Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1E9P0

Protein Details
Accession A0A0D1E9P0    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
608-637STDSSHSQLNRQRKKKRRADGKNARASHKSHydrophilic
652-677GPGNSGKKESKRARFSNKRQEDRGGNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
618-640RQRKKKRRADGKNARASHKSKKD
654-720GNSGKKESKRARFSNKRQEDRGGNPGERRGGGSGSGGRGKTTRRGGSARAQANSSTGARGGGKVRGG
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0031499  C:TRAMP complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0043629  P:ncRNA polyadenylation  
GO:0071031  P:nuclear mRNA surveillance of mRNA 3'-end processing  
GO:0071039  P:nuclear polyadenylation-dependent CUT catabolic process  
GO:0071035  P:nuclear polyadenylation-dependent rRNA catabolic process  
GO:0071036  P:nuclear polyadenylation-dependent snoRNA catabolic process  
GO:0071037  P:nuclear polyadenylation-dependent snRNA catabolic process  
GO:0071038  P:nuclear polyadenylation-dependent tRNA catabolic process  
KEGG uma:UMAG_00463  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MNRTHVAAVAQHAVISTVDQSATSTDPPSRASSRGSTRSSRGKPKAASTSRAGGSNRHVNGAPEDAVVVSDELEDKDQFLDDSQRAAHLEDDREQDARSYTMQEADEMSFIIDTAGDMDVDREIALEDQARADQADTHVEAGLLLPSHVNVIPQSSSDPVTQPGVSSSDPSRHVISDVPEDEDLEGDIGDFEQLDMDPSTANRYYGAEEKAERRAKEQCLACGELGHDRRHCPHQHCLACGAMDDHPTRFCPMSTSCFRCGGMGHQTRTCPKPRRAPRSEECQRCGSFTHVNALCPTLWRVYSYTTSDHVDRHRAKVFLKLQGSSKARDPRRDLEPDPEELSDSEDEFIKAGEPELPTGSSSSWSQFDPATRWCYNCSTSGNHWGDDCPEPRCNPTRGTGEPSAFSEFVSRLGPFSKLLPGAPPLAGFQMPSSQFTFNVGNSATMHVAADALPSSSGRSTPNGINKRHAIGRHVLSSPNSSRTASPVPNIVSFGRTKAVAVEGGLLTRKEAKKNKTPLPENLFKEWIRDRHDYPEHAHEIRSALEERADLQAKGLDTTKVRTTKEIVGDAAKRTGRRQERASTNRNSDASSDPAAARESEDDFRDDFSTDSSHSQLNRQRKKKRRADGKNARASHKSKKDTVHTGWAHTGDGPGNSGKKESKRARFSNKRQEDRGGNPGERRGGGSGSGGRGKTTRRGGSARAQANSSTGARGGGKVRGGGSKYRGSYF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.14
3 0.11
4 0.09
5 0.09
6 0.09
7 0.1
8 0.11
9 0.13
10 0.14
11 0.15
12 0.17
13 0.19
14 0.22
15 0.27
16 0.28
17 0.29
18 0.32
19 0.37
20 0.44
21 0.5
22 0.53
23 0.53
24 0.57
25 0.65
26 0.69
27 0.72
28 0.71
29 0.71
30 0.71
31 0.73
32 0.77
33 0.73
34 0.69
35 0.63
36 0.63
37 0.56
38 0.57
39 0.5
40 0.43
41 0.44
42 0.48
43 0.44
44 0.4
45 0.39
46 0.35
47 0.36
48 0.36
49 0.29
50 0.2
51 0.19
52 0.16
53 0.15
54 0.14
55 0.11
56 0.07
57 0.07
58 0.08
59 0.08
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.11
64 0.11
65 0.11
66 0.11
67 0.17
68 0.15
69 0.17
70 0.17
71 0.18
72 0.19
73 0.19
74 0.21
75 0.2
76 0.23
77 0.25
78 0.29
79 0.29
80 0.29
81 0.29
82 0.26
83 0.23
84 0.22
85 0.18
86 0.18
87 0.17
88 0.2
89 0.2
90 0.19
91 0.2
92 0.19
93 0.18
94 0.15
95 0.14
96 0.09
97 0.09
98 0.08
99 0.05
100 0.04
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.05
110 0.05
111 0.06
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.09
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.11
121 0.1
122 0.14
123 0.14
124 0.14
125 0.14
126 0.13
127 0.13
128 0.11
129 0.11
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.07
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.12
142 0.12
143 0.14
144 0.15
145 0.16
146 0.15
147 0.17
148 0.17
149 0.15
150 0.15
151 0.16
152 0.15
153 0.17
154 0.17
155 0.2
156 0.22
157 0.24
158 0.24
159 0.22
160 0.22
161 0.22
162 0.23
163 0.25
164 0.24
165 0.24
166 0.22
167 0.22
168 0.21
169 0.19
170 0.16
171 0.09
172 0.07
173 0.05
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.03
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.07
186 0.11
187 0.12
188 0.12
189 0.11
190 0.12
191 0.14
192 0.19
193 0.21
194 0.19
195 0.21
196 0.24
197 0.32
198 0.37
199 0.35
200 0.33
201 0.39
202 0.39
203 0.44
204 0.43
205 0.38
206 0.37
207 0.39
208 0.36
209 0.3
210 0.27
211 0.27
212 0.29
213 0.29
214 0.26
215 0.27
216 0.3
217 0.37
218 0.43
219 0.4
220 0.45
221 0.51
222 0.52
223 0.51
224 0.49
225 0.43
226 0.36
227 0.31
228 0.24
229 0.16
230 0.16
231 0.16
232 0.15
233 0.15
234 0.15
235 0.17
236 0.16
237 0.15
238 0.14
239 0.16
240 0.22
241 0.28
242 0.32
243 0.33
244 0.35
245 0.35
246 0.32
247 0.3
248 0.27
249 0.3
250 0.31
251 0.31
252 0.31
253 0.34
254 0.37
255 0.41
256 0.46
257 0.45
258 0.46
259 0.54
260 0.62
261 0.7
262 0.72
263 0.77
264 0.73
265 0.76
266 0.78
267 0.75
268 0.68
269 0.64
270 0.58
271 0.49
272 0.45
273 0.38
274 0.33
275 0.26
276 0.31
277 0.26
278 0.26
279 0.25
280 0.25
281 0.21
282 0.18
283 0.18
284 0.11
285 0.11
286 0.11
287 0.12
288 0.13
289 0.16
290 0.17
291 0.18
292 0.18
293 0.2
294 0.2
295 0.22
296 0.21
297 0.28
298 0.28
299 0.3
300 0.32
301 0.32
302 0.31
303 0.37
304 0.39
305 0.37
306 0.36
307 0.34
308 0.32
309 0.39
310 0.4
311 0.33
312 0.35
313 0.37
314 0.39
315 0.43
316 0.46
317 0.43
318 0.47
319 0.51
320 0.46
321 0.46
322 0.44
323 0.4
324 0.37
325 0.32
326 0.26
327 0.21
328 0.21
329 0.13
330 0.11
331 0.09
332 0.08
333 0.08
334 0.07
335 0.07
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.07
340 0.07
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.09
346 0.09
347 0.08
348 0.08
349 0.09
350 0.09
351 0.09
352 0.1
353 0.1
354 0.11
355 0.12
356 0.15
357 0.2
358 0.19
359 0.2
360 0.21
361 0.23
362 0.24
363 0.24
364 0.24
365 0.21
366 0.22
367 0.32
368 0.31
369 0.28
370 0.27
371 0.24
372 0.24
373 0.24
374 0.24
375 0.17
376 0.18
377 0.18
378 0.22
379 0.26
380 0.26
381 0.24
382 0.27
383 0.29
384 0.29
385 0.34
386 0.34
387 0.3
388 0.29
389 0.29
390 0.27
391 0.22
392 0.2
393 0.15
394 0.12
395 0.12
396 0.12
397 0.1
398 0.08
399 0.09
400 0.1
401 0.09
402 0.1
403 0.12
404 0.11
405 0.11
406 0.12
407 0.13
408 0.13
409 0.13
410 0.12
411 0.1
412 0.1
413 0.1
414 0.09
415 0.08
416 0.11
417 0.11
418 0.13
419 0.15
420 0.14
421 0.14
422 0.17
423 0.18
424 0.13
425 0.15
426 0.13
427 0.12
428 0.12
429 0.13
430 0.1
431 0.09
432 0.09
433 0.07
434 0.07
435 0.06
436 0.05
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.05
442 0.06
443 0.07
444 0.08
445 0.1
446 0.13
447 0.17
448 0.27
449 0.33
450 0.35
451 0.39
452 0.4
453 0.41
454 0.42
455 0.39
456 0.32
457 0.31
458 0.32
459 0.31
460 0.3
461 0.29
462 0.26
463 0.31
464 0.3
465 0.27
466 0.26
467 0.23
468 0.22
469 0.25
470 0.3
471 0.26
472 0.24
473 0.25
474 0.25
475 0.25
476 0.26
477 0.22
478 0.19
479 0.18
480 0.18
481 0.15
482 0.13
483 0.13
484 0.11
485 0.12
486 0.1
487 0.1
488 0.1
489 0.09
490 0.1
491 0.11
492 0.1
493 0.09
494 0.16
495 0.19
496 0.25
497 0.33
498 0.39
499 0.48
500 0.57
501 0.64
502 0.67
503 0.7
504 0.71
505 0.72
506 0.73
507 0.68
508 0.63
509 0.6
510 0.5
511 0.49
512 0.46
513 0.43
514 0.41
515 0.42
516 0.4
517 0.44
518 0.49
519 0.47
520 0.45
521 0.47
522 0.46
523 0.42
524 0.4
525 0.32
526 0.29
527 0.27
528 0.25
529 0.19
530 0.14
531 0.14
532 0.14
533 0.14
534 0.18
535 0.19
536 0.16
537 0.15
538 0.17
539 0.16
540 0.18
541 0.17
542 0.15
543 0.15
544 0.18
545 0.25
546 0.27
547 0.28
548 0.3
549 0.33
550 0.35
551 0.39
552 0.37
553 0.32
554 0.32
555 0.34
556 0.33
557 0.35
558 0.32
559 0.29
560 0.3
561 0.38
562 0.41
563 0.45
564 0.5
565 0.53
566 0.61
567 0.69
568 0.74
569 0.73
570 0.7
571 0.7
572 0.64
573 0.56
574 0.48
575 0.42
576 0.38
577 0.31
578 0.27
579 0.21
580 0.21
581 0.21
582 0.19
583 0.17
584 0.15
585 0.16
586 0.17
587 0.18
588 0.19
589 0.18
590 0.2
591 0.2
592 0.19
593 0.15
594 0.14
595 0.15
596 0.14
597 0.16
598 0.16
599 0.18
600 0.19
601 0.26
602 0.32
603 0.41
604 0.5
605 0.58
606 0.67
607 0.74
608 0.85
609 0.87
610 0.9
611 0.91
612 0.91
613 0.93
614 0.93
615 0.93
616 0.92
617 0.87
618 0.82
619 0.79
620 0.73
621 0.72
622 0.71
623 0.67
624 0.63
625 0.66
626 0.69
627 0.7
628 0.69
629 0.69
630 0.61
631 0.58
632 0.56
633 0.49
634 0.42
635 0.33
636 0.3
637 0.22
638 0.2
639 0.18
640 0.17
641 0.19
642 0.19
643 0.22
644 0.27
645 0.31
646 0.41
647 0.49
648 0.56
649 0.64
650 0.73
651 0.8
652 0.85
653 0.9
654 0.9
655 0.91
656 0.89
657 0.84
658 0.83
659 0.8
660 0.75
661 0.73
662 0.69
663 0.63
664 0.58
665 0.58
666 0.54
667 0.47
668 0.43
669 0.36
670 0.3
671 0.26
672 0.26
673 0.25
674 0.25
675 0.3
676 0.27
677 0.27
678 0.29
679 0.32
680 0.36
681 0.41
682 0.42
683 0.43
684 0.48
685 0.52
686 0.58
687 0.64
688 0.62
689 0.55
690 0.52
691 0.46
692 0.43
693 0.42
694 0.34
695 0.26
696 0.2
697 0.2
698 0.19
699 0.22
700 0.23
701 0.23
702 0.24
703 0.25
704 0.27
705 0.3
706 0.32
707 0.35
708 0.38
709 0.41