
211	0.67
212	0.63
213	0.6
214	0.58
215	0.58
216	0.63
217	0.62
218	0.63
219	0.63
220	0.61
221	0.62
222	0.6
223	0.6
224	0.55
225	0.51
226	0.43
227	0.41
228	0.4
229	0.35
230	0.34
231	0.37
232	0.35
233	0.4
234	0.47
235	0.44
236	0.47
237	0.55
238	0.57
239	0.58
240	0.64
241	0.62
242	0.59
243	0.66
244	0.63
245	0.56
246	0.53
247	0.46
248	0.4
249	0.37
250	0.34
251	0.29
252	0.27
253	0.23
254	0.2
255	0.21
256	0.19
257	0.19
258	0.19
259	0.19
260	0.19
261	0.19
262	0.21
263	0.17
264	0.17
265	0.18
266	0.2
267	0.2
268	0.26
269	0.3
270	0.29
271	0.32
272	0.33
273	0.34
274	0.32
275	0.29
276	0.23
277	0.23
278	0.28
279	0.32
280	0.38
281	0.4
282	0.41
283	0.44
284	0.5
285	0.5
286	0.45
287	0.41
288	0.35
289	0.36
290	0.33
291	0.3
292	0.23
293	0.21
294	0.2
295	0.16
296	0.14
297	0.08
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.09
305	0.14
306	0.19
307	0.2
308	0.21
309	0.21
310	0.26
311	0.33
312	0.38
313	0.35
314	0.34
315	0.36
316	0.4
317	0.39
318	0.36
319	0.32
320	0.28
321	0.26
322	0.22
323	0.21
324	0.18
325	0.2
326	0.21
327	0.19
328	0.16
329	0.17
330	0.22
331	0.25
332	0.25
333	0.24
334	0.22
335	0.29
336	0.34
337	0.44
338	0.45
339	0.45
340	0.48
341	0.52
342	0.57
343	0.57
344	0.56
345	0.52
346	0.51
347	0.53
348	0.49
349	0.46
350	0.38
351	0.32
352	0.35
353	0.34
354	0.29
355	0.26
356	0.28
357	0.29
358	0.28
359	0.27
360	0.2
361	0.18
362	0.18
363	0.17
364	0.14
365	0.13
366	0.13
367	0.15
368	0.2
369	0.17
370	0.24
371	0.3
372	0.34
373	0.38
374	0.41
375	0.47
376	0.52
377	0.61
378	0.63
379	0.63
380	0.6
381	0.57
382	0.61
383	0.55
384	0.48
385	0.39
386	0.3
387	0.21
388	0.21
389	0.19
390	0.13
391	0.11
392	0.1
393	0.11
394	0.13
395	0.14
396	0.14
397	0.17
398	0.2
399	0.23
400	0.22
401	0.22
402	0.22
403	0.22
404	0.22
405	0.19
406	0.17
407	0.13
408	0.13
409	0.11
410	0.09
411	0.08
412	0.06
413	0.07
414	0.06
415	0.06
416	0.06
417	0.07
418	0.07
419	0.07
420	0.08
421	0.12
422	0.17
423	0.26
424	0.33
425	0.41
426	0.42
427	0.43
428	0.44
429	0.42
430	0.38
431	0.3
432	0.29
433	0.23
434	0.25
435	0.24
436	0.23
437	0.21
438	0.19
439	0.19
440	0.14
441	0.12
442	0.08
443	0.08
444	0.08
445	0.08
446	0.09
447	0.08
448	0.07
449	0.07
450	0.08
451	0.09
452	0.07
453	0.07
454	0.06
455	0.06
456	0.06
457	0.06
458	0.07
459	0.08
460	0.08
461	0.16
462	0.17
463	0.2
464	0.22
465	0.24
466	0.24
467	0.3
468	0.34
469	0.35
470	0.38
471	0.38
472	0.45
473	0.48
474	0.5
475	0.5
476	0.52
477	0.53
478	0.56
479	0.56
480	0.5
481	0.48
482	0.46
483	0.41
484	0.35
485	0.25
486	0.18
487	0.15
488	0.12
489	0.08
490	0.07
491	0.04
492	0.02
493	0.02
494	0.02
495	0.02
496	0.02
497	0.03
498	0.03
499	0.05
500	0.06
501	0.09
502	0.09
503	0.1
504	0.13
505	0.13
506	0.16
507	0.17
508	0.19
509	0.18
510	0.19
511	0.18
512	0.18
513	0.17
514	0.15
515	0.14
516	0.11
517	0.16
518	0.16
519	0.17
520	0.2
521	0.21
522	0.24
523	0.32
524	0.4
525	0.43
526	0.52
527	0.58
528	0.61
529	0.66
530	0.69
531	0.67
532	0.64
533	0.59
534	0.53
535	0.51
536	0.47
537	0.44
538	0.37
539	0.35
540	0.29
541	0.26
542	0.23
543	0.17
544	0.14
545	0.1
546	0.11
547	0.09
548	0.08
549	0.09
550	0.11
551	0.12
552	0.15

A0A319CSH8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer