FuNGI

A8N9L6

Protein Details

Accession

A8N9L6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
31-56	TSRLKFVPTLPQRRKKEEVKAEPTPD	Hydrophilic
195-222	APESLRRDRSSKKKKVKKEKSAEDQVDH	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
66-90	GRGRGGARGGRGDGRGRGRGGRPGG
200-214	RRDRSSKKKKVKKEK

Subcellular Location(s)

cyto 15.5, cyto_nucl 14, nucl 9.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
KEGG	cci:CC1G_12054 -
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MADSNAPSGSGTPKAIPSLAKRPSDVTRQGTSRLKFVPTLPQRRKKEEVKAEPTPDVIPEASGTSGRGRGGARGGRGDGRGRGRGGRPGGPPPVVMTASGPFALGPTLAGSSARRSTPRSNFAPSIASSTSGSSSLGAGLSQTAPPTLKKDLNDLKGKGKEVKKEEDDDVEVYSDPDDGVEIIDIEQVRGLDYMAPESLRRDRSSKKKKVKKEKSAEDQVDHDIDHANALDLSEDEEEEEAELEDVIEDFAAQVNLESDNDLREEKIYLFQFPTPFPTFVQPETADNSAVSAGATDGDVEMTDGTGAGTTTGKKAVSFGPDVKPAAAPGVAGGAAPGMASRTPSGSGAAAEEKKPPKPVDGVIGQLELYKSGAVKIRLANGILLDVSRLLLDIIRLDFLTHSVFLLGSPPFPLSPIDLFRKREQVNPATQPSFLQQVVHVDHIHEKRISVLGEINKQFVVSPNVEALLEALDKADRMAPVLPKIEGEEKLIRMK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.24
3	0.27
4	0.31
5	0.37
6	0.43
7	0.44
8	0.44
9	0.47
10	0.51
11	0.55
12	0.56
13	0.53
14	0.52
15	0.52
16	0.58
17	0.61
18	0.57
19	0.54
20	0.49
21	0.46
22	0.41
23	0.4
24	0.44
25	0.46
26	0.55
27	0.6
28	0.67
29	0.71
30	0.77
31	0.83
32	0.81
33	0.81
34	0.81
35	0.81
36	0.79
37	0.8
38	0.77
39	0.7
40	0.63
41	0.53
42	0.42
43	0.34
44	0.26
45	0.18
46	0.14
47	0.14
48	0.12
49	0.12
50	0.13
51	0.12
52	0.15
53	0.14
54	0.17
55	0.16
56	0.18
57	0.24
58	0.27
59	0.27
60	0.28
61	0.3
62	0.3
63	0.33
64	0.34
65	0.33
66	0.35
67	0.36
68	0.35
69	0.39
70	0.39
71	0.43
72	0.44
73	0.44
74	0.42
75	0.44
76	0.47
77	0.42
78	0.39
79	0.34
80	0.34
81	0.28
82	0.24
83	0.19
84	0.16
85	0.16
86	0.16
87	0.13
88	0.09
89	0.09
90	0.08
91	0.07
92	0.06
93	0.05
94	0.05
95	0.06
96	0.07
97	0.08
98	0.11
99	0.15
100	0.17
101	0.19
102	0.24
103	0.33
104	0.41
105	0.48
106	0.48
107	0.51
108	0.5
109	0.49
110	0.48
111	0.39
112	0.36
113	0.28
114	0.25
115	0.2
116	0.19
117	0.18
118	0.15
119	0.15
120	0.1
121	0.09
122	0.08
123	0.08
124	0.06
125	0.05
126	0.06
127	0.07
128	0.07
129	0.07
130	0.07
131	0.08
132	0.1
133	0.14
134	0.18
135	0.2
136	0.21
137	0.3
138	0.36
139	0.43
140	0.49
141	0.48
142	0.5
143	0.51
144	0.52
145	0.52
146	0.49
147	0.49
148	0.48
149	0.53
150	0.49
151	0.49
152	0.48
153	0.43
154	0.4
155	0.33
156	0.28
157	0.21
158	0.17
159	0.13
160	0.12
161	0.09
162	0.06
163	0.05
164	0.05
165	0.04
166	0.04
167	0.04
168	0.04
169	0.04
170	0.06
171	0.06
172	0.06
173	0.06
174	0.06
175	0.06
176	0.06
177	0.06
178	0.06
179	0.06
180	0.07
181	0.07
182	0.08
183	0.07
184	0.1
185	0.15
186	0.17
187	0.19
188	0.23
189	0.31
190	0.42
191	0.52
192	0.6
193	0.66
194	0.72
195	0.81
196	0.88
197	0.91
198	0.9
199	0.9
200	0.89
201	0.87
202	0.88
203	0.8
204	0.7
205	0.61
206	0.52
207	0.42
208	0.32
209	0.23
210	0.14
211	0.11
212	0.09
213	0.07
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.04
218	0.04
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.04
226	0.05
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.02
235	0.02
236	0.02
237	0.03
238	0.03
239	0.03
240	0.03
241	0.03
242	0.04
243	0.04
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.06
251	0.07
252	0.07
253	0.12
254	0.12
255	0.13
256	0.14
257	0.16
258	0.17
259	0.16
260	0.21
261	0.19
262	0.2
263	0.19
264	0.21
265	0.22
266	0.21
267	0.24
268	0.19
269	0.18
270	0.2
271	0.2
272	0.16
273	0.14
274	0.14
275	0.1
276	0.09
277	0.07
278	0.05
279	0.04
280	0.04
281	0.04
282	0.03
283	0.03
284	0.03
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.03
289	0.03
290	0.03
291	0.03
292	0.03
293	0.03
294	0.03
295	0.04
296	0.05
297	0.06
298	0.08
299	0.08
300	0.08
301	0.1
302	0.12
303	0.15
304	0.18
305	0.2
306	0.22
307	0.25
308	0.26
309	0.25
310	0.22
311	0.19
312	0.17
313	0.13
314	0.09
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.05
319	0.05
320	0.03
321	0.03
322	0.03
323	0.03
324	0.03
325	0.03
326	0.05
327	0.05
328	0.07
329	0.08
330	0.08
331	0.1
332	0.09
333	0.09
334	0.1
335	0.15
336	0.16
337	0.16
338	0.23
339	0.25
340	0.27
341	0.32
342	0.31
343	0.29
344	0.31
345	0.32
346	0.31
347	0.3
348	0.31
349	0.26
350	0.26
351	0.22
352	0.2
353	0.18
354	0.12
355	0.1
356	0.08
357	0.07
358	0.09
359	0.14
360	0.14
361	0.17
362	0.19
363	0.23
364	0.24
365	0.25
366	0.23
367	0.18
368	0.18
369	0.14
370	0.12
371	0.08
372	0.06
373	0.06
374	0.05
375	0.05
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.07
380	0.08
381	0.08
382	0.08
383	0.09
384	0.09
385	0.1
386	0.11
387	0.09
388	0.09
389	0.08
390	0.08
391	0.08
392	0.11
393	0.1
394	0.09
395	0.1
396	0.11
397	0.1
398	0.11
399	0.12
400	0.12
401	0.16
402	0.21
403	0.28
404	0.34
405	0.39
406	0.42
407	0.51
408	0.49
409	0.52
410	0.55
411	0.54
412	0.56
413	0.59
414	0.62
415	0.54
416	0.53
417	0.48
418	0.41
419	0.39
420	0.3
421	0.23
422	0.17
423	0.22
424	0.24
425	0.26
426	0.24
427	0.21
428	0.29
429	0.31
430	0.34
431	0.29
432	0.26
433	0.26
434	0.29
435	0.28
436	0.21
437	0.26
438	0.27
439	0.35
440	0.36
441	0.35
442	0.32
443	0.31
444	0.3
445	0.28
446	0.28
447	0.2
448	0.21
449	0.21
450	0.22
451	0.21
452	0.2
453	0.17
454	0.13
455	0.11
456	0.09
457	0.09
458	0.08
459	0.08
460	0.1
461	0.12
462	0.1
463	0.12
464	0.17
465	0.2
466	0.25
467	0.28
468	0.27
469	0.25
470	0.29
471	0.32
472	0.29
473	0.31
474	0.32

A8N9L6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer