Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317X3H3

Protein Details
Accession A0A317X3H3    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
413-434NPPSPPPKPKPSTTKPKPRGLGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
313-321RRPPVAKAK
348-375PQPKPPARPSRGLGRIGGKKPQPPPVSK
418-451PPKPKPSTTKPKPRGLGVIGGRKIEKQPSPPPPQ
455-464SHPQPRKPGK
555-578RKRDELKRQLEAKSKAPAKKKRKF
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 10.5, mito 8, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MSSKWQRLHVSNQGSIPPLLFRYSLTQDGYELYMTDLTYIWSEHLDRQHILQRADEDNTTIDPSEDAEQLGILLDKVGEALRNEAGSSTVLTHGSFGDSLQLITSTKLPSPLRPLKWTIYLAKEPQSSSTRQLLLPLIKAEAGWASRQQTLIDQLKRKDWALGKLFDKLEAMGIELSTIFPNAKGVRGSHKGSMLSLAAGHIKGVAPFDEQAWLDETNTSSDLGFASNILTETAGSGFGDTSHFENLNPPPDGWWEKLTTAVVRTAETSPEYKERSQPVITRPPNDPMDTETDNDAETEDDEFERQETPPRLRRPPVAKAKPASPKPDEETESDGADFEEEHEVVKPPQPKPPARPSRGLGRIGGKKPQPPPVSKQKSPQSPPQSNTNEPSRAPKSPYQPDSDNDRTETDSENPPSPPPKPKPSTTKPKPRGLGVIGGRKIEKQPSPPPPQQSESHPQPRKPGKLGLIGGRKTVPVPAPATTRHADPTSPSRTETASEDEADDKDSNENANAPRVSSSPGHHRLKMSSTPAPAPAPPAAQPEPAREETEQERADRKRDELKRQLEAKSKAPAKKKRKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.44
3 0.36
4 0.29
5 0.24
6 0.21
7 0.19
8 0.17
9 0.21
10 0.25
11 0.29
12 0.29
13 0.28
14 0.26
15 0.27
16 0.27
17 0.21
18 0.17
19 0.13
20 0.12
21 0.12
22 0.12
23 0.1
24 0.1
25 0.1
26 0.1
27 0.1
28 0.11
29 0.13
30 0.17
31 0.23
32 0.26
33 0.26
34 0.3
35 0.36
36 0.4
37 0.39
38 0.37
39 0.36
40 0.36
41 0.38
42 0.34
43 0.28
44 0.24
45 0.24
46 0.22
47 0.18
48 0.14
49 0.12
50 0.13
51 0.15
52 0.14
53 0.12
54 0.11
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.09
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.04
63 0.05
64 0.06
65 0.08
66 0.08
67 0.11
68 0.12
69 0.12
70 0.13
71 0.12
72 0.13
73 0.11
74 0.11
75 0.1
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.11
81 0.12
82 0.11
83 0.09
84 0.11
85 0.1
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.11
91 0.14
92 0.12
93 0.13
94 0.2
95 0.21
96 0.24
97 0.33
98 0.42
99 0.44
100 0.47
101 0.5
102 0.47
103 0.52
104 0.52
105 0.48
106 0.45
107 0.46
108 0.44
109 0.46
110 0.45
111 0.4
112 0.41
113 0.39
114 0.35
115 0.35
116 0.37
117 0.33
118 0.3
119 0.33
120 0.32
121 0.31
122 0.3
123 0.26
124 0.21
125 0.19
126 0.18
127 0.16
128 0.13
129 0.12
130 0.11
131 0.13
132 0.15
133 0.17
134 0.18
135 0.18
136 0.17
137 0.24
138 0.31
139 0.34
140 0.37
141 0.38
142 0.42
143 0.44
144 0.43
145 0.41
146 0.37
147 0.39
148 0.39
149 0.42
150 0.4
151 0.43
152 0.43
153 0.37
154 0.33
155 0.25
156 0.21
157 0.15
158 0.14
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.06
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.09
169 0.09
170 0.11
171 0.12
172 0.13
173 0.2
174 0.25
175 0.28
176 0.28
177 0.3
178 0.28
179 0.27
180 0.28
181 0.21
182 0.16
183 0.13
184 0.11
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.12
200 0.11
201 0.1
202 0.11
203 0.11
204 0.1
205 0.11
206 0.1
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.07
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.04
