FuNGI

A0A319D627

Protein Details

Accession

A0A319D627

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-49	PPPLKIRRPKAADPLVRPKRRPVMKPFVPAS	Hydrophilic
132-152	ESQFTRPVRLQRRDPRVRSHE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
22-40	LKIRRPKAADPLVRPKRRP
410-433	KEKREKEARRVLGKKVRKALQKRE
486-510	PSGRLKHADPSKKGPSIAPRKRQGS
521-527	RKKGKSK

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito_nucl 12.833, cyto_nucl 12.333, mito 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MATPNNDPTLRTPMGLNGPPPLKIRRPKAADPLVRPKRRPVMKPFVPASALSGVPKLPPRQVVSNPTSAIRPDKNISTHPKNDFSVNGFSGPLLCETYVDYPIVTTKRALREGLKHHIARFTSKKSVDPRDESQFTRPVRLQRRDPRVRSHETHTERSQPNSKLGSEQSTQMDDVERDELEARKAAREKERAENMAQIAPSVGSAPKRHNAPKQKTQQVSKTDMTPEEIARTRIKYEEALPWHLEDFDNKNIWVGNYEAALSETHAVFVLENTGRMRMIPVEKWYRFSAKNHFKALTIEEAERFMAKKVKDPRWFMEKQQELAQRKELEQFAKQQKVYAGKQGTTAGVEGLEGDDMDFEEDRFADDEEHDDLFNEDEDAKAAEKRIKQDQLKANVFDLKDEKDYEEEELKEKREKEARRVLGKKVRKALQKREKNYDYSSGSDVNPYSDEESSEESEAERPKEDEEGKAEEEKNKKELSSRGNLTPSGRLKHADPSKKGPSIAPRKRQGSPSDASGTDTSRKKGKSKHASSQSTPQSSSRPISPSASASLAVSKKRVRTIPAGGAASVSDVDAGVGSAGEMSENGKSKKLKLNPPSVASQSVTPQGSRAGSPAPLGSKSFSGSRASSPESLRGNAGPTRISTPGPSGNSLSFPTPGEIHAAIPQSGILSSDLLRIFRPRIGESKENHRRFIAIVKDVGVYGKEDRLLRPGLLKES

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.37
3	0.34
4	0.33
5	0.34
6	0.36
7	0.39
8	0.41
9	0.43
10	0.49
11	0.56
12	0.59
13	0.65
14	0.69
15	0.75
16	0.79
17	0.78
18	0.78
19	0.81
20	0.81
21	0.82
22	0.78
23	0.76
24	0.76
25	0.77
26	0.76
27	0.75
28	0.75
29	0.75
30	0.81
31	0.75
32	0.69
33	0.62
34	0.54
35	0.47
36	0.39
37	0.32
38	0.24
39	0.22
40	0.18
41	0.2
42	0.26
43	0.26
44	0.27
45	0.32
46	0.36
47	0.42
48	0.48
49	0.53
50	0.53
51	0.55
52	0.52
53	0.47
54	0.44
55	0.39
56	0.4
57	0.35
58	0.35
59	0.33
60	0.37
61	0.4
62	0.46
63	0.53
64	0.54
65	0.59
66	0.6
67	0.61
68	0.57
69	0.56
70	0.51
71	0.46
72	0.43
73	0.36
74	0.31
75	0.26
76	0.24
77	0.22
78	0.2
79	0.17
80	0.12
81	0.1
82	0.1
83	0.12
84	0.15
85	0.15
86	0.15
87	0.13
88	0.12
89	0.17
90	0.18
91	0.17
92	0.17
93	0.22
94	0.28
95	0.31
96	0.34
97	0.35
98	0.42
99	0.48
100	0.55
101	0.57
102	0.53
103	0.52
104	0.55
105	0.51
106	0.51
107	0.5
108	0.48
109	0.48
110	0.47
111	0.52
112	0.55
113	0.63
114	0.62
115	0.62
116	0.61
117	0.61
118	0.63
119	0.59
120	0.56
121	0.54
122	0.47
123	0.47
124	0.45
125	0.46
126	0.52
127	0.57
128	0.62
129	0.65
130	0.75
131	0.79
132	0.8
133	0.81
134	0.79
135	0.79
136	0.73
137	0.7
138	0.7
139	0.66
140	0.68
141	0.62
142	0.63
143	0.57
144	0.59
145	0.6
146	0.52
147	0.52
148	0.48
149	0.45
150	0.39
151	0.39
152	0.38
153	0.31
154	0.32
155	0.28
156	0.27
157	0.26
158	0.22
159	0.22
160	0.17
161	0.17
162	0.15
163	0.12
164	0.11
165	0.13
166	0.14
167	0.13
168	0.16
169	0.15
170	0.19
171	0.23
172	0.28
173	0.34
174	0.4
175	0.43
176	0.49
177	0.55
178	0.52
179	0.5
180	0.49
181	0.43
182	0.38
183	0.33
184	0.24
185	0.18
186	0.15
187	0.13
188	0.1
189	0.1
190	0.1
191	0.13
192	0.17
193	0.21
194	0.27
195	0.34
196	0.42
197	0.51
198	0.57
199	0.64
200	0.71
201	0.75
202	0.76
203	0.77
204	0.75
205	0.71
206	0.68
207	0.6
208	0.53
209	0.47
210	0.41
211	0.38
212	0.32
213	0.26
214	0.24
215	0.24
216	0.23
217	0.23
218	0.23
219	0.22
220	0.21
221	0.22
222	0.19
223	0.2
224	0.24
225	0.25
226	0.28
227	0.27
228	0.26
229	0.25
230	0.24
231	0.21
232	0.18
233	0.18
234	0.18
235	0.19
236	0.18
237	0.18
238	0.18
239	0.18
240	0.16
241	0.13
242	0.09
243	0.08
244	0.09
245	0.08
246	0.08
247	0.08
248	0.07
249	0.08
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.06
255	0.06
256	0.09
257	0.08
258	0.09
259	0.09
260	0.1
261	0.1
262	0.1
263	0.11
264	0.1
265	0.13
266	0.14
267	0.19
268	0.28
269	0.28
270	0.32
271	0.33
272	0.35
273	0.35
274	0.37
275	0.41
276	0.43
277	0.48
278	0.49
279	0.48
280	0.43
281	0.42
282	0.4
283	0.34
284	0.26
285	0.21
286	0.17
287	0.17
288	0.16
289	0.15
290	0.14
291	0.11
292	0.13
293	0.13
294	0.19
295	0.28
296	0.37
297	0.44
298	0.48
299	0.51
300	0.54
301	0.56
302	0.52
303	0.53
304	0.46
305	0.41
306	0.43
307	0.46
308	0.41
309	0.41
310	0.43
311	0.35
312	0.33
313	0.35
314	0.31
315	0.26
316	0.24
317	0.31
318	0.33
319	0.37
320	0.36
321	0.33
322	0.34
323	0.38
324	0.37
325	0.35
326	0.31
327	0.26
328	0.27
329	0.26
330	0.23
331	0.18
332	0.17
333	0.09
334	0.07
335	0.06
336	0.05
337	0.04
338	0.04
339	0.03
340	0.03
341	0.03
342	0.03
343	0.03
344	0.03
345	0.03
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.07
354	0.08
355	0.09
356	0.08
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.07
361	0.06
362	0.05
363	0.04
364	0.05
365	0.05
366	0.06
367	0.06
368	0.08
369	0.11
370	0.14
371	0.17
372	0.24
373	0.31
374	0.32
375	0.4
376	0.46
377	0.51
378	0.52
379	0.49
380	0.44
381	0.4
382	0.38
383	0.32
384	0.26
385	0.19
386	0.17
387	0.17
388	0.16
389	0.14
390	0.14
391	0.15
392	0.16
393	0.15
394	0.16
395	0.18
396	0.19
397	0.23
398	0.23
399	0.26
400	0.31
401	0.33
402	0.39
403	0.46
404	0.51
405	0.56
406	0.59
407	0.62
408	0.64
409	0.67
410	0.65
411	0.62
412	0.62
413	0.61
414	0.66
415	0.69
416	0.71
417	0.73
418	0.73
419	0.75
420	0.73
421	0.69
422	0.63
423	0.59
424	0.51
425	0.43
426	0.4
427	0.32
428	0.28
429	0.26
430	0.23
431	0.17
432	0.15
433	0.13
434	0.13
435	0.11
436	0.11
437	0.11
438	0.13
439	0.14
440	0.14
441	0.13
442	0.11
443	0.15
444	0.17
445	0.16
446	0.15
447	0.14
448	0.14
449	0.19
450	0.2
451	0.18
452	0.19
453	0.22
454	0.23
455	0.26
456	0.27
457	0.28
458	0.33
459	0.33
460	0.33
461	0.31
462	0.29
463	0.3
464	0.35
465	0.35
466	0.38
467	0.39
468	0.39
469	0.41
470	0.42
471	0.39
472	0.4
473	0.38
474	0.33
475	0.3
476	0.28
477	0.27
478	0.34
479	0.41
480	0.42
481	0.42
482	0.47
483	0.53
484	0.54
485	0.54
486	0.48
487	0.5
488	0.53
489	0.58
490	0.6
491	0.61
492	0.63
493	0.66
494	0.69
495	0.63
496	0.58
497	0.51
498	0.47
499	0.43
500	0.38
501	0.37
502	0.32
503	0.3
504	0.3
505	0.3
506	0.28
507	0.3
508	0.33
509	0.37
510	0.44
511	0.52
512	0.57
513	0.62
514	0.7
515	0.74
516	0.78
517	0.75
518	0.76
519	0.74
520	0.66
521	0.6
522	0.51
523	0.45
524	0.42
525	0.4
526	0.35
527	0.3
528	0.29
529	0.3
530	0.3
531	0.28
532	0.26
533	0.25
534	0.21
535	0.18
536	0.22
537	0.22
538	0.22
539	0.25
540	0.26
541	0.29
542	0.35
543	0.37
544	0.36
545	0.39
546	0.45
547	0.47
548	0.49
549	0.46
550	0.4
551	0.37
552	0.32
553	0.26
554	0.19
555	0.12
556	0.06
557	0.04
558	0.04
559	0.04
560	0.04
561	0.03
562	0.03
563	0.03
564	0.03
565	0.03
566	0.03
567	0.03
568	0.04
569	0.08
570	0.13
571	0.14
572	0.2
573	0.22
574	0.27
575	0.36
576	0.44
577	0.51
578	0.55
579	0.65
580	0.66
581	0.68
582	0.67
583	0.61
584	0.55
585	0.47
586	0.39
587	0.32
588	0.31
589	0.29
590	0.24
591	0.22
592	0.22
593	0.22
594	0.21
595	0.2
596	0.16
597	0.16
598	0.17
599	0.19
600	0.18
601	0.19
602	0.2
603	0.19
604	0.18
605	0.2
606	0.21
607	0.21
608	0.22
609	0.22
610	0.24
611	0.27
612	0.3
613	0.33
614	0.33
615	0.37
616	0.36
617	0.36
618	0.35
619	0.31
620	0.31
621	0.28
622	0.28
623	0.23
624	0.21
625	0.24
626	0.24
627	0.24
628	0.22
629	0.24
630	0.3
631	0.31
632	0.31
633	0.3
634	0.3
635	0.31
636	0.31
637	0.28
638	0.22
639	0.21
640	0.2
641	0.18
642	0.17
643	0.19
644	0.18
645	0.17
646	0.2
647	0.21
648	0.19
649	0.18
650	0.17
651	0.14
652	0.13
653	0.13
654	0.09
655	0.09
656	0.09
657	0.14
658	0.16
659	0.16
660	0.18
661	0.2
662	0.22
663	0.23
664	0.27
665	0.26
666	0.33
667	0.39
668	0.45
669	0.46
670	0.55
671	0.63
672	0.64
673	0.63
674	0.56
675	0.5
676	0.45
677	0.49
678	0.45
679	0.39
680	0.37
681	0.35
682	0.35
683	0.33
684	0.32
685	0.25
686	0.19
687	0.17
688	0.18
689	0.21
690	0.22
691	0.23
692	0.27
693	0.3
694	0.28
695	0.32

A0A319D627

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer