Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317VB48

Protein Details
Accession A0A317VB48    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
53-77APSSPDSKRRRLSPRPSDRKPSSPDHydrophilic
79-100AAAARPRRPRDEDRKRGQRLFGBasic
138-159YGELRRRRREEKEQGRRREQRVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-46RRK
54-95PSSPDSKRRRLSPRPSDRKPSSPDTAAAARPRRPRDEDRKRG
142-155RRRRREEKEQGRRR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039853  Pinin  
IPR006786  Pinin_SDK_MemA  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04696  Pinin_SDK_memA  
Amino Acid Sequences MTEGTLASAVLLPEPSPPPQPEPALKRDQDYYHHHHQAPNYPKRRKSSLTSHAPSSPDSKRRRLSPRPSDRKPSSPDTAAAARPRRPRDEDRKRGQRLFGALLGTLSQSGPSNNAAQKRRADIERRQQDKLKLQDEAYGELRRRRREEKEQGRRREQRVYEGEVMRVRHANLLAEARFLRTRAEPALCYKPWQLRAEEEDRIQDQIREAEATVAREVEEFETRRSAEEEKKSEEENRKPEEVKLEEEKLQEVTQEVTQEAKQDTQEIQEQAPVPESDAQENKDIAQASSVTLGAEMTVDGGAEEAKPEVVPVQDTHVPFTHDHPDIHRHDDDGGEVVEDQEDTVIY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.17
3 0.21
4 0.24
5 0.28
6 0.33
7 0.38
8 0.43
9 0.47
10 0.52
11 0.56
12 0.55
13 0.54
14 0.54
15 0.52
16 0.5
17 0.52
18 0.53
19 0.53
20 0.6
21 0.59
22 0.57
23 0.58
24 0.61
25 0.63
26 0.66
27 0.66
28 0.67
29 0.71
30 0.74
31 0.77
32 0.73
33 0.7
34 0.7
35 0.7
36 0.72
37 0.7
38 0.67
39 0.63
40 0.59
41 0.53
42 0.49
43 0.47
44 0.45
45 0.48
46 0.52
47 0.55
48 0.62
49 0.71
50 0.75
51 0.77
52 0.79
53 0.84
54 0.86
55 0.87
56 0.88
57 0.84
58 0.82
59 0.77
60 0.73
61 0.67
62 0.59
63 0.53
64 0.47
65 0.45
66 0.41
67 0.42
68 0.41
69 0.42
70 0.47
71 0.51
72 0.53
73 0.57
74 0.63
75 0.66
76 0.72
77 0.76
78 0.78
79 0.84
80 0.85
81 0.82
82 0.75
83 0.68
84 0.6
85 0.53
86 0.44
87 0.34
88 0.27
89 0.22
90 0.2
91 0.15
92 0.11
93 0.08
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.08
98 0.09
99 0.13
100 0.16
101 0.24
102 0.26
103 0.31
104 0.33
105 0.36
106 0.39
107 0.4
108 0.44
109 0.45
110 0.53
111 0.58
112 0.6
113 0.6
114 0.6
115 0.61
116 0.62
117 0.61
118 0.52
119 0.45
120 0.41
121 0.42
122 0.38
123 0.35
124 0.3
125 0.25
126 0.25
127 0.28
128 0.33
129 0.34
130 0.38
131 0.41
132 0.46
133 0.53
134 0.63
135 0.68
136 0.74
137 0.79
138 0.82
139 0.85
140 0.85
141 0.78
142 0.76
143 0.66
144 0.63
145 0.58
146 0.55
147 0.51
148 0.44
149 0.42
150 0.36
151 0.36
152 0.28
153 0.25
154 0.19
155 0.15
156 0.14
157 0.12
158 0.11
159 0.13
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.1
168 0.12
169 0.13
170 0.15
171 0.14
172 0.19
173 0.25
174 0.23
175 0.25
176 0.27
177 0.29
178 0.33
179 0.34
180 0.31
181 0.27
182 0.33
183 0.35
184 0.33
185 0.3
186 0.26
187 0.24
188 0.25
189 0.22
190 0.17
191 0.13
192 0.13
193 0.12
194 0.11
195 0.1
196 0.11
197 0.12
198 0.13
199 0.12
200 0.11
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.09
205 0.12
206 0.12
207 0.13
208 0.16
209 0.16
210 0.17
211 0.18
212 0.2
213 0.24
214 0.31
215 0.33
216 0.36
217 0.38
218 0.39
219 0.44
220 0.49
221 0.49
222 0.49
223 0.5
224 0.49
225 0.48
226 0.48
227 0.48
228 0.42
229 0.4
230 0.37
231 0.35
232 0.35
233 0.34
234 0.34
235 0.28
236 0.25
237 0.2
238 0.16
239 0.14
240 0.12
241 0.12
242 0.11
243 0.12
244 0.12
245 0.15
246 0.15
247 0.15
248 0.14
249 0.16
250 0.17
251 0.18
252 0.22
253 0.21
254 0.2
255 0.22
256 0.23
257 0.21
258 0.23
259 0.2
260 0.17
261 0.2
262 0.2
263 0.22
264 0.24
265 0.25
266 0.25
267 0.26
268 0.24
269 0.23
270 0.23
271 0.18
272 0.16
273 0.15
274 0.12
275 0.13
276 0.13
277 0.09
278 0.08
279 0.08
280 0.06
281 0.06
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.04
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.08
296 0.08
297 0.11
298 0.11
299 0.17
300 0.21
301 0.22
302 0.26
303 0.26
304 0.28
305 0.27
306 0.3
307 0.32
308 0.3
309 0.31
310 0.32
311 0.39
312 0.4
313 0.46
314 0.43
315 0.36
316 0.35
317 0.34
318 0.3
319 0.24
320 0.2
321 0.14
322 0.13
323 0.12
324 0.11
325 0.11
326 0.09