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.05
227 0.06
228 0.07
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.13
233 0.15
234 0.18
235 0.18
236 0.17
237 0.16
238 0.2
239 0.23
240 0.2
241 0.2
242 0.17
243 0.16
244 0.18
245 0.17
246 0.14
247 0.13
248 0.13
249 0.12
250 0.11
251 0.13
252 0.12
253 0.12
254 0.13
255 0.13
256 0.12
257 0.16
258 0.19
259 0.18
260 0.22
261 0.25
262 0.28
263 0.29
264 0.31
265 0.33
266 0.41
267 0.42
268 0.4
269 0.38
270 0.39
271 0.39
272 0.35
273 0.3
274 0.21
275 0.25
276 0.23
277 0.22
278 0.17
279 0.16
280 0.15
281 0.14
282 0.12
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.06
291 0.07
292 0.07
293 0.12
294 0.15
295 0.21
296 0.29
297 0.35
298 0.4
299 0.42
300 0.49
301 0.5
302 0.56
303 0.61
304 0.6
305 0.6
306 0.57
307 0.61
308 0.63
309 0.61
310 0.58
311 0.49
312 0.46
313 0.44
314 0.46
315 0.41
316 0.35
317 0.35
318 0.3
319 0.27
320 0.24
321 0.2
322 0.15
323 0.13
324 0.1
325 0.06
326 0.07
327 0.06
328 0.06
329 0.07
330 0.08
331 0.09
332 0.14
333 0.19
334 0.19
335 0.25
336 0.32
337 0.36
338 0.43
339 0.53
340 0.59
341 0.57
342 0.62
343 0.58
344 0.6
345 0.62
346 0.56
347 0.48
348 0.45
349 0.49
350 0.46
351 0.49
352 0.43
353 0.43
354 0.45
355 0.52
356 0.49
357 0.46
358 0.51
359 0.56
360 0.61
361 0.58
362 0.63
363 0.62
364 0.66
365 0.67
366 0.7
367 0.68
368 0.67
369 0.66
370 0.67
371 0.64
372 0.58
373 0.58
374 0.54
375 0.47
376 0.41
377 0.46
378 0.41
379 0.38
380 0.4
381 0.41
382 0.44
383 0.5
384 0.53
385 0.51
386 0.49
387 0.49
388 0.53
389 0.53
390 0.46
391 0.39
392 0.37
393 0.33
394 0.31
395 0.3
396 0.25
397 0.26
398 0.26
399 0.27
400 0.26
401 0.28
402 0.3
403 0.32
404 0.38
405 0.39
406 0.46
407 0.49
408 0.56
409 0.63
410 0.69
411 0.77
412 0.77
413 0.81
414 0.8
415 0.83
416 0.79
417 0.72
418 0.68
419 0.59
420 0.57
421 0.52
422 0.53
423 0.46
424 0.44
425 0.41
426 0.37
427 0.38
428 0.36
429 0.33
430 0.31
431 0.39
432 0.47
433 0.55
434 0.59
435 0.64
436 0.63
437 0.63
438 0.59
439 0.57
440 0.57
441 0.58
442 0.63
443 0.62
444 0.58
445 0.64
446 0.7
447 0.7
448 0.65
449 0.62
450 0.57
451 0.58
452 0.6
453 0.58
454 0.58
455 0.52
456 0.49
457 0.43
458 0.38
459 0.31
460 0.31
461 0.25
462 0.2
463 0.22
464 0.23
465 0.26
466 0.28
467 0.32
468 0.3
469 0.29
470 0.29
471 0.28
472 0.25
473 0.27
474 0.33
475 0.35
476 0.35
477 0.35
478 0.32
479 0.32
480 0.33
481 0.32
482 0.3
483 0.25
484 0.24
485 0.24
486 0.24
487 0.24
488 0.25
489 0.22
490 0.17
491 0.16
492 0.17
493 0.16
494 0.15
495 0.2
496 0.18
497 0.24
498 0.24
499 0.22
500 0.23
501 0.23
502 0.26
503 0.25
504 0.27
505 0.31
506 0.41
507 0.45
508 0.47
509 0.49
510 0.49
511 0.53
512 0.55
513 0.52
514 0.48
515 0.47
516 0.45
517 0.46
518 0.45
519 0.39
520 0.36
521 0.32
522 0.28
523 0.26
524 0.31
525 0.29
526 0.34
527 0.35
528 0.37
529 0.41
530 0.41
531 0.43
532 0.36
533 0.39
534 0.37
535 0.43
536 0.4
537 0.37
538 0.42
539 0.43
540 0.49
541 0.48
542 0.49
543 0.5
544 0.57
545 0.64
546 0.66
547 0.7
548 0.73
549 0.75
550 0.78
551 0.77
552 0.73
553 0.68
554 0.68
555 0.68
556 0.66
557 0.7
558 0.73