Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317W2C4

Protein Details
Accession A0A317W2C4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
98-126VTSTPPSTPRSPKRKPRSIPKPNQLSHSFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
107-115RSPKRKPRS
Subcellular Location(s) mito 15.5, mito_nucl 13.166, nucl 9.5, cyto_nucl 6.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043519  NT_sf  
IPR045862  Trf4-like  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0031499  C:TRAMP complex  
GO:0043631  P:RNA polyadenylation  
Amino Acid Sequences MRTLCPSKRHSFSSTSVSSRLNRSVVFLSQARCFHKTSSSSKGSAIFKNSLQKTLEAHRSLNRASLIRRIPYKADHDDTLEDVTKSDGSSGDLPTADVTSTPPSTPRSPKRKPRSIPKPNQLSHSFQHTVPHRSIQWCSDPKTGRSNQSPWLEDLDFDRPFSDGLSQLDAEICALEKYLMPTPPEEEQVYTIAADVTRRLEGTVPHPPFIIGSWRTGLAMSHSDLDLLLPVPDSVRSVENIRKPSATRPKALGQHRSLLRDVEQALRKCPSFGHRIYQSTELDSITAIDTRTGLRLRFYCGEGTPPIIEYIKDYCAEYPSLRPLYMATRLILETQGVYGRHASSVRSEALVMLVVAFLKMSHGRFRQTDSLGETLLAFLQMYGTQVDLTTTGISVDPPGFFDADTIKTASRMYGLDDIPAHLRGQRAIINLKRTAATRGNRVAATRLCLQNPTNYMDDLGRFCIETMALQSALAGTCKRLRTALDMWERCMPVDPDCSVLSRVLQANFDDFNDVRSRLALGGGTNT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.52
3 0.5
4 0.49
5 0.48
6 0.47
7 0.48
8 0.42
9 0.36
10 0.37
11 0.36
12 0.33
13 0.34
14 0.33
15 0.31
16 0.33
17 0.39
18 0.4
19 0.39
20 0.4
21 0.37
22 0.41
23 0.44
24 0.45
25 0.49
26 0.49
27 0.48
28 0.48
29 0.53
30 0.5
31 0.49
32 0.48
33 0.42
34 0.41
35 0.49
36 0.48
37 0.46
38 0.43
39 0.4
40 0.38
41 0.43
42 0.47
43 0.41
44 0.42
45 0.42
46 0.46
47 0.44
48 0.45
49 0.4
50 0.35
51 0.34
52 0.4
53 0.4
54 0.41
55 0.45
56 0.44
57 0.44
58 0.46
59 0.51
60 0.5
61 0.49
62 0.45
63 0.43
64 0.41
65 0.39
66 0.37
67 0.31
68 0.24
69 0.19
70 0.19
71 0.16
72 0.14
73 0.14
74 0.1
75 0.11
76 0.14
77 0.14
78 0.15
79 0.14
80 0.14
81 0.14
82 0.14
83 0.11
84 0.09
85 0.1
86 0.12
87 0.13
88 0.13
89 0.16
90 0.2
91 0.27
92 0.36
93 0.45
94 0.51
95 0.6
96 0.71
97 0.79
98 0.85
99 0.88
100 0.89
101 0.9
102 0.91
103 0.92
104 0.91
105 0.91
106 0.83
107 0.81
108 0.74
109 0.69
110 0.6
111 0.57
112 0.49
113 0.39
114 0.44
115 0.42
116 0.42
117 0.39
118 0.4
119 0.36
120 0.36
121 0.38
122 0.35
123 0.39
124 0.4
125 0.43
126 0.46
127 0.46
128 0.46
129 0.53
130 0.54
131 0.52
132 0.53
133 0.52
134 0.52
135 0.54
136 0.53
137 0.45
138 0.45
139 0.37
140 0.31
141 0.31
142 0.29
143 0.23
144 0.21
145 0.2
146 0.15
147 0.15
148 0.15
149 0.13
150 0.09
151 0.1
152 0.12
153 0.12
154 0.12
155 0.12
156 0.11
157 0.1
158 0.08
159 0.07
160 0.04
161 0.04
162 0.05
163 0.05
164 0.08
165 0.11
166 0.13
167 0.14
168 0.15
169 0.17
170 0.19
171 0.21
172 0.19
173 0.16
174 0.15
175 0.15
176 0.15
177 0.12
178 0.1
179 0.08
180 0.08
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.1
189 0.15
190 0.24
191 0.23
192 0.23
193 0.23
194 0.23
195 0.22
196 0.21
197 0.23
198 0.14
199 0.14
200 0.15
201 0.15
202 0.15
203 0.15
204 0.14
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.07
214 0.05
215 0.05
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.05
221 0.06
222 0.07
223 0.08
224 0.11
225 0.16
226 0.21
227 0.24
228 0.24
229 0.25
230 0.25
231 0.34
232 0.41
233 0.4
234 0.37
235 0.38
236 0.43
237 0.49
238 0.53
239 0.52
240 0.43
241 0.47
242 0.47
243 0.45
244 0.4
245 0.33
246 0.29
247 0.23
248 0.22
249 0.21
250 0.24
251 0.23
252 0.24
253 0.25
254 0.24
255 0.21
256 0.22
257 0.2
258 0.21
259 0.22
260 0.26
261 0.28
262 0.31
263 0.33
264 0.36
265 0.32
266 0.27
267 0.26
268 0.2
269 0.16
270 0.13
271 0.11
272 0.07
273 0.08
274 0.06
275 0.05
276 0.06
277 0.06
278 0.09
279 0.1
280 0.1
281 0.12
282 0.13
283 0.17
284 0.18
285 0.19
286 0.19
287 0.17
288 0.2
289 0.18
290 0.18
291 0.14
292 0.13
293 0.13
294 0.11
295 0.11
296 0.1
297 0.12
298 0.12
299 0.12
300 0.12
301 0.11
302 0.13
303 0.14
304 0.13
305 0.13
306 0.18
307 0.19
308 0.18
309 0.17
310 0.17
311 0.19
312 0.22
313 0.21
314 0.16
315 0.16
316 0.16
317 0.17
318 0.15
319 0.12
320 0.08
321 0.08
322 0.1
323 0.09
324 0.09
325 0.1
326 0.11
327 0.12
328 0.12
329 0.12
330 0.12
331 0.15
332 0.15
333 0.14
334 0.13
335 0.12
336 0.12
337 0.11
338 0.08
339 0.05
340 0.05
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.03
345 0.05
346 0.07
347 0.09
348 0.15
349 0.17
350 0.21
351 0.23
352 0.28
353 0.33
354 0.32
355 0.33
356 0.3
357 0.3
358 0.26
359 0.25
360 0.2
361 0.14
362 0.12
363 0.09
364 0.06
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.07
382 0.08
383 0.07
384 0.08
385 0.1
386 0.09
387 0.09
388 0.1
389 0.11
390 0.12
391 0.13
392 0.13
393 0.13
394 0.13
395 0.14
396 0.13
397 0.12
398 0.11
399 0.13
400 0.17
401 0.17
402 0.19
403 0.19
404 0.2
405 0.2
406 0.21
407 0.18
408 0.14
409 0.15
410 0.14
411 0.16
412 0.18
413 0.2
414 0.27
415 0.31
416 0.35
417 0.36
418 0.37
419 0.36
420 0.34
421 0.36
422 0.37
423 0.36
424 0.39
425 0.43
426 0.45
427 0.44
428 0.44
429 0.44
430 0.38
431 0.38
432 0.36
433 0.35
434 0.32
435 0.35
436 0.35
437 0.35
438 0.36
439 0.36
440 0.31
441 0.27
442 0.27
443 0.25
444 0.26
445 0.22
446 0.21
447 0.18
448 0.16
449 0.16
450 0.16
451 0.14
452 0.12
453 0.13
454 0.13
455 0.12
456 0.12
457 0.11
458 0.11
459 0.12
460 0.13
461 0.11
462 0.11
463 0.17
464 0.19
465 0.21
466 0.22
467 0.24
468 0.29
469 0.34
470 0.4
471 0.45
472 0.45
473 0.47
474 0.51
475 0.5
476 0.43
477 0.43
478 0.35
479 0.28
480 0.31
481 0.28
482 0.25
483 0.26
484 0.27
485 0.24
486 0.23
487 0.21
488 0.21
489 0.25
490 0.23
491 0.25
492 0.24
493 0.26
494 0.26
495 0.26
496 0.26
497 0.21
498 0.23
499 0.25
500 0.24
501 0.21
502 0.21
503 0.22
504 0.17
505 0.19
506 0.16