FuNGI

A0A317VA88

Protein Details

Accession

A0A317VA88

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
39-69	VKNPTDKQKIPAKPKKTLRKQKVEKPATASK	Hydrophilic
105-125	LNKARVAKPRVTKPKPKVVIN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
45-121	KQKIPAKPKKTLRKQKVEKPATASKKGKTGDAIASNTAGAAPEKPRKRKAEIVDEAPARELNKARVAKPRVTKPKPK

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto 6.5, cyto_mito 6.5, mito 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009091 RCC1/BLIP-II IPR000408 Reg_chr_condens
Pfam	View protein in Pfam PF00415 RCC1
PROSITE	View protein in PROSITE PS00625 RCC1_1 PS00626 RCC1_2 PS50012 RCC1_3

Amino Acid Sequences

MPPKRSAPKTAAESATTTVKGKKTAAATTAKATAKTTTVKNPTDKQKIPAKPKKTLRKQKVEKPATASKKGKTGDAIASNTAGAAPEKPRKRKAEIVDEAPARELNKARVAKPRVTKPKPKVVINHAPTTRLNVYVCGEGSSGELGLGSTTNAIDVKRPRLNANLPADGVGVVQVAAGGMHCVALTSDNKILTWGVNDQGALGRDTTWDGGYKEINEDSNESDSDSDYDLALNPYESIPTAIPSEAFPEGTIFVEVAAGDSSSFALTDDGQVYGWGTFRSNDGILGFDANHKVQLTPSLISSLKKIKHMACGDNHALALDNKGAVFSWGSGQQNQLGRRIIERNRLNGLQPREFGLPKDIVHIGCGAFHSFAIHQSGKVYAWGLNSFGETGIRAGAGDDEAAIVHPTVVDSLSGKIITQICGGAHHSLAIANDGECLVWGRLDGHQTGLKIDSLPDEAVIKDERGRARILIEPKPVPGIKVNAVAAGSDHSIAIDVDGRPWSWGFSATYQTGQGIQDDVEVATIIENTAVRGKKLNWAGAGGQFSVFTEPAALAQAIK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.43
3	0.36
4	0.32
5	0.3
6	0.3
7	0.32
8	0.31
9	0.34
10	0.34
11	0.37
12	0.41
13	0.41
14	0.41
15	0.41
16	0.47
17	0.43
18	0.39
19	0.36
20	0.32
21	0.3
22	0.33
23	0.34
24	0.36
25	0.43
26	0.48
27	0.54
28	0.6
29	0.66
30	0.71
31	0.7
32	0.67
33	0.69
34	0.72
35	0.76
36	0.78
37	0.75
38	0.75
39	0.82
40	0.86
41	0.87
42	0.89
43	0.88
44	0.9
45	0.92
46	0.92
47	0.93
48	0.89
49	0.84
50	0.8
51	0.79
52	0.76
53	0.76
54	0.72
55	0.64
56	0.64
57	0.6
58	0.55
59	0.48
60	0.45
61	0.42
62	0.42
63	0.41
64	0.34
65	0.34
66	0.3
67	0.27
68	0.22
69	0.15
70	0.1
71	0.1
72	0.16
73	0.25
74	0.34
75	0.42
76	0.51
77	0.57
78	0.63
79	0.69
80	0.71
81	0.73
82	0.71
83	0.69
84	0.68
85	0.63
86	0.56
87	0.49
88	0.41
89	0.31
90	0.28
91	0.24
92	0.21
93	0.28
94	0.31
95	0.34
96	0.42
97	0.47
98	0.51
99	0.57
100	0.63
101	0.66
102	0.71
103	0.77
104	0.75
105	0.81
106	0.81
107	0.78
108	0.75
109	0.74
110	0.76
111	0.7
112	0.71
113	0.61
114	0.57
115	0.51
116	0.5
117	0.42
118	0.34
119	0.29
120	0.23
121	0.24
122	0.23
123	0.22
124	0.17
125	0.16
126	0.13
127	0.13
128	0.11
129	0.09
130	0.06
131	0.06
132	0.05
133	0.05
134	0.05
135	0.04
136	0.04
137	0.04
138	0.05
139	0.06
140	0.06
141	0.11
142	0.15
143	0.23
144	0.27
145	0.29
146	0.31
147	0.36
148	0.41
149	0.44
150	0.46
151	0.4
152	0.37
153	0.35
154	0.33
155	0.26
156	0.21
157	0.13
158	0.07
159	0.05
160	0.04
161	0.03
162	0.03
163	0.03
164	0.03
165	0.03
166	0.03
167	0.03
168	0.03
169	0.03
170	0.03
171	0.06
172	0.07
173	0.09
174	0.12
175	0.12
176	0.12
177	0.13
178	0.13
179	0.11
180	0.12
181	0.11
182	0.09
183	0.1
184	0.1
185	0.09
186	0.11
187	0.11
188	0.1
189	0.09
190	0.08
191	0.08
192	0.09
193	0.1
194	0.08
195	0.09
196	0.09
197	0.1
198	0.11
199	0.11
200	0.12
201	0.12
202	0.13
203	0.12
204	0.13
205	0.13
206	0.14
207	0.13
208	0.12
209	0.11
210	0.1
211	0.11
212	0.1
213	0.09
214	0.07
215	0.07
216	0.08
217	0.08
218	0.07
219	0.06
220	0.06
221	0.06
222	0.06
223	0.06
224	0.06
225	0.06
226	0.07
227	0.08
228	0.07
229	0.07
230	0.07
231	0.1
232	0.09
233	0.09
234	0.08
235	0.07
236	0.08
237	0.08
238	0.08
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.04
244	0.04
245	0.03
246	0.03
247	0.03
248	0.04
249	0.03
250	0.04
251	0.03
252	0.04
253	0.04
254	0.05
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.06
259	0.06
260	0.06
261	0.06
262	0.05
263	0.05
264	0.05
265	0.06
266	0.08
267	0.07
268	0.08
269	0.07
270	0.08
271	0.07
272	0.08
273	0.07
274	0.07
275	0.08
276	0.08
277	0.09
278	0.08
279	0.08
280	0.08
281	0.11
282	0.11
283	0.11
284	0.11
285	0.13
286	0.14
287	0.14
288	0.16
289	0.2
290	0.2
291	0.22
292	0.26
293	0.25
294	0.32
295	0.36
296	0.37
297	0.33
298	0.37
299	0.35
300	0.32
301	0.3
302	0.22
303	0.19
304	0.15
305	0.14
306	0.08
307	0.07
308	0.06
309	0.06
310	0.06
311	0.05
312	0.05
313	0.05
314	0.06
315	0.1
316	0.11
317	0.12
318	0.13
319	0.16
320	0.21
321	0.22
322	0.24
323	0.22
324	0.21
325	0.24
326	0.3
327	0.31
328	0.36
329	0.38
330	0.38
331	0.4
332	0.41
333	0.4
334	0.4
335	0.41
336	0.35
337	0.32
338	0.31
339	0.3
340	0.3
341	0.28
342	0.25
343	0.21
344	0.18
345	0.21
346	0.2
347	0.17
348	0.17
349	0.17
350	0.13
351	0.11
352	0.12
353	0.1
354	0.08
355	0.08
356	0.08
357	0.07
358	0.09
359	0.13
360	0.13
361	0.12
362	0.13
363	0.14
364	0.13
365	0.14
366	0.13
367	0.1
368	0.12
369	0.12
370	0.12
371	0.11
372	0.11
373	0.11
374	0.1
375	0.08
376	0.07
377	0.07
378	0.06
379	0.05
380	0.05
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.05
389	0.05
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.04
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.06
399	0.08
400	0.08
401	0.08
402	0.12
403	0.13
404	0.13
405	0.13
406	0.13
407	0.12
408	0.14
409	0.16
410	0.13
411	0.12
412	0.11
413	0.11
414	0.11
415	0.11
416	0.1
417	0.09
418	0.08
419	0.08
420	0.08
421	0.07
422	0.06
423	0.08
424	0.07
425	0.06
426	0.07
427	0.08
428	0.1
429	0.13
430	0.13
431	0.14
432	0.17
433	0.17
434	0.18
435	0.18
436	0.17
437	0.14
438	0.15
439	0.13
440	0.13
441	0.13
442	0.12
443	0.12
444	0.11
445	0.14
446	0.14
447	0.13
448	0.15
449	0.2
450	0.22
451	0.23
452	0.25
453	0.23
454	0.25
455	0.3
456	0.33
457	0.34
458	0.39
459	0.38
460	0.37
461	0.43
462	0.4
463	0.36
464	0.34
465	0.32
466	0.28
467	0.32
468	0.31
469	0.26
470	0.26
471	0.24
472	0.2
473	0.17
474	0.15
475	0.1
476	0.09
477	0.08
478	0.08
479	0.08
480	0.09
481	0.1
482	0.1
483	0.11
484	0.13
485	0.13
486	0.14
487	0.15
488	0.15
489	0.12
490	0.15
491	0.16
492	0.17
493	0.22
494	0.23
495	0.24
496	0.23
497	0.23
498	0.23
499	0.21
500	0.19
501	0.15
502	0.13
503	0.12
504	0.12
505	0.11
506	0.09
507	0.08
508	0.07
509	0.07
510	0.07
511	0.06
512	0.07
513	0.07
514	0.08
515	0.15
516	0.16
517	0.17
518	0.21
519	0.23
520	0.3
521	0.37
522	0.4
523	0.35
524	0.37
525	0.39
526	0.39
527	0.4
528	0.32
529	0.26
530	0.21
531	0.2
532	0.2
533	0.17
534	0.12
535	0.1
536	0.1
537	0.1
538	0.13

A0A317VA88

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer