Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317XAY9

Protein Details
Accession A0A317XAY9    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-22AQKGKQAKPAKVSKGKKTAAHydrophilic
344-372LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDISHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-19GKQAKPAKVSKGKK
350-363KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 11.833, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MAAQKGKQAKPAKVSKGKKTAAPPAQLVAAISAFLKESGFSKTKDAFVKELDNKSIDSDAKNVPSLLELFQTWESQSQSSEKSSSSSSDESGSSSSESESESSDSSSDESSNSDVEMDDAPKKQAKSSSSSSSSSSSSDSDSDSDDEKETPAPAAKSQGTKRKAESSSSESDSDSSSDEAPKSKKTKVVSEKEESESEEEDSSSESESESDSSSDESSSSSDSDSDSDSDSDSSDDEDDKKALKTATKTPLPPSESSSSGSPSSSDDSDSSPQNSDSSGTVSNSEPVQETYSSSASPAPGNGFPKKKHVGARPTPLAVLSELPHDHPSNEYIPYAYAENAWKDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDISGGKSFKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.79
3 0.82
4 0.79
5 0.76
6 0.74
7 0.74
8 0.72
9 0.69
10 0.61
11 0.52
12 0.5
13 0.43
14 0.36
15 0.26
16 0.18
17 0.13
18 0.11
19 0.09
20 0.08
21 0.08
22 0.08
23 0.07
24 0.08
25 0.15
26 0.18
27 0.19
28 0.24
29 0.27
30 0.33
31 0.39
32 0.41
33 0.37
34 0.38
35 0.46
36 0.47
37 0.49
38 0.46
39 0.42
40 0.39
41 0.38
42 0.38
43 0.3
44 0.24
45 0.24
46 0.25
47 0.26
48 0.27
49 0.25
50 0.21
51 0.2
52 0.2
53 0.17
54 0.14
55 0.12
56 0.14
57 0.15
58 0.16
59 0.15
60 0.16
61 0.17
62 0.16
63 0.18
64 0.18
65 0.19
66 0.21
67 0.22
68 0.19
69 0.19
70 0.2
71 0.2
72 0.22
73 0.21
74 0.19
75 0.2
76 0.2
77 0.19
78 0.18
79 0.17
80 0.13
81 0.12
82 0.11
83 0.09
84 0.1
85 0.09
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.09
95 0.08
96 0.09
97 0.1
98 0.09
99 0.09
100 0.08
101 0.07
102 0.08
103 0.09
104 0.1
105 0.12
106 0.13
107 0.15
108 0.19
109 0.19
110 0.2
111 0.24
112 0.25
113 0.28
114 0.33
115 0.38
116 0.38
117 0.39
118 0.39
119 0.36
120 0.34
121 0.29
122 0.25
123 0.19
124 0.16
125 0.15
126 0.14
127 0.13
128 0.13
129 0.13
130 0.13
131 0.13
132 0.13
133 0.12
134 0.12
135 0.12
136 0.11
137 0.1
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.15
142 0.16
143 0.21
144 0.27
145 0.35
146 0.37
147 0.39
148 0.41
149 0.45
150 0.44
151 0.41
152 0.41
153 0.38
154 0.38
155 0.38
156 0.36
157 0.28
158 0.27
159 0.24
160 0.2
161 0.15
162 0.11
163 0.09
164 0.1
165 0.1
166 0.13
167 0.14
168 0.19
169 0.22
170 0.24
171 0.27
172 0.28
173 0.38
174 0.44
175 0.5
176 0.51
177 0.52
178 0.53
179 0.51
180 0.49
181 0.4
182 0.32
183 0.25
184 0.19
185 0.15
186 0.12
187 0.09
188 0.09
189 0.08
190 0.07
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.11
227 0.11
228 0.13
229 0.13
230 0.16
231 0.19
232 0.26
233 0.33
234 0.36
235 0.38
236 0.41
237 0.46
238 0.46
239 0.44
240 0.41
241 0.36
242 0.33
243 0.33
244 0.3
245 0.26
246 0.22
247 0.21
248 0.17
249 0.15
250 0.16
251 0.15
252 0.15
253 0.13
254 0.16
255 0.19
256 0.2
257 0.2
258 0.18
259 0.18
260 0.17
261 0.17
262 0.14
263 0.13
264 0.13
265 0.14
266 0.13
267 0.14
268 0.15
269 0.16
270 0.15
271 0.15
272 0.13
273 0.12
274 0.14
275 0.13
276 0.14
277 0.15
278 0.16
279 0.15
280 0.15
281 0.15
282 0.14
283 0.14
284 0.14
285 0.14
286 0.17
287 0.22
288 0.29
289 0.34
290 0.34
291 0.42
292 0.46
293 0.48
294 0.52
295 0.56
296 0.6
297 0.62
298 0.7
299 0.67
300 0.64
301 0.58
302 0.5
303 0.43
304 0.33
305 0.26
306 0.17
307 0.16
308 0.16
309 0.18
310 0.21
311 0.21
312 0.2
313 0.2
314 0.23
315 0.21
316 0.22
317 0.2
318 0.17
319 0.17
320 0.18
321 0.17
322 0.14
323 0.15
324 0.16
325 0.18
326 0.19
327 0.18
328 0.17
329 0.16
330 0.18
331 0.21
332 0.24
333 0.25
334 0.26
335 0.31
336 0.33
337 0.39
338 0.45
339 0.49
340 0.54
341 0.62
342 0.7
343 0.76
344 0.85
345 0.86
346 0.9
347 0.91
348 0.9
349 0.9
350 0.89
351 0.88
352 0.88
353 0.82
354 0.72
355 0.61
356 0.57
357 0.48
358 0.42
359 0.34
360 0.26
361 0.23