Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317V8S4

Protein Details
Accession A0A317V8S4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
339-367LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDISHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
345-358KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAVQKSKKASSVNMSKDKRNTTPTQLVAAISAYLADAGFSKTTAAFTKELSSKSIDSTAKNVPSLLELFQIWEGQKSASASTTSSSSSSDAESESESGSDSDSESESSSDESSSSDVEMNDAPKKEAKSSSASSSDSDSDSDSDNSDDDDEEEKEGKKTPANPQSQGMKRKAESSSESESESSEDEAPKPKKAKKQDSSSESESDSDSSSSEESSDESSDDSDSDSSSDDSDSSSSSSSSSSSSASSSKAALKNATKTPLPESDSSSSGSDTIENSNATSQEPTSSSASPAPGTDNYSSKKKHVGARPTPLAALSELPHDHPSNEYVPYAYAERAWNDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDISGGKSFKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.68
3 0.72
4 0.73
5 0.7
6 0.67
7 0.64
8 0.63
9 0.67
10 0.62
11 0.58
12 0.52
13 0.46
14 0.39
15 0.33
16 0.24
17 0.14
18 0.12
19 0.07
20 0.06
21 0.05
22 0.05
23 0.05
24 0.07
25 0.07
26 0.07
27 0.08
28 0.09
29 0.11
30 0.13
31 0.16
32 0.15
33 0.16
34 0.23
35 0.27
36 0.28
37 0.28
38 0.29
39 0.27
40 0.28
41 0.34
42 0.3
43 0.27
44 0.31
45 0.36
46 0.35
47 0.34
48 0.32
49 0.25
50 0.25
51 0.25
52 0.21
53 0.16
54 0.13
55 0.14
56 0.14
57 0.16
58 0.14
59 0.14
60 0.13
61 0.12
62 0.14
63 0.13
64 0.14
65 0.13
66 0.13
67 0.12
68 0.13
69 0.14
70 0.13
71 0.13
72 0.13
73 0.12
74 0.13
75 0.13
76 0.12
77 0.11
78 0.11
79 0.12
80 0.11
81 0.1
82 0.1
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.08
94 0.09
95 0.09
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.09
103 0.08
104 0.1
105 0.11
106 0.13
107 0.16
108 0.16
109 0.17
110 0.19
111 0.2
112 0.22
113 0.23
114 0.24
115 0.26
116 0.28
117 0.31
118 0.31
119 0.31
120 0.28
121 0.28
122 0.26
123 0.21
124 0.19
125 0.15
126 0.13
127 0.13
128 0.13
129 0.11
130 0.1
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.1
137 0.09
138 0.1
139 0.12
140 0.12
141 0.13
142 0.15
143 0.15
144 0.16
145 0.2
146 0.28
147 0.36
148 0.4
149 0.41
150 0.42
151 0.5
152 0.54
153 0.56
154 0.51
155 0.46
156 0.42
157 0.44
158 0.41
159 0.36
160 0.33
161 0.31
162 0.32
163 0.28
164 0.29
165 0.24
166 0.23
167 0.2
168 0.17
169 0.13
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.18
174 0.19
175 0.22
176 0.27
177 0.31
178 0.38
179 0.47
180 0.57
181 0.57
182 0.65
183 0.7
184 0.7
185 0.72
186 0.67
187 0.59
188 0.49
189 0.41
190 0.32
191 0.24
192 0.19
193 0.12
194 0.09
195 0.08
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.1
231 0.11
232 0.12
233 0.12
234 0.13
235 0.18
236 0.2
237 0.21
238 0.25
239 0.27
240 0.32
241 0.34
242 0.36
243 0.31
244 0.3
245 0.33
246 0.34
247 0.34
248 0.3
249 0.32
250 0.31
251 0.31
252 0.31
253 0.27
254 0.22
255 0.19
256 0.17
257 0.13
258 0.11
259 0.12
260 0.12
261 0.11
262 0.12
263 0.13
264 0.13
265 0.13
266 0.13
267 0.11
268 0.12
269 0.13
270 0.15
271 0.17
272 0.17
273 0.18
274 0.19
275 0.2
276 0.18
277 0.17
278 0.18
279 0.16
280 0.19
281 0.2
282 0.24
283 0.26
284 0.33
285 0.35
286 0.34
287 0.41
288 0.42
289 0.48
290 0.52
291 0.59
292 0.61
293 0.68
294 0.71
295 0.64
296 0.59
297 0.51
298 0.43
299 0.33
300 0.26
301 0.17
302 0.16
303 0.16
304 0.18
305 0.21
306 0.21
307 0.2
308 0.2
309 0.23
310 0.21
311 0.22
312 0.2
313 0.17
314 0.17
315 0.18
316 0.19
317 0.15
318 0.16
319 0.17
320 0.18
321 0.2
322 0.2
323 0.19
324 0.18
325 0.19
326 0.2
327 0.22
328 0.23
329 0.22
330 0.24
331 0.25
332 0.31
333 0.37
334 0.43
335 0.5
336 0.59
337 0.68
338 0.76
339 0.85
340 0.86
341 0.9
342 0.91
343 0.9
344 0.9
345 0.89
346 0.88
347 0.88
348 0.82
349 0.72
350 0.61
351 0.57
352 0.48
353 0.42
354 0.34
355 0.26
356 0.23