Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317V5W8

Protein Details
Accession A0A317V5W8    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
99-122TSRLSAARRGSKRKSRSSGKDVSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
106-114RRGSKRKSR
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 4, cyto 2, extr 2, pero 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045862  Trf4-like  
Gene Ontology GO:0031499  C:TRAMP complex  
GO:0043631  P:RNA polyadenylation  
Amino Acid Sequences MRVLSSTSFPSRLACPATFFRARTISSFSKARCFHQTRANDKDLAIFKNSLQRTLDAHRSSNQASIIRRIPSQVDPKDTPEDATKSQDPLVVPPTAGITSRLSAARRGSKRKSRSSGKDVSPSQPTNLHRPVQWVPDPQRDRSEQCPWLNNLDPAHAFGDGLSQLDAEICALEKYVAPTLPEERQVHRIAADMSQLLEGTVPHAPLIIGSWQTGFAMGHSSLDLLLPIPDAVRSIEIIRKPSATRPKALTLRRGLLRDVNDILQNCPLFTGRVDLSIERSRITAVEGRTGLQMHIYCGEGLPPILEYVRDYRAEYPSLRPLYMTVRLILESQGLYGSRISSIGSEPLLMLVVAFLKMNHGRFRRSDGLGESLLAFLRMYGTQVDLTTTGVSVDPPTLFNAETLKLASRMYSPDNLPAHIRGQRSIMNLRRTAAIRGNVTTATRLCLQDPTNYMDDLGRTCIQTRGLQSALASAYERLSTTLNNWEKDRPSEPVSSLLGIALRANFDDFDDVRRQRTLGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.3
3 0.33
4 0.4
5 0.42
6 0.41
7 0.41
8 0.4
9 0.41
10 0.39
11 0.42
12 0.39
13 0.4
14 0.45
15 0.42
16 0.46
17 0.47
18 0.49
19 0.52
20 0.54
21 0.54
22 0.57
23 0.64
24 0.63
25 0.69
26 0.69
27 0.6
28 0.54
29 0.56
30 0.52
31 0.45
32 0.4
33 0.33
34 0.31
35 0.38
36 0.38
37 0.34
38 0.31
39 0.3
40 0.31
41 0.36
42 0.44
43 0.38
44 0.4
45 0.4
46 0.43
47 0.42
48 0.41
49 0.39
50 0.34
51 0.34
52 0.37
53 0.39
54 0.36
55 0.35
56 0.34
57 0.34
58 0.36
59 0.44
60 0.43
61 0.45
62 0.45
63 0.49
64 0.52
65 0.49
66 0.44
67 0.39
68 0.39
69 0.34
70 0.38
71 0.35
72 0.32
73 0.33
74 0.33
75 0.28
76 0.27
77 0.28
78 0.22
79 0.2
80 0.18
81 0.18
82 0.16
83 0.16
84 0.14
85 0.13
86 0.13
87 0.16
88 0.18
89 0.17
90 0.21
91 0.27
92 0.34
93 0.4
94 0.49
95 0.56
96 0.63
97 0.71
98 0.77
99 0.81
100 0.81
101 0.83
102 0.83
103 0.82
104 0.78
105 0.78
106 0.71
107 0.67
108 0.64
109 0.56
110 0.49
111 0.47
112 0.44
113 0.43
114 0.45
115 0.43
116 0.36
117 0.41
118 0.42
119 0.42
120 0.44
121 0.44
122 0.44
123 0.52
124 0.54
125 0.51
126 0.53
127 0.5
128 0.5
129 0.48
130 0.5
131 0.47
132 0.48
133 0.51
134 0.47
135 0.49
136 0.47
137 0.44
138 0.36
139 0.31
140 0.28
141 0.24
142 0.22
143 0.17
144 0.14
145 0.1
146 0.12
147 0.09
148 0.09
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.07
162 0.09
163 0.1
164 0.1
165 0.12
166 0.15
167 0.17
168 0.23
169 0.23
170 0.24
171 0.29
172 0.3
173 0.29
174 0.25
175 0.25
176 0.2
177 0.18
178 0.17
179 0.11
180 0.1
181 0.1
182 0.09
183 0.08
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.07
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.07
