Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317V2D6

Protein Details
Accession A0A317V2D6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
419-441EQIYKEKNVRGNKGPPRPRPKGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
425-441KNVRGNKGPPRPRPKGR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 8, nucl 7.5, cyto 7.5, cysk 5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024337  tRNA_splic_suSen54  
IPR024336  tRNA_splic_suSen54_N  
Gene Ontology GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF12928  tRNA_int_end_N2  
Amino Acid Sequences MADTDEAAINLPAQDAGAHIEVDLSDETQDFRMLNSISFLTDGSQTSLPKRGEKDFEPNPTLFQADILSASRQAMHNALSYPRLHHPKHHVTGVYAPNGPTPPRSAQTIETTISEESQAKKPATTEVGVPAESCVYISAPKGQLFKTIGQADRWNRIWLLPEEALYLLERGSLDIRWPCSEVGDGDEDGTEDSGIPMSLQAAYAAFMGRSGLTSERFSVYTGLRRLGYTITRAPGWYNEEEGADVSESEQTSLMRQQGPGLAGIFGRFLQWLYRPDEPTTALGPVAGLGFHRSYEEIYRKLSIIPWYDPTTAPSPAPRTTPPYRVVFHIYKPSTPFKKSAPPVPDFRIAVVNARTHTTFPLLSQLGALLESTPLDPPTERMSRQLYMRLRHGYRNVILAVVDEGVVSYLRIADSAFGKEQIYKEKNVRGNKGPPRPRPKGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.06
3 0.1
4 0.1
5 0.1
6 0.09
7 0.1
8 0.1
9 0.12
10 0.12
11 0.09
12 0.09
13 0.09
14 0.11
15 0.11
16 0.13
17 0.1
18 0.1
19 0.15
20 0.15
21 0.15
22 0.16
23 0.16
24 0.15
25 0.15
26 0.15
27 0.11
28 0.13
29 0.14
30 0.15
31 0.17
32 0.18
33 0.21
34 0.29
35 0.29
36 0.33
37 0.36
38 0.39
39 0.43
40 0.45
41 0.52
42 0.51
43 0.57
44 0.56
45 0.52
46 0.48
47 0.43
48 0.4
49 0.3
50 0.23
51 0.16
52 0.12
53 0.13
54 0.13
55 0.12
56 0.12
57 0.12
58 0.14
59 0.14
60 0.15
61 0.15
62 0.15
63 0.16
64 0.17
65 0.18
66 0.2
67 0.2
68 0.23
69 0.3
70 0.36
71 0.36
72 0.41
73 0.49
74 0.56
75 0.6
76 0.61
77 0.54
78 0.48
79 0.55
80 0.52
81 0.46
82 0.38
83 0.33
84 0.3
85 0.31
86 0.29
87 0.23
88 0.22
89 0.23
90 0.23
91 0.26
92 0.26
93 0.27
94 0.32
95 0.34
96 0.3
97 0.27
98 0.27
99 0.24
100 0.22
101 0.2
102 0.17
103 0.17
104 0.21
105 0.25
106 0.24
107 0.25
108 0.25
109 0.27
110 0.28
111 0.25
112 0.21
113 0.22
114 0.23
115 0.22
116 0.21
117 0.17
118 0.15
119 0.13
120 0.12
121 0.07
122 0.06
123 0.07
124 0.07
125 0.12
126 0.14
127 0.17
128 0.2
129 0.19
130 0.24
131 0.26
132 0.27
133 0.28
134 0.3
135 0.29
136 0.29
137 0.36
138 0.34
139 0.38
140 0.38
141 0.33
142 0.28
143 0.28
144 0.3
145 0.24
146 0.26
147 0.2
148 0.19
149 0.18
150 0.18
151 0.17
152 0.13
153 0.12
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.06
160 0.09
161 0.11
162 0.13
163 0.14
164 0.15
165 0.14
166 0.14
167 0.15
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.1
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.05
178 0.03
179 0.04
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.05
198 0.06
199 0.08
200 0.09
201 0.1
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.12
206 0.12
207 0.16
208 0.17
209 0.17
210 0.16
211 0.16
212 0.16
213 0.16
214 0.16
215 0.14
216 0.15
217 0.15
218 0.14
219 0.15
220 0.15
221 0.15
222 0.18
223 0.15
224 0.14
225 0.14
226 0.13
227 0.13
228 0.13
229 0.11
230 0.07
231 0.06
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.07
237 0.06
238 0.08
239 0.1
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.14
245 0.15
246 0.14
247 0.12
248 0.1
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.05
256 0.07
257 0.1
258 0.14
259 0.17
260 0.22
261 0.24
262 0.25
263 0.26
264 0.26
265 0.25
266 0.22
267 0.19
268 0.14
269 0.12
270 0.1
271 0.09
272 0.07
273 0.05
274 0.04
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.09
281 0.15
282 0.19
283 0.19
284 0.21
285 0.23
286 0.22
287 0.23
288 0.25
289 0.24
290 0.23
291 0.23
292 0.25
293 0.28
294 0.29
295 0.29
296 0.29
297 0.27
298 0.25
299 0.23
300 0.23
301 0.24
302 0.24
303 0.27
304 0.26
305 0.31
306 0.34
307 0.4
308 0.41
309 0.42
310 0.41
311 0.41
312 0.46
313 0.41
314 0.41
315 0.44
316 0.41
317 0.39
318 0.42
319 0.48
320 0.47
321 0.46
322 0.46
323 0.4
324 0.49
325 0.5
326 0.54
327 0.52
328 0.5
329 0.53
330 0.55
331 0.56
332 0.47
333 0.44
334 0.4
335 0.33
336 0.34
337 0.31
338 0.29
339 0.24
340 0.26
341 0.25
342 0.22
343 0.23
344 0.21
345 0.18
346 0.15
347 0.22
348 0.2
349 0.19
350 0.18
351 0.17
352 0.14
353 0.14
354 0.13
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.07
359 0.08
360 0.08
361 0.09
362 0.1
363 0.12
364 0.19
365 0.24
366 0.24
367 0.28
368 0.33
369 0.35
370 0.38
371 0.45
372 0.45
373 0.45
374 0.51
375 0.55
376 0.53
377 0.57
378 0.59
379 0.57
380 0.52
381 0.51
382 0.44
383 0.36
384 0.32
385 0.26
386 0.22
387 0.15
388 0.12
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.06
394 0.05
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.08
400 0.11
401 0.15
402 0.16
403 0.17
404 0.18
405 0.22
406 0.25
407 0.33
408 0.34
409 0.36
410 0.42
411 0.49
412 0.56
413 0.61
414 0.66
415 0.64
416 0.71
417 0.75
418 0.79
419 0.8
420 0.83
421 0.85