Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317VCS5

Protein Details
Accession A0A317VCS5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MSSQFANRRKPRKIGGDDEEHydrophilic
28-52SGPVVKRPQASKTKQKSNLRLSFGPHydrophilic
160-179EAEIREKKARRARLAKEQGTHydrophilic
232-255ISLGRKAEKEQKRKQREEMRELIDHydrophilic
943-968APSRNAFVHARPRPRRERPSSFPDTAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
166-171KKARRA
Subcellular Location(s) plas 24, nucl 1, mito 1, golg 1, mito_nucl 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010640  Low_temperature_requirement_A  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF06772  LtrA  
PF15458  NTR2  
Amino Acid Sequences MSSQFANRRKPRKIGGDDEENDADEQDSGPVVKRPQASKTKQKSNLRLSFGPGGTSMADDGDQESEVVIPKRPGLAKRALEKSALQRSLTPSGAGGQIPLRVGPEQDRPSYSNDYLKELRDSTPSTPKPAAEDESEKTIDVAAKFGEVMKVSTPAAIPSEAEIREKKARRARLAKEQGTISTEKDFISLEDDMEEDDWDLQGRREELKDTRLVRDDEDFAEGFDEFVEDGRISLGRKAEKEQKRKQREEMRELIDDAEGLSDDEDSDLEEKAAYEASQTRAAMGGGKDHIDRPRTPPKMTSLPRLSNCLDRLRINLAVLEKSKAQMIDRMEELRKEKADIAVREVEIQALIKEAGDNYEKLKQEAGITPGSQENLSAADEIANSRGLEVQRSVIAFIESPVDEKDGDRPHLRRQSEATPIELFFDLFFVANLSSFTATHEINNVEALWAYIGFLGVIWFTWLQVTLFDIRFARDSIFERICKAVQLAAMVGFASAGTRFTTRVRAENVWAFQSLSLILGGSRLLLALQYTVNTVFLRRRMMPAARGVSLIAGTQFVSSLTYLLLYYAFQQQRGLSPYIWTVWFVLFGVEMWVVMGTSSATPGIGLQDTHLNTRMGLLTLIIIGEGVIAVTRIVNKTVGPGGWTKWSFVHILGVTTNVYFLWQAYFDLSPRRILGKYSQQIWAQLHFPFHVALILLLEGSQILALSLDITLKLRYLAETILWACEEPRPRPDHAIRTLQTTIADMEIDYSRGAINEQIAITRILDDLPNHPLCPSYRTGQVPIIRDMLSDLVGNVTAALFSTMRIMPSNQPDPGHLSSDQLLQRYMALLEFVYVYYFAVASLTMFFFGGFVLLARRHTLRRCTSISATTRLTLGVLLASLVSFSRYFPLVYSFMTSPAILYAFTLTMLLGHWVVWLLKSGTVIYRRPRRVLAYIHVEKSDAERAPSRNAFVHARPRPRRERPSSFPDTAMYSKPVFRKGNELQADPNARIDRKTIANRQKTRATAGKSGPASRSRWQTGKAAAGTGIKKGGFMLPPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.78
3 0.79
4 0.73
5 0.71
6 0.62
7 0.53
8 0.44
9 0.35
10 0.27
11 0.17
12 0.15
13 0.1
14 0.09
15 0.09
16 0.11
17 0.15
18 0.17
19 0.22
20 0.28
21 0.32
22 0.4
23 0.5
24 0.57
25 0.64
26 0.72
27 0.77
28 0.81
29 0.88
30 0.88
31 0.89
32 0.88
33 0.85
34 0.77
35 0.72
36 0.7
37 0.6
38 0.51
39 0.4
40 0.33
41 0.26
42 0.24
43 0.18
44 0.11
45 0.1
46 0.09
47 0.1
48 0.09
49 0.09
50 0.08
51 0.08
52 0.09
53 0.13
54 0.14
55 0.16
56 0.16
57 0.17
58 0.23
59 0.28
60 0.31
61 0.33
62 0.41
63 0.45
64 0.53
65 0.58
66 0.54
67 0.52
68 0.53
69 0.56
70 0.57
71 0.53
72 0.45
73 0.43
74 0.46
75 0.49
76 0.45
77 0.36
78 0.26
79 0.25
80 0.26
81 0.22
82 0.18
83 0.14
84 0.15
85 0.15
86 0.15
87 0.15
88 0.13
89 0.15
90 0.18
91 0.26
92 0.29
93 0.32
94 0.36
95 0.35
96 0.4
97 0.46
98 0.44
99 0.42
100 0.38
101 0.42
102 0.41
103 0.42
104 0.41
105 0.36
106 0.35
107 0.33
108 0.36
109 0.34
110 0.42
111 0.41
112 0.43
113 0.43
114 0.42
115 0.41
116 0.42
117 0.4
118 0.35
119 0.38
120 0.34
121 0.37
122 0.37
123 0.32
124 0.28
125 0.26
126 0.24
127 0.19
128 0.18
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.13
133 0.13
134 0.11
135 0.12
136 0.12
137 0.14
138 0.13
139 0.14
140 0.14
141 0.13
142 0.14
143 0.13
144 0.12
145 0.12
146 0.17
147 0.17
148 0.2
149 0.21
150 0.24
151 0.33
152 0.38
153 0.45
154 0.48
155 0.56
156 0.63
157 0.71
158 0.73
159 0.75
160 0.81
161 0.77
162 0.72
163 0.65
164 0.57
165 0.51
166 0.45
167 0.35
168 0.28
169 0.24
170 0.2
171 0.18
172 0.17
173 0.13
174 0.16
175 0.14
176 0.12
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.11
181 0.11
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.09
188 0.11
189 0.13
190 0.15
191 0.17
192 0.21
193 0.24
194 0.28
195 0.34
196 0.34
197 0.38
198 0.4
199 0.4
200 0.37
201 0.37
202 0.34
203 0.28
204 0.29
205 0.23
206 0.18
207 0.18
208 0.15
209 0.12
210 0.09
211 0.08
212 0.05
213 0.05
214 0.07
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.08
219 0.08
220 0.11
221 0.16
222 0.18
223 0.2
224 0.26
225 0.36
226 0.45
227 0.54
228 0.62
229 0.68
230 0.75
231 0.79
232 0.84
233 0.84
234 0.84
235 0.82
236 0.8
237 0.74
238 0.66
239 0.6
240 0.51
241 0.4
242 0.3
243 0.22
244 0.13
245 0.08
246 0.06
247 0.05
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.04
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.07
260 0.06
261 0.07
262 0.1
263 0.13
264 0.16
265 0.16
266 0.15
267 0.16
268 0.16
269 0.17
270 0.14
271 0.15
272 0.12
273 0.14
274 0.15
275 0.17
276 0.22
277 0.23
278 0.24
279 0.29
280 0.38
281 0.41
282 0.42
283 0.42
284 0.45
285 0.51
286 0.52
287 0.55
288 0.52
289 0.56
290 0.56
291 0.57
292 0.53
293 0.48
294 0.48
295 0.43
296 0.38
297 0.32
298 0.33
299 0.31
300 0.31
301 0.25
302 0.24
303 0.21
304 0.21
305 0.21
306 0.2
307 0.16
308 0.16
309 0.17
310 0.15
311 0.14
312 0.16
313 0.17
314 0.18
315 0.19
316 0.23
317 0.23
318 0.25
319 0.27
320 0.27
321 0.25
322 0.24
323 0.24
324 0.25
325 0.31
326 0.29
327 0.31
328 0.3
329 0.29
330 0.29
331 0.27
332 0.22
333 0.15
334 0.14
335 0.09
336 0.07
337 0.06
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.07
342 0.09
343 0.09
344 0.11
345 0.17
346 0.17
347 0.18
348 0.18
349 0.17
350 0.18
351 0.2
352 0.21
353 0.17
354 0.16
355 0.17
356 0.17
357 0.17
358 0.14
359 0.11
360 0.09
361 0.08
362 0.08
363 0.07
364 0.06
365 0.06
366 0.07
367 0.07
368 0.08
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.1
373 0.09
374 0.11
375 0.11
376 0.11
377 0.11
378 0.12
379 0.12
380 0.09
381 0.09
382 0.08
383 0.08
384 0.09
385 0.07
386 0.08
387 0.08
388 0.09
389 0.08
390 0.09
391 0.15
392 0.16
393 0.19
394 0.23
395 0.25
396 0.33
397 0.41
398 0.41
399 0.37
400 0.38
401 0.4
402 0.44
403 0.43
404 0.36
405 0.3
406 0.29
407 0.29
408 0.24
409 0.19
410 0.1
411 0.1
412 0.08
413 0.06
414 0.06
415 0.05
416 0.04
417 0.04
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.07
423 0.08
424 0.08
425 0.09
426 0.11
427 0.1
428 0.1
429 0.1
430 0.09
431 0.07
432 0.07
433 0.06
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.03
438 0.03
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.06
452 0.08
453 0.08
454 0.1
455 0.1
456 0.1
457 0.11
458 0.12
459 0.11
460 0.1
461 0.13
462 0.17
463 0.2
464 0.19
465 0.2
466 0.21
467 0.2
468 0.19
469 0.16
470 0.12
471 0.09
472 0.09
473 0.08
474 0.07
475 0.07
476 0.06
477 0.06
478 0.04
479 0.03
480 0.03
481 0.03
482 0.03
483 0.04
484 0.05
485 0.06
486 0.07
487 0.14
488 0.15
489 0.18
490 0.21
491 0.22
492 0.24
493 0.27
494 0.27
495 0.21
496 0.21
497 0.17
498 0.13
499 0.12
500 0.1
501 0.07
502 0.05
503 0.04
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.03
508 0.03
509 0.03
510 0.03
511 0.03
512 0.03
513 0.03
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.05
518 0.06
519 0.06
520 0.07
521 0.08
522 0.1
523 0.13
524 0.14
525 0.16
526 0.19
527 0.2
528 0.22
529 0.25
530 0.26
531 0.23
532 0.22
533 0.2
534 0.16
535 0.15
536 0.12
537 0.07
538 0.05
539 0.04
540 0.04
541 0.04
542 0.04
543 0.05
544 0.04
545 0.05
546 0.04
547 0.04
548 0.04
549 0.04
550 0.05
551 0.04
552 0.06
553 0.13
554 0.14
555 0.14
556 0.15
557 0.15
558 0.18
559 0.21
560 0.21
561 0.14
562 0.14
563 0.15
564 0.16
565 0.15
566 0.13
567 0.1
568 0.08
569 0.08
570 0.08
571 0.07
572 0.05
573 0.05
574 0.05
575 0.04
576 0.04
577 0.04
578 0.04
579 0.03
580 0.03
581 0.03
582 0.03
583 0.03
584 0.03
585 0.03
586 0.03
587 0.03
588 0.04
589 0.05
590 0.05
591 0.05
592 0.05
593 0.1
594 0.11
595 0.12
596 0.14
597 0.13
598 0.13
599 0.14
600 0.14
601 0.09
602 0.09
603 0.08
604 0.05
605 0.05
606 0.05
607 0.04
608 0.03
609 0.03
610 0.03
611 0.02
612 0.02
613 0.02
614 0.02
615 0.02
616 0.03
617 0.04
618 0.05
619 0.06
620 0.07
621 0.07
622 0.08
623 0.1
624 0.1
625 0.1
626 0.11
627 0.12
628 0.18
629 0.18
630 0.17
631 0.17
632 0.18
633 0.18
634 0.16
635 0.19
636 0.13
637 0.14
638 0.13
639 0.13
640 0.12
641 0.11
642 0.1
643 0.06
644 0.06
645 0.05
646 0.05
647 0.05
648 0.05
649 0.06
650 0.07
651 0.08
652 0.08
653 0.14
654 0.14
655 0.15
656 0.15
657 0.18
658 0.17
659 0.18
660 0.24
661 0.28
662 0.32
663 0.33
664 0.37
665 0.35
666 0.39
667 0.38
668 0.34
669 0.26
670 0.23
671 0.22
672 0.17
673 0.17
674 0.13
675 0.12
676 0.1
677 0.08
678 0.07
679 0.06
680 0.05
681 0.04
682 0.04
683 0.04
684 0.03
685 0.03
686 0.03
687 0.02
688 0.02
689 0.02
690 0.02
691 0.03
692 0.03
693 0.03
694 0.04
695 0.05
696 0.05
697 0.06
698 0.06
699 0.06
700 0.07
701 0.08
702 0.08
703 0.07
704 0.1
705 0.1
706 0.1
707 0.1
708 0.09
709 0.09
710 0.12
711 0.17
712 0.17
713 0.23
714 0.26
715 0.28
716 0.36
717 0.42
718 0.46
719 0.48
720 0.54
721 0.48
722 0.5
723 0.49
724 0.42
725 0.36
726 0.29
727 0.23
728 0.14
729 0.14
730 0.08
731 0.09
732 0.08
733 0.09
734 0.08
735 0.07
736 0.07
737 0.07
738 0.08
739 0.07
740 0.07
741 0.08
742 0.09
743 0.09
744 0.1
745 0.1
746 0.1
747 0.09
748 0.09
749 0.08
750 0.09
751 0.1
752 0.11
753 0.18
754 0.18
755 0.18
756 0.18
757 0.19
758 0.19
759 0.22
760 0.23
761 0.19
762 0.24
763 0.27
764 0.3
765 0.34
766 0.37
767 0.37
768 0.36
769 0.36
770 0.29
771 0.27
772 0.25
773 0.19
774 0.15
775 0.12
776 0.09
777 0.07
778 0.07
779 0.07
780 0.06
781 0.05
782 0.04
783 0.04
784 0.05
785 0.05
786 0.05
787 0.08
788 0.09
789 0.1
790 0.11
791 0.14
792 0.18
793 0.25
794 0.29
795 0.28
796 0.28
797 0.29
798 0.34
799 0.34
800 0.33
801 0.26
802 0.24
803 0.22
804 0.28
805 0.29
806 0.23
807 0.22
808 0.18
809 0.18
810 0.17
811 0.16
812 0.09
813 0.08
814 0.07
815 0.07
816 0.07
817 0.07
818 0.06
819 0.06
820 0.06
821 0.06
822 0.06
823 0.05
824 0.05
825 0.05
826 0.05
827 0.06
828 0.06
829 0.06
830 0.06
831 0.06
832 0.06
833 0.06
834 0.06
835 0.04
836 0.04
837 0.07
838 0.08
839 0.09
840 0.12
841 0.15
842 0.2
843 0.26
844 0.35
845 0.39
846 0.45
847 0.48
848 0.52
849 0.53
850 0.56
851 0.55
852 0.51
853 0.46
854 0.4
855 0.36
856 0.3
857 0.27
858 0.18
859 0.14
860 0.08
861 0.06
862 0.05
863 0.05
864 0.04
865 0.04
866 0.04
867 0.06
868 0.06
869 0.07
870 0.09
871 0.1
872 0.1
873 0.11
874 0.15
875 0.15
876 0.16
877 0.2
878 0.18
879 0.19
880 0.2
881 0.19
882 0.15
883 0.14
884 0.14
885 0.09
886 0.09
887 0.09
888 0.08
889 0.08
890 0.08
891 0.06
892 0.06
893 0.07
894 0.08
895 0.06
896 0.06
897 0.06
898 0.07
899 0.08
900 0.08
901 0.1
902 0.1
903 0.11
904 0.12
905 0.13
906 0.17
907 0.22
908 0.28
909 0.35
910 0.44
911 0.49
912 0.52
913 0.56
914 0.56
915 0.58
916 0.58
917 0.57
918 0.57
919 0.58
920 0.57
921 0.52
922 0.47
923 0.41
924 0.39
925 0.38
926 0.29
927 0.26
928 0.29
929 0.31
930 0.39
931 0.41
932 0.4
933 0.36
934 0.39
935 0.41
936 0.41
937 0.49
938 0.5
939 0.58
940 0.64
941 0.71
942 0.77
943 0.82
944 0.86
945 0.86
946 0.87
947 0.85
948 0.85
949 0.84
950 0.76
951 0.67
952 0.59
953 0.54
954 0.48
955 0.42
956 0.37
957 0.31
958 0.33
959 0.36
960 0.43
961 0.41
962 0.39
963 0.46
964 0.48
965 0.56
966 0.55
967 0.53
968 0.48
969 0.52
970 0.55
971 0.46
972 0.47
973 0.43
974 0.39
975 0.38
976 0.36
977 0.33
978 0.38
979 0.46
980 0.5
981 0.55
982 0.65
983 0.71
984 0.76
985 0.78
986 0.73
987 0.72
988 0.69
989 0.65
990 0.63
991 0.6
992 0.61
993 0.58
994 0.59
995 0.57
996 0.55
997 0.54
998 0.52
999 0.56
1000 0.55
1001 0.56
1002 0.55
1003 0.56
1004 0.56
1005 0.59
1006 0.53
1007 0.45
1008 0.41
1009 0.42
1010 0.39
1011 0.35
1012 0.33
1013 0.25
1014 0.24
1015 0.24
1016 0.26