Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317WJP7

Protein Details
Accession A0A317WJP7    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-57DSPAKKTKKVEAKPSESPKDAPKSILKKAKKNEPAAKAEHydrophilic
94-115AAKPKAEKEKPSTKKSKKEDGTBasic
190-213VPKIPDSKKAKRKILKKQRENAGSHydrophilic
305-330KGANRRFKRTPWNRIEKKRLDKGKTRBasic
402-428AEKPAEDTPKKTKKTKKAAQSPAAQETHydrophilic
444-465AASPAGQKAKKVQKKTKTKAKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-77KKDKKRKAAAAVAADSPAKKTKKVEAKPSESPKDAPKSILKKAKKNEPAAKAESDPKVKANGQPARQVKPRKR
96-134KPKAEKEKPSTKKSKKEDGTAAPATKAKPTKPDTKAKKA
192-208KIPDSKKAKRKILKKQR
306-333GANRRFKRTPWNRIEKKRLDKGKTREQW
336-336R
338-338G
410-465PKKTKKTKKAAQSPAAQETPKSEEKPAPKKSAEVAASPAGQKAKKVQKKTKTKAKA
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 12.166, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPDKKDKKRKAAAAVAADSPAKKTKKVEAKPSESPKDAPKSILKKAKKNEPAAKAESDPKVKANGQPARQVKPRKRAADFLSDNEDSEPEVEAAKPKAEKEKPSTKKSKKEDGTAAPATKAKPTKPDTKAKKAAPVAEESDKEDEPVASEASESEVEEDDRTVALIRGFESSGDEDESGDEGFDSNKAVPKIPDSKKAKRKILKKQRENAGSAEEPGTVYVGRIPHGFYEHQMREYFSQFGEITRLRLSRNRITGRSKHYAFIEFASTSVAKIVAGTMDNYLMYGHILKCKYVPAEQLHPEIWKGANRRFKRTPWNRIEKKRLDKGKTREQWTERIGREQQRRLAKAEKLKTALGYDFELPQLKSVDEVPVQEAKAIEASEPAAEEPVKAIEATSTEEIKAEKPAEDTPKKTKKTKKAAQSPAAQETPKSEEKPAPKKSAEVAASPAGQKAKKVQKKTKTKAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.73
3 0.64
4 0.55
5 0.48
6 0.39
7 0.33
8 0.33
9 0.28
10 0.29
11 0.32
12 0.4
13 0.49
14 0.57
15 0.65
16 0.67
17 0.73
18 0.79
19 0.85
20 0.82
21 0.74
22 0.69
23 0.67
24 0.65
25 0.59
26 0.54
27 0.54
28 0.53
29 0.59
30 0.66
31 0.65
32 0.66
33 0.73
34 0.79
35 0.79
36 0.82
37 0.82
38 0.8
39 0.8
40 0.75
41 0.7
42 0.63
43 0.61
44 0.58
45 0.54
46 0.47
47 0.41
48 0.42
49 0.41
50 0.42
51 0.45
52 0.46
53 0.45
54 0.53
55 0.56
56 0.58
57 0.63
58 0.69
59 0.68
60 0.7
61 0.75
62 0.74
63 0.73
64 0.74
65 0.71
66 0.71
67 0.66
68 0.59
69 0.57
70 0.49
71 0.45
72 0.37
73 0.32
74 0.22
75 0.19
76 0.16
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.12
81 0.13
82 0.16
83 0.17
84 0.18
85 0.28
86 0.33
87 0.39
88 0.44
89 0.54
90 0.59
91 0.68
92 0.77
93 0.76
94 0.81
95 0.82
96 0.84
97 0.79
98 0.78
99 0.76
100 0.71
101 0.7
102 0.66
103 0.59
104 0.5
105 0.47
106 0.4
107 0.38
108 0.35
109 0.29
110 0.33
111 0.37
112 0.45
113 0.5
114 0.6
115 0.63
116 0.69
117 0.76
118 0.7
119 0.73
120 0.67
121 0.64
122 0.56
123 0.51
124 0.45
125 0.41
126 0.38
127 0.32
128 0.32
129 0.26
130 0.24
131 0.21
132 0.16
133 0.13
134 0.14
135 0.11
136 0.08
137 0.08
138 0.07
139 0.09
140 0.09
141 0.07
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.08
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.09
175 0.1
176 0.11
177 0.12
178 0.16
179 0.26
180 0.29
181 0.38
182 0.42
183 0.51
184 0.6
185 0.68
186 0.73
187 0.7
188 0.77
189 0.78
190 0.82
191 0.83
192 0.83
193 0.83
194 0.83
195 0.8
196 0.73
197 0.63
198 0.56
199 0.46
200 0.37
201 0.29
202 0.2
203 0.15
204 0.13
205 0.11
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.1
215 0.11
216 0.1
217 0.18
218 0.18
219 0.2
220 0.2
221 0.21
222 0.2
223 0.22
224 0.21
225 0.13
226 0.15
227 0.12
228 0.12
229 0.15
230 0.13
231 0.13
232 0.15
233 0.16
234 0.14
235 0.19
236 0.24
237 0.26
238 0.35
239 0.38
240 0.41
241 0.46
242 0.51
243 0.55
244 0.57
245 0.52
246 0.46
247 0.43
248 0.41
249 0.35
250 0.29
251 0.25
252 0.17
253 0.15
254 0.15
255 0.13
256 0.1
257 0.1
258 0.09
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.04
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.07
273 0.07
274 0.12
275 0.12
276 0.13
277 0.13
278 0.16
279 0.17
280 0.17
281 0.22
282 0.22
283 0.28
284 0.31
285 0.33
286 0.31
287 0.3
288 0.28
289 0.24
290 0.21
291 0.19
292 0.21
293 0.25
294 0.34
295 0.37
296 0.45
297 0.49
298 0.54
299 0.61
300 0.66
301 0.7
302 0.71
303 0.79
304 0.8
305 0.84
306 0.89
307 0.87
308 0.86
309 0.85
310 0.84
311 0.8
312 0.8
313 0.78
314 0.79
315 0.77
316 0.74
317 0.73
318 0.68
319 0.68
320 0.64
321 0.64
322 0.55
323 0.54
324 0.55
325 0.55
326 0.6
327 0.59
328 0.61
329 0.61
330 0.62
331 0.59
332 0.59
333 0.57
334 0.57
335 0.58
336 0.56
337 0.51
338 0.49
339 0.46
340 0.41
341 0.36
342 0.28
343 0.24
344 0.19
345 0.17
346 0.18
347 0.2
348 0.17
349 0.18
350 0.17
351 0.15
352 0.14
353 0.14
354 0.17
355 0.15
356 0.16
357 0.17
358 0.19
359 0.19
360 0.2
361 0.19
362 0.15
363 0.16
364 0.15
365 0.12
366 0.09
367 0.1
368 0.09
369 0.09
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.09
379 0.08
380 0.09
381 0.13
382 0.15
383 0.15
384 0.14
385 0.16
386 0.17
387 0.17
388 0.21
389 0.18
390 0.17
391 0.19
392 0.25
393 0.34
394 0.4
395 0.44
396 0.5
397 0.59
398 0.64
399 0.71
400 0.75
401 0.75
402 0.8
403 0.83
404 0.84
405 0.85
406 0.89
407 0.88
408 0.87
409 0.82
410 0.79
411 0.74
412 0.64
413 0.53
414 0.47
415 0.46
416 0.43
417 0.39
418 0.36
419 0.39
420 0.48
421 0.58
422 0.62
423 0.63
424 0.58
425 0.59
426 0.59
427 0.61
428 0.54
429 0.46
430 0.42
431 0.37
432 0.38
433 0.36
434 0.35
435 0.32
436 0.3
437 0.3
438 0.35
439 0.42
440 0.49
441 0.59
442 0.65
443 0.7
444 0.81
445 0.89