Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1E1T0

Protein Details
Accession A0A0D1E1T0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
561-584GDGGYRRERSPDRRDDNRRYDSGQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
548-569GPRHDRERSPGRGGDGGYRRER
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034156  Hrp1_RRM1  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006417  P:regulation of translation  
KEGG uma:UMAG_02420  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12577  RRM1_Hrp1p  
Amino Acid Sequences MASQEDTDDLYADLYGAATSEAGDEAFPRGEGGDDKAHAGDEQDLTGYEDSNNKNGNSSEKAEEKPTVAASTGSFIPPASSAPAQQSDTGLQIKGSFIPPPVVNSPAAHSQSDVRDLTPASHNDASSNQQSLSHQTQVADDRGEGQNAGTERQGLDNRSAMPHEMPEEGKMFIGGLNWDTTEDSLRRYFSQFGEVGNCAIMRDNMTGRSRGFAFLNFVDPKAVNTVMVREHYLDGKVIDPKRAIPRPQHNQQGGGHHNNYNNGGGGGGGGGSYSASSQKLFVGGLPPSVTPATFRTFFEQFGTLSDCTCMMDRETGKPRGFGFLTYADDSSLNHVLNTRPIVFDGKEVDVKRAQSKNDPQSLQIRRQQRMDNPEMAYGMQQGGAGARFNNYNTGASGGGGGMGGNAWQMNPMMMGMMGQGGDMSQMYQNMGWGNQNWNPQMAWQQMMASMAGNTGGGMDMGAMMNNMGMMGSMGGTMGSMGGMGSMSPPSMKQSMSPTVNAASAVPTGASAGGDDRTERSGSASAPSSSRQQRGGSVHNGASRPPPMGPRHDRERSPGRGGDGGYRRERSPDRRDDNRRYDSGQRNRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.06
3 0.05
4 0.05
5 0.05
6 0.05
7 0.05
8 0.06
9 0.06
10 0.06
11 0.06
12 0.09
13 0.09
14 0.09
15 0.09
16 0.09
17 0.1
18 0.12
19 0.15
20 0.18
21 0.18
22 0.2
23 0.2
24 0.2
25 0.19
26 0.18
27 0.18
28 0.14
29 0.14
30 0.13
31 0.13
32 0.15
33 0.15
34 0.15
35 0.12
36 0.18
37 0.2
38 0.25
39 0.28
40 0.26
41 0.29
42 0.29
43 0.34
44 0.32
45 0.34
46 0.34
47 0.36
48 0.38
49 0.39
50 0.4
51 0.36
52 0.33
53 0.3
54 0.26
55 0.21
56 0.2
57 0.16
58 0.17
59 0.17
60 0.14
61 0.13
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.12
66 0.13
67 0.13
68 0.14
69 0.18
70 0.23
71 0.23
72 0.23
73 0.24
74 0.21
75 0.24
76 0.24
77 0.2
78 0.16
79 0.15
80 0.16
81 0.16
82 0.16
83 0.14
84 0.13
85 0.18
86 0.18
87 0.22
88 0.23
89 0.23
90 0.23
91 0.22
92 0.25
93 0.28
94 0.3
95 0.25
96 0.24
97 0.26
98 0.27
99 0.31
100 0.28
101 0.21
102 0.21
103 0.21
104 0.23
105 0.25
106 0.24
107 0.25
108 0.26
109 0.26
110 0.25
111 0.27
112 0.29
113 0.26
114 0.26
115 0.2
116 0.2
117 0.21
118 0.26
119 0.28
120 0.26
121 0.25
122 0.23
123 0.26
124 0.28
125 0.29
126 0.23
127 0.19
128 0.2
129 0.2
130 0.19
131 0.16
132 0.13
133 0.14
134 0.14
135 0.15
136 0.11
137 0.11
138 0.11
139 0.16
140 0.19
141 0.17
142 0.19
143 0.2
144 0.21
145 0.22
146 0.22
147 0.19
148 0.17
149 0.16
150 0.16
151 0.15
152 0.15
153 0.15
154 0.16
155 0.14
156 0.13
157 0.12
158 0.1
159 0.08
160 0.09
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.11
169 0.1
170 0.13
171 0.14
172 0.16
173 0.17
174 0.19
175 0.21
176 0.19
177 0.24
178 0.21
179 0.21
180 0.22
181 0.21
182 0.19
183 0.16
184 0.15
185 0.1
186 0.1
187 0.09
188 0.08
189 0.09
190 0.1
191 0.15
192 0.17
193 0.19
194 0.18
195 0.2
196 0.19
197 0.19
198 0.18
199 0.14
200 0.16
201 0.15
202 0.2
203 0.18
204 0.18
205 0.17
206 0.17
207 0.16
208 0.16
209 0.15
210 0.1
211 0.1
212 0.11
213 0.12
214 0.13
215 0.13
216 0.12
217 0.12
218 0.13
219 0.13
220 0.12
221 0.11
222 0.12
223 0.18
224 0.17
225 0.19
226 0.18
227 0.22
228 0.3
229 0.35
230 0.37
231 0.39
232 0.48
233 0.54
234 0.61
235 0.65
236 0.58
237 0.57
238 0.55
239 0.54
240 0.49
241 0.46
242 0.41
243 0.35
244 0.35
245 0.33
246 0.31
247 0.24
248 0.19
249 0.14
250 0.11
251 0.08
252 0.06
253 0.05
254 0.03
255 0.03
256 0.02
257 0.02
258 0.02
259 0.02
260 0.03
261 0.04
262 0.04
263 0.05
264 0.06
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.08
271 0.09
272 0.09
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.07
278 0.1
279 0.12
280 0.13
281 0.14
282 0.16
283 0.17
284 0.18
285 0.18
286 0.17
287 0.14
288 0.13
289 0.16
290 0.12
291 0.11
292 0.11
293 0.1
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.06
298 0.1
299 0.12
300 0.18
301 0.24
302 0.29
303 0.3
304 0.31
305 0.31
306 0.3
307 0.29
308 0.24
309 0.2
310 0.16
311 0.18
312 0.17
313 0.17
314 0.14
315 0.14
316 0.13
317 0.14
318 0.13
319 0.11
320 0.1
321 0.11
322 0.11
323 0.13
324 0.15
325 0.13
326 0.11
327 0.12
328 0.14
329 0.13
330 0.14
331 0.15
332 0.14
333 0.18
334 0.19
335 0.21
336 0.21
337 0.22
338 0.28
339 0.29
340 0.29
341 0.32
342 0.41
343 0.46
344 0.51
345 0.5
346 0.45
347 0.51
348 0.54
349 0.53
350 0.5
351 0.5
352 0.46
353 0.5
354 0.53
355 0.49
356 0.53
357 0.51
358 0.5
359 0.43
360 0.41
361 0.37
362 0.32
363 0.26
364 0.18
365 0.13
366 0.08
367 0.07
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.07
374 0.07
375 0.08
376 0.11
377 0.11
378 0.11
379 0.11
380 0.13
381 0.12
382 0.11
383 0.11
384 0.08
385 0.07
386 0.06
387 0.05
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.03
403 0.04
404 0.04
405 0.03
406 0.03
407 0.03
408 0.04
409 0.03
410 0.04
411 0.05
412 0.05
413 0.06
414 0.06
415 0.08
416 0.08
417 0.09
418 0.1
419 0.11
420 0.15
421 0.19
422 0.24
423 0.23
424 0.24
425 0.23
426 0.23
427 0.27
428 0.24
429 0.22
430 0.17
431 0.17
432 0.17
433 0.17
434 0.16
435 0.1
436 0.08
437 0.07
438 0.06
439 0.06
440 0.05
441 0.04
442 0.04
443 0.03
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.03
451 0.03
452 0.03
453 0.03
454 0.03
455 0.02
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.03
461 0.03
462 0.03
463 0.03
464 0.03
465 0.03
466 0.02
467 0.02
468 0.03
469 0.03
470 0.03
471 0.04
472 0.04
473 0.05
474 0.05
475 0.06
476 0.1
477 0.12
478 0.12
479 0.14
480 0.21
481 0.29
482 0.32
483 0.32
484 0.31
485 0.3
486 0.31
487 0.28
488 0.22
489 0.15
490 0.12
491 0.11
492 0.09
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.06
497 0.05
498 0.06
499 0.08
500 0.08
501 0.09
502 0.11
503 0.13
504 0.14
505 0.13
506 0.15
507 0.16
508 0.16
509 0.19
510 0.21
511 0.2
512 0.22
513 0.24
514 0.3
515 0.34
516 0.37
517 0.38
518 0.37
519 0.42
520 0.46
521 0.51
522 0.48
523 0.47
524 0.47
525 0.48
526 0.46
527 0.41
528 0.4
529 0.35
530 0.31
531 0.28
532 0.32
533 0.32
534 0.42
535 0.49
536 0.52
537 0.6
538 0.66
539 0.66
540 0.67
541 0.71
542 0.68
543 0.66
544 0.62
545 0.56
546 0.52
547 0.51
548 0.51
549 0.5
550 0.5
551 0.5
552 0.5
553 0.47
554 0.51
555 0.58
556 0.58
557 0.61
558 0.64
559 0.66
560 0.74
561 0.83
562 0.86
563 0.87
564 0.86
565 0.8
566 0.75
567 0.76
568 0.76