FuNGI

A0A317WRA6

Protein Details

Accession

A0A317WRA6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
88-111	GEPAKPTLKYKPRAVNRRSKEERD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
95-154	LKYKPRAVNRRSKEERDAIEKLEAQRHRERLAEAAAIQRGRGTSGPGGRGAGFGARGRGG
168-174	GARRGRG
299-302	KAKA

Subcellular Location(s)

mito 21, nucl 4.5, cyto_nucl 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKASRGRGAATSAGTRSNATANAAPTSATATSTPAPDTTTPGPSTSTRAPVQRLQSLKKRTPSGSIGPSAAASASASAPSGPPGTGEPAKPTLKYKPRAVNRRSKEERDAIEKLEAQRHRERLAEAAAIQRGRGTSGPGGRGAGFGARGRGGMMGSAGPLGAGMAGARRGRGGRFGGDSRHSSMSRSRSVIDLGSGVGGAGGAGYVSSDESDSELRVSIDQINLEGDGEDDEDEEAREVVERKKNGKGKGVVKYADEERGLRPIRVERHEHEERTVSVNMESSTSKSAELREQAKAKAKAKGKGDDGDDDDDALFVVQDEVEEGVKVKDEPKDDDEDHVMVDVPEAPTTDDGFLPVQKVKVRRRLSPPETAESTPQPDTDDAPAVKDPKSLLRTKEDIEEYERHEQDLEIVKDLFQKEPEPEPKETETTPAEGDAPDVVANDQDKGKEKQEDKDDADAEEDHSKDKLAGQLFLMQFPPMTPNLVVPGSNLENNADGAATGTTTGQADGSGGEQQQQQGVKREEGAEMVDGGEDGAATRGSSKVVTASDWGLSAGRAGKLNVHASGRVTMDWGGISFELDRATAVDFLQEALIVSTPPGATDEEFPDDEKKVWAMGQLSGKFTVMPDWSKML

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.32
3	0.28
4	0.26
5	0.24
6	0.23
7	0.21
8	0.21
9	0.23
10	0.22
11	0.23
12	0.22
13	0.21
14	0.18
15	0.2
16	0.17
17	0.15
18	0.13
19	0.15
20	0.17
21	0.18
22	0.19
23	0.16
24	0.19
25	0.19
26	0.24
27	0.24
28	0.28
29	0.28
30	0.27
31	0.3
32	0.28
33	0.33
34	0.32
35	0.35
36	0.34
37	0.38
38	0.42
39	0.45
40	0.5
41	0.51
42	0.53
43	0.56
44	0.61
45	0.65
46	0.68
47	0.69
48	0.7
49	0.65
50	0.64
51	0.63
52	0.61
53	0.58
54	0.54
55	0.47
56	0.4
57	0.38
58	0.31
59	0.24
60	0.16
61	0.1
62	0.08
63	0.07
64	0.07
65	0.07
66	0.07
67	0.08
68	0.09
69	0.1
70	0.09
71	0.09
72	0.11
73	0.17
74	0.2
75	0.21
76	0.24
77	0.29
78	0.32
79	0.33
80	0.35
81	0.39
82	0.45
83	0.51
84	0.56
85	0.59
86	0.68
87	0.76
88	0.81
89	0.81
90	0.8
91	0.84
92	0.83
93	0.79
94	0.77
95	0.74
96	0.7
97	0.67
98	0.62
99	0.54
100	0.5
101	0.47
102	0.42
103	0.43
104	0.41
105	0.4
106	0.44
107	0.46
108	0.44
109	0.43
110	0.41
111	0.36
112	0.36
113	0.31
114	0.25
115	0.26
116	0.27
117	0.24
118	0.23
119	0.2
120	0.17
121	0.17
122	0.16
123	0.15
124	0.17
125	0.21
126	0.23
127	0.22
128	0.24
129	0.22
130	0.22
131	0.19
132	0.14
133	0.12
134	0.11
135	0.12
136	0.11
137	0.11
138	0.11
139	0.11
140	0.1
141	0.08
142	0.08
143	0.06
144	0.06
145	0.06
146	0.05
147	0.04
148	0.04
149	0.04
150	0.03
151	0.03
152	0.02
153	0.03
154	0.07
155	0.07
156	0.08
157	0.09
158	0.11
159	0.12
160	0.17
161	0.18
162	0.18
163	0.22
164	0.24
165	0.27
166	0.3
167	0.32
168	0.31
169	0.33
170	0.31
171	0.28
172	0.32
173	0.34
174	0.35
175	0.34
176	0.3
177	0.27
178	0.28
179	0.27
180	0.21
181	0.15
182	0.11
183	0.09
184	0.08
185	0.06
186	0.05
187	0.04
188	0.03
189	0.02
190	0.02
191	0.02
192	0.02
193	0.02
194	0.02
195	0.02
196	0.03
197	0.03
198	0.04
199	0.05
200	0.06
201	0.06
202	0.07
203	0.07
204	0.07
205	0.08
206	0.09
207	0.09
208	0.1
209	0.1
210	0.09
211	0.09
212	0.09
213	0.09
214	0.07
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.05
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.04
226	0.06
227	0.08
228	0.13
229	0.19
230	0.22
231	0.25
232	0.33
233	0.39
234	0.41
235	0.47
236	0.49
237	0.51
238	0.56
239	0.58
240	0.51
241	0.46
242	0.46
243	0.4
244	0.35
245	0.29
246	0.22
247	0.17
248	0.23
249	0.23
250	0.2
251	0.21
252	0.23
253	0.28
254	0.31
255	0.35
256	0.3
257	0.38
258	0.43
259	0.41
260	0.38
261	0.34
262	0.31
263	0.3
264	0.28
265	0.2
266	0.16
267	0.16
268	0.14
269	0.14
270	0.13
271	0.1
272	0.11
273	0.11
274	0.11
275	0.11
276	0.12
277	0.14
278	0.18
279	0.2
280	0.22
281	0.24
282	0.27
283	0.34
284	0.39
285	0.39
286	0.41
287	0.43
288	0.45
289	0.47
290	0.48
291	0.43
292	0.4
293	0.39
294	0.34
295	0.32
296	0.28
297	0.24
298	0.19
299	0.16
300	0.12
301	0.1
302	0.07
303	0.05
304	0.03
305	0.03
306	0.02
307	0.02
308	0.03
309	0.03
310	0.03
311	0.03
312	0.04
313	0.04
314	0.05
315	0.05
316	0.07
317	0.1
318	0.12
319	0.15
320	0.17
321	0.22
322	0.22
323	0.24
324	0.23
325	0.2
326	0.18
327	0.15
328	0.13
329	0.08
330	0.07
331	0.07
332	0.06
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.07
338	0.08
339	0.06
340	0.07
341	0.08
342	0.08
343	0.09
344	0.1
345	0.11
346	0.14
347	0.22
348	0.27
349	0.37
350	0.4
351	0.45
352	0.53
353	0.62
354	0.63
355	0.65
356	0.62
357	0.57
358	0.57
359	0.51
360	0.45
361	0.36
362	0.35
363	0.26
364	0.22
365	0.19
366	0.16
367	0.16
368	0.15
369	0.17
370	0.14
371	0.15
372	0.17
373	0.17
374	0.17
375	0.17
376	0.16
377	0.18
378	0.23
379	0.26
380	0.27
381	0.31
382	0.34
383	0.34
384	0.38
385	0.33
386	0.3
387	0.31
388	0.31
389	0.29
390	0.34
391	0.33
392	0.28
393	0.27
394	0.25
395	0.24
396	0.29
397	0.25
398	0.19
399	0.19
400	0.2
401	0.23
402	0.24
403	0.21
404	0.14
405	0.15
406	0.16
407	0.24
408	0.31
409	0.32
410	0.33
411	0.36
412	0.38
413	0.39
414	0.36
415	0.33
416	0.26
417	0.23
418	0.22
419	0.18
420	0.16
421	0.13
422	0.13
423	0.09
424	0.08
425	0.07
426	0.07
427	0.06
428	0.07
429	0.07
430	0.08
431	0.09
432	0.11
433	0.15
434	0.18
435	0.22
436	0.29
437	0.31
438	0.37
439	0.44
440	0.48
441	0.47
442	0.5
443	0.47
444	0.39
445	0.38
446	0.31
447	0.26
448	0.23
449	0.2
450	0.15
451	0.14
452	0.14
453	0.13
454	0.14
455	0.17
456	0.14
457	0.15
458	0.15
459	0.22
460	0.22
461	0.23
462	0.21
463	0.17
464	0.15
465	0.14
466	0.16
467	0.1
468	0.12
469	0.11
470	0.11
471	0.14
472	0.15
473	0.14
474	0.12
475	0.16
476	0.16
477	0.17
478	0.17
479	0.14
480	0.14
481	0.15
482	0.14
483	0.09
484	0.07
485	0.07
486	0.06
487	0.05
488	0.05
489	0.05
490	0.06
491	0.06
492	0.06
493	0.05
494	0.05
495	0.06
496	0.06
497	0.07
498	0.09
499	0.08
500	0.11
501	0.12
502	0.13
503	0.17
504	0.19
505	0.22
506	0.28
507	0.31
508	0.3
509	0.31
510	0.32
511	0.29
512	0.27
513	0.25
514	0.17
515	0.14
516	0.12
517	0.1
518	0.08
519	0.07
520	0.06
521	0.04
522	0.04
523	0.04
524	0.04
525	0.04
526	0.06
527	0.06
528	0.07
529	0.08
530	0.08
531	0.1
532	0.11
533	0.13
534	0.14
535	0.15
536	0.15
537	0.15
538	0.15
539	0.12
540	0.11
541	0.12
542	0.13
543	0.13
544	0.14
545	0.14
546	0.18
547	0.22
548	0.25
549	0.27
550	0.26
551	0.25
552	0.26
553	0.29
554	0.26
555	0.22
556	0.2
557	0.17
558	0.16
559	0.15
560	0.13
561	0.11
562	0.1
563	0.11
564	0.09
565	0.1
566	0.1
567	0.09
568	0.09
569	0.08
570	0.1
571	0.1
572	0.09
573	0.1
574	0.09
575	0.1
576	0.1
577	0.09
578	0.07
579	0.07
580	0.08
581	0.07
582	0.07
583	0.08
584	0.08
585	0.08
586	0.1
587	0.11
588	0.12
589	0.15
590	0.19
591	0.22
592	0.23
593	0.24
594	0.26
595	0.26
596	0.26
597	0.24
598	0.21
599	0.18
600	0.18
601	0.2
602	0.19
603	0.23
604	0.3
605	0.31
606	0.33
607	0.33
608	0.32
609	0.28
610	0.27
611	0.26
612	0.22
613	0.22

A0A317WRA6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer