Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317VWP9

Protein Details
Accession A0A317VWP9    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
96-147GDDDERSKRKREGRREKKSRRMRELEDGGGSDDEKASRRRKRKEASPPDEELBasic
162-181MDEALKKPTKRRFRKADGIDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
90-94KRTRA
99-142DERSKRKREGRREKKSRRMRELEDGGGSDDEKASRRRKRKEASP
152-176TRRRRALDRAMDEALKKPTKRRFRK
407-422RKMRARQIAAAKGSRR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSEPNSPSENPLPAEEVEETQAPTPDAAAEEPAAAASSPDDNDNNSDDESILSEVDEAQFDDFDPENVDIEDRPQLAIDEDNLKLIGRHKRTRAEGDDDERSKRKREGRREKKSRRMRELEDGGGSDDEKASRRRKRKEASPPDEELLDPATRRRRALDRAMDEALKKPTKRRFRKADGIDLEQMADAEIEDMRKRMTHAAQMDAVNRRDGKPAMHKLKMLPEVVSLLNRNQYVNSLVDPEINLLEAVKFFLEPLDDGSLPAYNIQRDLMTALGKLPINKEALIASGIGKVVVFYTRSKRPEAGIKRMAERLLAEWTRPILQRSDDYSKRVYQEAAFDPTKLTAARPQSVHVTAAEARARELLPPRLANRARADITHTSYTVVPRPTMVQESKFARPLGASGEDRFRKMRARQIAAAKGSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.26
3 0.23
4 0.21
5 0.21
6 0.2
7 0.19
8 0.2
9 0.17
10 0.15
11 0.14
12 0.12
13 0.12
14 0.12
15 0.12
16 0.11
17 0.1
18 0.1
19 0.1
20 0.09
21 0.08
22 0.07
23 0.07
24 0.08
25 0.09
26 0.12
27 0.13
28 0.14
29 0.17
30 0.19
31 0.19
32 0.18
33 0.18
34 0.15
35 0.15
36 0.15
37 0.13
38 0.11
39 0.09
40 0.08
41 0.08
42 0.09
43 0.09
44 0.08
45 0.07
46 0.08
47 0.08
48 0.11
49 0.11
50 0.11
51 0.12
52 0.13
53 0.13
54 0.13
55 0.14
56 0.1
57 0.12
58 0.16
59 0.14
60 0.13
61 0.13
62 0.13
63 0.13
64 0.14
65 0.14
66 0.14
67 0.14
68 0.14
69 0.14
70 0.14
71 0.14
72 0.2
73 0.27
74 0.31
75 0.38
76 0.44
77 0.52
78 0.58
79 0.65
80 0.64
81 0.63
82 0.61
83 0.59
84 0.62
85 0.57
86 0.57
87 0.54
88 0.51
89 0.48
90 0.49
91 0.52
92 0.53
93 0.62
94 0.68
95 0.73
96 0.82
97 0.89
98 0.92
99 0.94
100 0.95
101 0.94
102 0.92
103 0.89
104 0.83
105 0.82
106 0.76
107 0.69
108 0.59
109 0.49
110 0.4
111 0.32
112 0.26
113 0.17
114 0.12
115 0.1
116 0.12
117 0.18
118 0.25
119 0.34
120 0.44
121 0.52
122 0.62
123 0.7
124 0.77
125 0.82
126 0.84
127 0.83
128 0.8
129 0.75
130 0.66
131 0.58
132 0.47
133 0.37
134 0.28
135 0.21
136 0.14
137 0.16
138 0.22
139 0.24
140 0.25
141 0.28
142 0.32
143 0.37
144 0.46
145 0.5
146 0.46
147 0.48
148 0.49
149 0.46
150 0.41
151 0.38
152 0.35
153 0.31
154 0.28
155 0.31
156 0.39
157 0.48
158 0.57
159 0.64
160 0.67
161 0.71
162 0.8
163 0.78
164 0.79
165 0.72
166 0.66
167 0.58
168 0.48
169 0.39
170 0.29
171 0.24
172 0.14
173 0.09
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.11
184 0.12
185 0.17
186 0.18
187 0.2
188 0.23
189 0.23
190 0.26
191 0.26
192 0.25
193 0.22
194 0.21
195 0.2
196 0.2
197 0.2
198 0.19
199 0.23
200 0.32
201 0.36
202 0.37
203 0.38
204 0.37
205 0.42
206 0.43
207 0.35
208 0.26
209 0.2
210 0.2
211 0.2
212 0.19
213 0.14
214 0.11
215 0.14
216 0.14
217 0.13
218 0.12
219 0.12
220 0.13
221 0.13
222 0.12
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.09
229 0.08
230 0.07
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.05
240 0.04
241 0.06
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.12
249 0.11
250 0.09
251 0.09
252 0.1
253 0.09
254 0.09
255 0.1
256 0.09
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.1
261 0.11
262 0.12
263 0.13
264 0.14
265 0.15
266 0.15
267 0.15
268 0.12
269 0.12
270 0.12
271 0.11
272 0.09
273 0.08
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.07
280 0.08
281 0.1
282 0.16
283 0.24
284 0.27
285 0.29
286 0.31
287 0.33
288 0.41
289 0.46
290 0.5
291 0.5
292 0.5
293 0.51
294 0.52
295 0.49
296 0.4
297 0.33
298 0.25
299 0.25
300 0.23
301 0.2
302 0.19
303 0.2
304 0.23
305 0.24
306 0.24
307 0.19
308 0.21
309 0.24
310 0.3
311 0.37
312 0.37
313 0.39
314 0.41
315 0.42
316 0.42
317 0.4
318 0.35
319 0.27
320 0.31
321 0.31
322 0.34
323 0.3
324 0.28
325 0.27
326 0.26
327 0.26
328 0.2
329 0.17
330 0.17
331 0.23
332 0.27
333 0.27
334 0.29
335 0.33
336 0.34
337 0.33
338 0.27
339 0.25
340 0.22
341 0.26
342 0.26
343 0.21
344 0.2
345 0.22
346 0.22
347 0.21
348 0.26
349 0.27
350 0.3
351 0.35
352 0.36
353 0.44
354 0.46
355 0.48
356 0.48
357 0.49
358 0.45
359 0.41
360 0.46
361 0.42
362 0.45
363 0.42
364 0.37
365 0.31
366 0.32
367 0.35
368 0.34
369 0.3
370 0.25
371 0.23
372 0.26
373 0.28
374 0.33
375 0.34
376 0.31
377 0.36
378 0.41
379 0.45
380 0.46
381 0.43
382 0.36
383 0.32
384 0.3
385 0.29
386 0.3
387 0.27
388 0.26
389 0.36
390 0.38
391 0.4
392 0.41
393 0.39
394 0.41
395 0.45
396 0.52
397 0.52
398 0.57
399 0.61
400 0.69
401 0.74
402 0.72