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.08
201 0.07
202 0.05
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.07
222 0.1
223 0.12
224 0.15
225 0.15
226 0.17
227 0.17
228 0.24
229 0.33
230 0.31
231 0.33
232 0.34
233 0.41
234 0.46
235 0.49
236 0.48
237 0.42
238 0.45
239 0.44
240 0.42
241 0.36
242 0.32
243 0.31
244 0.26
245 0.24
246 0.19
247 0.18
248 0.18
249 0.17
250 0.16
251 0.14
252 0.12
253 0.11
254 0.1
255 0.08
256 0.08
257 0.1
258 0.08
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.15
263 0.18
264 0.18
265 0.16
266 0.16
267 0.14
268 0.13
269 0.15
270 0.15
271 0.12
272 0.15
273 0.15
274 0.16
275 0.16
276 0.17
277 0.14
278 0.13
279 0.12
280 0.09
281 0.1
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.06
287 0.06
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.09
295 0.12
296 0.12
297 0.14
298 0.16
299 0.18
300 0.21
301 0.21
302 0.22
303 0.27
304 0.27
305 0.26
306 0.23
307 0.22
308 0.24
309 0.27
310 0.24
311 0.17
312 0.17
313 0.17
314 0.18
315 0.16
316 0.13
317 0.09
318 0.08
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.06
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.06
336 0.05
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.08
343 0.11
344 0.13
345 0.2
346 0.23
347 0.26
348 0.28
349 0.35
350 0.38
351 0.37
352 0.38
353 0.33
354 0.34
355 0.31
356 0.3
357 0.23
358 0.17
359 0.15
360 0.12
361 0.09
362 0.05
363 0.06
364 0.06
365 0.07
366 0.06
367 0.08
368 0.08
369 0.09
370 0.1
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.08
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.1
383 0.11
384 0.11
385 0.11
386 0.13
387 0.12
388 0.12
389 0.13
390 0.13
391 0.13
392 0.13
393 0.13
394 0.13
395 0.15
396 0.18
397 0.21
398 0.21
399 0.28
400 0.29
401 0.29
402 0.3
403 0.28
404 0.3
405 0.31
406 0.31
407 0.25
408 0.27
409 0.29
410 0.32
411 0.39
412 0.41
413 0.43
414 0.44
415 0.44
416 0.45
417 0.43
418 0.43
419 0.4
420 0.38
421 0.34
422 0.33
423 0.34
424 0.31
425 0.3
426 0.29
427 0.23
428 0.2
429 0.21
430 0.21
431 0.2
432 0.24
433 0.25
434 0.27
435 0.3
436 0.32
437 0.3
438 0.29
439 0.28
440 0.24
441 0.24
442 0.2
443 0.22
444 0.18
445 0.17
446 0.19
447 0.21
448 0.23
449 0.26
450 0.27
451 0.28
452 0.27
453 0.27
454 0.25
455 0.26
456 0.24
457 0.2
458 0.18
459 0.13
460 0.14
461 0.14
462 0.14
463 0.12
464 0.12
465 0.12
466 0.14
467 0.24
468 0.29
469 0.31
470 0.34
471 0.39
472 0.41
473 0.46
474 0.47
475 0.42
476 0.41
477 0.43
478 0.42
479 0.41
480 0.39
481 0.34
482 0.31
483 0.26
484 0.22
485 0.17
486 0.17
487 0.13
488 0.12
489 0.12
490 0.13
491 0.12
492 0.12
493 0.17
494 0.16
495 0.2
496 0.28
497 0.3
498 0.32
499 0.33