Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317VHW2

Protein Details
Accession A0A317VHW2    Localization Confidence Low Confidence Score 6.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
716-735GKVLARWRPQKPQEDQQPPQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 9.833, cyto_mito 9.666, mito 5.5, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR021850  Symplekin/Pta1  
IPR032460  Symplekin/Pta1_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF11935  SYMPK_PTA1_N  
Amino Acid Sequences MAQSSDHLVDQIAQLNAARNLVLGDAAFYPQIVNGVLPLIGATARVELRRWGTEFLAETFASPALATSQKEQLAPRVLQTLREILELPEGDPLVLKQIVQNAASLYPLVFRHIVNHPDDGAVWENMTAVKQDILRRWDAFPFAVKILCIKFVQRVVQVQTHGSISDPRRPEQNETSLAIVPRTHAVLSLPNLEAEASGLLDRLLAVFQEDSSDPLFVNATLNCLAVLIRTRQSIGNKIINAIMNFLPARQVRPPITPSIRVGVKSMERTARAVMVNIMKRNPNHPLVGKMQQYIDRLMQSRLEVVDDASRKRGLPVEPTDGLDHAKRARLGVETPPLVKVPPLPPGPISYAQLFTLTEDAGLSSFDVKQLPPDLLVKIVVPLLARVDQSMMNQSVEAIRGRYQTIQKQQAAQQKQAAAAAAAAAAAAAAPVDDDDDDYEPEYQPMDIPEPVAEQEDAVPTEVADLQPDLVSLGPFVLPQPPPLTEDEAADIGRSAVGRVFGMLASTGVTPTPAKGKSQQQLGFARLAGSTFDRDAWVTLLTRLATRAPAGLEPRAVKSEQERGKPTISDSIRETLYRYILEDFRGRVNVGIMWLNEEWYNDRIQMQFTASQRTEEDEDVTVPLHYDHWVLRLLDGFLPYLDSRDTKIFIRFLSEIPEVTIPITKRVASLAKDPERVNLCVQSLLYLIMFRPPAREMCLNAVEDVYQTYEESRPAAGKVLARWRPQKPQEDQQPPQQLQTQPQPQDQQQQEETILASRTVAPESATNNTSLANGTDGIHAAARR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.2
3 0.21
4 0.2
5 0.18
6 0.13
7 0.13
8 0.12
9 0.12
10 0.07
11 0.08
12 0.08
13 0.09
14 0.09
15 0.09
16 0.09
17 0.08
18 0.1
19 0.08
20 0.07
21 0.07
22 0.08
23 0.08
24 0.07
25 0.07
26 0.06
27 0.06
28 0.06
29 0.06
30 0.09
31 0.11
32 0.13
33 0.14
34 0.18
35 0.23
36 0.28
37 0.3
38 0.29
39 0.28
40 0.31
41 0.32
42 0.3
43 0.29
44 0.24
45 0.22
46 0.2
47 0.19
48 0.15
49 0.12
50 0.1
51 0.1
52 0.14
53 0.15
54 0.17
55 0.22
56 0.24
57 0.27
58 0.28
59 0.32
60 0.35
61 0.35
62 0.34
63 0.36
64 0.34
65 0.35
66 0.36
67 0.34
68 0.28
69 0.28
70 0.27
71 0.2
72 0.25
73 0.23
74 0.2
75 0.18
76 0.17
77 0.16
78 0.15
79 0.14
80 0.13
81 0.13
82 0.13
83 0.12
84 0.17
85 0.21
86 0.2
87 0.21
88 0.18
89 0.18
90 0.18
91 0.17
92 0.11
93 0.12
94 0.12
95 0.14
96 0.14
97 0.14
98 0.18
99 0.24
100 0.29
101 0.28
102 0.3
103 0.27
104 0.26
105 0.26
106 0.25
107 0.21
108 0.17
109 0.14
110 0.12
111 0.12
112 0.12
113 0.12
114 0.1
115 0.08
116 0.1
117 0.13
118 0.18
119 0.23
120 0.27
121 0.31
122 0.33
123 0.34
124 0.35
125 0.33
126 0.3
127 0.28
128 0.26
129 0.23
130 0.22
131 0.2
132 0.21
133 0.19
134 0.21
135 0.18
136 0.17
137 0.2
138 0.24
139 0.28
140 0.28
141 0.31
142 0.32
143 0.36
144 0.35
145 0.32
146 0.29
147 0.26
148 0.22
149 0.18
150 0.21
151 0.21
152 0.27
153 0.29
154 0.29
155 0.36
156 0.39
157 0.45
158 0.45
159 0.48
160 0.44
161 0.43
162 0.44
163 0.4
164 0.37
165 0.31
166 0.24
167 0.18
168 0.16
169 0.15
170 0.12
171 0.1
172 0.11
173 0.14
174 0.16
175 0.19
176 0.18
177 0.16
178 0.16
179 0.16
180 0.15
181 0.11
182 0.09
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.07
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.1
200 0.09
201 0.09
202 0.1
203 0.08
204 0.1
205 0.08
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.11
214 0.11
215 0.12
216 0.13
217 0.15
218 0.18
219 0.21
220 0.27
221 0.3
222 0.32
223 0.31
224 0.31
225 0.33
226 0.31
227 0.28
228 0.25
229 0.19
230 0.15
231 0.15
232 0.14
233 0.16
234 0.15
235 0.18
236 0.17
237 0.23
238 0.23
239 0.27
240 0.3
241 0.33
242 0.36
243 0.36
244 0.35
245 0.35
246 0.35
247 0.31
248 0.3
249 0.26
250 0.26
251 0.25
252 0.27
253 0.25
254 0.24
255 0.25
256 0.25
257 0.24
258 0.21
259 0.19
260 0.18
261 0.21
262 0.24
263 0.25
264 0.26
265 0.26
266 0.27
267 0.3
268 0.32
269 0.28
270 0.28
271 0.28
272 0.3
273 0.31
274 0.37
275 0.36
276 0.32
277 0.31
278 0.31
279 0.31
280 0.28
281 0.25
282 0.21
283 0.21
284 0.2
285 0.2
286 0.17
287 0.16
288 0.14
289 0.13
290 0.11
291 0.1
292 0.14
293 0.15
294 0.15
295 0.16
296 0.17
297 0.16
298 0.17
299 0.21
300 0.17
301 0.22
302 0.25
303 0.29
304 0.29
305 0.3
306 0.29
307 0.26
308 0.26
309 0.19
310 0.17
311 0.13
312 0.14
313 0.13
314 0.13
315 0.14
316 0.14
317 0.16
318 0.17
319 0.21
320 0.19
321 0.2
322 0.2
323 0.19
324 0.17
325 0.16
326 0.15
327 0.12
328 0.18
329 0.18
330 0.18
331 0.19
332 0.21
333 0.24
334 0.22
335 0.22
336 0.17
337 0.17
338 0.16
339 0.16
340 0.14
341 0.1
342 0.09
343 0.07
344 0.06
345 0.05
346 0.05
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.05
353 0.06
354 0.06
355 0.07
356 0.08
357 0.08
358 0.09
359 0.1
360 0.09
361 0.09
362 0.1
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.07
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.11
377 0.11
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.07
385 0.08
386 0.09
387 0.1
388 0.14
389 0.17
390 0.22
391 0.3
392 0.36
393 0.36
394 0.37
395 0.43
396 0.47
397 0.47
398 0.43
399 0.38
400 0.32
401 0.31
402 0.29
403 0.23
404 0.14
405 0.11
406 0.08
407 0.05
408 0.04
409 0.03
410 0.02
411 0.02
412 0.02
413 0.02
414 0.01
415 0.01
416 0.01
417 0.02
418 0.02
419 0.02
420 0.03
421 0.04
422 0.05
423 0.05
424 0.06
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.06
431 0.07
432 0.08
433 0.07
434 0.08
435 0.08
436 0.08
437 0.09
438 0.09
439 0.08
440 0.06
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.05
447 0.06
448 0.07
449 0.06
450 0.06
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.04
462 0.05
463 0.09
464 0.09
465 0.1
466 0.12
467 0.12
468 0.14
469 0.16
470 0.2
471 0.16
472 0.17
473 0.17
474 0.16
475 0.15
476 0.13
477 0.11
478 0.07
479 0.07
480 0.06
481 0.05
482 0.05
483 0.06
484 0.05
485 0.06
486 0.06
487 0.05
488 0.06
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.05
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.12
499 0.12
500 0.14
501 0.2
502 0.28
503 0.32
504 0.41
505 0.43
506 0.44
507 0.47
508 0.47
509 0.42
510 0.34
511 0.3
512 0.21
513 0.18
514 0.13
515 0.11
516 0.1
517 0.1
518 0.1
519 0.1
520 0.1
521 0.1
522 0.1
523 0.1
524 0.09
525 0.09
526 0.11
527 0.1
528 0.1
529 0.11
530 0.11
531 0.1
532 0.1
533 0.11
534 0.1
535 0.13
536 0.15
537 0.15
538 0.18
539 0.18
540 0.2
541 0.21
542 0.2
543 0.19
544 0.2
545 0.28
546 0.31
547 0.36
548 0.39
549 0.39
550 0.42
551 0.41
552 0.39
553 0.39
554 0.34
555 0.3
556 0.29
557 0.29
558 0.28
559 0.27
560 0.27
561 0.2
562 0.21
563 0.19
564 0.17
565 0.17
566 0.18
567 0.2
568 0.21
569 0.2
570 0.21
571 0.22
572 0.2
573 0.18
574 0.17
575 0.15
576 0.14
577 0.15
578 0.12
579 0.14
580 0.14
581 0.14
582 0.14
583 0.14
584 0.15
585 0.14
586 0.15
587 0.12
588 0.14
589 0.14
590 0.15
591 0.16
592 0.16
593 0.2
594 0.2
595 0.28
596 0.26
597 0.27
598 0.26
599 0.28
600 0.28
601 0.24
602 0.24
603 0.17
604 0.18
605 0.16
606 0.16
607 0.13
608 0.1
609 0.1
610 0.08
611 0.08
612 0.09
613 0.09
614 0.11
615 0.14
616 0.14
617 0.15
618 0.16
619 0.17
620 0.16
621 0.17
622 0.15
623 0.11
624 0.14
625 0.13
626 0.13
627 0.13
628 0.12
629 0.14
630 0.17
631 0.19
632 0.18
633 0.23
634 0.24
635 0.22
636 0.27
637 0.26
638 0.24
639 0.28
640 0.27
641 0.22
642 0.22
643 0.23
644 0.17
645 0.17
646 0.2
647 0.15
648 0.18
649 0.2
650 0.18
651 0.17
652 0.21
653 0.25
654 0.24
655 0.31
656 0.37
657 0.41
658 0.46
659 0.46
660 0.49
661 0.49
662 0.48
663 0.44
664 0.38
665 0.32
666 0.29
667 0.28
668 0.23
669 0.19
670 0.17
671 0.14
672 0.11
673 0.1
674 0.12
675 0.14
676 0.13
677 0.16
678 0.17
679 0.19
680 0.24
681 0.27
682 0.26
683 0.31
684 0.35
685 0.33
686 0.31
687 0.29
688 0.24
689 0.21
690 0.19
691 0.14
692 0.1
693 0.09
694 0.11
695 0.13
696 0.13
697 0.14
698 0.15
699 0.15
700 0.15
701 0.18
702 0.19
703 0.2
704 0.26
705 0.35
706 0.41
707 0.47
708 0.55
709 0.58
710 0.65
711 0.71
712 0.74
713 0.72
714 0.75
715 0.79
716 0.81
717 0.79
718 0.78
719 0.8
720 0.71
721 0.67
722 0.64
723 0.56
724 0.53
725 0.59
726 0.58
727 0.53
728 0.58
729 0.6
730 0.58
731 0.64
732 0.62
733 0.59
734 0.52
735 0.5
736 0.44
737 0.39
738 0.35
739 0.28
740 0.25
741 0.17
742 0.16
743 0.15
744 0.16
745 0.16
746 0.16
747 0.14
748 0.16
749 0.2
750 0.24
751 0.23
752 0.22
753 0.21
754 0.21
755 0.21
756 0.18
757 0.16
758 0.12
759 0.12
760 0.13
761 0.14
762 0.14
763 0.14