Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317WMD5

Protein Details
Accession A0A317WMD5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-38GVPRVASKTRYPNQRRDSSPHydrophilic
696-717EETSEKLDRRRNRKSLIANPLDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 9, mito 8, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024420  TRAPP_III_complex_Trs85  
Pfam View protein in Pfam  
PF12739  TRAPPC-Trs85  
Amino Acid Sequences MTSPGDAAPVKPPPSFSPGVPRVASKTRYPNQRRDSSPSLDADLGDSRLRSSPTPPLSATTSDLPIRSASPRPQSFRSSTPQLARSSLGSPVEGRFEGSEEIRSLIIRSFSPVVGVCASADTDELVRQKGFAGGFWELIRPFGENIPGKIVIRDSVGASRGWEDFGVRFVDLAGKTPTPNDSSAGRSSSLAQVEDVLDKQLGSTDDPLGGSLRPKDFLSFPTTSPLYKVFLRQLLSISSATPHETFRHPVASIIAISSRNTAPLETLRQLYADTNNGNKKVPDWVHPEYLRYYVLVHDEDRDDIAESTKLYDQMKRHFGLHCHLLRLRSNQCVVTDDDSAQVPECEWQSPAERLSGRIEPLVDLDTNGLLYLFESDVMAIKAFVRELVAQSVIPYMENRVAVWNDQVASRRRGISGRFMSMSRRWAGFGSGSRSSLTAGGASGNYDLSHGYYKADTPEAVLRKMADFAFMLRDWKLSASTYELLRSDYANDKAWRYHAGAYEMCAVSMLLNPSAIGTKMKLDGVDQMFDTACYSYLTRCSDAPNALRCLTLAMELLKSRGGSAVESAARWAMRAMDLGLVGPIGQGLFSERVSACYAARAPVSGMKWGSRHRKAGMWSVFAADAWLRLGKPSLASASLEEAERLYADVLDADGSFPMPEMQTFIDNLRHAVKVEYLEARGLDTRDETTTAEALGTEETSEKLDRRRNRKSLIANPLDLGGLGPAQGPRDNDNAANDDFERA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.4
3 0.36
4 0.4
5 0.41
6 0.47
7 0.45
8 0.43
9 0.42
10 0.48
11 0.5
12 0.47
13 0.52
14 0.54
15 0.64
16 0.7
17 0.74
18 0.76
19 0.81
20 0.79
21 0.78
22 0.77
23 0.72
24 0.69
25 0.61
26 0.55
27 0.46
28 0.4
29 0.34
30 0.29
31 0.25
32 0.21
33 0.19
34 0.17
35 0.19
36 0.21
37 0.2
38 0.22
39 0.29
40 0.33
41 0.37
42 0.36
43 0.36
44 0.38
45 0.39
46 0.38
47 0.32
48 0.31
49 0.29
50 0.28
51 0.25
52 0.23
53 0.23
54 0.24
55 0.27
56 0.31
57 0.39
58 0.46
59 0.51
60 0.55
61 0.59
62 0.6
63 0.59
64 0.59
65 0.57
66 0.57
67 0.57
68 0.58
69 0.53
70 0.51
71 0.46
72 0.41
73 0.35
74 0.33
75 0.27
76 0.22
77 0.21
78 0.2
79 0.23
80 0.2
81 0.2
82 0.16
83 0.16
84 0.18
85 0.17
86 0.18
87 0.15
88 0.17
89 0.16
90 0.15
91 0.15
92 0.14
93 0.15
94 0.13
95 0.16
96 0.17
97 0.16
98 0.18
99 0.18
100 0.17
101 0.16
102 0.16
103 0.12
104 0.11
105 0.11
106 0.09
107 0.09
108 0.07
109 0.07
110 0.1
111 0.12
112 0.13
113 0.13
114 0.13
115 0.13
116 0.16
117 0.16
118 0.14
119 0.16
120 0.16
121 0.17
122 0.18
123 0.2
124 0.16
125 0.17
126 0.16
127 0.13
128 0.13
129 0.13
130 0.2
131 0.2
132 0.21
133 0.24
134 0.25
135 0.24
136 0.24
137 0.24
138 0.17
139 0.17
140 0.17
141 0.14
142 0.15
143 0.16
144 0.15
145 0.15
146 0.16
147 0.15
148 0.14
149 0.13
150 0.11
151 0.11
152 0.13
153 0.13
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.15
158 0.13
159 0.16
160 0.17
161 0.16
162 0.17
163 0.18
164 0.2
165 0.18
166 0.19
167 0.18
168 0.18
169 0.21
170 0.23
171 0.24
172 0.22
173 0.2
174 0.21
175 0.23
176 0.23
177 0.19
178 0.16
179 0.15
180 0.15
181 0.16
182 0.14
183 0.11
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.12
191 0.11
192 0.12
193 0.12
194 0.13
195 0.11
196 0.11
197 0.12
198 0.14
199 0.15
200 0.16
201 0.16
202 0.18
203 0.18
204 0.2
205 0.24
206 0.22
207 0.22
208 0.25
209 0.26
210 0.24
211 0.24
212 0.24
213 0.2
214 0.19
215 0.22
216 0.2
217 0.24
218 0.25
219 0.24
220 0.24
221 0.22
222 0.23
223 0.2
224 0.16
225 0.13
226 0.12
227 0.14
228 0.13
229 0.14
230 0.14
231 0.16
232 0.19
233 0.19
234 0.22
235 0.19
236 0.19
237 0.19
238 0.18
239 0.15
240 0.13
241 0.13
242 0.11
243 0.11
244 0.13
245 0.11
246 0.12
247 0.12
248 0.11
249 0.11
250 0.13
251 0.17
252 0.17
253 0.18
254 0.16
255 0.16
256 0.17
257 0.17
258 0.16
259 0.15
260 0.14
261 0.19
262 0.23
263 0.24
264 0.24
265 0.23
266 0.22
267 0.26
268 0.26
269 0.27
270 0.3
271 0.33
272 0.38
273 0.39
274 0.4
275 0.34
276 0.33
277 0.28
278 0.2
279 0.17
280 0.12
281 0.14
282 0.13
283 0.12
284 0.12
285 0.12
286 0.13
287 0.12
288 0.11
289 0.1
290 0.09
291 0.09
292 0.08
293 0.08
294 0.09
295 0.1
296 0.12
297 0.13
298 0.17
299 0.19
300 0.25
301 0.3
302 0.29
303 0.3
304 0.3
305 0.31
306 0.31
307 0.35
308 0.3
309 0.29
310 0.29
311 0.3
312 0.3
313 0.35
314 0.34
315 0.29
316 0.3
317 0.27
318 0.26
319 0.26
320 0.24
321 0.21
322 0.19
323 0.16
324 0.15
325 0.14
326 0.13
327 0.11
328 0.09
329 0.06
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.09
335 0.11
336 0.12
337 0.13
338 0.14
339 0.14
340 0.15
341 0.18
342 0.18
343 0.16
344 0.15
345 0.15
346 0.12
347 0.12
348 0.12
349 0.09
350 0.07
351 0.07
352 0.06
353 0.06
354 0.05
355 0.04
356 0.03
357 0.03
358 0.04
359 0.03
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.05
365 0.05
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.06
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.08
379 0.07
380 0.07
381 0.06
382 0.06
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.09
387 0.1
388 0.1
389 0.11
390 0.1
391 0.09
392 0.1
393 0.15
394 0.16
395 0.18
396 0.19
397 0.2
398 0.2
399 0.23
400 0.23
401 0.28
402 0.27
403 0.27
404 0.27
405 0.26
406 0.29
407 0.29
408 0.31
409 0.23
410 0.21
411 0.19
412 0.18
413 0.19
414 0.17
415 0.18
416 0.19
417 0.19
418 0.19
419 0.19
420 0.18
421 0.18
422 0.16
423 0.13
424 0.08
425 0.07
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.06
435 0.07
436 0.07
437 0.08
438 0.08
439 0.09
440 0.1
