Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317WH70

Protein Details
Accession A0A317WH70    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
331-357DEYFKGKEDKSKREKQRKEKNVLEVDMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
154-166APRVGKRDAPKEV
171-171R
175-181TPRRGGR
200-200R
202-202K
208-218KDAQRRGFRAR
335-350KGKEDKSKREKQRKEK
363-392PRGGASGPRGRGGRGGRGARGGRGAGPRTE
Subcellular Location(s) mito 22, extr 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MAEIRSKVRCSRGLLNFSLGCWRRIRELGGAAAPSGFLDRVGRSHLKASGVGRRNLQFPAPIRGTSTSFLVMLALPSLPASPPEFTLFCNTHRVFPSLDFVRILRIRLHPASGKRTAFLTSCVLFSRCAATGNDPELDPNRAPEPPTKAVDRPAPRVGKRDAPKEVPSQPRENNTPRRGGRATGNEAAFRDRNAGRSNNREKPTEDGKDAQRRGFRAREDRGERVRHDRQSRTGQTDTRKQVNQGWGNQSGEKTLDDEKAGENIAHNEESEPQTPAEPEEPADKSKSYNDYLAEKAAQGDLSAKPVRAANEGSKLDKKWAAAKELKRTEEDEYFKGKEDKSKREKQRKEKNVLEVDMRFVEAPRGGASGPRGRGGRGGRGARGGRGAGPRTERPTGAAPASVSVDEKNFPSLGGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.6
3 0.54
4 0.48
5 0.52
6 0.44
7 0.38
8 0.35
9 0.34
10 0.33
11 0.36
12 0.39
13 0.34
14 0.37
15 0.38
16 0.37
17 0.35
18 0.3
19 0.26
20 0.23
21 0.17
22 0.14
23 0.1
24 0.07
25 0.09
26 0.1
27 0.12
28 0.19
29 0.22
30 0.22
31 0.26
32 0.29
33 0.29
34 0.32
35 0.35
36 0.38
37 0.42
38 0.44
39 0.45
40 0.45
41 0.45
42 0.43
43 0.4
44 0.36
45 0.33
46 0.38
47 0.35
48 0.33
49 0.33
50 0.34
51 0.35
52 0.3
53 0.29
54 0.21
55 0.19
56 0.18
57 0.16
58 0.13
59 0.1
60 0.09
61 0.07
62 0.06
63 0.06
64 0.07
65 0.06
66 0.08
67 0.1
68 0.1
69 0.12
70 0.15
71 0.16
72 0.17
73 0.23
74 0.23
75 0.23
76 0.32
77 0.31
78 0.33
79 0.35
80 0.35
81 0.3
82 0.3
83 0.35
84 0.28
85 0.29
86 0.25
87 0.22
88 0.28
89 0.28
90 0.28
91 0.25
92 0.25
93 0.3
94 0.3
95 0.34
96 0.32
97 0.36
98 0.42
99 0.44
100 0.42
101 0.36
102 0.36
103 0.35
104 0.3
105 0.27
106 0.24
107 0.18
108 0.19
109 0.19
110 0.19
111 0.17
112 0.17
113 0.17
114 0.13
115 0.14
116 0.14
117 0.16
118 0.19
119 0.21
120 0.21
121 0.18
122 0.19
123 0.19
124 0.21
125 0.18
126 0.16
127 0.16
128 0.16
129 0.18
130 0.21
131 0.26
132 0.28
133 0.3
134 0.32
135 0.31
136 0.35
137 0.41
138 0.41
139 0.39
140 0.43
141 0.47
142 0.45
143 0.49
144 0.48
145 0.48
146 0.49
147 0.5
148 0.48
149 0.46
150 0.48
151 0.48
152 0.53
153 0.53
154 0.52
155 0.52
156 0.5
157 0.5
158 0.53
159 0.56
160 0.57
161 0.53
162 0.57
163 0.51
164 0.54
165 0.5
166 0.46
167 0.43
168 0.4
169 0.42
170 0.38
171 0.38
172 0.32
173 0.31
174 0.32
175 0.26
176 0.2
177 0.19
178 0.15
179 0.17
180 0.2
181 0.25
182 0.25
183 0.35
184 0.43
185 0.47
186 0.49
187 0.48
188 0.45
189 0.45
190 0.49
191 0.42
192 0.37
193 0.33
194 0.37
195 0.43
196 0.44
197 0.42
198 0.37
199 0.36
200 0.39
201 0.39
202 0.37
203 0.37
204 0.4
205 0.45
206 0.47
207 0.51
208 0.52
209 0.52
210 0.5
211 0.5
212 0.53
213 0.52
214 0.53
215 0.51
216 0.51
217 0.56
218 0.58
219 0.55
220 0.52
221 0.49
222 0.48
223 0.53
224 0.52
225 0.49
226 0.45
227 0.41
228 0.43
229 0.47
230 0.47
231 0.43
232 0.43
233 0.4
234 0.4
235 0.39
236 0.34
237 0.26
238 0.22
239 0.17
240 0.14
241 0.13
242 0.13
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.13
247 0.13
248 0.11
249 0.09
250 0.1
251 0.12
252 0.11
253 0.11
254 0.1
255 0.13
256 0.16
257 0.16
258 0.15
259 0.14
260 0.14
261 0.14
262 0.15
263 0.14
264 0.11
265 0.11
266 0.14
267 0.16
268 0.17
269 0.19
270 0.18
271 0.18
272 0.22
273 0.26
274 0.23
275 0.25
276 0.25
277 0.27
278 0.28
279 0.28
280 0.24
281 0.2
282 0.18
283 0.16
284 0.13
285 0.1
286 0.11
287 0.1
288 0.15
289 0.16
290 0.15
291 0.16
292 0.18
293 0.2
294 0.2
295 0.23
296 0.21
297 0.28
298 0.3
299 0.33
300 0.36
301 0.35
302 0.36
303 0.35
304 0.33
305 0.32
306 0.34
307 0.37
308 0.42
309 0.47
310 0.53
311 0.58
312 0.59
313 0.54
314 0.53
315 0.5
316 0.49
317 0.47
318 0.4
319 0.39
320 0.38
321 0.39
322 0.41
323 0.37
324 0.39
325 0.43
326 0.49
327 0.54
328 0.63
329 0.71
330 0.78
331 0.86
332 0.88
333 0.91
334 0.91
335 0.91
336 0.89
337 0.88
338 0.84
339 0.77
340 0.72
341 0.62
342 0.55
343 0.46
344 0.39
345 0.29
346 0.21
347 0.21
348 0.16
349 0.16
350 0.13
351 0.13
352 0.12
353 0.15
354 0.2
355 0.25
356 0.26
357 0.29
358 0.29
359 0.29
360 0.36
361 0.37
362 0.4
363 0.42
364 0.44
365 0.42
366 0.49
367 0.5
368 0.46
369 0.45
370 0.37
371 0.34
372 0.37
373 0.38
374 0.36
375 0.41
376 0.44
377 0.47
378 0.5
379 0.45
380 0.42
381 0.44
382 0.43
383 0.38
384 0.34
385 0.28
386 0.27
387 0.29
388 0.25
389 0.21
390 0.18
391 0.18
392 0.18
393 0.18
394 0.19
395 0.17