FuNGI

A0A317W1C0

Protein Details

Accession

A0A317W1C0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
384-403	REREQMRRERRQENERQLRQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
224-239	PKFKHKKIPRGPPSPP
339-362	ALAQKAREERRGGGRRDSRGGSRS

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 10, nucl 9.5, cyto 9.5, cysk 3, mito 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017862 SKI-int_prot_SKIP IPR004015 SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF02731 SKIP_SNW

Amino Acid Sequences

MASIAEGLFKSLPKPKHTGEEELPLHAQPRGPRIVGPGQLDETQVVLRRTGPPPYQNRSGWRPRAPEDFGDGGAFPEILVAQYPLDMGRKGTSSTSNALAVQVDAEGKVKYDAIARRGHSDSHIVHASFKDLIPLRQRVDMGEISLDRPSEEEVQLQMEKTKNALASLVDGAVAAQKPKNVRTGKRAEPTFVRYTPANQMGDTERKNDRIMKIVERQQDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAEDQEAWRIPPPVSNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGMQDVTINDKFAQFAEALFTADRHAREEVRLRAQMQQKLAEKEKALKEDHLRALAQKAREERRGGGRRDSRGGSRSPSRSVSRSVTPESVSEGEEAAREREQMRRERRQENERQLRQSRMGTERRIQMMAREQNRDISEKVALGLAKPTQASESMYDSRLFNQTSGMDTGFNEDNPYDKPLFAAQDAINSIYRPRAQADDEDEEAGDGEMNRIQKSNRFEVLGKAKEGFRGADLAESRDGPVQFEKDSDPFGIDTMIADVTAGSGAGQKRYGIQEVDQSGRERGSKRARVDDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.42
3	0.5
4	0.55
5	0.58
6	0.55
7	0.59
8	0.55
9	0.52
10	0.5
11	0.41
12	0.38
13	0.31
14	0.3
15	0.24
16	0.29
17	0.3
18	0.3
19	0.3
20	0.35
21	0.4
22	0.42
23	0.42
24	0.38
25	0.36
26	0.37
27	0.36
28	0.3
29	0.24
30	0.21
31	0.22
32	0.2
33	0.17
34	0.19
35	0.24
36	0.27
37	0.33
38	0.37
39	0.42
40	0.5
41	0.56
42	0.62
43	0.6
44	0.65
45	0.67
46	0.71
47	0.71
48	0.7
49	0.69
50	0.66
51	0.69
52	0.66
53	0.59
54	0.55
55	0.48
56	0.41
57	0.35
58	0.3
59	0.23
60	0.19
61	0.16
62	0.09
63	0.07
64	0.07
65	0.06
66	0.06
67	0.06
68	0.06
69	0.06
70	0.06
71	0.07
72	0.1
73	0.1
74	0.11
75	0.12
76	0.14
77	0.15
78	0.17
79	0.2
80	0.22
81	0.24
82	0.25
83	0.24
84	0.23
85	0.23
86	0.2
87	0.16
88	0.13
89	0.1
90	0.08
91	0.07
92	0.08
93	0.08
94	0.08
95	0.09
96	0.09
97	0.09
98	0.15
99	0.19
100	0.22
101	0.29
102	0.29
103	0.34
104	0.36
105	0.36
106	0.32
107	0.34
108	0.3
109	0.29
110	0.32
111	0.27
112	0.27
113	0.26
114	0.26
115	0.21
116	0.2
117	0.21
118	0.19
119	0.23
120	0.28
121	0.32
122	0.32
123	0.34
124	0.34
125	0.29
126	0.32
127	0.28
128	0.22
129	0.2
130	0.19
131	0.16
132	0.17
133	0.16
134	0.11
135	0.11
136	0.13
137	0.13
138	0.13
139	0.14
140	0.13
141	0.17
142	0.17
143	0.17
144	0.19
145	0.17
146	0.17
147	0.17
148	0.18
149	0.15
150	0.15
151	0.16
152	0.12
153	0.12
154	0.13
155	0.12
156	0.09
157	0.08
158	0.08
159	0.09
160	0.09
161	0.09
162	0.09
163	0.11
164	0.14
165	0.16
166	0.25
167	0.3
168	0.34
169	0.42
170	0.49
171	0.55
172	0.61
173	0.6
174	0.55
175	0.53
176	0.54
177	0.51
178	0.44
179	0.38
180	0.3
181	0.32
182	0.35
183	0.36
184	0.3
185	0.24
186	0.25
187	0.27
188	0.32
189	0.31
190	0.29
191	0.26
192	0.27
193	0.29
194	0.32
195	0.29
196	0.3
197	0.33
198	0.34
199	0.39
200	0.43
201	0.48
202	0.45
203	0.45
204	0.39
205	0.39
206	0.36
207	0.38
208	0.37
209	0.31
210	0.31
211	0.4
212	0.46
213	0.44
214	0.52
215	0.53
216	0.59
217	0.67
218	0.76
219	0.75
220	0.77
221	0.79
222	0.78
223	0.76
224	0.72
