Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1DUL7

Protein Details
Accession A0A0D1DUL7    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
98-118VKFAPFSSRRRRRPGKTTESAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
106-111RRRRRP
Subcellular Location(s) extr 6, mito 5, plas 5, E.R. 4, cyto_mito 4, mito_nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001247  ExoRNase_PH_dom1  
IPR027408  PNPase/RNase_PH_dom_sf  
IPR020568  Ribosomal_S5_D2-typ_fold  
Gene Ontology GO:0000177  C:cytoplasmic exosome (RNase complex)  
GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0071028  P:nuclear mRNA surveillance  
GO:0034427  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, exonucleolytic, 3'-5'  
GO:0071051  P:polyadenylation-dependent snoRNA 3'-end processing  
GO:0016075  P:rRNA catabolic process  
GO:0034475  P:U4 snRNA 3'-end processing  
KEGG uma:UMAG_04549  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01138  RNase_PH  
CDD cd11371  RNase_PH_MTR3  
Amino Acid Sequences MSNYDRRRVNGPSSYVPIYDAAGIASTSTPVATTSQQRPDQRSYSQLRPIFLQTHLVPSASGSSYVEIGDLKLACSVFGPRQVKGRQYSGKAELNVEVKFAPFSSRRRRRPGKTTESAHLSGLLHQALLPSLRLDLLPKASLDIHIMVLQTDGLEESCIAAACIAATTALASAGIEMYGLVVGCVALVPSTTDSKDKQVLVDPSSADLGLVTAMKTATRVLLCGMPALASVTCLNVSAASNVASKSHDAGAGIGTDALDVALESLNTSLVDIHKVVAQALAEDFQRRTALTTAAAHK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.46
3 0.42
4 0.34
5 0.28
6 0.22
7 0.16
8 0.11
9 0.09
10 0.09
11 0.08
12 0.07
13 0.07
14 0.06
15 0.06
16 0.06
17 0.06
18 0.09
19 0.12
20 0.19
21 0.26
22 0.35
23 0.42
24 0.47
25 0.53
26 0.57
27 0.59
28 0.55
29 0.57
30 0.55
31 0.55
32 0.59
33 0.56
34 0.5
35 0.48
36 0.48
37 0.42
38 0.36
39 0.35
40 0.26
41 0.29
42 0.28
43 0.25
44 0.21
45 0.19
46 0.21
47 0.15
48 0.15
49 0.1
50 0.1
51 0.11
52 0.11
53 0.1
54 0.08
55 0.07
56 0.09
57 0.09
58 0.08
59 0.1
60 0.1
61 0.09
62 0.1
63 0.12
64 0.11
65 0.2
66 0.22
67 0.21
68 0.29
69 0.33
70 0.38
71 0.4
72 0.46
73 0.43
74 0.45
75 0.5
76 0.48
77 0.5
78 0.45
79 0.42
80 0.37
81 0.34
82 0.29
83 0.25
84 0.18
85 0.14
86 0.13
87 0.12
88 0.13
89 0.14
90 0.22
91 0.33
92 0.43
93 0.5
94 0.61
95 0.7
96 0.74
97 0.8
98 0.83
99 0.81
100 0.79
101 0.76
102 0.7
103 0.66
104 0.59
105 0.49
106 0.41
107 0.31
108 0.24
109 0.21
110 0.16
111 0.1
112 0.09
113 0.09
114 0.07
115 0.07
116 0.06
117 0.04
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.1
130 0.09
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.07
135 0.07
136 0.06
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.02
153 0.02
154 0.02
155 0.02
156 0.03
157 0.02
158 0.02
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.02
163 0.02
164 0.02
165 0.03
166 0.03
167 0.02
168 0.02
169 0.02
170 0.02
171 0.02
172 0.02
173 0.02
174 0.02
175 0.03
176 0.05
177 0.07
178 0.08
179 0.1
180 0.12
181 0.15
182 0.19
183 0.19
184 0.19
185 0.23
186 0.26
187 0.26
188 0.27
189 0.23
190 0.21
191 0.21
192 0.19
193 0.13
194 0.09
195 0.07
196 0.05
197 0.05
198 0.04
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.11
209 0.11
210 0.12
211 0.11
212 0.08
213 0.08
214 0.09
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.11
228 0.1
229 0.11
230 0.12
231 0.12
232 0.13
233 0.14
234 0.13
235 0.12
236 0.12
237 0.12
238 0.11
239 0.11
240 0.08
241 0.07
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.04
246 0.03
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.08
257 0.11
258 0.11
259 0.11
260 0.13
261 0.13
262 0.14
263 0.14
264 0.13
265 0.11
266 0.12
267 0.13
268 0.12
269 0.15
270 0.15
271 0.16
272 0.17
273 0.16
274 0.19
275 0.19
276 0.2
277 0.2