441 0.11
442 0.1
443 0.1
444 0.16
445 0.17
446 0.18
447 0.17
448 0.16
449 0.16
450 0.18
451 0.16
452 0.11
453 0.09
454 0.09
455 0.12
456 0.12
457 0.13
458 0.11
459 0.12
460 0.11
461 0.11
462 0.12
463 0.09
464 0.1
465 0.12
466 0.14
467 0.14
468 0.16
469 0.16
470 0.16
471 0.16
472 0.15
473 0.14
474 0.16
475 0.18
476 0.22
477 0.23
478 0.23
479 0.24
480 0.25
481 0.26
482 0.23
483 0.25
484 0.22
485 0.24
486 0.23
487 0.24
488 0.27
489 0.24
490 0.21
491 0.17
492 0.15
493 0.11
494 0.13
495 0.12
496 0.07
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.08
501 0.08
502 0.07
503 0.07
504 0.09
505 0.1
506 0.11
507 0.11
508 0.11
509 0.17
510 0.18
511 0.18
512 0.16
513 0.16
514 0.15
515 0.15
516 0.15
517 0.09
518 0.08
519 0.08
520 0.08
521 0.08
522 0.14
523 0.16
524 0.17
525 0.18
526 0.21
527 0.23
528 0.28
529 0.32
530 0.32
531 0.33
532 0.32
533 0.31
534 0.28
535 0.25
536 0.21
537 0.16
538 0.13
539 0.1
540 0.11
541 0.12
542 0.12
543 0.12
544 0.11
545 0.11
546 0.12
547 0.11
548 0.1
549 0.11
550 0.15
551 0.14
552 0.14
553 0.15
554 0.14
555 0.14
556 0.13
557 0.12
558 0.09
559 0.09
560 0.09
561 0.1
562 0.09
563 0.09
564 0.09
565 0.08
566 0.07
567 0.06
568 0.05
569 0.05
570 0.03
571 0.03
572 0.03
573 0.06
574 0.07
575 0.08
576 0.11
577 0.11
578 0.14
579 0.16
580 0.17
581 0.15
582 0.17
583 0.18
584 0.17
585 0.17
586 0.15
587 0.15
588 0.18
589 0.2
590 0.2
591 0.21
592 0.22
593 0.26
594 0.34
595 0.43
596 0.45
597 0.49
598 0.48
599 0.52
600 0.53
601 0.59
602 0.55
603 0.48
604 0.42
605 0.38
606 0.36
607 0.3
608 0.27
609 0.17
610 0.12
611 0.1
612 0.11
613 0.09
614 0.1
615 0.12
616 0.11
617 0.12
618 0.14
619 0.15
620 0.15
621 0.16
622 0.16
623 0.18
624 0.18
625 0.17
626 0.15
627 0.13
628 0.12
629 0.12
630 0.11
631 0.08
632 0.06
633 0.06
634 0.06
635 0.06
636 0.07
637 0.06
638 0.06
639 0.06
640 0.06
641 0.06
642 0.06
643 0.07
644 0.07
645 0.07
646 0.09
647 0.1
648 0.12
649 0.13
650 0.15
651 0.19
652 0.19
653 0.21
654 0.22
655 0.22
656 0.21
657 0.21
658 0.22
659 0.19
660 0.22
661 0.23
662 0.22
663 0.22
664 0.22
665 0.22
666 0.22
667 0.21
668 0.18
669 0.17
670 0.18
671 0.18
672 0.19
673 0.18
674 0.18
675 0.18
676 0.16
677 0.14
678 0.12
679 0.11
680 0.11
681 0.1
682 0.08
683 0.08
684 0.09
685 0.11
686 0.14
687 0.16
688 0.23
689 0.32
690 0.41
691 0.51
692 0.61
693 0.67
694 0.72
695 0.78
696 0.8
697 0.81
698 0.83
699 0.79
700 0.7
701 0.62
702 0.56
703 0.46
704 0.36
705 0.26
706 0.16
707 0.09
708 0.07
709 0.08
710 0.09
711 0.11
712 0.14
713 0.17
714 0.19
715 0.24
716 0.26
717 0.27
718 0.3
719 0.32
720 0.3
721 0.3