Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317VJV3

Protein Details
Accession A0A317VJV3    Localization Confidence High Confidence Score 18.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
181-221RESRRYRSRSPEERRERNHRDRDGRRSDRDRDRRDRDRDRDBasic
254-275LQDRSPERHHSDRRRDDRRDTDBasic
283-306RDSRDDRRDRPRYQDRRDYRGPRDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
164-244RRGRGRVGGGERRSHRDRESRRYRSRSPEERRERNHRDRDGRRSDRDRDRRDRDRDRDDDRRRDRDDKDYRSRHRDHREER
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR022209  CWC25  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
PF12542  CWC25  
Amino Acid Sequences MGGDLNLKKSWHPSLLRNQERVWAEEKRALEERKRIDQLRRERDEERQIQELQRLHEDSGKPKQIQRVDWMYQEPSGQGGMYGEEMEGYLLGKRRIDGILLKGGETEGLKKGAEVGVAMQAQDGGVASGTNPRDTMAKVLADPLLEIRKREQAAVEGMVKEVVRRGRGRVGGGERRSHRDRESRRYRSRSPEERRERNHRDRDGRRSDRDRDRRDRDRDRDDDRRRDRDDKDYRSRHRDHREERYDRSTRRGSLQDRSPERHHSDRRRDDRRDTDGYRDTRDRDSRDDRRDRPRYQDRRDYRGPRDSYQRERAPKVSAEEAEQKRKAQEEERQRKLAEMQSNASEMEDSRRQRIAEVTAMEEKKLEEDEKHRSDKGRFVGGLHRQLQEDSLDDRIKRSRGGLARLDED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.63
3 0.7
4 0.68
5 0.63
6 0.63
7 0.6
8 0.55
9 0.49
10 0.44
11 0.4
12 0.41
13 0.41
14 0.39
15 0.44
16 0.47
17 0.49
18 0.52
19 0.55
20 0.58
21 0.65
22 0.65
23 0.67
24 0.7
25 0.74
26 0.76
27 0.76
28 0.72
29 0.67
30 0.7
31 0.71
32 0.69
33 0.63
34 0.57
35 0.54
36 0.52
37 0.55
38 0.5
39 0.43
40 0.41
41 0.39
42 0.35
43 0.37
44 0.37
45 0.38
46 0.44
47 0.48
48 0.45
49 0.47
50 0.54
51 0.54
52 0.54
53 0.55
54 0.54
55 0.5
56 0.51
57 0.5
58 0.44
59 0.38
60 0.35
61 0.27
62 0.2
63 0.17
64 0.13
65 0.1
66 0.08
67 0.08
68 0.07
69 0.07
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.07
77 0.1
78 0.11
79 0.12
80 0.12
81 0.15
82 0.15
83 0.17
84 0.18
85 0.19
86 0.25
87 0.24
88 0.24
89 0.22
90 0.21
91 0.2
92 0.17
93 0.16
94 0.11
95 0.12
96 0.12
97 0.12
98 0.13
99 0.13
100 0.12
101 0.1
102 0.09
103 0.11
104 0.12
105 0.12
106 0.1
107 0.09
108 0.09
109 0.08
110 0.07
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.09
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.12
121 0.13
122 0.15
123 0.13
124 0.13
125 0.13
126 0.14
127 0.14
128 0.13
129 0.13
130 0.12
131 0.16
132 0.15
133 0.16
134 0.17
135 0.22
136 0.23
137 0.24
138 0.22
139 0.19
140 0.2
141 0.22
142 0.22
143 0.16
144 0.16
145 0.16
146 0.15
147 0.12
148 0.13
149 0.13
150 0.15
151 0.16
152 0.19
153 0.23
154 0.25
155 0.27
156 0.29
157 0.34
158 0.37
159 0.39
160 0.43
161 0.4
162 0.45
163 0.47
164 0.44
165 0.42
166 0.44
167 0.49
168 0.53
169 0.62
170 0.65
171 0.72
172 0.76
173 0.77
174 0.77
175 0.8
176 0.79
177 0.77
178 0.78
179 0.78
180 0.8
181 0.81
182 0.81
183 0.81
184 0.8
185 0.8
186 0.77
187 0.77
188 0.76
189 0.79
190 0.79
191 0.76
192 0.73
193 0.7
194 0.71
195 0.72
196 0.75
197 0.74
198 0.73
199 0.75
200 0.77
201 0.8
202 0.82
203 0.79
204 0.77
205 0.74
206 0.71
207 0.74
208 0.73
209 0.74
210 0.71
211 0.71
212 0.68
213 0.69
214 0.65
215 0.65
216 0.66
217 0.64
218 0.67
219 0.69
220 0.7
221 0.72
222 0.75
223 0.74
224 0.74
225 0.75
226 0.73
227 0.74
228 0.78
229 0.74
230 0.74
231 0.73
232 0.7
233 0.62
234 0.61
235 0.55
236 0.47
237 0.47
238 0.49
239 0.44
240 0.44
241 0.49
242 0.51
243 0.52
244 0.55
245 0.54
246 0.53
247 0.55
248 0.58
249 0.6
250 0.61
251 0.67
252 0.72
253 0.79
254 0.81
255 0.81
256 0.8
257 0.79
258 0.76
259 0.73
260 0.65
261 0.62
262 0.6
263 0.57
264 0.54
265 0.49
266 0.45
267 0.45
268 0.48
269 0.45
270 0.45
271 0.52
272 0.56
273 0.62
274 0.69
275 0.69
276 0.74
277 0.79
278 0.75
279 0.76
280 0.78
281 0.78
282 0.78
283 0.81
284 0.77
285 0.76
286 0.82
287 0.8
288 0.77
289 0.76
290 0.72
291 0.66
292 0.69
293 0.68
294 0.67
295 0.68
296 0.69
297 0.66
298 0.66
299 0.65
300 0.59
301 0.55
302 0.5
303 0.46
304 0.39
305 0.36
306 0.41
307 0.44
308 0.48
309 0.47
310 0.45
311 0.42
312 0.45
313 0.44
314 0.41
315 0.44
316 0.47
317 0.56
318 0.61
319 0.63
320 0.6
321 0.57
322 0.56
323 0.54
324 0.49
325 0.43
326 0.39
327 0.36
328 0.37
329 0.35
330 0.3
331 0.23
332 0.17
333 0.19
334 0.23
335 0.24
336 0.27
337 0.3
338 0.3
339 0.31
340 0.35
341 0.33
342 0.31
343 0.3
344 0.31
345 0.36
346 0.36
347 0.34
348 0.31
349 0.27
350 0.23
351 0.24
352 0.22
353 0.19
354 0.25
355 0.35
356 0.42
357 0.46
358 0.48
359 0.51
360 0.53
361 0.56
362 0.55
363 0.53
364 0.47
365 0.44
366 0.5
367 0.53
368 0.57
369 0.54
370 0.51
371 0.43
372 0.43
373 0.42
374 0.34
375 0.29
376 0.22
377 0.24
378 0.26
379 0.26
380 0.3
381 0.34
382 0.35
383 0.35
384 0.36
385 0.38
386 0.4
387 0.48
388 0.51