Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317VJS3

Protein Details
Accession A0A317VJS3    Localization Confidence High Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
124-152GGDEERSKRKREGRREKKTRRMRELEDGGBasic
154-174SDEEKASRKRKRKEAAMQEEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
115-167GRHKRKRAEGGDEERSKRKREGRREKKTRRMRELEDGGASDEEKASRKRKRKE
181-204RRRRALDRAMDEALKKPTKRRFRK
438-440RAR
445-450QKGSRR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSETHSPEPELEVKPTVTDDQAPPTPGGAISDDEPAKEEIDDAQPEVEQQPEGEGEAEVEAEEQVEEEDEDKQSDDESILSEVDEAQFEDFDPENVDIEDRPQLAIDEDNLKLIGRHKRKRAEGGDEERSKRKREGRREKKTRRMRELEDGGASDEEKASRKRKRKEAAMQEEELLDPATRRRRALDRAMDEALKKPTKRRFRKADGIDLEQMADAEIEDMRKRMTHAAQMDAINRRESKPAMHKLKMLPEVVSLLNRNQYVNSLVDPEINLLEAVKFFLEPLDDASLPAYNIQRDLMTALGKLPINKEALVASGIGKVIVFYTRSKRPEPGIKRMAERLLAEWTRPILQRSDDYSKRVYQEAAFDPTKLNTTRTQSVQATAAEARARALLPPRLANRARADMTHTSYTVVPRPTMVQESKFARPLGASGEDRFRKMRARQIAAQKGSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.29
3 0.27
4 0.22
5 0.25
6 0.24
7 0.28
8 0.31
9 0.32
10 0.29
11 0.28
12 0.26
13 0.22
14 0.21
15 0.16
16 0.15
17 0.14
18 0.2
19 0.2
20 0.19
21 0.21
22 0.2
23 0.19
24 0.17
25 0.16
26 0.13
27 0.17
28 0.18
29 0.17
30 0.17
31 0.16
32 0.17
33 0.18
34 0.16
35 0.11
36 0.1
37 0.11
38 0.1
39 0.11
40 0.1
41 0.09
42 0.09
43 0.08
44 0.08
45 0.07
46 0.07
47 0.06
48 0.05
49 0.05
50 0.05
51 0.05
52 0.05
53 0.05
54 0.06
55 0.08
56 0.09
57 0.09
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.08
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.1
77 0.1
78 0.1
79 0.12
80 0.12
81 0.12
82 0.12
83 0.13
84 0.09
85 0.11
86 0.14
87 0.12
88 0.12
89 0.11
90 0.12
91 0.12
92 0.13
93 0.13
94 0.13
95 0.13
96 0.13
97 0.13
98 0.13
99 0.13
100 0.18
101 0.26
102 0.33
103 0.41
104 0.49
105 0.58
106 0.64
107 0.73
108 0.73
109 0.72
110 0.71
111 0.71
112 0.72
113 0.7
114 0.68
115 0.67
116 0.64
117 0.58
118 0.56
119 0.57
120 0.57
121 0.62
122 0.7
123 0.73
124 0.81
125 0.89
126 0.92
127 0.94
128 0.94
129 0.93
130 0.92
131 0.88
132 0.82
133 0.81
134 0.75
135 0.67
136 0.57
137 0.47
138 0.38
139 0.3
140 0.25
141 0.15
142 0.11
143 0.09
144 0.11
145 0.16
146 0.24
147 0.32
148 0.41
149 0.5
150 0.59
151 0.67
152 0.74
153 0.79
154 0.82
155 0.84
156 0.8
157 0.72
158 0.62
159 0.54
160 0.44
161 0.34
162 0.23
163 0.12
164 0.07
165 0.11
166 0.18
167 0.19
168 0.2
169 0.24
170 0.29
171 0.35
172 0.44
173 0.48
174 0.44
175 0.46
176 0.47
177 0.44
178 0.39
179 0.36
180 0.33
181 0.29
182 0.26
183 0.3
184 0.37
185 0.47
186 0.56
187 0.62
188 0.66
189 0.7
190 0.79
191 0.77
192 0.77
193 0.7
194 0.65
195 0.56
196 0.46
197 0.38
198 0.28
199 0.23
200 0.13
201 0.09
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.06
210 0.07
211 0.1
212 0.11
213 0.16
214 0.17
215 0.19
216 0.22
217 0.22
218 0.25
219 0.26
220 0.25
221 0.22
222 0.22
223 0.21
224 0.21
225 0.2
226 0.22
227 0.26
228 0.35
229 0.4
230 0.41
231 0.44
232 0.44
233 0.5
234 0.49
235 0.41
236 0.31
237 0.25
238 0.25
239 0.21
240 0.2
241 0.14
242 0.12
243 0.14
244 0.14
245 0.14
246 0.12
247 0.13
248 0.13
249 0.13
250 0.13
251 0.12
252 0.12
253 0.12
254 0.12
255 0.11
256 0.09
257 0.09
258 0.08
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.07
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.12
277 0.12
278 0.09
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.1
284 0.09
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.11
289 0.12
290 0.12
291 0.13
292 0.15
293 0.16
294 0.15
295 0.15
296 0.12
297 0.13
298 0.12
299 0.11
300 0.09
301 0.09
302 0.08
303 0.08
304 0.07
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.08
309 0.11
310 0.17
311 0.24
312 0.29
313 0.31
314 0.35
315 0.4
316 0.49
317 0.53
318 0.57
319 0.58
320 0.58
321 0.59
322 0.6
323 0.55
324 0.48
325 0.41
326 0.33
327 0.32
328 0.3
329 0.26
330 0.23
331 0.23
332 0.24
333 0.24
334 0.24
335 0.19
336 0.21
337 0.25
338 0.31
339 0.38
340 0.37
341 0.39
342 0.42
343 0.43
344 0.43
345 0.4
346 0.35
347 0.28
348 0.31
349 0.32
350 0.34
351 0.31
352 0.29
353 0.29
354 0.28
355 0.31
356 0.26
357 0.24
358 0.24
359 0.3
360 0.35
361 0.36
362 0.42
363 0.38
364 0.39
365 0.39
366 0.34
367 0.3
368 0.26
369 0.25
370 0.2
371 0.19
372 0.17
373 0.15
374 0.15
375 0.14
376 0.2
377 0.23
378 0.25
379 0.32
380 0.34
381 0.42
382 0.43
383 0.47
384 0.47
385 0.48
386 0.47
387 0.41
388 0.44
389 0.42
390 0.46
391 0.42
392 0.37
393 0.32
394 0.32
395 0.35
396 0.34
397 0.31
398 0.25
399 0.23
400 0.26
401 0.28
402 0.34
403 0.34
404 0.32
405 0.36
406 0.41
407 0.45
408 0.47
409 0.43
410 0.36
411 0.32
412 0.31
413 0.29
414 0.3
415 0.27
416 0.26
417 0.36
418 0.38
419 0.4
420 0.41
421 0.39
422 0.41
423 0.45
424 0.52
425 0.52
426 0.57
427 0.63
428 0.71
429 0.78
430 0.77