225	0.65
226	0.56
227	0.52
228	0.49
229	0.49
230	0.49
231	0.49
232	0.47
233	0.48
234	0.5
235	0.46
236	0.42
237	0.42
238	0.41
239	0.39
240	0.36
241	0.34
242	0.33
243	0.33
244	0.31
245	0.28
246	0.21
247	0.15
248	0.16
249	0.18
250	0.25
251	0.29
252	0.36
253	0.41
254	0.46
255	0.51
256	0.49
257	0.49
258	0.41
259	0.4
260	0.37
261	0.4
262	0.38
263	0.38
264	0.39
265	0.35
266	0.32
267	0.32
268	0.28
269	0.19
270	0.17
271	0.14
272	0.14
273	0.14
274	0.14
275	0.11
276	0.12
277	0.12
278	0.15
279	0.13
280	0.12
281	0.12
282	0.12
283	0.13
284	0.11
285	0.11
286	0.06
287	0.06
288	0.07
289	0.07
290	0.07
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.09
295	0.1
296	0.1
297	0.11
298	0.11
299	0.14
300	0.2
301	0.23
302	0.26
303	0.28
304	0.27
305	0.33
306	0.38
307	0.39
308	0.35
309	0.36
310	0.36
311	0.38
312	0.4
313	0.36
314	0.31
315	0.34
316	0.35
317	0.34
318	0.31
319	0.31
320	0.32
321	0.36
322	0.37
323	0.32
324	0.29
325	0.26
326	0.29
327	0.29
328	0.26
329	0.23
330	0.28
331	0.31
332	0.35
333	0.36
334	0.34
335	0.42
336	0.48
337	0.47
338	0.5
339	0.51
340	0.5
341	0.53
342	0.52
343	0.45
344	0.4
345	0.4
346	0.36
347	0.37
348	0.36
349	0.35
350	0.38
351	0.38
352	0.37
353	0.39
354	0.38
355	0.35
356	0.36
357	0.36
358	0.33
359	0.3
360	0.28
361	0.27
362	0.24
363	0.2
364	0.16
365	0.13
366	0.11
367	0.11
368	0.12
369	0.1
370	0.1
371	0.1
372	0.11
373	0.16
374	0.22
375	0.3
376	0.39
377	0.47
378	0.54
379	0.61
380	0.68
381	0.73
382	0.77
383	0.78
384	0.8
385	0.77
386	0.78
387	0.74
388	0.71
389	0.65
390	0.59
391	0.53
392	0.51
393	0.5
394	0.47
395	0.48
396	0.49
397	0.48
398	0.46
399	0.4
400	0.36
401	0.39
402	0.43
403	0.42
404	0.41
405	0.39
406	0.42
407	0.44
408	0.42
409	0.33
410	0.27
411	0.24
412	0.19
413	0.19
414	0.16
415	0.14
416	0.12
417	0.14
418	0.12
419	0.13
420	0.12
421	0.12
422	0.11
423	0.12
424	0.14
425	0.13
426	0.18
427	0.19
428	0.21
429	0.22
430	0.21
431	0.23
432	0.25
433	0.24
434	0.18
435	0.18
436	0.17
437	0.19
438	0.2
439	0.18
440	0.14
441	0.13
442	0.18
443	0.16
444	0.15
445	0.14
446	0.12
447	0.13
448	0.14
449	0.19
450	0.16
451	0.15
452	0.16
453	0.17
454	0.2
455	0.18
456	0.21
457	0.17
458	0.19
459	0.2
460	0.21
461	0.19
462	0.17
463	0.18
464	0.18
465	0.2
466	0.18
467	0.19
468	0.21
469	0.22
470	0.27
471	0.33
472	0.33
473	0.33
474	0.32
475	0.29
476	0.25
477	0.23
478	0.18
479	0.13
480	0.08
481	0.07
482	0.09
483	0.11
484	0.12
485	0.14
486	0.15
487	0.21
488	0.27
489	0.33
490	0.34
491	0.36
492	0.37
493	0.43
494	0.51
495	0.49
496	0.45
497	0.4
498	0.38
499	0.38
500	0.38
501	0.3
502	0.22
503	0.2
504	0.18
505	0.21
506	0.21
507	0.21
508	0.21
509	0.21
510	0.21
511	0.24
512	0.23
513	0.2
514	0.23
515	0.23
516	0.22
517	0.23
518	0.25
519	0.22
520	0.25
521	0.23
522	0.2
523	0.18
524	0.18
525	0.16
526	0.13
527	0.11
528	0.1
529	0.09
530	0.07
531	0.07
532	0.06
533	0.06
534	0.06
535	0.05
536	0.04
537	0.09
538	0.11
539	0.13
540	0.14
541	0.15
542	0.19
543	0.23
544	0.27
545	0.24
546	0.25
547	0.31
548	0.34
549	0.38
550	0.37
551	0.36
552	0.34
553	0.35
554	0.38
555	0.32
556	0.37
557	0.44
558	0.49
559	0.53

A0A317W1C0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer