FuNGI

A0A317VGT6

Protein Details

Accession

A0A317VGT6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
193-225	ASEKEGKAKKPVKKNKNKSKKKEEEKEKKEEEQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
196-222	KEGKAKKPVKKNKNKSKKKEEEKEKKE

Subcellular Location(s)

nucl 18, mito_nucl 12.833, cyto_nucl 10.833, mito 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MVLPKPNSSFASNRLLRSDHIGTSLLSNFRKSSAERPNPTPKPEPATDDEPLSSTDDDSKIGDSDDSDTATATATATRRPRVSRPSLEEKLAKGSDGGRTPRASRQRNQTKNATSSPALSHKRSSREMAGAGDGDRDGDGRDSEEENVLFSSIRDLDRGHKRRKPTVGYQSRRSFGEASTRVTEEREREEQSASEKEGKAKKPVKKNKNKSKKKEEEKEKKEEEQTPKPQFKVPREIDEARIFKQSNDMISSSSYAPSSARDAMVFDYDDDDDSSVGTPLSTASSTLMHELEDAAKDAEPVLTEPSVCPWCKAPVDPGLLLQFRAQPKQRLREQQRFCDSHKQSSAEQEWKEKGYPTIDWEGFDARIERHFADLEKVMVPDSKSFYRNILDGNLKSGQAKNFRLTLDGEGLENISCGYYGTRGAGKMLQAITTRYARKLRRLAADDHIVKTAGVVGYAQAVLVPELAVRLVKEDMDVTDEAARQILRETIDIGEKLNFALNDRVPVPVPEEEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.43
3	0.39
4	0.43
5	0.41
6	0.32
7	0.3
8	0.29
9	0.25
10	0.27
11	0.3
12	0.29
13	0.26
14	0.27
15	0.26
16	0.27
17	0.3
18	0.3
19	0.35
20	0.4
21	0.49
22	0.53
23	0.6
24	0.69
25	0.72
26	0.76
27	0.73
28	0.67
29	0.65
30	0.62
31	0.6
32	0.55
33	0.55
34	0.5
35	0.45
36	0.4
37	0.33
38	0.32
39	0.28
40	0.22
41	0.17
42	0.19
43	0.17
44	0.18
45	0.18
46	0.17
47	0.15
48	0.15
49	0.14
50	0.11
51	0.14
52	0.14
53	0.14
54	0.13
55	0.13
56	0.12
57	0.12
58	0.11
59	0.08
60	0.11
61	0.11
62	0.17
63	0.22
64	0.27
65	0.32
66	0.37
67	0.44
68	0.5
69	0.58
70	0.61
71	0.64
72	0.69
73	0.68
74	0.69
75	0.64
76	0.56
77	0.54
78	0.46
79	0.37
80	0.29
81	0.27
82	0.27
83	0.3
84	0.32
85	0.29
86	0.31
87	0.34
88	0.41
89	0.49
90	0.51
91	0.52
92	0.59
93	0.66
94	0.72
95	0.76
96	0.77
97	0.74
98	0.73
99	0.69
100	0.63
101	0.53
102	0.47
103	0.44
104	0.44
105	0.42
106	0.38
107	0.41
108	0.42
109	0.47
110	0.48
111	0.49
112	0.44
113	0.42
114	0.41
115	0.36
116	0.32
117	0.27
118	0.23
119	0.19
120	0.15
121	0.11
122	0.09
123	0.08
124	0.07
125	0.07
126	0.07
127	0.08
128	0.1
129	0.11
130	0.12
131	0.14
132	0.13
133	0.12
134	0.12
135	0.11
136	0.09
137	0.08
138	0.1
139	0.1
140	0.1
141	0.11
142	0.12
143	0.2
144	0.31
145	0.39
146	0.46
147	0.48
148	0.54
149	0.62
150	0.69
151	0.68
152	0.67
153	0.7
154	0.72
155	0.74
156	0.77
157	0.74
158	0.69
159	0.62
160	0.55
161	0.45
162	0.35
163	0.38
164	0.31
165	0.29
166	0.29
167	0.29
168	0.27
169	0.27
170	0.29
171	0.22
172	0.25
173	0.25
174	0.25
175	0.26
176	0.26
177	0.26
178	0.27
179	0.26
180	0.23
181	0.25
182	0.23
183	0.28
184	0.34
185	0.36
186	0.41
187	0.47
188	0.52
189	0.57
190	0.67
191	0.72
192	0.76
193	0.85
194	0.86
195	0.9
196	0.93
197	0.93
198	0.94
199	0.93
200	0.92
201	0.92
202	0.92
203	0.92
204	0.88
205	0.87
206	0.8
207	0.74
208	0.69
209	0.67
210	0.63
211	0.61
212	0.63
213	0.62
214	0.62
215	0.58
216	0.57
217	0.56
218	0.53
219	0.54
220	0.47
221	0.45
222	0.48
223	0.48
224	0.48
225	0.48
226	0.44
227	0.35
228	0.37
229	0.32
230	0.25
231	0.28
232	0.25
233	0.19
234	0.19
235	0.18
236	0.14
237	0.14
238	0.16
239	0.12
240	0.11
241	0.1
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.1
246	0.1
247	0.09
248	0.09
249	0.1
250	0.1
251	0.11
252	0.1
253	0.07
254	0.08
255	0.08
256	0.08
257	0.07
258	0.07
259	0.06
260	0.06
261	0.06
262	0.05
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.04
267	0.05
268	0.05
269	0.05
270	0.05
271	0.06
272	0.07
273	0.08
274	0.08
275	0.07
276	0.07
277	0.07
278	0.07
279	0.07
280	0.07
281	0.06
282	0.06
283	0.06
284	0.06
285	0.06
286	0.06
287	0.06
288	0.07
289	0.06
290	0.07
291	0.07
292	0.1
293	0.14
294	0.14
295	0.14
296	0.14
297	0.18
298	0.19
299	0.2
300	0.2
301	0.22
302	0.25
303	0.24
304	0.24
305	0.24
306	0.23
307	0.23
308	0.2
309	0.19
310	0.18
311	0.24
312	0.26
313	0.3
314	0.37
315	0.44
316	0.51
317	0.57
318	0.64
319	0.69
320	0.72
321	0.73
322	0.75
323	0.71
324	0.68
325	0.68
326	0.62
327	0.59
328	0.57
329	0.51
330	0.43
331	0.47
332	0.49
333	0.45
334	0.44
335	0.41
336	0.39
337	0.38
338	0.38
339	0.31
340	0.28
341	0.24
342	0.23
343	0.22
344	0.27
345	0.26
346	0.25
347	0.25
348	0.24
349	0.21
350	0.21
351	0.18
352	0.11
353	0.13
354	0.15
355	0.14
356	0.14
357	0.15
358	0.15
359	0.17
360	0.17
361	0.17
362	0.15
363	0.15
364	0.14
365	0.15
366	0.16
367	0.15
368	0.18
369	0.2
370	0.21
371	0.22
372	0.24
373	0.24
374	0.24
375	0.23
376	0.24
377	0.26
378	0.25
379	0.28
380	0.27
381	0.25
382	0.26
383	0.28
384	0.28
385	0.3
386	0.33
387	0.32
388	0.34
389	0.34
390	0.34
391	0.32
392	0.29
393	0.25
394	0.22
395	0.19
396	0.16
397	0.16
398	0.14
399	0.12
400	0.09
401	0.06
402	0.05
403	0.05
404	0.06
405	0.06
406	0.07
407	0.09
408	0.12
409	0.12
410	0.14
411	0.16
412	0.16
413	0.19
414	0.19
415	0.2
416	0.19
417	0.2
418	0.23
419	0.27
420	0.29
421	0.3
422	0.38
423	0.4
424	0.48
425	0.55
426	0.58
427	0.61
428	0.63
429	0.62
430	0.61
431	0.66
432	0.6
433	0.53
434	0.47
435	0.38
436	0.33
437	0.28
438	0.25
439	0.15
440	0.12
441	0.1
442	0.09
443	0.1
444	0.1
445	0.1
446	0.06
447	0.07
448	0.07
449	0.07
450	0.07
451	0.05
452	0.05
453	0.06
454	0.07
455	0.06
456	0.09
457	0.09
458	0.09
459	0.1
460	0.11
461	0.12
462	0.15
463	0.15
464	0.14
465	0.17
466	0.18
467	0.17
468	0.18
469	0.17
470	0.13
471	0.15
472	0.16
473	0.14
474	0.14
475	0.16
476	0.16
477	0.21
478	0.21
479	0.21
480	0.2
481	0.18
482	0.18
483	0.2
484	0.18
485	0.17
486	0.24
487	0.23
488	0.26
489	0.26
490	0.28
491	0.25
492	0.26
493	0.28

A0A317VGT6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer