Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317VT62

Protein Details
Accession A0A317VT62    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
168-190GEVRRNPRRKFAKGPKLRRRDAVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
171-187RRNPRRKFAKGPKLRRR
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 9, cyto 6.5, plas 4, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045888  Erv  
IPR012936  Erv_C  
IPR039542  Erv_N  
Gene Ontology GO:0030134  C:COPII-coated ER to Golgi transport vesicle  
GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0033116  C:endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane  
GO:0000139  C:Golgi membrane  
GO:0006888  P:endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport  
GO:0006890  P:retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum  
Pfam View protein in Pfam  
PF07970  COPIIcoated_ERV  
PF13850  ERGIC_N  
Amino Acid Sequences MNGFSAHGLDEDAFSEKSGLQGGLKTFDAFPKTKSSYTAPSTRGGQWTVLVLLICTAFTFTEFRTWLHGTENHQFSVEKGVGHDLQMNLDMVVHMPCETLHVNIQDASGDRILAGELLQLERTSWQLWMDKRNGEKYGGAHEYQTLSREDTDRVAQQEADAHVHHVLGEVRRNPRRKFAKGPKLRRRDAVDSCRIYGSLEGNKVQGDFHITAKGHGYGMFGQHLDHEAFNFTHMVTELSFGPHYPTLLNPLDKTIATTESHYYKYQYFLSVVPTIYSKGASALDAYTSAPSSLAPSQFSNTNKNLVFTNQYAATSQGGNLPESPFFVPGIFFKYNIEPILLLVSEERSSFLSLLIRLVNTVSGVMVTGGWVYQISGWLGALLLKRKGRGKSEGVLTGKHDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.12
4 0.13
5 0.14
6 0.14
7 0.12
8 0.15
9 0.17
10 0.19
11 0.2
12 0.2
13 0.19
14 0.23
15 0.28
16 0.25
17 0.26
18 0.32
19 0.35
20 0.35
21 0.38
22 0.39
23 0.41
24 0.46
25 0.52
26 0.46
27 0.45
28 0.48
29 0.48
30 0.47
31 0.4
32 0.35
33 0.28
34 0.27
35 0.23
36 0.2
37 0.16
38 0.11
39 0.11
40 0.1
41 0.08
42 0.07
43 0.07
44 0.05
45 0.07
46 0.09
47 0.09
48 0.15
49 0.16
50 0.17
51 0.22
52 0.23
53 0.23
54 0.27
55 0.3
56 0.3
57 0.38
58 0.4
59 0.34
60 0.34
61 0.33
62 0.28
63 0.31
64 0.27
65 0.18
66 0.16
67 0.2
68 0.2
69 0.21
70 0.23
71 0.16
72 0.16
73 0.17
74 0.16
75 0.12
76 0.11
77 0.1
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.09
85 0.1
86 0.1
87 0.13
88 0.14
89 0.15
90 0.15
91 0.15
92 0.13
93 0.13
94 0.14
95 0.11
96 0.1
97 0.09
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.06
102 0.05
103 0.05
104 0.06
105 0.07
106 0.06
107 0.07
108 0.07
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.1
113 0.15
114 0.18
115 0.25
116 0.28
117 0.32
118 0.35
119 0.39
120 0.38
121 0.35
122 0.34
123 0.29
124 0.32
125 0.3
126 0.26
127 0.22
128 0.21
129 0.22
130 0.2
131 0.2
132 0.15
133 0.13
134 0.14
135 0.15
136 0.15
137 0.14
138 0.16
139 0.17
140 0.17
141 0.17
142 0.16
143 0.15
144 0.17
145 0.16
146 0.16
147 0.13
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.11
152 0.09
153 0.1
154 0.1
155 0.14
156 0.18
157 0.26
158 0.33
159 0.4
160 0.4
161 0.48
162 0.54
163 0.56
164 0.62
165 0.65
166 0.69
167 0.73
168 0.83
169 0.83
170 0.84
171 0.81
172 0.76
173 0.71
174 0.68
175 0.66
176 0.63
177 0.61
178 0.54
179 0.52
180 0.46
181 0.4
182 0.32
183 0.25
184 0.2
185 0.14
186 0.14
187 0.14
188 0.14
189 0.14
190 0.14
191 0.13
192 0.1
193 0.11
194 0.1
195 0.1
196 0.14
197 0.14
198 0.14
199 0.16
200 0.16
201 0.12
202 0.11
203 0.12
204 0.09
205 0.1
206 0.1
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.1
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.06
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.1
229 0.09
230 0.1
231 0.09
232 0.09
233 0.14
234 0.16
235 0.18
236 0.16
237 0.17
238 0.18
239 0.17
240 0.18
241 0.14
242 0.13
243 0.13
244 0.14
245 0.16
246 0.17
247 0.2
248 0.2
249 0.21
250 0.19
251 0.21
252 0.21
253 0.19
254 0.18
255 0.16
256 0.2
257 0.2
258 0.19
259 0.16
260 0.16
261 0.15
262 0.14
263 0.14
264 0.1
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.07
277 0.06
278 0.09
279 0.12
280 0.13
281 0.14
282 0.15
283 0.17
284 0.22
285 0.25
286 0.28
287 0.27
288 0.32
289 0.3
290 0.3
291 0.3
292 0.27
293 0.29
294 0.23
295 0.25
296 0.2
297 0.2
298 0.2
299 0.2
300 0.19
301 0.14
302 0.14
303 0.14
304 0.14
305 0.15
306 0.16
307 0.16
308 0.15
309 0.17
310 0.17
311 0.14
312 0.13
313 0.13
314 0.12
315 0.12
316 0.18
317 0.17
318 0.16
319 0.17
320 0.21
321 0.23
322 0.23
323 0.22
324 0.15
325 0.15
326 0.17
327 0.15
328 0.12
329 0.1
330 0.11
331 0.11
332 0.11
333 0.12
334 0.11
335 0.12
336 0.12
337 0.13
338 0.14
339 0.14
340 0.16
341 0.17
342 0.15
343 0.14
344 0.15
345 0.13
346 0.11
347 0.1
348 0.08
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.07
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.11
367 0.14
368 0.17
369 0.23
370 0.26
371 0.32
372 0.38
373 0.45
374 0.49
375 0.53
376 0.54
377 0.55
378 0.6
379 0.63
380 0.59
381 0.55