Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A317X9M7

Protein Details
Accession A0A317X9M7    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-26ATAISKPTSHTPKMKRPPPPFVQTGHydrophilic
75-96TTSTKGSRSPNRPKKEAQTHGDHydrophilic
410-429SPLHRDPPPSPKRRKRTVAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
420-424PKRRK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10.333, mito 7.5, cyto_mito 5.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MATAISKPTSHTPKMKRPPPPFVQTGVNGVKSQQSSISSPPATAKRLPGASQPTSASSATGPPLNGANGAANAGTTSTKGSRSPNRPKKEAQTHGDQASRAQKPLMRTLSMDNDRRAGNRCPEPYVKTPSYILKKFAKSPPSLILHLHPTHFRFEQQDGSFPYNSEMKVIIEHIRAGTVPHDMMEELLRANVRFYEGCLIVRVVDHKSVSAHARKSTAPASNESNTPFSIHNYNEHVTPSAYVPYPKQSQLNSEKPVGEKAPSANQHDIKTNGEQAGDPGSRAEETSSNSTQPKQPPKPRVFTTVLHPTPRSFQAELTLLATTPDPKSARQQASNATSHSHQSSSTAPSSPGTSNQSDRGPVPKRQKMMVEPQDFLECESKLTRALAPPLFLDPVHSFDAMQDLLKHMESPLHRDPPPSPKRRKRTVAELAADEALAAEEERFMLIMDERLEPTTAGGAGGPKSAVVDDTGGGAPFEPRFSRFKTLENIRMQHEEKAKREHEVKLKQELAKRQQQEQERERRRALEQRQAEEHAKEEARRQLVAAQQAQAQLAAQQQQTRHVMTQTNGISQAPQSSPVVRNQTPHNISSPVVGNTIAAQPGVPMSMTNSMQGAGSPPRPPSALQHAHPTVMSHPMAPSRSQQGQSRHGTPQLNGTPALSHSTPIMRNVTPTQRMSHASPSHSTMAPTPVLNQATMMGTPQMSNGMGLTPQQQQQMLLQQRQQLLAQQSHMVQNQFSPKQVAQMHANVHAQQNIQAHQQQMLQAQQQNYQGQPKFPNPQAYQAQLMRAQLAQMHMAQQQQQQQQAQQQQQQHQQVQGQQSQPQQGQVHQNSPHMNPQQQMLMAAAQANGGLRQANAPQANSVAQRYQQLYAQRLIRLRQEMAAKYMPQYGSPAQFPQHIQQQYTTGLENAAKIWVQEIMRRERDMVQHRASQVAAVQAQVMQQQQQNMMQNRGNS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.8
3 0.82
4 0.82
5 0.85
6 0.84
7 0.82
8 0.75
9 0.69
10 0.67
11 0.58
12 0.58
13 0.53
14 0.47
15 0.39
16 0.36
17 0.38
18 0.32
19 0.31
20 0.26
21 0.25
22 0.25
23 0.29
24 0.36
25 0.31
26 0.31
27 0.37
28 0.38
29 0.39
30 0.4
31 0.4
32 0.4
33 0.43
34 0.44
35 0.45
36 0.48
37 0.46
38 0.46
39 0.43
40 0.39
41 0.38
42 0.36
43 0.29
44 0.22
45 0.22
46 0.21
47 0.22
48 0.19
49 0.17
50 0.19
51 0.18
52 0.17
53 0.15
54 0.14
55 0.12
56 0.12
57 0.11
58 0.09
59 0.08
60 0.09
61 0.08
62 0.07
63 0.1
64 0.12
65 0.15
66 0.18
67 0.27
68 0.36
69 0.46
70 0.57
71 0.64
72 0.71
73 0.75
74 0.79
75 0.82
76 0.83
77 0.81
78 0.76
79 0.75
80 0.73
81 0.72
82 0.68
83 0.57
84 0.52
85 0.52
86 0.48
87 0.4
88 0.37
89 0.34
90 0.35
91 0.44
92 0.43
93 0.35
94 0.35
95 0.39
96 0.46
97 0.51
98 0.52
99 0.45
100 0.44
101 0.43
102 0.44
103 0.44
104 0.41
105 0.41
106 0.44
107 0.45
108 0.48
109 0.52
110 0.55
111 0.57
112 0.59
113 0.52
114 0.47
115 0.47
116 0.5
117 0.54
118 0.5
119 0.5
120 0.49
121 0.52
122 0.56
123 0.61
124 0.6
125 0.53
126 0.55
127 0.56
128 0.53
129 0.5
130 0.45
131 0.41
132 0.41
133 0.4
134 0.38
135 0.35
136 0.32
137 0.35
138 0.34
139 0.33
140 0.29
141 0.3
142 0.36
143 0.33
144 0.37
145 0.36
146 0.39
147 0.37
148 0.33
149 0.33
150 0.28
151 0.26
152 0.22
153 0.19
154 0.15
155 0.15
156 0.17
157 0.19
158 0.16
159 0.18
160 0.16
161 0.16
162 0.15
163 0.15
164 0.14
165 0.12
166 0.11
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.11
171 0.11
172 0.1
173 0.08
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.11
178 0.1
179 0.12
180 0.11
181 0.13
182 0.16
183 0.16
184 0.17
185 0.18
186 0.17
187 0.15
188 0.16
189 0.17
190 0.14
191 0.16
192 0.16
193 0.15
194 0.16
195 0.19
196 0.24
197 0.28
198 0.3
199 0.29
200 0.32
201 0.32
202 0.35
203 0.37
204 0.37
205 0.33
206 0.33
207 0.36
208 0.36
209 0.37
210 0.36
211 0.32
212 0.26
213 0.26
214 0.23
215 0.2
216 0.22
217 0.21
218 0.23
219 0.25
220 0.26
221 0.25
222 0.26
223 0.24
224 0.2
225 0.19
226 0.17
227 0.15
228 0.15
229 0.15
230 0.16
231 0.21
232 0.24
233 0.26
234 0.29
235 0.27
236 0.35
237 0.42
238 0.48
239 0.46
240 0.45
241 0.45
242 0.42
243 0.44
244 0.37
245 0.29
246 0.23
247 0.22
248 0.27
249 0.29
250 0.33
251 0.37
252 0.39
253 0.39
254 0.41
255 0.4
256 0.36
257 0.34
258 0.32
259 0.26
260 0.23
261 0.21
262 0.18
263 0.21
264 0.18
265 0.16
266 0.13
267 0.13
268 0.12
269 0.12
270 0.13
271 0.1
272 0.13
273 0.19
274 0.2
275 0.22
276 0.23
277 0.25
278 0.3
279 0.36
280 0.44
281 0.48
282 0.55
283 0.63
284 0.69
285 0.74
286 0.71
287 0.7
288 0.64
289 0.56
290 0.54
291 0.54
292 0.5
293 0.46
294 0.43
295 0.37
296 0.36
297 0.38
298 0.35
299 0.25
300 0.23
301 0.23
302 0.24
303 0.24
304 0.21
305 0.17
306 0.13
307 0.12
308 0.12
309 0.1
310 0.09
311 0.13
312 0.13
313 0.14
314 0.21
315 0.3
316 0.35
317 0.36
318 0.38
319 0.4
320 0.45
321 0.46
322 0.4
323 0.33
324 0.29
325 0.28
326 0.26
327 0.2
328 0.14
329 0.14
330 0.16
331 0.18
332 0.19
333 0.18
334 0.17
335 0.17
336 0.2
337 0.19
338 0.19
339 0.19
340 0.2
341 0.21
342 0.24
343 0.24
344 0.23
345 0.23
346 0.28
347 0.28
348 0.33
349 0.41
350 0.43
351 0.44
352 0.46
353 0.49
354 0.45
355 0.51
356 0.53
357 0.47
358 0.43
359 0.41
360 0.4
361 0.36
362 0.33
363 0.25
364 0.15
365 0.13
366 0.13
367 0.13
368 0.12
369 0.13
370 0.13
371 0.12
372 0.17
373 0.16
374 0.16
375 0.17
376 0.17
377 0.17
378 0.15
379 0.16
380 0.12
381 0.15
382 0.15
383 0.15
384 0.14
385 0.13
386 0.15
387 0.12
388 0.11
389 0.08
390 0.07
391 0.08
392 0.08
393 0.08
394 0.07
395 0.1
396 0.11
397 0.18
398 0.22
399 0.26
400 0.27
401 0.29
402 0.32
403 0.39
404 0.48
405 0.5
406 0.56
407 0.6
408 0.69
409 0.76
410 0.82
411 0.76
412 0.76
413 0.76
414 0.73
415 0.66
416 0.58
417 0.5
418 0.41
419 0.36
420 0.25
421 0.15
422 0.07
423 0.05
424 0.04
425 0.03
426 0.02
427 0.03
428 0.03
429 0.03
430 0.03
431 0.03
432 0.03
433 0.05
434 0.07
435 0.07
436 0.08
437 0.08
438 0.09
439 0.08
440 0.08
441 0.07
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.07
464 0.06
465 0.08
466 0.11
467 0.14
468 0.2
469 0.21
470 0.24
471 0.3
472 0.35
473 0.41
474 0.42
475 0.42
476 0.38
477 0.42
478 0.4
479 0.37
480 0.4
481 0.36
482 0.35
483 0.4
484 0.38
485 0.37
486 0.4
487 0.41
488 0.42
489 0.45
490 0.46
491 0.45
492 0.49
493 0.49
494 0.5
495 0.52
496 0.49
497 0.49
498 0.48
499 0.46
500 0.47
501 0.51
502 0.55
503 0.56
504 0.6
505 0.6
506 0.63
507 0.59
508 0.56
509 0.53
510 0.53
511 0.51
512 0.49
513 0.46
514 0.45
515 0.46
516 0.47
517 0.45
518 0.36
519 0.31
520 0.26
521 0.22
522 0.2
523 0.21
524 0.22
525 0.22
526 0.21
527 0.2
528 0.2
529 0.22
530 0.26
531 0.23
532 0.19
533 0.2
534 0.2
535 0.2
536 0.16
537 0.13
538 0.1
539 0.1
540 0.12
541 0.11
542 0.13
543 0.13
544 0.18
545 0.2
546 0.2
547 0.2
548 0.18
549 0.2
550 0.18
551 0.25
552 0.21
553 0.2
554 0.2
555 0.19
556 0.17
557 0.15
558 0.18
559 0.11
560 0.12
561 0.11
562 0.14
563 0.16
564 0.2
565 0.27
566 0.25
567 0.27
568 0.29
569 0.37
570 0.36
571 0.36
572 0.33
573 0.28
574 0.27
575 0.27
576 0.26
577 0.17
578 0.15
579 0.14
580 0.12
581 0.11
582 0.12
583 0.1
584 0.07
585 0.06
586 0.06
587 0.06
588 0.06
589 0.04
590 0.03
591 0.05
592 0.09
593 0.1
594 0.1
595 0.1
596 0.1
597 0.1
598 0.1
599 0.11
600 0.1
601 0.13
602 0.14
603 0.15
604 0.16
605 0.17
606 0.18
607 0.2
608 0.27
609 0.3
610 0.3
611 0.37
612 0.37
613 0.36
614 0.36
615 0.32
616 0.23
617 0.22
618 0.21
619 0.14
620 0.14
621 0.16
622 0.18
623 0.18
624 0.2
625 0.2
626 0.25
627 0.27
628 0.33
629 0.36
630 0.43
631 0.46
632 0.48
633 0.45
634 0.46
635 0.45
636 0.39
637 0.41
638 0.36
639 0.33
640 0.28
641 0.26
642 0.21
643 0.2
644 0.23
645 0.15
646 0.12
647 0.12
648 0.15
649 0.16
650 0.18
651 0.21
652 0.18
653 0.21
654 0.25
655 0.31
656 0.32
657 0.33
658 0.32
659 0.32
660 0.35
661 0.35
662 0.39
663 0.36
664 0.33
665 0.34
666 0.35
667 0.35
668 0.32
669 0.3
670 0.23
671 0.23
672 0.21
673 0.19
674 0.17
675 0.19
676 0.19
677 0.18
678 0.17
679 0.14
680 0.14
681 0.14
682 0.12
683 0.08
684 0.08
685 0.08
686 0.08
687 0.08
688 0.07
689 0.07
690 0.07
691 0.07
692 0.07
693 0.07
694 0.11
695 0.13
696 0.16
697 0.17
698 0.18
699 0.18
700 0.2
701 0.28
702 0.31
703 0.31
704 0.32
705 0.35
706 0.36
707 0.37
708 0.35
709 0.31
710 0.3
711 0.28
712 0.26
713 0.24
714 0.24
715 0.27
716 0.29
717 0.24
718 0.2
719 0.21
720 0.28
721 0.27
722 0.27
723 0.27
724 0.24
725 0.31
726 0.33
727 0.33
728 0.29
729 0.32
730 0.33
731 0.34
732 0.35
733 0.3
734 0.3
735 0.29
736 0.25
737 0.24
738 0.25
739 0.22
740 0.25
741 0.25
742 0.24
743 0.24
744 0.25
745 0.24
746 0.23
747 0.25
748 0.26
749 0.28
750 0.28
751 0.31
752 0.34
753 0.34
754 0.34
755 0.39
756 0.35
757 0.36
758 0.39
759 0.41
760 0.43
761 0.46
762 0.53
763 0.46
764 0.53
765 0.53
766 0.51
767 0.51
768 0.45
769 0.43
770 0.36
771 0.35
772 0.28
773 0.24
774 0.21
775 0.17
776 0.17
777 0.15
778 0.13
779 0.15
780 0.16
781 0.18
782 0.21
783 0.24
784 0.31
785 0.33
786 0.38
787 0.38
788 0.39
789 0.45
790 0.49
791 0.52
792 0.5
793 0.53
794 0.55
795 0.61
796 0.66
797 0.61
798 0.57
799 0.54
800 0.53
801 0.53
802 0.52
803 0.46
804 0.43
805 0.45
806 0.47
807 0.44
808 0.45
809 0.4
810 0.38
811 0.46
812 0.45
813 0.47
814 0.44
815 0.48
816 0.46
817 0.47
818 0.51
819 0.46
820 0.45
821 0.39
822 0.38
823 0.36
824 0.33
825 0.31
826 0.23
827 0.18
828 0.15
829 0.15
830 0.12
831 0.09
832 0.09
833 0.08
834 0.07
835 0.07
836 0.07
837 0.07
838 0.09
839 0.11
840 0.18
841 0.2
842 0.2
843 0.21
844 0.22
845 0.25
846 0.25
847 0.27
848 0.23
849 0.22
850 0.27
851 0.29
852 0.29
853 0.29
854 0.33
855 0.34
856 0.37
857 0.39
858 0.39
859 0.41
860 0.42
861 0.45
862 0.44
863 0.42
864 0.4
865 0.43
866 0.41
867 0.42
868 0.43
869 0.38
870 0.35
871 0.39
872 0.35
873 0.28
874 0.31
875 0.3
876 0.29
877 0.31
878 0.32
879 0.28
880 0.32
881 0.34
882 0.35
883 0.4
884 0.39
885 0.38
886 0.38
887 0.39
888 0.37
889 0.36
890 0.31
891 0.23
892 0.22
893 0.21
894 0.2
895 0.17
896 0.16
897 0.14
898 0.13
899 0.13
900 0.16
901 0.16
902 0.2
903 0.26
904 0.33
905 0.38
906 0.39
907 0.41
908 0.42
909 0.5
910 0.54
911 0.56
912 0.52
913 0.54
914 0.53
915 0.53
916 0.47
917 0.39
918 0.33
919 0.3
920 0.25
921 0.19
922 0.18
923 0.16
924 0.18
925 0.2
926 0.19
927 0.18
928 0.2
929 0.23
930 0.26
931 0.31
932 0.38
933 0.4
934 0.45