Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317XDM9

Protein Details
Accession A0A317XDM9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
541-561LSENRRKRRRVDQQTDEQPSSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR039601  Rrn5  
IPR001005  SANT/Myb  
Gene Ontology GO:0000500  C:RNA polymerase I upstream activating factor complex  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
CDD cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MSSPIPYEYEEDDDASDFKLEIQQSQTSAPLPAPPSYGPTSSSTNNPPAQTSVTRRSTRGTRAQALEDLQSSLPRSSVEAYSDVLVRTVEDHAPVPATIGGENYRVTQNGIVTWTPKEKEVLYSVLDRKGKDGIKEISRHLGSKSELEVQEHLKLLHTGLEKQHLKDRHTRTVILGDVPAAAEISGECCDALDQYAELVALEEQLAEDVAGKQKHHDLWIIDRKAAEELGQEIKTQGADPGANSSAHLTADLLNMKKWIRLSERFFMNFGGARLEDNWVNVAFAGETPSMTADAFADFYALTVSLTRRLVQSTLFFAMSRRRNMRQTGNEKANVVRSRDVQTAVNVLNMQRDSSDFWVGLARRCSLRVEDSRHRKGWKAVHMEHSDVEDILSAQVPFEFESGERSISQGRSASRVGRATDSEDADASDAESEPPSPAESLPSSPLSSPGEEKPTDPEDDHAEHVDEQMSRLEEVDLWKLIGQPPQSLEAQIEEDQARGTHRRKPVGERKTTADLVDWRDRTFYRNEWEEYGHDIVDLHDELSENRRKRRRVDQQTDEQPSSAPILKHLSPRPTAGLVQEEGDEGSDYENNEDGGEEDDEGDDDERNGVEENYEDYEEMAVDEPTPAKSDIEESENNDATGGDEGEDDGDDDDDDDSDEEGGEEEHYQEMALDEPSPAKYEAEETPEKEATPEESPVSELASRLIYELEKGHSDPKHTPRIRTQDTGSSAFSTPSKPNETVRPMRRSARLQKAAQTAPEDDISFSSDDNLPSPHERTVSEEEEDDDEGGMPLYSHPMSPADSSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.18
3 0.16
4 0.11
5 0.11
6 0.15
7 0.15
8 0.17
9 0.21
10 0.23
11 0.24
12 0.25
13 0.26
14 0.22
15 0.23
16 0.2
17 0.21
18 0.22
19 0.21
20 0.23
21 0.22
22 0.27
23 0.29
24 0.29
25 0.27
26 0.28
27 0.31
28 0.31
29 0.36
30 0.37
31 0.4
32 0.44
33 0.42
34 0.4
35 0.38
36 0.41
37 0.42
38 0.43
39 0.45
40 0.5
41 0.52
42 0.51
43 0.55
44 0.57
45 0.59
46 0.62
47 0.6
48 0.59
49 0.6
50 0.62
51 0.59
52 0.54
53 0.48
54 0.39
55 0.33
56 0.25
57 0.23
58 0.22
59 0.19
60 0.17
61 0.15
62 0.16
63 0.17
64 0.18
65 0.18
66 0.18
67 0.18
68 0.19
69 0.21
70 0.18
71 0.16
72 0.14
73 0.11
74 0.11
75 0.13
76 0.13
77 0.13
78 0.13
79 0.14
80 0.15
81 0.15
82 0.14
83 0.13
84 0.12
85 0.11
86 0.12
87 0.13
88 0.14
89 0.14
90 0.15
91 0.16
92 0.15
93 0.17
94 0.17
95 0.16
96 0.16
97 0.18
98 0.17
99 0.18
100 0.21
101 0.25
102 0.24
103 0.25
104 0.26
105 0.23
106 0.26
107 0.28
108 0.27
109 0.24
110 0.3
111 0.32
112 0.37
113 0.39
114 0.35
115 0.34
116 0.38
117 0.38
118 0.34
119 0.38
120 0.37
121 0.42
122 0.45
123 0.46
124 0.47
125 0.46
126 0.44
127 0.38
128 0.36
129 0.31
130 0.3
131 0.3
132 0.29
133 0.29
134 0.3
135 0.31
136 0.29
137 0.31
138 0.29
139 0.26
140 0.2
141 0.19
142 0.17
143 0.2
144 0.19
145 0.19
146 0.2
147 0.3
148 0.32
149 0.33
150 0.41
151 0.4
152 0.43
153 0.49
154 0.54
155 0.54
156 0.55
157 0.55
158 0.5
159 0.49
160 0.47
161 0.38
162 0.31
163 0.21
164 0.17
165 0.16
166 0.13
167 0.08
168 0.06
169 0.05
170 0.04
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.06
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.03
194 0.04
195 0.06
196 0.11
197 0.13
198 0.13
199 0.15
200 0.2
201 0.22
202 0.23
203 0.25
204 0.22
205 0.3
206 0.4
207 0.4
208 0.36
209 0.35
210 0.34
211 0.31
212 0.29
213 0.2
214 0.11
215 0.12
216 0.16
217 0.16
218 0.15
219 0.14
220 0.14
221 0.14
222 0.13
223 0.11
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.12
228 0.13
229 0.12
230 0.12
231 0.13
232 0.12
233 0.11
234 0.11
235 0.08
236 0.08
237 0.11
238 0.14
239 0.13
240 0.13
241 0.15
242 0.16
243 0.17
244 0.17
245 0.2
246 0.23
247 0.31
248 0.36
249 0.4
250 0.46
251 0.45
252 0.44
253 0.4
254 0.35
255 0.28
256 0.23
257 0.18
258 0.12
259 0.12
260 0.12
261 0.13
262 0.12
263 0.11
264 0.12
265 0.09
266 0.09
267 0.08
268 0.08
269 0.06
270 0.06
271 0.08
272 0.07
273 0.06
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.05
280 0.05
281 0.06
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.04
289 0.05
290 0.06
291 0.09
292 0.1
293 0.11
294 0.12
295 0.13
296 0.13
297 0.14
298 0.15
299 0.14
300 0.15
301 0.15
302 0.14
303 0.14
304 0.22
305 0.25
306 0.3
307 0.32
308 0.34
309 0.39
310 0.44
311 0.52
312 0.53
313 0.56
314 0.58
315 0.58
316 0.56
317 0.52
318 0.48
319 0.46
320 0.4
321 0.35
322 0.29
323 0.26
324 0.28
325 0.29
326 0.29
327 0.22
328 0.2
329 0.21
330 0.19
331 0.17
332 0.14
333 0.12
334 0.13
335 0.12
336 0.12
337 0.09
338 0.09
339 0.1
340 0.12
341 0.13
342 0.1
343 0.1
344 0.14
345 0.14
346 0.17
347 0.16
348 0.16
349 0.15
350 0.16
351 0.17
352 0.15
353 0.2
354 0.23
355 0.29
356 0.37
357 0.46
358 0.51
359 0.54
360 0.54
361 0.51
362 0.51
363 0.5
364 0.49
365 0.48
366 0.45
367 0.5
368 0.5
369 0.48
370 0.42
371 0.37
372 0.28
373 0.2
374 0.16
375 0.08
376 0.07
377 0.06
378 0.06
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.04
387 0.08
388 0.08
389 0.09
390 0.09
391 0.09
392 0.12
393 0.11
394 0.13
395 0.12
396 0.12
397 0.14
398 0.16
399 0.17
400 0.18
401 0.2
402 0.2
403 0.19
404 0.19
405 0.19
406 0.2
407 0.19
408 0.16
409 0.14
410 0.13
411 0.11
412 0.11
413 0.08
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.08
425 0.09
426 0.09
427 0.11
428 0.12
429 0.13
430 0.12
431 0.15
432 0.14
433 0.14
434 0.15
435 0.15
436 0.18
437 0.18
438 0.19
439 0.2
440 0.21
441 0.22
442 0.19
443 0.19
444 0.18
445 0.2
446 0.2
447 0.17
448 0.15
449 0.14
450 0.14
451 0.14
452 0.1
453 0.09
454 0.1
455 0.1
456 0.09
457 0.09
458 0.09
459 0.08
460 0.1
461 0.11
462 0.09
463 0.09
464 0.09
465 0.1
466 0.12
467 0.14
468 0.13
469 0.13
470 0.14
471 0.16
472 0.16
473 0.15
474 0.14
475 0.12
476 0.14
477 0.13
478 0.14
479 0.11
480 0.11
481 0.11
482 0.11
483 0.12
484 0.15
485 0.17
486 0.22
487 0.27
488 0.34
489 0.37
490 0.47
491 0.55
492 0.59
493 0.64
494 0.6
495 0.6
496 0.59
497 0.57
498 0.47
499 0.4
500 0.34
501 0.32
502 0.36
503 0.32
504 0.27
505 0.28
506 0.28
507 0.28
508 0.28
509 0.26
510 0.25
511 0.29
512 0.3
513 0.3
514 0.31
515 0.3
516 0.3
517 0.27
518 0.2
519 0.16
520 0.14
521 0.12
522 0.13
523 0.11
524 0.07
525 0.07
526 0.07
527 0.08
528 0.15
529 0.22
530 0.24
531 0.32
532 0.4
533 0.44
534 0.5
535 0.6
536 0.65
537 0.69
538 0.75
539 0.75
540 0.78
541 0.83
542 0.83
543 0.73
544 0.62
545 0.5
546 0.41
547 0.35
548 0.28
549 0.19
550 0.15
551 0.19
552 0.21
553 0.28
554 0.32
555 0.34
556 0.32
557 0.34
558 0.35
559 0.32
560 0.31
561 0.26
562 0.24
563 0.19
564 0.18
565 0.17
566 0.14
567 0.12
568 0.11
569 0.1
570 0.06
571 0.07
572 0.07
573 0.07
574 0.08
575 0.09
576 0.08
577 0.08
578 0.08
579 0.08
580 0.09
581 0.09
582 0.08
583 0.08
584 0.08
585 0.08
586 0.08
587 0.08
588 0.06
589 0.06
590 0.06
591 0.06
592 0.07
593 0.07
594 0.07
595 0.06
596 0.07
597 0.09
598 0.11
599 0.11
600 0.1
601 0.1
602 0.1
603 0.1
604 0.1
605 0.08
606 0.06
607 0.06
608 0.07
609 0.08
610 0.08
611 0.1
612 0.1
613 0.1
614 0.1
615 0.13
616 0.14
617 0.19
618 0.21
619 0.22
620 0.27
621 0.28
622 0.27
623 0.24
624 0.22
625 0.17
626 0.16
627 0.13
628 0.07
629 0.06
630 0.07
631 0.07
632 0.07
633 0.06
634 0.06
635 0.06
636 0.05
637 0.06
638 0.06
639 0.06
640 0.06
641 0.06
642 0.06
643 0.06
644 0.06
645 0.06
646 0.06
647 0.06
648 0.06
649 0.06
650 0.06
651 0.07
652 0.07
653 0.07
654 0.07
655 0.07
656 0.07
657 0.08
658 0.07
659 0.07
660 0.09
661 0.1
662 0.12
663 0.13
664 0.12
665 0.12
666 0.15
667 0.17
668 0.22
669 0.26
670 0.25
671 0.3
672 0.31
673 0.3
674 0.27
675 0.26
676 0.23
677 0.22
678 0.22
679 0.18
680 0.17
681 0.18
682 0.18
683 0.19
684 0.16
685 0.13
686 0.12
687 0.12
688 0.12
689 0.11
690 0.13
691 0.1
692 0.11
693 0.14
694 0.15
695 0.16
696 0.17
697 0.24
698 0.24
699 0.29
700 0.36
701 0.42
702 0.5
703 0.52
704 0.58
705 0.6
706 0.69
707 0.7
708 0.67
709 0.63
710 0.61
711 0.62
712 0.59
713 0.51
714 0.44
715 0.38
716 0.34
717 0.31
718 0.27
719 0.26
720 0.29
721 0.33
722 0.32
723 0.36
724 0.43
725 0.51
726 0.57
727 0.62
728 0.64
729 0.64
730 0.68
731 0.71
732 0.72
733 0.73
734 0.74
735 0.74
736 0.71
737 0.73
738 0.74
739 0.7
740 0.64
741 0.57
742 0.48
743 0.42
744 0.41
745 0.33
746 0.26
747 0.23
748 0.21
749 0.18
750 0.15
751 0.16
752 0.16
753 0.16
754 0.17
755 0.17
756 0.19
757 0.23
758 0.26
759 0.26
760 0.25
761 0.25
762 0.31
763 0.37
764 0.37
765 0.34
766 0.32
767 0.31
768 0.32
769 0.32
770 0.25
771 0.18
772 0.15
773 0.13
774 0.12
775 0.1
776 0.08
777 0.07
778 0.11
779 0.11
780 0.11
781 0.12
782 0.14
783 0.16