Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317W3Y1

Protein Details
Accession A0A317W3Y1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
377-398TDSERARPSRGRKRHYDENSFVHydrophilic
413-439FYSNSEGIGKKKRKKDHVSKISTPLPDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
421-427GKKKRKK
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 10.5, cyto_mito 8, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08633  Rox3  
Amino Acid Sequences MSDRASSASFRVGPLSPSSPAAGSLKQSQPPSVLSDRIPQTPTSPPLMSVSAQNYATNLASSQTSPNQATSQPANLSSPPSSAPMSHQASQQPTVGTANSFPTPASSVSGHIPNANSFDESEPADKPMGTEPGATTATMNAAAMQQAEHRRTDHDRDLGGMGPAIGVRDFADVNGESDAMDIDREAPALSLHNGPSLESLQKDFSSAFHLCKSSYSATGPDPAVDLISLYGLGPVAHSVARLDSVTGEKINRLRKSYEGKLKGLGLAGRNKPVKQEPGAPGGLRHLTMWPEEEWQNQKVFGKEIKVADMDSALHNLQMKAMKMEPGTVPNNDYWEDVLGHEKPSKHAGSGDAGKKAVGAPPNGIRITQPNGTPAPVTDSERARPSRGRKRHYDENSFVGYGEGYADDDDEGAFYSNSEGIGKKKRKKDHVSKISTPLPDRGGSYGVGMFGIGAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.29
3 0.25
4 0.25
5 0.26
6 0.22
7 0.24
8 0.25
9 0.22
10 0.22
11 0.29
12 0.33
13 0.37
14 0.38
15 0.38
16 0.37
17 0.37
18 0.4
19 0.36
20 0.33
21 0.3
22 0.37
23 0.38
24 0.4
25 0.4
26 0.34
27 0.34
28 0.37
29 0.39
30 0.36
31 0.33
32 0.3
33 0.31
34 0.33
35 0.3
36 0.27
37 0.27
38 0.26
39 0.26
40 0.25
41 0.22
42 0.22
43 0.21
44 0.17
45 0.14
46 0.1
47 0.11
48 0.12
49 0.16
50 0.17
51 0.22
52 0.22
53 0.24
54 0.25
55 0.25
56 0.28
57 0.27
58 0.28
59 0.25
60 0.25
61 0.26
62 0.25
63 0.28
64 0.24
65 0.23
66 0.19
67 0.2
68 0.2
69 0.18
70 0.21
71 0.26
72 0.3
73 0.31
74 0.33
75 0.35
76 0.38
77 0.4
78 0.38
79 0.29
80 0.25
81 0.25
82 0.22
83 0.18
84 0.15
85 0.16
86 0.14
87 0.14
88 0.13
89 0.12
90 0.14
91 0.14
92 0.15
93 0.13
94 0.14
95 0.17
96 0.2
97 0.19
98 0.19
99 0.19
100 0.18
101 0.2
102 0.19
103 0.17
104 0.15
105 0.15
106 0.15
107 0.16
108 0.17
109 0.14
110 0.15
111 0.15
112 0.13
113 0.13
114 0.15
115 0.16
116 0.14
117 0.15
118 0.13
119 0.17
120 0.18
121 0.16
122 0.13
123 0.11
124 0.11
125 0.1
126 0.1
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.1
133 0.15
134 0.17
135 0.18
136 0.18
137 0.22
138 0.27
139 0.34
140 0.35
141 0.33
142 0.32
143 0.32
144 0.32
145 0.29
146 0.24
147 0.18
148 0.11
149 0.08
150 0.08
151 0.06
152 0.05
153 0.04
154 0.05
155 0.06
156 0.06
157 0.05
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.08
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.05
175 0.06
176 0.07
177 0.08
178 0.09
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.11
183 0.12
184 0.12
185 0.1
186 0.12
187 0.11
188 0.11
189 0.12
190 0.11
191 0.1
192 0.14
193 0.15
194 0.15
195 0.15
196 0.16
197 0.15
198 0.16
199 0.18
200 0.14
201 0.14
202 0.14
203 0.14
204 0.14
205 0.17
206 0.16
207 0.13
208 0.12
209 0.11
210 0.1
211 0.08
212 0.07
213 0.04
214 0.04
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.1
236 0.15
237 0.22
238 0.24
239 0.26
240 0.27
241 0.31
242 0.38
243 0.44
244 0.49
245 0.47
246 0.45
247 0.45
248 0.43
249 0.38
250 0.33
251 0.26
252 0.2
253 0.23
254 0.23
255 0.28
256 0.29
257 0.29
258 0.31
259 0.33
260 0.34
261 0.29
262 0.36
263 0.32
264 0.35
265 0.37
266 0.33
267 0.29
268 0.28
269 0.26
270 0.18
271 0.16
272 0.12
273 0.11
274 0.12
275 0.14
276 0.11
277 0.14
278 0.15
279 0.19
280 0.21
281 0.22
282 0.22
283 0.22
284 0.24
285 0.22
286 0.24
287 0.22
288 0.21
289 0.23
290 0.23
291 0.24
292 0.22
293 0.21
294 0.18
295 0.16
296 0.14
297 0.1
298 0.12
299 0.09
300 0.1
301 0.11
302 0.11
303 0.13
304 0.15
305 0.15
306 0.15
307 0.16
308 0.18
309 0.16
310 0.19
311 0.18
312 0.2
313 0.23
314 0.21
315 0.22
316 0.2
317 0.22
318 0.21
319 0.2
320 0.15
321 0.14
322 0.14
323 0.12
324 0.16
325 0.14
326 0.16
327 0.19
328 0.19
329 0.2
330 0.25
331 0.26
332 0.22
333 0.23
334 0.23
335 0.25
336 0.33
337 0.35
338 0.31
339 0.3
340 0.29
341 0.28
342 0.27
343 0.24
344 0.2
345 0.17
346 0.19
347 0.23
348 0.28
349 0.28
350 0.28
351 0.25
352 0.26
353 0.29
354 0.28
355 0.26
356 0.24
357 0.25
358 0.26
359 0.25
360 0.21
361 0.23
362 0.22
363 0.25
364 0.26
365 0.29
366 0.32
367 0.39
368 0.41
369 0.39
370 0.44
371 0.5
372 0.56
373 0.63
374 0.67
375 0.7
376 0.76
377 0.82
378 0.84
379 0.84
380 0.77
381 0.73
382 0.69
383 0.59
384 0.5
385 0.4
386 0.3
387 0.2
388 0.16
389 0.1
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.07
399 0.07
400 0.06
401 0.08
402 0.08
403 0.09
404 0.1
405 0.11
406 0.17
407 0.28
408 0.38
409 0.45
410 0.54
411 0.64
412 0.73
413 0.83
414 0.88
415 0.89
416 0.9
417 0.9
418 0.88
419 0.86
420 0.83
421 0.78
422 0.7
423 0.63
424 0.56
425 0.48
426 0.43
427 0.37
428 0.32
429 0.26
430 0.25
431 0.2
432 0.17
433 0.15
434 0.12