Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317VBC2

Protein Details
Accession A0A317VBC2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-33DYERRPHGARGGRKRRYREDDDYDRRQRRRYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-18RPHGARGGRKRR
Subcellular Location(s) nucl 9.5, cyto_nucl 8.5, cyto 6.5, mito 4, plas 3, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR027159  CBP80  
IPR015172  MIF4G-like_typ-1  
IPR015174  MIF4G-like_typ-2  
Gene Ontology GO:0005846  C:nuclear cap binding complex  
GO:0000339  F:RNA cap binding  
GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
GO:0016070  P:RNA metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF09088  MIF4G_like  
PF09090  MIF4G_like_2  
Amino Acid Sequences MADYERRPHGARGGRKRRYREDDDYDRRQRRRYEEPLIVKVRRQLLTIAESAARRAEDDAISIAKSVADNYGDEEFRNSFVEIALDLALEQPLKIPFIAATVLIANFQKPELVSDVLNRSGECLQKYVDVGAWREVKLLLRLLGCLQCVFEGDGIFPVLEDLFARAVDLQTASSEDLLGLELVKIILFTIPYVMASPAAGFESQATALLEKTDIIASTPHALVDLVNPFGPENGKPTAMQSVISLVQNQLQGESAQGWALACLPRPWRGALEALNAQRAEEMQETQDAQEEGAETMEATEAPEPKTYENGPKHVFPQINVPSPVKNGTRAIFPEVYLSVYANQDIETVPPTSDISSSLLRDALVDTINILDFNRIATAKFLIDVDCYFTPYTFVKRATPFDRLRDLPGDTQWKPEDVAVDAVFSQLFQLPSPEHKLVYYHSVLTECCKIAPAAIAPSLGRAIRFLYRSLETMDLDLSHRFLDWFAHHLSNFGFTWKWSEWIEDLELPLVHPRMAFITGALDKEIRLSFAQRIRGTLPDPYQDLITEGKEKDTPDFKYSSDTTPYANEGREIMQLVRKKAGDEEIQPVISAIEEQASSLGVDDPLLPSTDAFVTAICFVGSKSLSHVLSCIERNKERLLAIGPQSPRARRQIITSVMEYWVDQPGVGINIIDKLLNYTILTPLSVIEWALVDKLEAGTVLAESHIFEMISATVGKVTNRLRQIVAARTQPGLYEPQLSVLDETLNREKVDMQALFRVIEDSIVSVAGGSNDELMERGDGSGSLPEDEIIRQWGQRWLRVFRRKAGVEESFIADAMAAATPVGTVAPPHALEETVSENIPADGEMDVAEADASVDLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.78
3 0.85
4 0.86
5 0.86
6 0.85
7 0.84
8 0.82
9 0.84
10 0.84
11 0.86
12 0.86
13 0.86
14 0.82
15 0.8
16 0.78
17 0.75
18 0.76
19 0.74
20 0.73
21 0.74
22 0.76
23 0.78
24 0.79
25 0.74
26 0.67
27 0.64
28 0.62
29 0.54
30 0.47
31 0.4
32 0.36
33 0.38
34 0.36
35 0.32
36 0.28
37 0.27
38 0.26
39 0.26
40 0.21
41 0.17
42 0.17
43 0.18
44 0.15
45 0.16
46 0.18
47 0.17
48 0.16
49 0.16
50 0.14
51 0.12
52 0.12
53 0.11
54 0.11
55 0.11
56 0.11
57 0.14
58 0.18
59 0.18
60 0.18
61 0.2
62 0.18
63 0.19
64 0.2
65 0.17
66 0.13
67 0.13
68 0.14
69 0.11
70 0.11
71 0.09
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.08
76 0.07
77 0.07
78 0.08
79 0.09
80 0.11
81 0.1
82 0.1
83 0.09
84 0.11
85 0.12
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.1
90 0.11
91 0.11
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.11
96 0.1
97 0.12
98 0.14
99 0.15
100 0.15
101 0.2
102 0.24
103 0.25
104 0.26
105 0.23
106 0.23
107 0.25
108 0.28
109 0.24
110 0.22
111 0.2
112 0.22
113 0.23
114 0.21
115 0.2
116 0.2
117 0.2
118 0.25
119 0.27
120 0.25
121 0.25
122 0.25
123 0.24
124 0.24
125 0.24
126 0.21
127 0.18
128 0.19
129 0.21
130 0.22
131 0.21
132 0.18
133 0.16
134 0.13
135 0.14
136 0.14
137 0.11
138 0.1
139 0.09
140 0.1
141 0.1
142 0.09
143 0.08
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.08
156 0.07
157 0.07
158 0.09
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.07
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.11
205 0.11
206 0.1
207 0.09
208 0.1
209 0.09
210 0.12
211 0.12
212 0.1
213 0.1
214 0.11
215 0.11
216 0.11
217 0.13
218 0.1
219 0.12
220 0.13
221 0.14
222 0.14
223 0.16
224 0.19
225 0.18
226 0.17
227 0.14
228 0.15
229 0.16
230 0.16
231 0.15
232 0.11
233 0.14
234 0.15
235 0.15
236 0.12
237 0.11
238 0.11
239 0.11
240 0.11
241 0.08
242 0.06
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.11
250 0.13
251 0.18
252 0.19
253 0.21
254 0.2
255 0.21
256 0.23
257 0.22
258 0.24
259 0.25
260 0.24
261 0.26
262 0.25
263 0.23
264 0.2
265 0.18
266 0.16
267 0.12
268 0.12
269 0.1
270 0.11
271 0.12
272 0.12
273 0.14
274 0.11
275 0.1
276 0.09
277 0.09
278 0.08
279 0.07
280 0.07
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.04
285 0.04
286 0.06
287 0.08
288 0.09
289 0.12
290 0.12
291 0.13
292 0.16
293 0.17
294 0.25
295 0.26
296 0.31
297 0.32
298 0.32
299 0.34
300 0.37
301 0.36
302 0.27
303 0.33
304 0.32
305 0.35
306 0.36
307 0.35
308 0.3
309 0.31
310 0.35
311 0.26
312 0.24
313 0.21
314 0.2
315 0.22
316 0.22
317 0.26
318 0.22
319 0.21
320 0.19
321 0.17
322 0.17
323 0.14
324 0.13
325 0.1
326 0.09
327 0.09
328 0.08
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.08
335 0.07
336 0.08
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.09
341 0.1
342 0.11
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.1
347 0.1
348 0.1
349 0.08
350 0.07
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.05
357 0.04
358 0.04
359 0.05
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.08
367 0.08
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.1
372 0.09
373 0.11
374 0.1
375 0.1
376 0.12
377 0.12
378 0.15
379 0.15
380 0.16
381 0.19
382 0.22
383 0.27
384 0.28
385 0.36
386 0.35
387 0.36
388 0.39
389 0.36
390 0.35
391 0.33
392 0.31
393 0.24
394 0.26
395 0.28
396 0.23
397 0.26
398 0.24
399 0.22
400 0.21
401 0.2
402 0.17
403 0.11
404 0.13
405 0.09
406 0.09
407 0.08
408 0.08
409 0.07
410 0.06
411 0.06
412 0.05
413 0.06
414 0.05
415 0.07
416 0.07
417 0.1
418 0.15
419 0.15
420 0.13
421 0.13
422 0.14
423 0.15
424 0.18
425 0.17
426 0.13
427 0.13
428 0.13
429 0.13
430 0.15
431 0.15
432 0.11
433 0.1
434 0.1
435 0.09
436 0.09
437 0.1
438 0.08
439 0.07
440 0.08
441 0.08
442 0.07
443 0.08
444 0.09
445 0.08
446 0.07
447 0.06
448 0.08
449 0.1
450 0.11
451 0.12
452 0.14
453 0.15
454 0.16
455 0.17
456 0.17
457 0.14
458 0.13
459 0.13
460 0.1
461 0.1
462 0.1
463 0.09
464 0.07
465 0.07
466 0.06
467 0.06
468 0.08
469 0.08
470 0.1
471 0.12
472 0.14
473 0.13
474 0.14
475 0.14
476 0.15
477 0.14
478 0.12
479 0.1
480 0.09
481 0.14
482 0.13
483 0.15
484 0.13
485 0.14
486 0.14
487 0.15
488 0.17
489 0.12
490 0.12
491 0.11
492 0.1
493 0.09
494 0.1
495 0.09
496 0.08
497 0.07
498 0.07
499 0.08
500 0.09
501 0.08
502 0.06
503 0.09
504 0.1
505 0.11
506 0.11
507 0.1
508 0.09
509 0.11
510 0.11
511 0.09
512 0.09
513 0.11
514 0.16
515 0.2
516 0.27
517 0.24
518 0.26
519 0.26
520 0.28
521 0.27
522 0.27
523 0.25
524 0.2
525 0.21
526 0.2
527 0.19
528 0.16
529 0.17
530 0.13
531 0.13
532 0.14
533 0.13
534 0.14
535 0.16
536 0.16
537 0.19
538 0.23
539 0.24
540 0.23
541 0.25
542 0.24
543 0.27
544 0.28
545 0.28
546 0.27
547 0.24
548 0.22
549 0.22
550 0.25
551 0.22
552 0.2
553 0.17
554 0.14
555 0.15
556 0.15
557 0.15
558 0.13
559 0.16
560 0.2
561 0.21
562 0.24
563 0.23
564 0.22
565 0.23
566 0.26
567 0.25
568 0.24
569 0.26
570 0.24
571 0.24
572 0.23
573 0.21
574 0.17
575 0.13
576 0.1
577 0.06
578 0.05
579 0.05
580 0.05
581 0.05
582 0.05
583 0.05
584 0.05
585 0.06
586 0.05
587 0.05
588 0.06
589 0.06
590 0.07
591 0.08
592 0.07
593 0.06
594 0.08
595 0.08
596 0.08
597 0.07
598 0.07
599 0.07
600 0.07
601 0.08
602 0.06
603 0.06
604 0.05
605 0.09
606 0.09
607 0.08
608 0.11
609 0.16
610 0.16
611 0.16
612 0.17
613 0.16
614 0.19
615 0.22
616 0.24
617 0.26
618 0.28
619 0.31
620 0.33
621 0.34
622 0.3
623 0.29
624 0.26
625 0.26
626 0.27
627 0.3
628 0.28
629 0.32
630 0.37
631 0.37
632 0.39
633 0.4
634 0.41
635 0.36
636 0.41
637 0.42
638 0.44
639 0.45
640 0.42
641 0.37
642 0.34
643 0.33
644 0.28
645 0.21
646 0.17
647 0.13
648 0.11
649 0.09
650 0.09
651 0.1
652 0.09
653 0.08
654 0.06
655 0.07
656 0.08
657 0.08
658 0.07
659 0.08
660 0.09
661 0.1
662 0.1
663 0.09
664 0.11
665 0.11
666 0.11
667 0.09
668 0.09
669 0.09
670 0.09
671 0.07
672 0.06
673 0.06
674 0.06
675 0.06
676 0.06
677 0.05
678 0.06
679 0.06
680 0.06
681 0.05
682 0.05
683 0.05
684 0.05
685 0.05
686 0.05
687 0.05
688 0.05
689 0.06
690 0.06
691 0.06
692 0.06
693 0.06
694 0.06
695 0.08
696 0.07
697 0.07
698 0.08
699 0.1
700 0.1
701 0.16
702 0.2
703 0.25
704 0.29
705 0.31
706 0.3
707 0.34
708 0.39
709 0.4
710 0.41
711 0.39
712 0.38
713 0.36
714 0.36
715 0.31
716 0.28
717 0.25
718 0.21
719 0.2
720 0.18
721 0.2
722 0.21
723 0.21
724 0.2
725 0.16
726 0.18
727 0.15
728 0.2
729 0.22
730 0.24
731 0.23
732 0.23
733 0.23
734 0.23
735 0.3
736 0.27
737 0.23
738 0.25
739 0.26
740 0.26
741 0.25
742 0.24
743 0.16
744 0.15
745 0.12
746 0.09
747 0.08
748 0.08
749 0.07
750 0.06
751 0.06
752 0.06
753 0.07
754 0.06
755 0.07
756 0.06
757 0.07
758 0.07
759 0.08
760 0.08
761 0.07
762 0.08
763 0.07
764 0.07
765 0.08
766 0.11
767 0.11
768 0.11
769 0.11
770 0.11
771 0.12
772 0.12
773 0.13
774 0.14
775 0.15
776 0.15
777 0.17
778 0.25
779 0.28
780 0.33
781 0.38
782 0.43
783 0.52
784 0.61
785 0.64
786 0.64
787 0.7
788 0.68
789 0.66
790 0.65
791 0.59
792 0.54
793 0.51
794 0.46
795 0.37
796 0.33
797 0.28
798 0.2
799 0.15
800 0.12
801 0.09
802 0.05
803 0.04
804 0.04
805 0.04
806 0.05
807 0.05
808 0.04
809 0.04
810 0.06
811 0.1
812 0.11
813 0.13
814 0.13
815 0.14
816 0.14
817 0.16
818 0.19
819 0.17
820 0.17
821 0.15
822 0.15
823 0.15
824 0.15
825 0.12
826 0.08
827 0.07
828 0.07
829 0.07
830 0.06
831 0.06
832 0.06
833 0.06
834 0.05
835 0.05