Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

D6RL71

Protein Details
Accession D6RL71    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-34ETARLQKRIKLKQLNLSGTNHydrophilic
277-300ESVCKKLVKEHKRLQEQDKRNHEAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 10.833, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR003890  MIF4G-like_typ-3  
IPR039762  Nmd2/UPF2  
IPR007193  Upf2/Nmd2_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
KEGG cci:CC1G_14170  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02854  MIF4G  
PF04050  Upf2  
Amino Acid Sequences MEATTSGPPGKVDEETARLQKRIKLKQLNLSGTNETGSWISLQTLVKHTALIKRIRQSMASDNKDHIMKDIDSLSLEKYIDEIAGAVVEGLSRCKTERDVWGAVEVICALHRRFPNTFTPAVISSLATALTPPTKAYLATLTPEQREKEDNARISRQRPILRVCSELALVGIIRDSPDRSGGEWIMKTMKDLLSNDPALSSLPLLATFLKSYGRPFLGLVPPATAKQIPSDSEPGTLSENLANESQEGKPATVSEEEELIEQDIRDRFKRMCEGYFESVCKKLVKEHKRLQEQDKRNHEAYIRSGEIFEDRQQAYEKMTKSYEKLHSSCQSLSELLYLPLPELPTSTQKSDSIQIGSSGNSLLTDSDENITTGGKWEDEEERRFYEEIPDLRDFVPSSVLGVEAASEEESKEQEEAKEKERIEREKEEVRKLEEELQKLEVGGSSAASAPATGDSEDVEDDLPTPKAGTPKATTPPLSPHLAPQGPSQLLTALLAKLPDAVSRTMIDQAAVEFAFLNSKAARKRLIKFMSQVPKNRVDLLPHYSRLIAILNKYMPDIGSEVVSILDEEFRYLQRKKNVVKELAEVRMKNIIFLSNLTKFRVVPFHLILHMFKVCLDDFAGTNIENIALLLEGCGRFLLRTEETRERFGTMLELMKRKQTMQHLDQRQLLLLENAYYQCNPPERAPRQEKIRTPMELFIRHLIYDVLSKKTIDKVLKLIRKLDWDDENVRRVLHKVFTKPWKIRYSNISLLAMLTYDLQRYRPAFAIAVVDQILEDIRRGLEQNVYSTNQRRLATVKYLGELYIYRLLSSGIIFDTLWTIVTFGHPEGRPLPHQMVPIDMPDDFFRIRLVCVLLDTCGMCFDRGTQKKKLDNFLTFFLLNRRLQYYVQCKDPLPMDVEFVLSDSLEAVRPKLEMPKNIEEAAKAVDEMFNTAFQSAGLPEEQSDEGEGSDDEGDGDEEGRRDGARDEDGDLDEPESPVEKRAQSPEEPDVVISAKERQEFLGPSEEAEAEFAKELAKMFTDTSTESRKVDKKTAQALWDSTVIPPAVLKKKVESDPAASESGVTSFTVLTKRGNKQVARQLAVPSTSTLAVATKSQQLQDKVEQQQLKQLVLDYEQREEAEEMKARMESQRNRGQIKIRLAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.32
3 0.41
4 0.42
5 0.43
6 0.45
7 0.47
8 0.52
9 0.58
10 0.62
11 0.64
12 0.67
13 0.74
14 0.8
15 0.82
16 0.76
17 0.71
18 0.63
19 0.53
20 0.47
21 0.37
22 0.29
23 0.21
24 0.17
25 0.13
26 0.11
27 0.11
28 0.15
29 0.17
30 0.19
31 0.23
32 0.26
33 0.25
34 0.27
35 0.3
36 0.31
37 0.36
38 0.41
39 0.44
40 0.48
41 0.55
42 0.55
43 0.54
44 0.52
45 0.55
46 0.58
47 0.57
48 0.52
49 0.48
50 0.5
51 0.5
52 0.45
53 0.37
54 0.32
55 0.26
56 0.26
57 0.25
58 0.22
59 0.21
60 0.22
61 0.2
62 0.18
63 0.18
64 0.14
65 0.14
66 0.13
67 0.12
68 0.1
69 0.09
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.05
74 0.04
75 0.05
76 0.06
77 0.08
78 0.09
79 0.1
80 0.11
81 0.14
82 0.18
83 0.22
84 0.3
85 0.35
86 0.37
87 0.37
88 0.38
89 0.37
90 0.33
91 0.28
92 0.2
93 0.13
94 0.12
95 0.14
96 0.12
97 0.18
98 0.2
99 0.25
100 0.28
101 0.31
102 0.39
103 0.41
104 0.42
105 0.36
106 0.38
107 0.33
108 0.33
109 0.3
110 0.21
111 0.17
112 0.16
113 0.14
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.1
118 0.11
119 0.1
120 0.12
121 0.13
122 0.13
123 0.15
124 0.17
125 0.17
126 0.19
127 0.25
128 0.27
129 0.3
130 0.34
131 0.34
132 0.33
133 0.35
134 0.36
135 0.39
136 0.43
137 0.47
138 0.48
139 0.55
140 0.58
141 0.58
142 0.61
143 0.61
144 0.59
145 0.58
146 0.59
147 0.58
148 0.56
149 0.55
150 0.49
151 0.42
152 0.36
153 0.3
154 0.23
155 0.15
156 0.12
157 0.09
158 0.08
159 0.06
160 0.07
161 0.08
162 0.09
163 0.09
164 0.13
165 0.14
166 0.15
167 0.19
168 0.2
169 0.24
170 0.23
171 0.25
172 0.25
173 0.24
174 0.24
175 0.24
176 0.24
177 0.23
178 0.25
179 0.27
180 0.3
181 0.31
182 0.3
183 0.26
184 0.24
185 0.2
186 0.19
187 0.14
188 0.08
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.1
196 0.11
197 0.12
198 0.14
199 0.19
200 0.19
201 0.18
202 0.19
203 0.24
204 0.27
205 0.28
206 0.27
207 0.24
208 0.24
209 0.23
210 0.25
211 0.2
212 0.16
213 0.17
214 0.2
215 0.19
216 0.22
217 0.27
218 0.25
219 0.26
220 0.26
221 0.23
222 0.23
223 0.21
224 0.18
225 0.15
226 0.15
227 0.15
228 0.15
229 0.14
230 0.12
231 0.14
232 0.13
233 0.15
234 0.15
235 0.14
236 0.14
237 0.14
238 0.16
239 0.15
240 0.16
241 0.13
242 0.13
243 0.13
244 0.13
245 0.13
246 0.12
247 0.1
248 0.09
249 0.12
250 0.14
251 0.17
252 0.18
253 0.21
254 0.21
255 0.26
256 0.34
257 0.33
258 0.33
259 0.37
260 0.42
261 0.44
262 0.47
263 0.44
264 0.38
265 0.37
266 0.36
267 0.32
268 0.26
269 0.28
270 0.35
271 0.43
272 0.5
273 0.57
274 0.64
275 0.72
276 0.78
277 0.8
278 0.8
279 0.8
280 0.8
281 0.8
282 0.77
283 0.68
284 0.64
285 0.56
286 0.5
287 0.45
288 0.41
289 0.34
290 0.28
291 0.27
292 0.24
293 0.25
294 0.23
295 0.21
296 0.21
297 0.19
298 0.2
299 0.22
300 0.23
301 0.24
302 0.28
303 0.26
304 0.23
305 0.26
306 0.27
307 0.27
308 0.34
309 0.38
310 0.39
311 0.39
312 0.44
313 0.45
314 0.46
315 0.45
316 0.39
317 0.33
318 0.26
319 0.25
320 0.19
321 0.16
322 0.13
323 0.13
324 0.11
325 0.09
326 0.1
327 0.1
328 0.08
329 0.09
330 0.1
331 0.15
332 0.19
333 0.2
334 0.21
335 0.22
336 0.24
337 0.26
338 0.26
339 0.22
340 0.19
341 0.19
342 0.17
343 0.17
344 0.15
345 0.12
346 0.09
347 0.08
348 0.07
349 0.06
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.08
354 0.09
355 0.09
356 0.09
357 0.09
358 0.07
359 0.08
360 0.08
361 0.07
362 0.07
363 0.09
364 0.15
365 0.2
366 0.23
367 0.24
368 0.26
369 0.28
370 0.28
371 0.26
372 0.25
373 0.25
374 0.24
375 0.26
376 0.25
377 0.25
378 0.25
379 0.26
380 0.21
381 0.16
382 0.16
383 0.1
384 0.1
385 0.09
386 0.08
387 0.07
388 0.06
389 0.06
390 0.04
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.07
398 0.07
399 0.08
400 0.09
401 0.16
402 0.18
403 0.22
404 0.27
405 0.27
406 0.33
407 0.39
408 0.43
409 0.42
410 0.44
411 0.45
412 0.48
413 0.52
414 0.52
415 0.48
416 0.46
417 0.42
418 0.39
419 0.43
420 0.39
421 0.35
422 0.31
423 0.29
424 0.26
425 0.24
426 0.22
427 0.14
428 0.1
429 0.08
430 0.06
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.04
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.06
443 0.06
444 0.06
445 0.06
446 0.05
447 0.05
448 0.07
449 0.07
450 0.06
451 0.07
452 0.08
453 0.11
454 0.12
455 0.15
456 0.16
457 0.2
458 0.25
459 0.28
460 0.27
461 0.26
462 0.3
463 0.3
464 0.31
465 0.26
466 0.23
467 0.27
468 0.26
469 0.26
470 0.22
471 0.24
472 0.21
473 0.21
474 0.19
475 0.13
476 0.12
477 0.12
478 0.11
479 0.06
480 0.07
481 0.06
482 0.06
483 0.06
484 0.06
485 0.07
486 0.08
487 0.08
488 0.09
489 0.09
490 0.1
491 0.11
492 0.11
493 0.1
494 0.08
495 0.08
496 0.08
497 0.07
498 0.06
499 0.05
500 0.05
501 0.06
502 0.05
503 0.06
504 0.06
505 0.09
506 0.11
507 0.13
508 0.2
509 0.24
510 0.27
511 0.36
512 0.39
513 0.38
514 0.39
515 0.46
516 0.49
517 0.49
518 0.51
519 0.47
520 0.48
521 0.46
522 0.46
523 0.38
524 0.31
525 0.3
526 0.31
527 0.3
528 0.25
529 0.25
530 0.22
531 0.21
532 0.19
533 0.17
534 0.13
535 0.1
536 0.12
537 0.11
538 0.12
539 0.12
540 0.11
541 0.09
542 0.08
543 0.08
544 0.06
545 0.06
546 0.05
547 0.06
548 0.05
549 0.05
550 0.04
551 0.04
552 0.04
553 0.04
554 0.04
555 0.05
556 0.06
557 0.11
558 0.13
559 0.18
560 0.23
561 0.3
562 0.34
563 0.42
564 0.48
565 0.48
566 0.47
567 0.47
568 0.44
569 0.43
570 0.42
571 0.33
572 0.27
573 0.28
574 0.26
575 0.22
576 0.19
577 0.14
578 0.12
579 0.13
580 0.16
581 0.16
582 0.18
583 0.18
584 0.18
585 0.17
586 0.18
587 0.21
588 0.19
589 0.17
590 0.18
591 0.18
592 0.18
593 0.19
594 0.18
595 0.16
596 0.15
597 0.11
598 0.09
599 0.1
600 0.09
601 0.08
602 0.09
603 0.07
604 0.07
605 0.08
606 0.09
607 0.07
608 0.07
609 0.07
610 0.06
611 0.05
612 0.05
613 0.04
614 0.03
615 0.03
616 0.03
617 0.04
618 0.04
619 0.04
620 0.04
621 0.04
622 0.04
623 0.05
624 0.09
625 0.1
626 0.12
627 0.18
628 0.26
629 0.28
630 0.31
631 0.31
632 0.28
633 0.27
634 0.24
635 0.2
636 0.13
637 0.16
638 0.16
639 0.18
640 0.18
641 0.2
642 0.21
643 0.2
644 0.24
645 0.27
646 0.31
647 0.36
648 0.45
649 0.47
650 0.5
651 0.52
652 0.47
653 0.4
654 0.33
655 0.26
656 0.17
657 0.12
658 0.09
659 0.08
660 0.08
661 0.09
662 0.08
663 0.08
664 0.11
665 0.13
666 0.15
667 0.17
668 0.27
669 0.3
670 0.39
671 0.45
672 0.48
673 0.54
674 0.59
675 0.6
676 0.56
677 0.57
678 0.5
679 0.46
680 0.45
681 0.41
682 0.36
683 0.33
684 0.31
685 0.26
686 0.23
687 0.22
688 0.17
689 0.13
690 0.15
691 0.16
692 0.15
693 0.15
694 0.16
695 0.17
696 0.2
697 0.25
698 0.22
699 0.22
700 0.27
701 0.35
702 0.4
703 0.41
704 0.4
705 0.37
706 0.4
707 0.41
708 0.37
709 0.32
710 0.31
711 0.35
712 0.35
713 0.36
714 0.31
715 0.29
716 0.25
717 0.24
718 0.22
719 0.22
720 0.24
721 0.26
722 0.33
723 0.41
724 0.5
725 0.52
726 0.58
727 0.61
728 0.59
729 0.59
730 0.58
731 0.57
732 0.53
733 0.52
734 0.44
735 0.35
736 0.33
737 0.28
738 0.22
739 0.14
740 0.09
741 0.06
742 0.07
743 0.08
744 0.08
745 0.12
746 0.13
747 0.15
748 0.15
749 0.16
750 0.15
751 0.15
752 0.18
753 0.15
754 0.15
755 0.12
756 0.11
757 0.09
758 0.09
759 0.08
760 0.05
761 0.05
762 0.04
763 0.05
764 0.06
765 0.07
766 0.08
767 0.12
768 0.13
769 0.15
770 0.18
771 0.2
772 0.23
773 0.26
774 0.3
775 0.32
776 0.32
777 0.31
778 0.3
779 0.32
780 0.34
781 0.35
782 0.3
783 0.26
784 0.26
785 0.24
786 0.23
787 0.19
788 0.17
789 0.17
790 0.16
791 0.15
792 0.15
793 0.15
794 0.14
795 0.14
796 0.11
797 0.06
798 0.07
799 0.06
800 0.06
801 0.07
802 0.07
803 0.07
804 0.06
805 0.06
806 0.06
807 0.07
808 0.08
809 0.07
810 0.14
811 0.13
812 0.15
813 0.18
814 0.21
815 0.22
816 0.26
817 0.29
818 0.26
819 0.29
820 0.27
821 0.27
822 0.24
823 0.23
824 0.2
825 0.16
826 0.15
827 0.13
828 0.15
829 0.12
830 0.11
831 0.11
832 0.11
833 0.11
834 0.12
835 0.12
836 0.1
837 0.11
838 0.11
839 0.1
840 0.11
841 0.11
842 0.09
843 0.1
844 0.1
845 0.09
846 0.09
847 0.12
848 0.21
849 0.29
850 0.35
851 0.41
852 0.48
853 0.55
854 0.6
855 0.65
856 0.62
857 0.6
858 0.58
859 0.54
860 0.5
861 0.43
862 0.38
863 0.34
864 0.34
865 0.28
866 0.27
867 0.26
868 0.25
869 0.26
870 0.33
871 0.38
872 0.35
873 0.39
874 0.4
875 0.38
876 0.39
877 0.39
878 0.33
879 0.27
880 0.24
881 0.2
882 0.18
883 0.18
884 0.15
885 0.14
886 0.12
887 0.08
888 0.07
889 0.06
890 0.06
891 0.08
892 0.09
893 0.09
894 0.09
895 0.1
896 0.11
897 0.2
898 0.25
899 0.28
900 0.36
901 0.42
902 0.45
903 0.46
904 0.45
905 0.36
906 0.33
907 0.29
908 0.21
909 0.14
910 0.12
911 0.11
912 0.1
913 0.12
914 0.12
915 0.1
916 0.1
917 0.1
918 0.1
919 0.09
920 0.09
921 0.07
922 0.08
923 0.08
924 0.08
925 0.08
926 0.11
927 0.11
928 0.11
929 0.11
930 0.1
931 0.09
932 0.1
933 0.1
934 0.08
935 0.08
936 0.07
937 0.07
938 0.07
939 0.07
940 0.06
941 0.07
942 0.07
943 0.07
944 0.08
945 0.09
946 0.08
947 0.09
948 0.11
949 0.13
950 0.15
951 0.16
952 0.18
953 0.19
954 0.21
955 0.21
956 0.2
957 0.18
958 0.16
959 0.14
960 0.13
961 0.12
962 0.11
963 0.12
964 0.17
965 0.18
966 0.22
967 0.28
968 0.33
969 0.34
970 0.39
971 0.42
972 0.4
973 0.38
974 0.34
975 0.28
976 0.24
977 0.22
978 0.18
979 0.19
980 0.19
981 0.21
982 0.21
983 0.21
984 0.25
985 0.26
986 0.27
987 0.29
988 0.25
989 0.24
990 0.26
991 0.25
992 0.2
993 0.2
994 0.18
995 0.11
996 0.11
997 0.1
998 0.09
999 0.09
1000 0.1
1001 0.1
1002 0.11
1003 0.11
1004 0.12
1005 0.13
1006 0.15
1007 0.16
1008 0.2
1009 0.26
1010 0.27
1011 0.27
1012 0.34
1013 0.39
1014 0.43
1015 0.49
1016 0.51
1017 0.53
1018 0.6
1019 0.63
1020 0.59
1021 0.58
1022 0.54
1023 0.48
1024 0.44
1025 0.36
1026 0.28
1027 0.26
1028 0.22
1029 0.17
1030 0.17
1031 0.22
1032 0.27
1033 0.3
1034 0.31
1035 0.33
1036 0.41
1037 0.45
1038 0.51
1039 0.47
1040 0.45
1041 0.46
1042 0.48
1043 0.45
1044 0.36
1045 0.32
1046 0.26
1047 0.22
1048 0.18
1049 0.12
1050 0.09
1051 0.08
1052 0.11
1053 0.13
1054 0.14
1055 0.2
1056 0.28
1057 0.34
1058 0.42
1059 0.5
1060 0.51
1061 0.58
1062 0.66
1063 0.68
1064 0.64
1065 0.6
1066 0.56
1067 0.52
1068 0.5
1069 0.42
1070 0.34
1071 0.27
1072 0.23
1073 0.21
1074 0.17
1075 0.14
1076 0.13
1077 0.14
1078 0.16
1079 0.2
1080 0.22
1081 0.26
1082 0.33
1083 0.35
1084 0.4
1085 0.46
1086 0.52
1087 0.51
1088 0.57
1089 0.57
1090 0.5
1091 0.55
1092 0.52
1093 0.45
1094 0.37
1095 0.34
1096 0.28
1097 0.28
1098 0.34
1099 0.29
1100 0.29
1101 0.29
1102 0.28
1103 0.29
1104 0.27
1105 0.26
1106 0.25
1107 0.27
1108 0.24
1109 0.25
1110 0.25
1111 0.24
1112 0.3
1113 0.38
1114 0.4
1115 0.45
1116 0.53
1117 0.58
1118 0.61
1119 0.66
1120 0.67
1121 0.66